MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 4844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	CGGT	2	8	428	435	0 %	25 %	50 %	25 %	322690194
2	NC_015067	ACGA	2	8	694	701	50 %	0 %	25 %	25 %	322690194
3	NC_015067	ATGC	2	8	1399	1406	25 %	25 %	25 %	25 %	322690194
4	NC_015067	GCGT	2	8	2653	2660	0 %	25 %	50 %	25 %	322690195
5	NC_015067	GCCG	2	8	2923	2930	0 %	0 %	50 %	50 %	322690195
6	NC_015067	ATGG	2	8	3166	3173	25 %	25 %	50 %	0 %	322690195
7	NC_015067	GATG	2	8	3924	3931	25 %	25 %	50 %	0 %	322690196
8	NC_015067	CCCG	2	8	4240	4247	0 %	0 %	25 %	75 %	322690196
9	NC_015067	TGGG	2	8	4568	4575	0 %	25 %	75 %	0 %	322690196
10	NC_015067	CGCC	2	8	4640	4647	0 %	0 %	25 %	75 %	322690197
11	NC_015067	GCCG	2	8	4673	4680	0 %	0 %	50 %	50 %	322690197
12	NC_015067	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	322690197
13	NC_015067	ACCT	2	8	4974	4981	25 %	25 %	0 %	50 %	322690197
14	NC_015067	GCCA	2	8	5535	5542	25 %	0 %	25 %	50 %	322690198
15	NC_015067	CGTG	2	8	6386	6393	0 %	25 %	50 %	25 %	322690198
16	NC_015067	CGCC	2	8	8625	8632	0 %	0 %	25 %	75 %	322690199
17	NC_015067	TCCA	2	8	9325	9332	25 %	25 %	0 %	50 %	322690199
18	NC_015067	ATCG	2	8	11994	12001	25 %	25 %	25 %	25 %	322690201
19	NC_015067	CGGC	2	8	12336	12343	0 %	0 %	50 %	50 %	322690202
20	NC_015067	ACCG	2	8	12437	12444	25 %	0 %	25 %	50 %	322690202
21	NC_015067	GCCG	2	8	12745	12752	0 %	0 %	50 %	50 %	322690202
22	NC_015067	ACCT	2	8	13193	13200	25 %	25 %	0 %	50 %	322690202
23	NC_015067	GCCA	2	8	13319	13326	25 %	0 %	25 %	50 %	322690202
24	NC_015067	GGTC	2	8	16175	16182	0 %	25 %	50 %	25 %	322690204
25	NC_015067	TTGA	2	8	17455	17462	25 %	50 %	25 %	0 %	322690205
26	NC_015067	TTGC	2	8	18352	18359	0 %	50 %	25 %	25 %	322690206
27	NC_015067	CAGC	2	8	18982	18989	25 %	0 %	25 %	50 %	322690207
28	NC_015067	TCAG	2	8	19356	19363	25 %	25 %	25 %	25 %	322690207
29	NC_015067	GCGG	2	8	21945	21952	0 %	0 %	75 %	25 %	322690210
30	NC_015067	GTTT	2	8	22511	22518	0 %	75 %	25 %	0 %	322690211
31	NC_015067	GTCC	2	8	23257	23264	0 %	25 %	25 %	50 %	322690211
32	NC_015067	GTCG	2	8	23624	23631	0 %	25 %	50 %	25 %	322690212
33	NC_015067	GGCC	2	8	23875	23882	0 %	0 %	50 %	50 %	322690212
34	NC_015067	TTCC	2	8	24881	24888	0 %	50 %	0 %	50 %	322690213
35	NC_015067	CATC	2	8	26475	26482	25 %	25 %	0 %	50 %	322690215
36	NC_015067	CCTA	2	8	27128	27135	25 %	25 %	0 %	50 %	322690215
37	NC_015067	CAGG	2	8	27939	27946	25 %	0 %	50 %	25 %	322690217
38	NC_015067	ACGA	2	8	28610	28617	50 %	0 %	25 %	25 %	322690217
39	NC_015067	GGCA	2	8	28627	28634	25 %	0 %	50 %	25 %	322690217
40	NC_015067	GTGC	2	8	29817	29824	0 %	25 %	50 %	25 %	322690218
41	NC_015067	CGGC	2	8	30057	30064	0 %	0 %	50 %	50 %	322690219
42	NC_015067	CCGT	2	8	30422	30429	0 %	25 %	25 %	50 %	322690219
43	NC_015067	GATG	2	8	30459	30466	25 %	25 %	50 %	0 %	322690219
44	NC_015067	ATGG	2	8	32215	32222	25 %	25 %	50 %	0 %	322690220
45	NC_015067	CGGC	2	8	33316	33323	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
46	NC_015067	CGCT	2	8	33338	33345	0 %	25 %	25 %	50 %	322690222
47	NC_015067	GCCG	2	8	33639	33646	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
48	NC_015067	CACG	2	8	34055	34062	25 %	0 %	25 %	50 %	322690222
49	NC_015067	CGGC	2	8	34096	34103	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
50	NC_015067	CCCG	2	8	34420	34427	0 %	0 %	25 %	75 %	322690222
51	NC_015067	CGCT	2	8	34432	34439	0 %	25 %	25 %	50 %	322690222
52	NC_015067	CGCC	2	8	34703	34710	0 %	0 %	25 %	75 %	322690222
53	NC_015067	TCGT	2	8	34830	34837	0 %	50 %	25 %	25 %	322690222
54	NC_015067	TGCT	2	8	34972	34979	0 %	50 %	25 %	25 %	322690222
55	NC_015067	ACGA	2	8	35436	35443	50 %	0 %	25 %	25 %	322690223
56	NC_015067	CGTG	2	8	35497	35504	0 %	25 %	50 %	25 %	322690223
57	NC_015067	GCCG	2	8	35999	36006	0 %	0 %	50 %	50 %	322690223
58	NC_015067	CGTG	2	8	37233	37240	0 %	25 %	50 %	25 %	322690224
59	NC_015067	CCTT	2	8	37316	37323	0 %	50 %	0 %	50 %	322690224
60	NC_015067	AAAG	2	8	38354	38361	75 %	0 %	25 %	0 %	322690225
61	NC_015067	TGTT	2	8	38712	38719	0 %	75 %	25 %	0 %	322690225
62	NC_015067	ATCG	2	8	38982	38989	25 %	25 %	25 %	25 %	322690225
63	NC_015067	TCGA	2	8	39165	39172	25 %	25 %	25 %	25 %	322690225
64	NC_015067	TCGT	2	8	39724	39731	0 %	50 %	25 %	25 %	322690225
65	NC_015067	TTTG	2	8	39880	39887	0 %	75 %	25 %	0 %	322690225
66	NC_015067	CCTG	2	8	40222	40229	0 %	25 %	25 %	50 %	322690226
67	NC_015067	GCCA	2	8	40588	40595	25 %	0 %	25 %	50 %	322690227
68	NC_015067	GTTG	2	8	41132	41139	0 %	50 %	50 %	0 %	322690227
69	NC_015067	CTTT	2	8	42784	42791	0 %	75 %	0 %	25 %	322690229
70	NC_015067	TTCC	2	8	43000	43007	0 %	50 %	0 %	50 %	322690229
71	NC_015067	GAAG	2	8	43353	43360	50 %	0 %	50 %	0 %	322690229
72	NC_015067	CAGG	2	8	43497	43504	25 %	0 %	50 %	25 %	322690229
73	NC_015067	GAAA	2	8	44792	44799	75 %	0 %	25 %	0 %	322690230
74	NC_015067	TCCG	2	8	45602	45609	0 %	25 %	25 %	50 %	322690231
75	NC_015067	GGGC	2	8	45868	45875	0 %	0 %	75 %	25 %	322690231
76	NC_015067	CCGT	2	8	46006	46013	0 %	25 %	25 %	50 %	322690231
77	NC_015067	TCCG	2	8	46152	46159	0 %	25 %	25 %	50 %	322690231
78	NC_015067	TCCC	2	8	46302	46309	0 %	25 %	0 %	75 %	322690231
79	NC_015067	TGCC	2	8	46647	46654	0 %	25 %	25 %	50 %	322690231
80	NC_015067	TGGC	2	8	47074	47081	0 %	25 %	50 %	25 %	322690231
81	NC_015067	TTCT	2	8	47259	47266	0 %	75 %	0 %	25 %	322690231
82	NC_015067	AGTG	2	8	47482	47489	25 %	25 %	50 %	0 %	322690231
83	NC_015067	CATT	2	8	47505	47512	25 %	50 %	0 %	25 %	322690231
84	NC_015067	GCAT	2	8	48462	48469	25 %	25 %	25 %	25 %	322690233
85	NC_015067	ACGA	2	8	48625	48632	50 %	0 %	25 %	25 %	322690233
86	NC_015067	AATC	2	8	49127	49134	50 %	25 %	0 %	25 %	322690233
87	NC_015067	CGGG	2	8	50525	50532	0 %	0 %	75 %	25 %	322690234
88	NC_015067	ACCG	2	8	50828	50835	25 %	0 %	25 %	50 %	322690234
89	NC_015067	CGAC	2	8	50874	50881	25 %	0 %	25 %	50 %	322690234
90	NC_015067	GCTC	2	8	51664	51671	0 %	25 %	25 %	50 %	322690234
91	NC_015067	CGTG	2	8	53233	53240	0 %	25 %	50 %	25 %	322690235
92	NC_015067	TGGC	2	8	54667	54674	0 %	25 %	50 %	25 %	322690235
93	NC_015067	TCTG	2	8	54831	54838	0 %	50 %	25 %	25 %	322690235
94	NC_015067	GCGG	2	8	55242	55249	0 %	0 %	75 %	25 %	322690236
95	NC_015067	GGCT	2	8	55305	55312	0 %	25 %	50 %	25 %	322690236
96	NC_015067	TTCA	2	8	55698	55705	25 %	50 %	0 %	25 %	322690236
97	NC_015067	GCGG	2	8	55761	55768	0 %	0 %	75 %	25 %	322690236
98	NC_015067	CCAG	2	8	57329	57336	25 %	0 %	25 %	50 %	322690237
99	NC_015067	CGGC	2	8	59128	59135	0 %	0 %	50 %	50 %	322690238
100	NC_015067	CGGA	2	8	59269	59276	25 %	0 %	50 %	25 %	322690238
101	NC_015067	TGCC	2	8	59411	59418	0 %	25 %	25 %	50 %	322690238
102	NC_015067	CACG	2	8	59468	59475	25 %	0 %	25 %	50 %	322690238
103	NC_015067	GATC	2	8	59482	59489	25 %	25 %	25 %	25 %	322690238
104	NC_015067	CGGC	2	8	59614	59621	0 %	0 %	50 %	50 %	322690238
105	NC_015067	TGGC	2	8	59706	59713	0 %	25 %	50 %	25 %	322690238
106	NC_015067	CGTA	2	8	59949	59956	25 %	25 %	25 %	25 %	322690238
107	NC_015067	GCGG	2	8	60413	60420	0 %	0 %	75 %	25 %	322690239
108	NC_015067	TCGG	2	8	60454	60461	0 %	25 %	50 %	25 %	322690239
109	NC_015067	CAGA	2	8	60572	60579	50 %	0 %	25 %	25 %	322690239
110	NC_015067	CGGC	2	8	60860	60867	0 %	0 %	50 %	50 %	322690239
111	NC_015067	CGGT	2	8	60973	60980	0 %	25 %	50 %	25 %	322690239
112	NC_015067	GCCG	2	8	61079	61086	0 %	0 %	50 %	50 %	322690239
113	NC_015067	TGCC	2	8	61196	61203	0 %	25 %	25 %	50 %	322690239
114	NC_015067	GAGC	2	8	61461	61468	25 %	0 %	50 %	25 %	322690240
115	NC_015067	ACCC	2	8	63457	63464	25 %	0 %	0 %	75 %	322690242
116	NC_015067	GGCC	2	8	63599	63606	0 %	0 %	50 %	50 %	322690242
117	NC_015067	TGCA	2	8	65559	65566	25 %	25 %	25 %	25 %	322690244
118	NC_015067	CGTG	2	8	65641	65648	0 %	25 %	50 %	25 %	322690244
119	NC_015067	GTGG	2	8	66138	66145	0 %	25 %	75 %	0 %	322690244
120	NC_015067	GGTG	2	8	66164	66171	0 %	25 %	75 %	0 %	322690244
121	NC_015067	GGCA	2	8	68489	68496	25 %	0 %	50 %	25 %	322690248
122	NC_015067	GAGC	2	8	68587	68594	25 %	0 %	50 %	25 %	322690248
123	NC_015067	GCGT	2	8	70078	70085	0 %	25 %	50 %	25 %	322690249
124	NC_015067	TCAC	2	8	70462	70469	25 %	25 %	0 %	50 %	322690250
125	NC_015067	GACC	2	8	70893	70900	25 %	0 %	25 %	50 %	322690250
126	NC_015067	TGGG	2	8	71555	71562	0 %	25 %	75 %	0 %	322690250
127	NC_015067	GCTG	2	8	72174	72181	0 %	25 %	50 %	25 %	322690250
128	NC_015067	TCCC	2	8	72542	72549	0 %	25 %	0 %	75 %	322690251
129	NC_015067	CTGG	2	8	76306	76313	0 %	25 %	50 %	25 %	322690253
130	NC_015067	CTGG	2	8	76602	76609	0 %	25 %	50 %	25 %	322690254
131	NC_015067	CCGC	2	8	77486	77493	0 %	0 %	25 %	75 %	322690254
132	NC_015067	CGTC	2	8	77788	77795	0 %	25 %	25 %	50 %	322690254
133	NC_015067	CTGC	2	8	78546	78553	0 %	25 %	25 %	50 %	322690255
134	NC_015067	GCCA	2	8	78656	78663	25 %	0 %	25 %	50 %	322690255
135	NC_015067	ACGT	2	8	78859	78866	25 %	25 %	25 %	25 %	322690256
136	NC_015067	ATTC	2	8	79286	79293	25 %	50 %	0 %	25 %	322690256
137	NC_015067	GGTG	2	8	80108	80115	0 %	25 %	75 %	0 %	322690257
138	NC_015067	GCGG	2	8	80587	80594	0 %	0 %	75 %	25 %	322690257
139	NC_015067	CCAG	2	8	80857	80864	25 %	0 %	25 %	50 %	322690257
140	NC_015067	GAGC	2	8	80923	80930	25 %	0 %	50 %	25 %	322690257
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