MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-3

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015908	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126974
2	NC_015908	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126974
3	NC_015908	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126974
4	NC_015908	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126974
5	NC_015908	TTA	2	6	499	504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126974
6	NC_015908	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126974
7	NC_015908	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126974
8	NC_015908	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126974
9	NC_015908	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126974
10	NC_015908	ATA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126974
11	NC_015908	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126974
12	NC_015908	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126974
13	NC_015908	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126974
14	NC_015908	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126974
15	NC_015908	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126974
16	NC_015908	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126974
17	NC_015908	AGT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126974
18	NC_015908	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126974
19	NC_015908	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126974
20	NC_015908	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126974
21	NC_015908	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126975
22	NC_015908	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126975
23	NC_015908	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126975
24	NC_015908	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126975
25	NC_015908	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126975
26	NC_015908	TTG	2	6	1841	1846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126975
27	NC_015908	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126975
28	NC_015908	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126976
29	NC_015908	GCT	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126976
30	NC_015908	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126976
31	NC_015908	CTA	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126976
32	NC_015908	GAG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126976
33	NC_015908	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126976
34	NC_015908	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126976
35	NC_015908	GAT	2	6	2283	2288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126976
36	NC_015908	AGA	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126976
37	NC_015908	GAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126977
38	NC_015908	AGA	2	6	2889	2894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126977
39	NC_015908	TAA	3	9	3123	3131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126977
40	NC_015908	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126977
41	NC_015908	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343126977
42	NC_015908	TAG	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126978
43	NC_015908	ATC	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126978
44	NC_015908	TGG	3	9	3650	3658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126978
45	NC_015908	CTA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126978
46	NC_015908	AAT	2	6	3729	3734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126978
47	NC_015908	TAG	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126978
48	NC_015908	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126978
49	NC_015908	TAA	2	6	3942	3947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126978
50	NC_015908	ATT	2	6	3971	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126979
51	NC_015908	TGA	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126979
52	NC_015908	ATT	2	6	3985	3990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126979
53	NC_015908	TAT	2	6	4034	4039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126979
54	NC_015908	ACA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126979
55	NC_015908	GGT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126979
56	NC_015908	ATT	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126979
57	NC_015908	TAA	3	9	4289	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126979
58	NC_015908	AGT	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126979
59	NC_015908	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126979
60	NC_015908	ACT	2	6	4436	4441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126979
61	NC_015908	AGA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126979
62	NC_015908	GTG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126979
63	NC_015908	ATG	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126979
64	NC_015908	GCA	3	9	4617	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126979
65	NC_015908	TAA	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126979
66	NC_015908	AGA	2	6	4697	4702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126979
67	NC_015908	TTA	2	6	4768	4773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126979
68	NC_015908	CTA	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126979
69	NC_015908	GAA	3	9	4984	4992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126980
70	NC_015908	GTT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126980
71	NC_015908	ATT	2	6	5258	5263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126980
72	NC_015908	AGT	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126980
73	NC_015908	GAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126980
74	NC_015908	GGT	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126980
75	NC_015908	TGT	2	6	5492	5497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126981
76	NC_015908	CTC	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343126981
77	NC_015908	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126981
78	NC_015908	TGG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126982
79	NC_015908	AGC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126982
80	NC_015908	TAA	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126982
81	NC_015908	TAT	2	6	6018	6023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126982
82	NC_015908	TTG	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126982
83	NC_015908	AAT	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126983
84	NC_015908	GCT	2	6	6292	6297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126983
85	NC_015908	ATA	2	6	6307	6312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126983
86	NC_015908	TTA	2	6	6605	6610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126983
87	NC_015908	AGG	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343126983
88	NC_015908	ATT	2	6	6768	6773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126984
89	NC_015908	TAA	2	6	6814	6819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126984
90	NC_015908	GCC	2	6	6824	6829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343126984
91	NC_015908	TAA	2	6	6856	6861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126984
92	NC_015908	GAA	2	6	6974	6979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126984
93	NC_015908	TGT	2	6	7063	7068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126984
94	NC_015908	GAT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126984
95	NC_015908	TAA	2	6	7129	7134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126984
96	NC_015908	AAT	2	6	7247	7252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126984
97	NC_015908	GCT	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126984
98	NC_015908	TTG	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126984
99	NC_015908	CTT	2	6	7409	7414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343126984
100	NC_015908	AAG	2	6	7449	7454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126984
101	NC_015908	ATT	2	6	7520	7525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126984
102	NC_015908	ATA	2	6	7551	7556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126984
103	NC_015908	TAA	2	6	7659	7664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126984
104	NC_015908	TAC	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126984
105	NC_015908	TTG	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126984
106	NC_015908	TGG	2	6	7872	7877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126985
107	NC_015908	CAA	2	6	7922	7927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126985
108	NC_015908	TAA	2	6	7964	7969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126985
109	NC_015908	TGA	2	6	8058	8063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126985
110	NC_015908	ACA	2	6	8072	8077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126985
111	NC_015908	CTA	2	6	8132	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126985
112	NC_015908	ATT	2	6	8140	8145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126985
113	NC_015908	AAG	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126985
114	NC_015908	CTG	2	6	8189	8194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126985
115	NC_015908	ACA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126985
116	NC_015908	TTA	2	6	8506	8511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126986
117	NC_015908	TTG	2	6	8523	8528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126986
118	NC_015908	AAT	2	6	8530	8535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126986
119	NC_015908	AAT	2	6	8615	8620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343126986
120	NC_015908	TCA	2	6	8690	8695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343126986
121	NC_015908	ATT	2	6	8828	8833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343126987
122	NC_015908	TGC	2	6	9016	9021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343126988
123	NC_015908	AGC	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126988
124	NC_015908	TTG	2	6	9372	9377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126988
125	NC_015908	TGG	2	6	9436	9441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343126988
126	NC_015908	AGA	2	6	9499	9504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126988
127	NC_015908	AAC	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126988
128	NC_015908	AAG	2	6	9606	9611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126988
129	NC_015908	AAG	2	6	9672	9677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343126988
130	NC_015908	CAA	2	6	9696	9701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343126988
131	NC_015908	AGC	2	6	9706	9711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343126988
132	NC_015908	TTG	2	6	9732	9737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126988
133	NC_015908	GTT	2	6	9761	9766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343126988
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153	NC_015908	TAG	2	6	11341	11346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343126990
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.