MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_3p

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015378	GACG	2	8	609	616	25 %	0 %	50 %	25 %	330818809
2	NC_015378	AACA	2	8	748	755	75 %	0 %	0 %	25 %	330818809
3	NC_015378	TCGC	2	8	853	860	0 %	25 %	25 %	50 %	330818809
4	NC_015378	TCGA	2	8	1967	1974	25 %	25 %	25 %	25 %	330818810
5	NC_015378	CAAG	2	8	2166	2173	50 %	0 %	25 %	25 %	330818810
6	NC_015378	CCGG	2	8	2204	2211	0 %	0 %	50 %	50 %	330818810
7	NC_015378	TCGC	2	8	2317	2324	0 %	25 %	25 %	50 %	330818810
8	NC_015378	ATGC	2	8	2630	2637	25 %	25 %	25 %	25 %	330818811
9	NC_015378	ATGG	2	8	2674	2681	25 %	25 %	50 %	0 %	330818811
10	NC_015378	TCCC	2	8	2721	2728	0 %	25 %	0 %	75 %	330818811
11	NC_015378	TGCG	2	8	2774	2781	0 %	25 %	50 %	25 %	330818811
12	NC_015378	ACGG	2	8	3552	3559	25 %	0 %	50 %	25 %	330818811
13	NC_015378	GAGC	2	8	3607	3614	25 %	0 %	50 %	25 %	330818811
14	NC_015378	TGGC	2	8	3745	3752	0 %	25 %	50 %	25 %	330818811
15	NC_015378	CGAT	2	8	3790	3797	25 %	25 %	25 %	25 %	330818811
16	NC_015378	CTGG	2	8	4722	4729	0 %	25 %	50 %	25 %	330818812
17	NC_015378	GCTG	2	8	4784	4791	0 %	25 %	50 %	25 %	330818812
18	NC_015378	GGCC	2	8	4858	4865	0 %	0 %	50 %	50 %	330818812
19	NC_015378	GATC	2	8	5011	5018	25 %	25 %	25 %	25 %	330818812
20	NC_015378	GGCC	2	8	5350	5357	0 %	0 %	50 %	50 %	330818813
21	NC_015378	GGAT	2	8	5913	5920	25 %	25 %	50 %	0 %	330818813
22	NC_015378	GAGC	2	8	6350	6357	25 %	0 %	50 %	25 %	330818814
23	NC_015378	GGAC	2	8	6568	6575	25 %	0 %	50 %	25 %	330818815
24	NC_015378	CGGG	2	8	6683	6690	0 %	0 %	75 %	25 %	330818815
25	NC_015378	TACG	2	8	6721	6728	25 %	25 %	25 %	25 %	330818815
26	NC_015378	GCAA	2	8	6938	6945	50 %	0 %	25 %	25 %	330818815
27	NC_015378	CAGC	2	8	6950	6957	25 %	0 %	25 %	50 %	330818815
28	NC_015378	GGCC	2	8	7856	7863	0 %	0 %	50 %	50 %	330818817
29	NC_015378	GTCG	2	8	8337	8344	0 %	25 %	50 %	25 %	330818817
30	NC_015378	CCAG	2	8	8579	8586	25 %	0 %	25 %	50 %	330818817
31	NC_015378	GTCG	2	8	8952	8959	0 %	25 %	50 %	25 %	330818818
32	NC_015378	AGGT	2	8	9002	9009	25 %	25 %	50 %	0 %	330818818
33	NC_015378	GAGC	2	8	9527	9534	25 %	0 %	50 %	25 %	330818819
34	NC_015378	TCGA	2	8	12617	12624	25 %	25 %	25 %	25 %	330818821
35	NC_015378	CCGC	2	8	13133	13140	0 %	0 %	25 %	75 %	330818822
36	NC_015378	GTGC	2	8	13190	13197	0 %	25 %	50 %	25 %	330818822
37	NC_015378	CGTC	2	8	13278	13285	0 %	25 %	25 %	50 %	330818822
38	NC_015378	CGTT	2	8	13401	13408	0 %	50 %	25 %	25 %	330818822
39	NC_015378	CACG	2	8	13826	13833	25 %	0 %	25 %	50 %	330818822
40	NC_015378	GGTC	2	8	13902	13909	0 %	25 %	50 %	25 %	330818822
41	NC_015378	GTTT	2	8	13985	13992	0 %	75 %	25 %	0 %	330818822
42	NC_015378	TTCG	2	8	14364	14371	0 %	50 %	25 %	25 %	330818823
43	NC_015378	CGAT	2	8	14672	14679	25 %	25 %	25 %	25 %	330818823
44	NC_015378	ACGG	2	8	14851	14858	25 %	0 %	50 %	25 %	330818823
45	NC_015378	CGTC	2	8	14867	14874	0 %	25 %	25 %	50 %	330818823
46	NC_015378	CGCC	2	8	15750	15757	0 %	0 %	25 %	75 %	330818824
47	NC_015378	CGGT	2	8	16107	16114	0 %	25 %	50 %	25 %	330818824
48	NC_015378	TCAA	2	8	17031	17038	50 %	25 %	0 %	25 %	330818824
49	NC_015378	TCGC	2	8	17655	17662	0 %	25 %	25 %	50 %	330818824
50	NC_015378	GTCG	2	8	17788	17795	0 %	25 %	50 %	25 %	330818824
51	NC_015378	TGCA	2	8	18246	18253	25 %	25 %	25 %	25 %	330818824
52	NC_015378	CGGC	2	8	18330	18337	0 %	0 %	50 %	50 %	330818824
53	NC_015378	TTCC	2	8	18395	18402	0 %	50 %	0 %	50 %	330818824
54	NC_015378	GACC	2	8	18523	18530	25 %	0 %	25 %	50 %	330818824
55	NC_015378	GCAA	2	8	19102	19109	50 %	0 %	25 %	25 %	330818824
56	NC_015378	CAAT	2	8	19149	19156	50 %	25 %	0 %	25 %	330818824
57	NC_015378	GTTT	2	8	19204	19211	0 %	75 %	25 %	0 %	330818824
58	NC_015378	CGAC	2	8	19212	19219	25 %	0 %	25 %	50 %	330818824
59	NC_015378	CGTC	2	8	19268	19275	0 %	25 %	25 %	50 %	330818824
60	NC_015378	CGGC	2	8	19548	19555	0 %	0 %	50 %	50 %	330818824
61	NC_015378	GTAC	2	8	19610	19617	25 %	25 %	25 %	25 %	330818824
62	NC_015378	CGAC	2	8	20700	20707	25 %	0 %	25 %	50 %	330818824
63	NC_015378	GCAC	2	8	21240	21247	25 %	0 %	25 %	50 %	330818825
64	NC_015378	AGCC	2	8	21643	21650	25 %	0 %	25 %	50 %	330818825
65	NC_015378	CGGC	2	8	22178	22185	0 %	0 %	50 %	50 %	330818825
66	NC_015378	CGCA	2	8	22546	22553	25 %	0 %	25 %	50 %	330818825
67	NC_015378	GACC	2	8	23162	23169	25 %	0 %	25 %	50 %	330818826
68	NC_015378	GATC	2	8	23327	23334	25 %	25 %	25 %	25 %	330818826
69	NC_015378	TCGG	2	8	23409	23416	0 %	25 %	50 %	25 %	330818826
70	NC_015378	AGCG	2	8	24191	24198	25 %	0 %	50 %	25 %	330818826
71	NC_015378	ACGT	2	8	24409	24416	25 %	25 %	25 %	25 %	330818826
72	NC_015378	GCAG	2	8	25134	25141	25 %	0 %	50 %	25 %	330818827
73	NC_015378	TCGG	2	8	25298	25305	0 %	25 %	50 %	25 %	330818827
74	NC_015378	TCGC	2	8	25400	25407	0 %	25 %	25 %	50 %	330818827
75	NC_015378	TCGA	2	8	25696	25703	25 %	25 %	25 %	25 %	330818827
76	NC_015378	ACGG	2	8	25817	25824	25 %	0 %	50 %	25 %	330818827
77	NC_015378	CCCG	2	8	27517	27524	0 %	0 %	25 %	75 %	330818828
78	NC_015378	TTGC	2	8	28855	28862	0 %	50 %	25 %	25 %	330818830
79	NC_015378	GTAG	2	8	29654	29661	25 %	25 %	50 %	0 %	330818831
80	NC_015378	CGAA	2	8	29991	29998	50 %	0 %	25 %	25 %	330818831
81	NC_015378	CGGT	2	8	30027	30034	0 %	25 %	50 %	25 %	330818831
82	NC_015378	TTCG	2	8	30073	30080	0 %	50 %	25 %	25 %	330818831
83	NC_015378	CATA	2	8	30947	30954	50 %	25 %	0 %	25 %	330818833
84	NC_015378	CCGG	2	8	31155	31162	0 %	0 %	50 %	50 %	330818833
85	NC_015378	GCGA	2	8	31292	31299	25 %	0 %	50 %	25 %	330818833
86	NC_015378	CGTC	2	8	31613	31620	0 %	25 %	25 %	50 %	330818834
87	NC_015378	CCTG	2	8	31813	31820	0 %	25 %	25 %	50 %	330818834
88	NC_015378	ATCA	2	8	32054	32061	50 %	25 %	0 %	25 %	330818834
89	NC_015378	ACGC	2	8	32172	32179	25 %	0 %	25 %	50 %	330818835
90	NC_015378	TGGG	2	8	32756	32763	0 %	25 %	75 %	0 %	330818836
91	NC_015378	CGCC	2	8	33966	33973	0 %	0 %	25 %	75 %	330818837
92	NC_015378	GTTG	2	8	34443	34450	0 %	50 %	50 %	0 %	330818837
93	NC_015378	GCCT	2	8	34523	34530	0 %	25 %	25 %	50 %	330818837
94	NC_015378	TGCG	2	8	36131	36138	0 %	25 %	50 %	25 %	330818839
95	NC_015378	TTCG	2	8	36276	36283	0 %	50 %	25 %	25 %	330818839
96	NC_015378	TCGC	2	8	36351	36358	0 %	25 %	25 %	50 %	330818839
97	NC_015378	CAGC	2	8	36616	36623	25 %	0 %	25 %	50 %	330818839
98	NC_015378	TTGC	2	8	36741	36748	0 %	50 %	25 %	25 %	330818839
99	NC_015378	CGCA	2	8	37668	37675	25 %	0 %	25 %	50 %	330818840
100	NC_015378	ATCG	2	8	37923	37930	25 %	25 %	25 %	25 %	330818840
101	NC_015378	GCAG	2	8	38052	38059	25 %	0 %	50 %	25 %	330818841
102	NC_015378	GATC	2	8	39618	39625	25 %	25 %	25 %	25 %	330818843
103	NC_015378	ATCG	2	8	39871	39878	25 %	25 %	25 %	25 %	330818843
104	NC_015378	CGGC	2	8	39995	40002	0 %	0 %	50 %	50 %	330818843
105	NC_015378	AGTC	2	8	40219	40226	25 %	25 %	25 %	25 %	330818843
106	NC_015378	GCTG	2	8	40820	40827	0 %	25 %	50 %	25 %	330818844
107	NC_015378	GCTC	2	8	41356	41363	0 %	25 %	25 %	50 %	330818845
108	NC_015378	GCCG	2	8	44209	44216	0 %	0 %	50 %	50 %	330818847
109	NC_015378	GCGG	2	8	44489	44496	0 %	0 %	75 %	25 %	330818847
110	NC_015378	CAGC	2	8	44982	44989	25 %	0 %	25 %	50 %	330818847
111	NC_015378	CGAC	2	8	45129	45136	25 %	0 %	25 %	50 %	330818847
112	NC_015378	ATCC	2	8	46338	46345	25 %	25 %	0 %	50 %	330818847
113	NC_015378	CGAA	2	8	47182	47189	50 %	0 %	25 %	25 %	330818848
114	NC_015378	CGGC	2	8	47467	47474	0 %	0 %	50 %	50 %	330818848
115	NC_015378	CGAA	2	8	47497	47504	50 %	0 %	25 %	25 %	330818848
116	NC_015378	CAAG	2	8	47633	47640	50 %	0 %	25 %	25 %	330818848
117	NC_015378	CGGT	2	8	47839	47846	0 %	25 %	50 %	25 %	330818848
118	NC_015378	CCTT	2	8	48977	48984	0 %	50 %	0 %	50 %	330818849
119	NC_015378	TCTT	2	8	51606	51613	0 %	75 %	0 %	25 %	330818850
120	NC_015378	GCAA	2	8	52396	52403	50 %	0 %	25 %	25 %	330818851
121	NC_015378	CGAC	2	8	52685	52692	25 %	0 %	25 %	50 %	330818852
122	NC_015378	CGGC	2	8	53006	53013	0 %	0 %	50 %	50 %	330818852
123	NC_015378	CGAG	2	8	53207	53214	25 %	0 %	50 %	25 %	330818852
124	NC_015378	GCAT	2	8	53605	53612	25 %	25 %	25 %	25 %	330818852
125	NC_015378	CAAG	2	8	55394	55401	50 %	0 %	25 %	25 %	330818853
126	NC_015378	TGAA	2	8	55465	55472	50 %	25 %	25 %	0 %	330818853
127	NC_015378	GCGA	2	8	55669	55676	25 %	0 %	50 %	25 %	330818854
128	NC_015378	TGGT	2	8	55838	55845	0 %	50 %	50 %	0 %	330818854
129	NC_015378	AGTG	2	8	61192	61199	25 %	25 %	50 %	0 %	330818855
130	NC_015378	ACGC	2	8	63349	63356	25 %	0 %	25 %	50 %	330818856
131	NC_015378	GTCG	2	8	63853	63860	0 %	25 %	50 %	25 %	330818856
132	NC_015378	CGGC	2	8	63913	63920	0 %	0 %	50 %	50 %	330818856
133	NC_015378	GCCG	2	8	63924	63931	0 %	0 %	50 %	50 %	330818856
134	NC_015378	GCGA	2	8	64037	64044	25 %	0 %	50 %	25 %	330818856
135	NC_015378	CCGG	2	8	64402	64409	0 %	0 %	50 %	50 %	330818856
136	NC_015378	CCGG	2	8	65489	65496	0 %	0 %	50 %	50 %	330818856
137	NC_015378	TCGG	2	8	65537	65544	0 %	25 %	50 %	25 %	330818856
138	NC_015378	CGGG	2	8	65815	65822	0 %	0 %	75 %	25 %	330818857
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.