MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-6

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015905	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	343126802
2	NC_015905	ACAA	2	8	768	775	75 %	0 %	0 %	25 %	343126802
3	NC_015905	AGAA	2	8	1313	1320	75 %	0 %	25 %	0 %	343126803
4	NC_015905	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	343126803
5	NC_015905	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	343126803
6	NC_015905	AAAG	2	8	2378	2385	75 %	0 %	25 %	0 %	343126804
7	NC_015905	TTTA	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	343126804
8	NC_015905	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	343126805
9	NC_015905	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	343126805
10	NC_015905	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	343126805
11	NC_015905	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	343126805
12	NC_015905	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	343126805
13	NC_015905	TAAA	2	8	3365	3372	75 %	25 %	0 %	0 %	343126806
14	NC_015905	ATCA	2	8	4351	4358	50 %	25 %	0 %	25 %	343126808
15	NC_015905	CTAC	2	8	4795	4802	25 %	25 %	0 %	50 %	343126808
16	NC_015905	TCAT	2	8	4842	4849	25 %	50 %	0 %	25 %	343126808
17	NC_015905	TAAG	2	8	5052	5059	50 %	25 %	25 %	0 %	343126809
18	NC_015905	TACT	2	8	5151	5158	25 %	50 %	0 %	25 %	343126809
19	NC_015905	AATG	2	8	5397	5404	50 %	25 %	25 %	0 %	343126809
20	NC_015905	AGCA	2	8	6063	6070	50 %	0 %	25 %	25 %	343126811
21	NC_015905	AGTC	2	8	6527	6534	25 %	25 %	25 %	25 %	343126812
22	NC_015905	AGAA	2	8	7220	7227	75 %	0 %	25 %	0 %	343126813
23	NC_015905	CAAG	2	8	7293	7300	50 %	0 %	25 %	25 %	343126813
24	NC_015905	CCCA	2	8	8240	8247	25 %	0 %	0 %	75 %	343126814
25	NC_015905	ATTT	2	8	8496	8503	25 %	75 %	0 %	0 %	343126815
26	NC_015905	TGAG	2	8	8600	8607	25 %	25 %	50 %	0 %	343126815
27	NC_015905	CTTG	2	8	8798	8805	0 %	50 %	25 %	25 %	343126816
28	NC_015905	GAAA	2	8	9599	9606	75 %	0 %	25 %	0 %	343126817
29	NC_015905	TTGA	2	8	10251	10258	25 %	50 %	25 %	0 %	343126817
30	NC_015905	GGCA	2	8	11203	11210	25 %	0 %	50 %	25 %	343126819
31	NC_015905	TATT	2	8	11538	11545	25 %	75 %	0 %	0 %	343126819
32	NC_015905	ACAA	2	8	11550	11557	75 %	0 %	0 %	25 %	343126819
33	NC_015905	TCAA	2	8	12110	12117	50 %	25 %	0 %	25 %	343126820
34	NC_015905	CAGT	2	8	12355	12362	25 %	25 %	25 %	25 %	343126820
35	NC_015905	AATT	2	8	12383	12390	50 %	50 %	0 %	0 %	343126820
36	NC_015905	TAAT	2	8	12944	12951	50 %	50 %	0 %	0 %	343126822
37	NC_015905	CAAA	2	8	13567	13574	75 %	0 %	0 %	25 %	343126822
38	NC_015905	AGAT	2	8	13623	13630	50 %	25 %	25 %	0 %	343126822
39	NC_015905	AACA	2	8	13652	13659	75 %	0 %	0 %	25 %	343126822
40	NC_015905	ATTG	2	8	14714	14721	25 %	50 %	25 %	0 %	343126823
41	NC_015905	TCAA	2	8	15666	15673	50 %	25 %	0 %	25 %	343126825
42	NC_015905	CTAT	2	8	15684	15691	25 %	50 %	0 %	25 %	343126825
43	NC_015905	TAAC	2	8	15754	15761	50 %	25 %	0 %	25 %	343126826
44	NC_015905	AAAC	2	8	16330	16337	75 %	0 %	0 %	25 %	343126827
45	NC_015905	AGAT	2	8	16792	16799	50 %	25 %	25 %	0 %	343126828
46	NC_015905	AAAC	2	8	17514	17521	75 %	0 %	0 %	25 %	343126829
47	NC_015905	CAAC	2	8	19268	19275	50 %	0 %	0 %	50 %	343126831
48	NC_015905	GAAA	2	8	19683	19690	75 %	0 %	25 %	0 %	343126831
49	NC_015905	AGAA	2	8	19727	19734	75 %	0 %	25 %	0 %	343126831
50	NC_015905	AAAT	2	8	19769	19776	75 %	25 %	0 %	0 %	343126831
51	NC_015905	GAAA	2	8	19882	19889	75 %	0 %	25 %	0 %	343126831
52	NC_015905	TTTA	2	8	20335	20342	25 %	75 %	0 %	0 %	343126832
53	NC_015905	AAAT	2	8	20457	20464	75 %	25 %	0 %	0 %	343126832
54	NC_015905	TTTA	2	8	20602	20609	25 %	75 %	0 %	0 %	343126832
55	NC_015905	TCAA	2	8	20722	20729	50 %	25 %	0 %	25 %	343126833
56	NC_015905	AAAG	2	8	21869	21876	75 %	0 %	25 %	0 %	343126834
57	NC_015905	AGAT	2	8	22257	22264	50 %	25 %	25 %	0 %	343126835
58	NC_015905	AGAT	2	8	22290	22297	50 %	25 %	25 %	0 %	343126835
59	NC_015905	ATAG	2	8	22325	22332	50 %	25 %	25 %	0 %	343126835
60	NC_015905	ATAG	2	8	22358	22365	50 %	25 %	25 %	0 %	343126835
61	NC_015905	ATAG	2	8	22391	22398	50 %	25 %	25 %	0 %	343126835
62	NC_015905	AGAT	2	8	22464	22471	50 %	25 %	25 %	0 %	343126835
63	NC_015905	ATAG	2	8	22520	22527	50 %	25 %	25 %	0 %	343126835
64	NC_015905	GATA	2	8	23389	23396	50 %	25 %	25 %	0 %	343126836
65	NC_015905	AGAA	2	8	24202	24209	75 %	0 %	25 %	0 %	343126837
66	NC_015905	AGAT	2	8	24374	24381	50 %	25 %	25 %	0 %	343126837
67	NC_015905	TTTA	2	8	24611	24618	25 %	75 %	0 %	0 %	343126838
68	NC_015905	TAAA	2	8	25111	25118	75 %	25 %	0 %	0 %	343126839
69	NC_015905	AACC	2	8	25479	25486	50 %	0 %	0 %	50 %	343126839
70	NC_015905	AGAA	2	8	26287	26294	75 %	0 %	25 %	0 %	343126841
71	NC_015905	TATT	2	8	26932	26939	25 %	75 %	0 %	0 %	343126841
72	NC_015905	GCAT	2	8	28502	28509	25 %	25 %	25 %	25 %	343126842
73	NC_015905	TAAA	2	8	28547	28554	75 %	25 %	0 %	0 %	343126842
74	NC_015905	CAAG	2	8	28572	28579	50 %	0 %	25 %	25 %	343126842
75	NC_015905	CAAA	2	8	28752	28759	75 %	0 %	0 %	25 %	343126843
76	NC_015905	AAAT	2	8	28790	28797	75 %	25 %	0 %	0 %	343126843
77	NC_015905	AATT	2	8	28841	28848	50 %	50 %	0 %	0 %	343126843
78	NC_015905	TAGC	2	8	28948	28955	25 %	25 %	25 %	25 %	343126843
79	NC_015905	TGAT	2	8	29155	29162	25 %	50 %	25 %	0 %	343126843
80	NC_015905	AAAC	2	8	29268	29275	75 %	0 %	0 %	25 %	343126843
81	NC_015905	AGCA	2	8	29516	29523	50 %	0 %	25 %	25 %	343126843
82	NC_015905	AAAT	2	8	29542	29549	75 %	25 %	0 %	0 %	343126843
83	NC_015905	TACA	2	8	29746	29753	50 %	25 %	0 %	25 %	343126843
84	NC_015905	TTAC	2	8	29908	29915	25 %	50 %	0 %	25 %	343126843

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.