MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015067	GTT	2	6	183465	183470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690334
3502	NC_015067	ATG	2	6	183482	183487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690334
3503	NC_015067	TGGC	2	8	183543	183550	0 %	25 %	50 %	25 %	322690334
3504	NC_015067	AGT	2	6	183558	183563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690334
3505	NC_015067	GAA	2	6	183610	183615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690334
3506	NC_015067	ATGG	2	8	183640	183647	25 %	25 %	50 %	0 %	322690334
3507	NC_015067	GC	3	6	183694	183699	0 %	0 %	50 %	50 %	322690334
3508	NC_015067	TCT	2	6	183706	183711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690334
3509	NC_015067	CGG	2	6	183734	183739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690334
3510	NC_015067	ATT	2	6	183779	183784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690334
3511	NC_015067	GT	3	6	183995	184000	0 %	50 %	50 %	0 %	322690334
3512	NC_015067	ATG	2	6	184079	184084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690334
3513	NC_015067	GCG	2	6	184135	184140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690334
3514	NC_015067	CCGT	2	8	184188	184195	0 %	25 %	25 %	50 %	322690334
3515	NC_015067	GAT	2	6	184240	184245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690334
3516	NC_015067	CAG	2	6	184640	184645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690335
3517	NC_015067	CGG	2	6	184668	184673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690335
3518	NC_015067	TCG	2	6	184675	184680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690335
3519	NC_015067	GTT	2	6	184720	184725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690335
3520	NC_015067	CAA	2	6	184743	184748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690335
3521	NC_015067	GTG	2	6	184756	184761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690335
3522	NC_015067	ACC	2	6	184780	184785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690335
3523	NC_015067	CCCG	2	8	184824	184831	0 %	0 %	25 %	75 %	322690335
3524	NC_015067	TGA	2	6	184850	184855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690335
3525	NC_015067	GCGA	2	8	184862	184869	25 %	0 %	50 %	25 %	322690335
3526	NC_015067	CTG	2	6	184882	184887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690335
3527	NC_015067	CAG	2	6	184936	184941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690335
3528	NC_015067	CTT	2	6	184947	184952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690335
3529	NC_015067	GACCG	2	10	184994	185003	20 %	0 %	40 %	40 %	322690335
3530	NC_015067	GAA	2	6	185007	185012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690335
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3533	NC_015067	CCG	2	6	185183	185188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690335
3534	NC_015067	CCGC	2	8	185207	185214	0 %	0 %	25 %	75 %	322690335
3535	NC_015067	TG	3	6	185287	185292	0 %	50 %	50 %	0 %	322690335
3536	NC_015067	TGG	2	6	185360	185365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690335
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3542	NC_015067	GTG	2	6	185807	185812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690336
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3544	NC_015067	TTC	2	6	185852	185857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690336
3545	NC_015067	TGA	2	6	185889	185894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690336
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3553	NC_015067	GCGG	2	8	186295	186302	0 %	0 %	75 %	25 %	322690337
3554	NC_015067	GTGC	2	8	186337	186344	0 %	25 %	50 %	25 %	322690337
3555	NC_015067	CAGCTC	2	12	186347	186358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690337
3556	NC_015067	TGG	2	6	186406	186411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690337
3557	NC_015067	CTT	2	6	186413	186418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690337
3558	NC_015067	GGC	2	6	186524	186529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690337
3559	NC_015067	GAT	2	6	186596	186601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690337
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3562	NC_015067	CG	3	6	186679	186684	0 %	0 %	50 %	50 %	322690337
3563	NC_015067	TTCC	2	8	186692	186699	0 %	50 %	0 %	50 %	322690337
3564	NC_015067	GTG	2	6	186765	186770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690337
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3573	NC_015067	GACC	2	8	187156	187163	25 %	0 %	25 %	50 %	322690337
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3589	NC_015067	CGTG	2	8	188554	188561	0 %	25 %	50 %	25 %	322690340
3590	NC_015067	GCG	2	6	188599	188604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690340
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3602	NC_015067	CG	3	6	189087	189092	0 %	0 %	50 %	50 %	322690340
3603	NC_015067	CGAT	2	8	189141	189148	25 %	25 %	25 %	25 %	322690340
3604	NC_015067	TGCC	2	8	189204	189211	0 %	25 %	25 %	50 %	322690340
3605	NC_015067	CCG	2	6	189230	189235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690340
3606	NC_015067	GCCG	2	8	189342	189349	0 %	0 %	50 %	50 %	322690340
3607	NC_015067	AGGC	2	8	189417	189424	25 %	0 %	50 %	25 %	322690340
3608	NC_015067	CGGC	2	8	189585	189592	0 %	0 %	50 %	50 %	322690340
3609	NC_015067	TGG	2	6	189624	189629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690340
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3613	NC_015067	ATCA	2	8	190298	190305	50 %	25 %	0 %	25 %	322690341
3614	NC_015067	G	6	6	190345	190350	0 %	0 %	100 %	0 %	322690341
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3620	NC_015067	GAC	2	6	190693	190698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690341
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3864	NC_015067	CGG	2	6	202649	202654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690348
3865	NC_015067	TGC	2	6	202684	202689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690348
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3867	NC_015067	TGG	2	6	202797	202802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690348
3868	NC_015067	GGC	2	6	202815	202820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690348
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3979	NC_015067	ACCGA	2	10	208286	208295	40 %	0 %	20 %	40 %	322690352
3980	NC_015067	GCA	2	6	208323	208328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690352
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3982	NC_015067	GCCA	2	8	208372	208379	25 %	0 %	25 %	50 %	322690352
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3984	NC_015067	ACC	2	6	208684	208689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690353
3985	NC_015067	TTCG	2	8	208696	208703	0 %	50 %	25 %	25 %	322690353
3986	NC_015067	TC	3	6	208761	208766	0 %	50 %	0 %	50 %	322690353
3987	NC_015067	CCG	2	6	208796	208801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690353
3988	NC_015067	CG	3	6	208868	208873	0 %	0 %	50 %	50 %	322690353
3989	NC_015067	CCG	2	6	208877	208882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690353
3990	NC_015067	CCG	2	6	208946	208951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690353
3991	NC_015067	GAA	2	6	209022	209027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690353
3992	NC_015067	GCGCA	2	10	209092	209101	20 %	0 %	40 %	40 %	322690353
3993	NC_015067	GAT	2	6	209104	209109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690353
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3997	NC_015067	CACG	2	8	209596	209603	25 %	0 %	25 %	50 %	322690354
3998	NC_015067	CGCA	2	8	209608	209615	25 %	0 %	25 %	50 %	322690354
3999	NC_015067	GCT	2	6	209710	209715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690354
4000	NC_015067	TGC	2	6	209716	209721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690354

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