MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp9

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015911	TAG	2	6	215	220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127106
2	NC_015911	ATA	2	6	587	592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127106
3	NC_015911	ATA	3	9	596	604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127106
4	NC_015911	GAA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127106
5	NC_015911	ATA	2	6	646	651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127106
6	NC_015911	TAA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127106
7	NC_015911	TAT	2	6	948	953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127106
8	NC_015911	AAC	2	6	1082	1087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127106
9	NC_015911	TAT	2	6	1122	1127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127106
10	NC_015911	ATT	2	6	1184	1189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127106
11	NC_015911	ATT	2	6	1194	1199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127106
12	NC_015911	ATA	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127107
13	NC_015911	CAT	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127107
14	NC_015911	AGT	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127107
15	NC_015911	TAA	2	6	1679	1684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127107
16	NC_015911	TAA	2	6	1710	1715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127107
17	NC_015911	TTG	2	6	1721	1726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127107
18	NC_015911	ATT	2	6	1795	1800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127107
19	NC_015911	ATA	2	6	1824	1829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127107
20	NC_015911	GTG	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127108
21	NC_015911	ATT	2	6	1889	1894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127108
22	NC_015911	CTA	3	9	1942	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127108
23	NC_015911	TAA	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127108
24	NC_015911	GAA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127108
25	NC_015911	ATT	2	6	2026	2031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127108
26	NC_015911	TAA	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127108
27	NC_015911	ATC	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127108
28	NC_015911	TAA	2	6	2057	2062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127108
29	NC_015911	TTA	2	6	2233	2238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127108
30	NC_015911	CAG	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127108
31	NC_015911	ACT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127108
32	NC_015911	CAA	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127108
33	NC_015911	TAT	2	6	2423	2428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127108
34	NC_015911	AGA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127108
35	NC_015911	ATG	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127108
36	NC_015911	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127108
37	NC_015911	AAT	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127109
38	NC_015911	AGA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127109
39	NC_015911	ATA	2	6	2695	2700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127109
40	NC_015911	ATA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127109
41	NC_015911	ACA	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127109
42	NC_015911	ATA	2	6	2812	2817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127109
43	NC_015911	GAG	2	6	2937	2942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127109
44	NC_015911	TTA	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127109
45	NC_015911	GAA	2	6	3117	3122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127109
46	NC_015911	CTT	2	6	3123	3128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127109
47	NC_015911	GAA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127109
48	NC_015911	TAG	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127110
49	NC_015911	TGT	2	6	3768	3773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127110
50	NC_015911	TTG	2	6	3896	3901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127110
51	NC_015911	TAT	2	6	4105	4110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127110
52	NC_015911	GAA	3	9	4165	4173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127110
53	NC_015911	TTA	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127110
54	NC_015911	TGA	2	6	4242	4247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127110
55	NC_015911	ATA	2	6	4355	4360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127110
56	NC_015911	ACG	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127110
57	NC_015911	ATA	2	6	4443	4448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127110
58	NC_015911	AAT	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127111
59	NC_015911	TTC	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127111
60	NC_015911	TAA	4	12	5097	5108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127111
61	NC_015911	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127112
62	NC_015911	TAA	2	6	5328	5333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127112
63	NC_015911	TCT	3	9	5422	5430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127112
64	NC_015911	TTA	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127112
65	NC_015911	GTA	2	6	7080	7085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127114
66	NC_015911	TCT	2	6	7134	7139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127114
67	NC_015911	TAT	2	6	7151	7156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127114
68	NC_015911	CTA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127114
69	NC_015911	ATC	2	6	7283	7288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127114
70	NC_015911	ATT	2	6	7289	7294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127114
71	NC_015911	TTC	2	6	7394	7399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127114
72	NC_015911	TCT	2	6	7431	7436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127114
73	NC_015911	TAA	2	6	7439	7444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127114
74	NC_015911	ATA	2	6	7512	7517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127114
75	NC_015911	AAT	2	6	7581	7586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127114
76	NC_015911	TGA	2	6	7809	7814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127115
77	NC_015911	AGT	2	6	7857	7862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127115
78	NC_015911	AGT	2	6	7878	7883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127115
79	NC_015911	TAA	2	6	8060	8065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127115
80	NC_015911	ACA	2	6	8147	8152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127115
81	NC_015911	TAC	2	6	8181	8186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127115
82	NC_015911	GTA	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127115
83	NC_015911	ATT	2	6	8249	8254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127115
84	NC_015911	ATA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127115
85	NC_015911	TTC	2	6	8484	8489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127115
86	NC_015911	ATA	2	6	8504	8509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127115
87	NC_015911	AGC	2	6	8560	8565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127115
88	NC_015911	TGT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127116
89	NC_015911	TCT	2	6	8644	8649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127116
90	NC_015911	ATT	2	6	8829	8834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127117
91	NC_015911	CTA	2	6	9086	9091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127117
92	NC_015911	ATT	2	6	9120	9125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127117
93	NC_015911	TAA	2	6	9141	9146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127117
94	NC_015911	TTA	2	6	9205	9210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127117
95	NC_015911	TTA	2	6	9271	9276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127117
96	NC_015911	TAT	2	6	9386	9391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127117
97	NC_015911	TCA	2	6	9394	9399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127117
98	NC_015911	ACT	2	6	9405	9410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127117
99	NC_015911	TAT	2	6	9461	9466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127117
100	NC_015911	TAA	2	6	9467	9472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127117
101	NC_015911	TTG	2	6	9485	9490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127117
102	NC_015911	AAT	2	6	9527	9532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127117
103	NC_015911	TAA	2	6	9599	9604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127117
104	NC_015911	TCA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127117
105	NC_015911	CAC	2	6	9725	9730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127117
106	NC_015911	ATC	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127117
107	NC_015911	TTG	2	6	9936	9941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127117
108	NC_015911	ATT	2	6	9969	9974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127117

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.