MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacteroides salanitronis DSM 18170 plasmid pBACSA02

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015168	AAC	2	6	335	340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976988
2	NC_015168	TAA	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976988
3	NC_015168	ATC	2	6	498	503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976988
4	NC_015168	GCA	2	6	590	595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976988
5	NC_015168	GGC	2	6	738	743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976988
6	NC_015168	TGA	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976988
7	NC_015168	CTT	2	6	820	825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976988
8	NC_015168	AGG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976988
9	NC_015168	GGA	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976988
10	NC_015168	TGA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976989
11	NC_015168	AGG	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976989
12	NC_015168	CAA	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976989
13	NC_015168	CCA	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324976989
14	NC_015168	ACA	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976989
15	NC_015168	TGC	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976989
16	NC_015168	TGA	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976990
17	NC_015168	GTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976990
18	NC_015168	CTT	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976990
19	NC_015168	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976990
20	NC_015168	GCA	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976990
21	NC_015168	ATG	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976990
22	NC_015168	ACT	3	9	2856	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976990
23	NC_015168	GTT	2	6	2867	2872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976990
24	NC_015168	TCT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
25	NC_015168	AAC	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324976991
26	NC_015168	GCC	2	6	3876	3881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976991
27	NC_015168	GCT	2	6	3912	3917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
28	NC_015168	CTT	2	6	3926	3931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
29	NC_015168	TCC	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
30	NC_015168	GAA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976991
31	NC_015168	TCC	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
32	NC_015168	CTT	2	6	4394	4399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976991
33	NC_015168	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
34	NC_015168	TCC	2	6	4443	4448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976991
35	NC_015168	TGC	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976991
36	NC_015168	TGG	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976992
37	NC_015168	AGA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976992
38	NC_015168	AAG	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976992
39	NC_015168	GGT	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976992
40	NC_015168	TTG	2	6	5173	5178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976992
41	NC_015168	GGA	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976993
42	NC_015168	GAA	2	6	5392	5397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976993
43	NC_015168	AGG	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324976993
44	NC_015168	GAA	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976994
45	NC_015168	CCA	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324976995
46	NC_015168	ATC	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976995
47	NC_015168	CGG	2	6	6479	6484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976995
48	NC_015168	TCA	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324976995
49	NC_015168	CTT	2	6	6706	6711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976995
50	NC_015168	GTT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976995
51	NC_015168	ATG	3	9	6863	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976995
52	NC_015168	TCC	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976995
53	NC_015168	CGG	2	6	6918	6923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324976995
54	NC_015168	GCC	2	6	6937	6942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976995
55	NC_015168	AGT	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976995
56	NC_015168	ATA	2	6	7045	7050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
57	NC_015168	CTG	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976996
58	NC_015168	TCT	2	6	7154	7159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976996
59	NC_015168	GCC	3	9	7177	7185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324976996
60	NC_015168	TTG	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
61	NC_015168	TGC	2	6	7205	7210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324976996
62	NC_015168	TGA	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976996
63	NC_015168	AGC	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976996
64	NC_015168	TTG	2	6	7531	7536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
65	NC_015168	CAG	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324976996
66	NC_015168	GAA	2	6	7578	7583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976996
67	NC_015168	TGG	2	6	7649	7654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976996
68	NC_015168	ATA	2	6	7774	7779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
69	NC_015168	TTC	2	6	7947	7952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976996
70	NC_015168	TTG	2	6	7987	7992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
71	NC_015168	CAC	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324976996
72	NC_015168	TAT	2	6	8121	8126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324976996
73	NC_015168	GTT	2	6	8144	8149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976996
74	NC_015168	CTT	2	6	8180	8185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324976996
75	NC_015168	TAT	2	6	8187	8192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324976996
76	NC_015168	ATT	2	6	8193	8198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324976996
77	NC_015168	TAA	2	6	8222	8227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
78	NC_015168	ATA	2	6	8264	8269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
79	NC_015168	ATA	2	6	8275	8280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
80	NC_015168	ATA	2	6	8297	8302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324976996
81	NC_015168	ATT	2	6	8307	8312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324976996
82	NC_015168	TGG	2	6	8478	8483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324976997
83	NC_015168	GAT	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324976997
84	NC_015168	GAA	2	6	8707	8712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324976998
85	NC_015168	TCC	2	6	8942	8947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324976999
86	NC_015168	TTG	2	6	8996	9001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324976999
87	NC_015168	AAC	2	6	9062	9067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324977000
88	NC_015168	GGA	2	6	10914	10919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	324977001
89	NC_015168	ATG	2	6	11062	11067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324977002
90	NC_015168	TGG	2	6	11118	11123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977002
91	NC_015168	ACT	2	6	11137	11142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977002
92	NC_015168	TTG	2	6	11315	11320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324977003
93	NC_015168	ATT	2	6	11429	11434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
94	NC_015168	TCT	2	6	11435	11440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977003
95	NC_015168	TTA	2	6	11450	11455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
96	NC_015168	TAC	2	6	11515	11520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977003
97	NC_015168	GTT	2	6	11549	11554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324977003
98	NC_015168	GTG	2	6	11604	11609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977003
99	NC_015168	TAA	3	9	11760	11768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324977003
100	NC_015168	TGT	2	6	11824	11829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324977003
101	NC_015168	ATT	2	6	12022	12027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
102	NC_015168	ATT	2	6	12058	12063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
103	NC_015168	TAT	2	6	12073	12078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977003
104	NC_015168	CTT	2	6	12092	12097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977003
105	NC_015168	GCG	2	6	12391	12396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324977004
106	NC_015168	TCC	2	6	12432	12437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324977004
107	NC_015168	CAA	2	6	12518	12523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324977004
108	NC_015168	GCA	2	6	12641	12646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977004
109	NC_015168	GAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
110	NC_015168	GAA	2	6	12740	12745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
111	NC_015168	TAC	2	6	12774	12779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977004
112	NC_015168	CAG	2	6	12795	12800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977004
113	NC_015168	AGC	2	6	12984	12989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977004
114	NC_015168	GAA	2	6	13244	13249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
115	NC_015168	AGA	2	6	13336	13341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977004
116	NC_015168	GCG	2	6	13478	13483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	324977005
117	NC_015168	GCA	2	6	13704	13709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
118	NC_015168	AAG	2	6	13852	13857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977005
119	NC_015168	TTC	2	6	13888	13893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977005
120	NC_015168	GCT	2	6	13896	13901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324977005
121	NC_015168	CAC	2	6	13904	13909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324977005
122	NC_015168	ATG	2	6	13921	13926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324977005
123	NC_015168	GTG	2	6	14047	14052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977005
124	NC_015168	GCC	2	6	14134	14139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	324977005
125	NC_015168	CTG	2	6	14164	14169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324977005
126	NC_015168	ATC	2	6	14212	14217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977005
127	NC_015168	TCA	2	6	14252	14257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977005
128	NC_015168	TGG	2	6	14276	14281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977005
129	NC_015168	ATG	2	6	14287	14292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324977005
130	NC_015168	TCT	2	6	14381	14386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977005
131	NC_015168	AGC	2	6	14434	14439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
132	NC_015168	TGG	2	6	14459	14464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	324977005
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134	NC_015168	GAA	2	6	14553	14558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324977005
135	NC_015168	GCA	2	6	14567	14572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
136	NC_015168	TCA	2	6	14708	14713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977005
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138	NC_015168	GAC	2	6	14824	14829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324977005
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143	NC_015168	ATC	2	6	15139	15144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324977005
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151	NC_015168	TTC	2	6	16180	16185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324977006
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162	NC_015168	ATT	2	6	17392	17397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977008
163	NC_015168	CAA	2	6	17402	17407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324977008
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179	NC_015168	ATT	2	6	19178	19183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324977011

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.