MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp17

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015915	ACA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127119
2	NC_015915	ATA	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127119
3	NC_015915	ATT	2	6	364	369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127119
4	NC_015915	ACA	3	9	370	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127119
5	NC_015915	TCA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
6	NC_015915	ATC	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
7	NC_015915	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127120
8	NC_015915	CAT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
9	NC_015915	CAT	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127120
10	NC_015915	TTA	2	6	4090	4095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127122
11	NC_015915	CAA	2	6	4102	4107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127122
12	NC_015915	TAT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127123
13	NC_015915	GAA	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127124
14	NC_015915	ATT	2	6	4701	4706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127124
15	NC_015915	AGA	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127124
16	NC_015915	TCT	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127124
17	NC_015915	ATG	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127124
18	NC_015915	TAA	2	6	4858	4863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127124
19	NC_015915	GTG	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127124
20	NC_015915	GGA	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127124
21	NC_015915	ATT	2	6	5531	5536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127125
22	NC_015915	CAC	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127125
23	NC_015915	CAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127125
24	NC_015915	CAA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127125
25	NC_015915	ATA	2	6	5856	5861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127125
26	NC_015915	GAT	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127125
27	NC_015915	AGA	2	6	6103	6108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127125
28	NC_015915	GAA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127125
29	NC_015915	TAC	2	6	6171	6176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127125
30	NC_015915	CTA	2	6	6329	6334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127125
31	NC_015915	TGT	2	6	7185	7190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127126
32	NC_015915	TAT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127126
33	NC_015915	AGA	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
34	NC_015915	AGA	3	9	7438	7446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
35	NC_015915	TGA	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
36	NC_015915	TGA	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
37	NC_015915	TAT	2	6	7601	7606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127126
38	NC_015915	AAT	2	6	7652	7657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
39	NC_015915	ATA	3	9	7674	7682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
40	NC_015915	AAT	2	6	7721	7726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127126
41	NC_015915	TGA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127126
42	NC_015915	AAG	2	6	7836	7841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
43	NC_015915	CTT	2	6	7956	7961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127126
44	NC_015915	GAA	2	6	7986	7991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
45	NC_015915	AAG	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127126
46	NC_015915	TAT	2	6	8770	8775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127127
47	NC_015915	TCC	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127127
48	NC_015915	AAC	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127127
49	NC_015915	CTT	2	6	8868	8873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127127
50	NC_015915	TAG	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127127
51	NC_015915	AAG	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127128
52	NC_015915	CTT	2	6	10379	10384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127130
53	NC_015915	ACA	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127130
54	NC_015915	AAT	2	6	10461	10466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127130
55	NC_015915	TCA	2	6	10687	10692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127131
56	NC_015915	GAT	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127132
57	NC_015915	ATA	2	6	11136	11141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127132
58	NC_015915	ATA	2	6	11146	11151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127132
59	NC_015915	TAT	2	6	11154	11159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127132
60	NC_015915	CTA	3	9	11172	11180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127132
61	NC_015915	TAA	2	6	11187	11192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127132
62	NC_015915	TTA	2	6	11204	11209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127132
63	NC_015915	ATA	2	6	11282	11287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127132
64	NC_015915	ATT	2	6	11709	11714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127133
65	NC_015915	AAG	2	6	11857	11862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127133
66	NC_015915	CTA	2	6	11869	11874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127133
67	NC_015915	AGA	2	6	11882	11887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127133
68	NC_015915	AGA	2	6	11984	11989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127133
69	NC_015915	TCA	3	9	12036	12044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127133
70	NC_015915	CTG	2	6	12061	12066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127133
71	NC_015915	TGA	2	6	12122	12127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127133
72	NC_015915	CCT	2	6	12235	12240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127133
73	NC_015915	TAT	2	6	12316	12321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127133
74	NC_015915	ACA	2	6	12330	12335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127133
75	NC_015915	ATG	2	6	12345	12350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127133
76	NC_015915	TTA	2	6	12360	12365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127133
77	NC_015915	AAG	2	6	12460	12465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127133
78	NC_015915	AGA	2	6	13520	13525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127134
79	NC_015915	TAA	2	6	13676	13681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127134
80	NC_015915	TCA	2	6	13704	13709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127134
81	NC_015915	TAC	2	6	13889	13894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127134
82	NC_015915	TAT	2	6	13917	13922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127134
83	NC_015915	GAA	2	6	13974	13979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127134
84	NC_015915	CCA	2	6	14232	14237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127135
85	NC_015915	TTA	2	6	14289	14294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127135
86	NC_015915	CAT	2	6	14308	14313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127135
87	NC_015915	TAT	2	6	14344	14349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127135
88	NC_015915	CAA	2	6	14362	14367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127135
89	NC_015915	AAT	2	6	14390	14395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127135
90	NC_015915	TGT	2	6	14438	14443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127135
91	NC_015915	TAA	2	6	14481	14486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127135
92	NC_015915	ACA	2	6	14487	14492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127135
93	NC_015915	AAT	2	6	14674	14679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127135
94	NC_015915	ATA	2	6	14772	14777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127135
95	NC_015915	ATT	2	6	15052	15057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127136
96	NC_015915	ATT	2	6	15190	15195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127136
97	NC_015915	GAA	2	6	15283	15288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127136
98	NC_015915	ATG	2	6	15310	15315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127136
99	NC_015915	TAT	2	6	15435	15440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127136
100	NC_015915	TAA	2	6	15447	15452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127136
101	NC_015915	AAC	2	6	15478	15483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127136
102	NC_015915	TAC	2	6	15497	15502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127136
103	NC_015915	TAA	2	6	15573	15578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127136
104	NC_015915	ACA	2	6	15622	15627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127136
105	NC_015915	TTA	2	6	15637	15642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127136
106	NC_015915	GAA	2	6	15664	15669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127136
107	NC_015915	CAA	3	9	15705	15713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127136
108	NC_015915	TTA	2	6	15901	15906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127136
109	NC_015915	ATT	2	6	15975	15980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127136
110	NC_015915	AGA	2	6	16190	16195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127137
111	NC_015915	AGA	2	6	16289	16294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127137
112	NC_015915	AGA	2	6	16323	16328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127137
113	NC_015915	ATA	2	6	16619	16624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127138
114	NC_015915	TAA	2	6	16654	16659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127138
115	NC_015915	AGA	2	6	16672	16677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127138
116	NC_015915	CAA	2	6	16834	16839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127138
117	NC_015915	TAA	2	6	16879	16884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127138
118	NC_015915	TAA	2	6	16962	16967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127138
119	NC_015915	ATT	2	6	17054	17059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127138
120	NC_015915	GAA	2	6	17075	17080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127138
121	NC_015915	TAC	2	6	17140	17145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127138
122	NC_015915	TAA	2	6	17316	17321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127138
123	NC_015915	CAA	2	6	17371	17376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127138
124	NC_015915	AGA	2	6	17434	17439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127138
125	NC_015915	GAT	2	6	17509	17514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127138
126	NC_015915	TAA	2	6	17644	17649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127138
127	NC_015915	AAC	3	9	17678	17686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127138
128	NC_015915	ATC	2	6	17699	17704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127138
129	NC_015915	AGA	2	6	17960	17965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127139
130	NC_015915	ATT	2	6	18056	18061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127139
131	NC_015915	TCA	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127139
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135	NC_015915	TTA	2	6	19306	19311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127140
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.