MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_3p

Total Repeats: 1880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015378	TCT	2	6	28761	28766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818829
502	NC_015378	TGC	2	6	28774	28779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818829
503	NC_015378	GTC	2	6	28801	28806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818829
504	NC_015378	CGG	2	6	28844	28849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818830
505	NC_015378	TTGC	2	8	28855	28862	0 %	50 %	25 %	25 %	330818830
506	NC_015378	GCA	2	6	28873	28878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818830
507	NC_015378	GCT	2	6	28960	28965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818830
508	NC_015378	CGT	2	6	28977	28982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818830
509	NC_015378	ACG	2	6	29089	29094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818830
510	NC_015378	GC	4	8	29139	29146	0 %	0 %	50 %	50 %	330818830
511	NC_015378	TCG	2	6	29168	29173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818830
512	NC_015378	GTAG	2	8	29654	29661	25 %	25 %	50 %	0 %	330818831
513	NC_015378	TGT	2	6	29709	29714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818831
514	NC_015378	GGT	2	6	29805	29810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818831
515	NC_015378	CG	3	6	29818	29823	0 %	0 %	50 %	50 %	330818831
516	NC_015378	CTT	2	6	29890	29895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818831
517	NC_015378	GTC	2	6	29911	29916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818831
518	NC_015378	CAAATT	2	12	29935	29946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	330818831
519	NC_015378	GAT	2	6	29956	29961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818831
520	NC_015378	CGAA	2	8	29991	29998	50 %	0 %	25 %	25 %	330818831
521	NC_015378	CCA	2	6	30001	30006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818831
522	NC_015378	CGGT	2	8	30027	30034	0 %	25 %	50 %	25 %	330818831
523	NC_015378	GCA	2	6	30036	30041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818831
524	NC_015378	CCG	2	6	30042	30047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818831
525	NC_015378	TTCG	2	8	30073	30080	0 %	50 %	25 %	25 %	330818831
526	NC_015378	CG	3	6	30175	30180	0 %	0 %	50 %	50 %	330818831
527	NC_015378	GCC	2	6	30215	30220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818831
528	NC_015378	GCA	2	6	30264	30269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818831
529	NC_015378	GTC	2	6	30391	30396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818832
530	NC_015378	CGG	2	6	30421	30426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818832
531	NC_015378	CT	3	6	30495	30500	0 %	50 %	0 %	50 %	330818832
532	NC_015378	CGG	2	6	30509	30514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818832
533	NC_015378	TGT	2	6	30537	30542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818832
534	NC_015378	GATTT	2	10	30557	30566	20 %	60 %	20 %	0 %	330818832
535	NC_015378	GC	3	6	30595	30600	0 %	0 %	50 %	50 %	330818832
536	NC_015378	AGA	2	6	30638	30643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818832
537	NC_015378	TGG	2	6	30657	30662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818832
538	NC_015378	CAC	2	6	30861	30866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818833
539	NC_015378	ATG	2	6	30915	30920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818833
540	NC_015378	CATA	2	8	30947	30954	50 %	25 %	0 %	25 %	330818833
541	NC_015378	CCATG	2	10	31006	31015	20 %	20 %	20 %	40 %	330818833
542	NC_015378	CCA	2	6	31021	31026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818833
543	NC_015378	GCG	2	6	31047	31052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818833
544	NC_015378	CGC	2	6	31130	31135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818833
545	NC_015378	CCGG	2	8	31155	31162	0 %	0 %	50 %	50 %	330818833
546	NC_015378	GAA	2	6	31171	31176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818833
547	NC_015378	CAT	2	6	31264	31269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818833
548	NC_015378	CCA	2	6	31273	31278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818833
549	NC_015378	GCC	2	6	31280	31285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818833
550	NC_015378	GCGA	2	8	31292	31299	25 %	0 %	50 %	25 %	330818833
551	NC_015378	CGC	2	6	31303	31308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818833
552	NC_015378	TGG	2	6	31346	31351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818833
553	NC_015378	GAA	2	6	31363	31368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818833
554	NC_015378	TCG	2	6	31371	31376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818833
555	NC_015378	CGTC	2	8	31613	31620	0 %	25 %	25 %	50 %	330818834
556	NC_015378	TGC	3	9	31650	31658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818834
557	NC_015378	GGT	2	6	31684	31689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818834
558	NC_015378	GC	3	6	31704	31709	0 %	0 %	50 %	50 %	330818834
559	NC_015378	TGC	2	6	31791	31796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818834
560	NC_015378	CCTG	2	8	31813	31820	0 %	25 %	25 %	50 %	330818834
561	NC_015378	TCGCGA	2	12	31959	31970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330818834
562	NC_015378	TGC	2	6	31987	31992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818834
563	NC_015378	GCA	2	6	32014	32019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818834
564	NC_015378	GA	3	6	32025	32030	50 %	0 %	50 %	0 %	330818834
565	NC_015378	TGC	2	6	32031	32036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818834
566	NC_015378	ATCA	2	8	32054	32061	50 %	25 %	0 %	25 %	330818834
567	NC_015378	ACGC	2	8	32172	32179	25 %	0 %	25 %	50 %	330818835
568	NC_015378	GCGTTT	2	12	32245	32256	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330818835
569	NC_015378	GCT	2	6	32268	32273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818835
570	NC_015378	TGG	2	6	32308	32313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818835
571	NC_015378	TGG	2	6	32357	32362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818835
572	NC_015378	CCT	2	6	32378	32383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330818835
573	NC_015378	AAT	2	6	32531	32536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818835
574	NC_015378	AAC	2	6	32602	32607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818836
575	NC_015378	CAG	2	6	32681	32686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818836
576	NC_015378	CGA	2	6	32726	32731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818836
577	NC_015378	TGGG	2	8	32756	32763	0 %	25 %	75 %	0 %	330818836
578	NC_015378	GCT	2	6	32773	32778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818836
579	NC_015378	CTG	2	6	32781	32786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818836
580	NC_015378	CG	3	6	32810	32815	0 %	0 %	50 %	50 %	330818836
581	NC_015378	TGA	2	6	32887	32892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818836
582	NC_015378	CGC	2	6	32972	32977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818836
583	NC_015378	AGCAT	2	10	33890	33899	40 %	20 %	20 %	20 %	330818837
584	NC_015378	AC	3	6	33903	33908	50 %	0 %	0 %	50 %	330818837
585	NC_015378	CGCC	2	8	33966	33973	0 %	0 %	25 %	75 %	330818837
586	NC_015378	GGT	2	6	34262	34267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818837
587	NC_015378	GTTG	2	8	34443	34450	0 %	50 %	50 %	0 %	330818837
588	NC_015378	AAG	2	6	34451	34456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818837
589	NC_015378	GCCT	2	8	34523	34530	0 %	25 %	25 %	50 %	330818837
590	NC_015378	TGC	2	6	34634	34639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818837
591	NC_015378	CGC	2	6	35457	35462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818838
592	NC_015378	AGA	2	6	35482	35487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818838
593	NC_015378	GTC	2	6	35501	35506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818838
594	NC_015378	TG	3	6	35611	35616	0 %	50 %	50 %	0 %	330818838
595	NC_015378	CAC	2	6	35702	35707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818838
596	NC_015378	TCGTT	2	10	35839	35848	0 %	60 %	20 %	20 %	330818838
597	NC_015378	CGA	2	6	35883	35888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818839
598	NC_015378	GAC	2	6	35905	35910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818839
599	NC_015378	GGT	2	6	35993	35998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818839
600	NC_015378	CCG	2	6	36083	36088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818839
601	NC_015378	GCC	2	6	36096	36101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818839
602	NC_015378	TGCG	2	8	36131	36138	0 %	25 %	50 %	25 %	330818839
603	NC_015378	CGT	2	6	36194	36199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818839
604	NC_015378	GGCCC	2	10	36246	36255	0 %	0 %	40 %	60 %	330818839
605	NC_015378	GCA	2	6	36269	36274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818839
606	NC_015378	TTCG	2	8	36276	36283	0 %	50 %	25 %	25 %	330818839
607	NC_015378	TCGC	2	8	36351	36358	0 %	25 %	25 %	50 %	330818839
608	NC_015378	GC	3	6	36495	36500	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
609	NC_015378	GCC	2	6	36531	36536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818839
610	NC_015378	GCC	2	6	36547	36552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818839
611	NC_015378	TCG	2	6	36565	36570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818839
612	NC_015378	CAG	2	6	36597	36602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818839
613	NC_015378	CAGC	2	8	36616	36623	25 %	0 %	25 %	50 %	330818839
614	NC_015378	GTA	2	6	36642	36647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818839
615	NC_015378	TTGC	2	8	36741	36748	0 %	50 %	25 %	25 %	330818839
616	NC_015378	GTC	2	6	36768	36773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818839
617	NC_015378	GC	3	6	36788	36793	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
618	NC_015378	ACA	2	6	36827	36832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818839
619	NC_015378	TCC	2	6	36907	36912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330818839
620	NC_015378	ACG	2	6	36949	36954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818839
621	NC_015378	GC	3	6	36957	36962	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
622	NC_015378	TCA	2	6	36989	36994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818839
623	NC_015378	CGT	2	6	37011	37016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818839
624	NC_015378	TTC	2	6	37039	37044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818839
625	NC_015378	ACC	2	6	37075	37080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818839
626	NC_015378	ACG	2	6	37180	37185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818839
627	NC_015378	TGC	2	6	37226	37231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818839
628	NC_015378	CTC	2	6	37248	37253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330818839
629	NC_015378	GCT	2	6	37274	37279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818839
630	NC_015378	GCG	2	6	37280	37285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818839
631	NC_015378	GCG	2	6	37289	37294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818839
632	NC_015378	CG	3	6	37369	37374	0 %	0 %	50 %	50 %	330818839
633	NC_015378	AGC	2	6	37399	37404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818839
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645	NC_015378	CGG	2	6	37952	37957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330818840
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704	NC_015378	CG	3	6	44692	44697	0 %	0 %	50 %	50 %	330818847
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752	NC_015378	ACA	2	6	48062	48067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818849
753	NC_015378	T	6	6	48076	48081	0 %	100 %	0 %	0 %	330818849
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1000	NC_015378	GATACG	2	12	70236	70247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330818860

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