MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-4

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015917	GCTA	2	8	475	482	25 %	25 %	25 %	25 %	343127153
2	NC_015917	TCTT	2	8	670	677	0 %	75 %	0 %	25 %	343127153
3	NC_015917	AAAC	2	8	699	706	75 %	0 %	0 %	25 %	343127153
4	NC_015917	GTTT	2	8	1173	1180	0 %	75 %	25 %	0 %	343127153
5	NC_015917	TTGT	2	8	1271	1278	0 %	75 %	25 %	0 %	343127153
6	NC_015917	TATC	2	8	1684	1691	25 %	50 %	0 %	25 %	343127154
7	NC_015917	GGAT	2	8	2158	2165	25 %	25 %	50 %	0 %	343127155
8	NC_015917	GAAA	2	8	2307	2314	75 %	0 %	25 %	0 %	343127155
9	NC_015917	ATCA	2	8	2529	2536	50 %	25 %	0 %	25 %	343127155
10	NC_015917	ATCA	2	8	2689	2696	50 %	25 %	0 %	25 %	343127155
11	NC_015917	AAAG	2	8	2804	2811	75 %	0 %	25 %	0 %	343127155
12	NC_015917	AATA	2	8	3446	3453	75 %	25 %	0 %	0 %	343127157
13	NC_015917	CAAA	2	8	3491	3498	75 %	0 %	0 %	25 %	343127157
14	NC_015917	TTAA	2	8	3499	3506	50 %	50 %	0 %	0 %	343127157
15	NC_015917	CGGT	2	8	4369	4376	0 %	25 %	50 %	25 %	343127159
16	NC_015917	AATT	2	8	4697	4704	50 %	50 %	0 %	0 %	343127159
17	NC_015917	AAAC	2	8	4845	4852	75 %	0 %	0 %	25 %	343127159
18	NC_015917	GCTT	2	8	6067	6074	0 %	50 %	25 %	25 %	343127160
19	NC_015917	TTTG	2	8	7705	7712	0 %	75 %	25 %	0 %	343127163
20	NC_015917	CATT	2	8	10185	10192	25 %	50 %	0 %	25 %	343127164
21	NC_015917	CATC	2	8	10467	10474	25 %	25 %	0 %	50 %	343127165
22	NC_015917	ATTT	2	8	10777	10784	25 %	75 %	0 %	0 %	343127165
23	NC_015917	TAAT	2	8	10851	10858	50 %	50 %	0 %	0 %	343127165
24	NC_015917	AATA	2	8	11225	11232	75 %	25 %	0 %	0 %	343127166
25	NC_015917	TATT	2	8	11578	11585	25 %	75 %	0 %	0 %	343127166
26	NC_015917	ATTT	2	8	12001	12008	25 %	75 %	0 %	0 %	343127167
27	NC_015917	TTTG	2	8	12110	12117	0 %	75 %	25 %	0 %	343127167
28	NC_015917	CATT	2	8	12146	12153	25 %	50 %	0 %	25 %	343127167
29	NC_015917	TTTC	2	8	12363	12370	0 %	75 %	0 %	25 %	343127168
30	NC_015917	ATTG	2	8	13086	13093	25 %	50 %	25 %	0 %	343127168
31	NC_015917	GTTG	2	8	13177	13184	0 %	50 %	50 %	0 %	343127168
32	NC_015917	GTTG	2	8	13244	13251	0 %	50 %	50 %	0 %	343127168
33	NC_015917	TAAA	2	8	13470	13477	75 %	25 %	0 %	0 %	343127168
34	NC_015917	AATC	2	8	14855	14862	50 %	25 %	0 %	25 %	343127169
35	NC_015917	ATTA	2	8	16619	16626	50 %	50 %	0 %	0 %	343127171
36	NC_015917	TTGT	2	8	16671	16678	0 %	75 %	25 %	0 %	343127171
37	NC_015917	CTTT	2	8	16857	16864	0 %	75 %	0 %	25 %	343127171
38	NC_015917	TAAA	2	8	16990	16997	75 %	25 %	0 %	0 %	343127171
39	NC_015917	ATTT	2	8	17615	17622	25 %	75 %	0 %	0 %	343127172
40	NC_015917	TTAA	2	8	18364	18371	50 %	50 %	0 %	0 %	343127174
41	NC_015917	TATT	2	8	18890	18897	25 %	75 %	0 %	0 %	343127174
42	NC_015917	ATTT	2	8	19086	19093	25 %	75 %	0 %	0 %	343127174
43	NC_015917	TTAC	2	8	20123	20130	25 %	50 %	0 %	25 %	343127175
44	NC_015917	TTGA	2	8	23056	23063	25 %	50 %	25 %	0 %	343127177
45	NC_015917	GCTT	2	8	23626	23633	0 %	50 %	25 %	25 %	343127177
46	NC_015917	GTAT	2	8	24252	24259	25 %	50 %	25 %	0 %	343127178
47	NC_015917	CTTT	2	8	24265	24272	0 %	75 %	0 %	25 %	343127178
48	NC_015917	AATT	2	8	25077	25084	50 %	50 %	0 %	0 %	343127179
49	NC_015917	ATTA	2	8	26397	26404	50 %	50 %	0 %	0 %	343127181
50	NC_015917	TAAT	2	8	26861	26868	50 %	50 %	0 %	0 %	343127182

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.