MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-5

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015909	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127017
2	NC_015909	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127017
3	NC_015909	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127017
4	NC_015909	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127017
5	NC_015909	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127017
6	NC_015909	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127017
7	NC_015909	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127017
8	NC_015909	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127017
9	NC_015909	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127017
10	NC_015909	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127017
11	NC_015909	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127017
12	NC_015909	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127017
13	NC_015909	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127017
14	NC_015909	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127017
15	NC_015909	AGT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127017
16	NC_015909	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127017
17	NC_015909	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127017
18	NC_015909	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127017
19	NC_015909	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127018
20	NC_015909	AGC	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127018
21	NC_015909	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127018
22	NC_015909	TTG	2	6	1841	1846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127018
23	NC_015909	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127018
24	NC_015909	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127019
25	NC_015909	GCT	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127019
26	NC_015909	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127019
27	NC_015909	CTA	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127019
28	NC_015909	GAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127019
29	NC_015909	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127019
30	NC_015909	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127019
31	NC_015909	GAT	2	6	2283	2288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127019
32	NC_015909	AGA	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127019
33	NC_015909	TAA	2	6	2565	2570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127019
34	NC_015909	GCT	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127020
35	NC_015909	TGA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127020
36	NC_015909	AGA	2	6	2888	2893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127020
37	NC_015909	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127020
38	NC_015909	TGG	3	9	3149	3157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127020
39	NC_015909	ACC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127020
40	NC_015909	ACA	2	6	3380	3385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127021
41	NC_015909	TGG	3	9	3647	3655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127022
42	NC_015909	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127022
43	NC_015909	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127022
44	NC_015909	TAG	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127022
45	NC_015909	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127022
46	NC_015909	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127022
47	NC_015909	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127023
48	NC_015909	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127023
49	NC_015909	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127023
50	NC_015909	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127023
51	NC_015909	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127023
52	NC_015909	GGT	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127023
53	NC_015909	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127023
54	NC_015909	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127023
55	NC_015909	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127023
56	NC_015909	ATT	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127023
57	NC_015909	ACT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127023
58	NC_015909	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127023
59	NC_015909	GTG	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127023
60	NC_015909	ATG	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127023
61	NC_015909	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127023
62	NC_015909	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127023
63	NC_015909	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127023
64	NC_015909	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127023
65	NC_015909	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127023
66	NC_015909	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127024
67	NC_015909	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127024
68	NC_015909	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127024
69	NC_015909	GGT	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127024
70	NC_015909	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127025
71	NC_015909	CTC	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127025
72	NC_015909	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127025
73	NC_015909	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127026
74	NC_015909	AGC	2	6	5852	5857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127026
75	NC_015909	TAG	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127026
76	NC_015909	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127026
77	NC_015909	TAT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127026
78	NC_015909	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127026
79	NC_015909	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127026
80	NC_015909	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127027
81	NC_015909	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127027
82	NC_015909	ATA	2	6	6304	6309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127027
83	NC_015909	TTA	2	6	6602	6607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127027
84	NC_015909	AGG	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127027
85	NC_015909	ATT	2	6	6765	6770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127028
86	NC_015909	TAA	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127028
87	NC_015909	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127028
88	NC_015909	TAA	2	6	6853	6858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127028
89	NC_015909	GAA	2	6	6971	6976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127028
90	NC_015909	TGT	2	6	7060	7065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127028
91	NC_015909	GAT	2	6	7085	7090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127028
92	NC_015909	GAT	2	6	7094	7099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127028
93	NC_015909	TAA	2	6	7126	7131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127028
94	NC_015909	AAT	2	6	7244	7249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127028
95	NC_015909	GCT	2	6	7337	7342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127028
96	NC_015909	TTG	2	6	7350	7355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127028
97	NC_015909	CTT	2	6	7406	7411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127028
98	NC_015909	AAG	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127028
99	NC_015909	ATT	2	6	7517	7522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127028
100	NC_015909	TAC	2	6	7771	7776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127028
101	NC_015909	TGG	2	6	7868	7873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127029
102	NC_015909	CAA	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127029
103	NC_015909	TAG	2	6	7934	7939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127029
104	NC_015909	TAA	2	6	7960	7965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127029
105	NC_015909	TGA	2	6	8054	8059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127029
106	NC_015909	ATT	2	6	8136	8141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127029
107	NC_015909	GAA	2	6	8163	8168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127029
108	NC_015909	AAG	2	6	8174	8179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127029
109	NC_015909	TTA	2	6	8269	8274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127030
110	NC_015909	TAT	2	6	8505	8510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127030
111	NC_015909	TTG	2	6	8521	8526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127030
112	NC_015909	AAT	2	6	8528	8533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127030
113	NC_015909	AAT	2	6	8613	8618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127030
114	NC_015909	TCA	2	6	8688	8693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127030
115	NC_015909	ATT	2	6	8826	8831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127031
116	NC_015909	ATG	2	6	8883	8888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127031
117	NC_015909	TGC	2	6	9014	9019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127032
118	NC_015909	AGC	2	6	9347	9352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127032
119	NC_015909	TTG	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127032
120	NC_015909	GAA	3	9	9567	9575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127032
121	NC_015909	AGA	2	6	9629	9634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127032
122	NC_015909	GCA	2	6	9768	9773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127032
123	NC_015909	TGA	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127032
124	NC_015909	CTG	2	6	10033	10038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127032
125	NC_015909	ATA	2	6	10108	10113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127032
126	NC_015909	AAG	2	6	10114	10119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127032
127	NC_015909	TAT	2	6	10154	10159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127032
128	NC_015909	AAT	2	6	10312	10317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127033
129	NC_015909	AAC	2	6	10371	10376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127033
130	NC_015909	GTT	2	6	10514	10519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127033
131	NC_015909	ATT	2	6	10538	10543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127033
132	NC_015909	AAT	2	6	10578	10583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127033
133	NC_015909	AAC	2	6	10709	10714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127033
134	NC_015909	TGA	2	6	10824	10829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127033
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136	NC_015909	GAA	2	6	10981	10986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127034
137	NC_015909	TCA	2	6	11053	11058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127034
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146	NC_015909	TAA	2	6	11845	11850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127034
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152	NC_015909	AAT	2	6	12463	12468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127036
153	NC_015909	TAA	2	6	12483	12488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127036
154	NC_015909	TTG	2	6	12500	12505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127036
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158	NC_015909	TAA	2	6	12686	12691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127036
159	NC_015909	CTA	2	6	12698	12703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127036
160	NC_015909	ACA	2	6	12713	12718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127036
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162	NC_015909	ACA	2	6	12901	12906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127037
163	NC_015909	TCT	2	6	12915	12920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127037
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252	NC_015909	TAA	2	6	19952	19957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127048
253	NC_015909	AGA	2	6	19983	19988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127048
254	NC_015909	ATG	2	6	20147	20152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127049
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256	NC_015909	AAG	2	6	20262	20267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127049
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.