MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-11

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015903	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	343126713
2	NC_015903	AATTA	2	10	2566	2575	60 %	40 %	0 %	0 %	343126714
3	NC_015903	AAGAG	2	10	3406	3415	60 %	0 %	40 %	0 %	343126716
4	NC_015903	GCAAA	2	10	3870	3879	60 %	0 %	20 %	20 %	343126716
5	NC_015903	TTTTG	2	10	4859	4868	0 %	80 %	20 %	0 %	343126717
6	NC_015903	GAAAA	2	10	6921	6930	80 %	0 %	20 %	0 %	343126722
7	NC_015903	AACTT	2	10	13067	13076	40 %	40 %	0 %	20 %	343126730
8	NC_015903	AAAGT	2	10	13725	13734	60 %	20 %	20 %	0 %	343126731
9	NC_015903	AGAAA	2	10	14491	14500	80 %	0 %	20 %	0 %	343126732
10	NC_015903	ATCCC	2	10	15453	15462	20 %	20 %	0 %	60 %	343126733
11	NC_015903	ATTAA	2	10	15568	15577	60 %	40 %	0 %	0 %	343126734
12	NC_015903	AGTAA	2	10	16205	16214	60 %	20 %	20 %	0 %	343126736
13	NC_015903	TTGTT	2	10	16459	16468	0 %	80 %	20 %	0 %	343126737
14	NC_015903	TATGT	2	10	16569	16578	20 %	60 %	20 %	0 %	343126737
15	NC_015903	TGCTA	2	10	18045	18054	20 %	40 %	20 %	20 %	343126740
16	NC_015903	ATTAT	2	10	21517	21526	40 %	60 %	0 %	0 %	343126744
17	NC_015903	CAAAA	2	10	22268	22277	80 %	0 %	0 %	20 %	343126745
18	NC_015903	ATATA	2	10	22473	22482	60 %	40 %	0 %	0 %	343126746
19	NC_015903	GAGTT	2	10	24384	24393	20 %	40 %	40 %	0 %	343126747
20	NC_015903	AATAA	2	10	24827	24836	80 %	20 %	0 %	0 %	343126748
21	NC_015903	ATTTT	2	10	25928	25937	20 %	80 %	0 %	0 %	343126749
22	NC_015903	GAAAA	2	10	26828	26837	80 %	0 %	20 %	0 %	343126751
23	NC_015903	TAAAT	2	10	27278	27287	60 %	40 %	0 %	0 %	343126752
24	NC_015903	TTACA	2	10	30126	30135	40 %	40 %	0 %	20 %	343126757

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.