MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015067	CTT	2	6	156427	156432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690311
3002	NC_015067	CGC	2	6	156492	156497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3003	NC_015067	TGG	2	6	156524	156529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690311
3004	NC_015067	CTA	2	6	156535	156540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690311
3005	NC_015067	CAC	2	6	156604	156609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3006	NC_015067	GAC	2	6	156641	156646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3007	NC_015067	CCG	2	6	156710	156715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3008	NC_015067	CAC	2	6	156751	156756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3009	NC_015067	CG	3	6	156771	156776	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3010	NC_015067	GC	3	6	156784	156789	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3011	NC_015067	GAG	2	6	156845	156850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690311
3012	NC_015067	CAC	2	6	156905	156910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3013	NC_015067	TGG	2	6	156938	156943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690311
3014	NC_015067	GCA	2	6	156952	156957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3015	NC_015067	GCG	2	6	156960	156965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3016	NC_015067	GCG	2	6	157032	157037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3017	NC_015067	TCGC	2	8	157130	157137	0 %	25 %	25 %	50 %	322690311
3018	NC_015067	CACCGC	2	12	157153	157164	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322690311
3019	NC_015067	TGG	2	6	157184	157189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690311
3020	NC_015067	CGG	2	6	157201	157206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3021	NC_015067	CGTGA	2	10	157334	157343	20 %	20 %	40 %	20 %	322690311
3022	NC_015067	TGG	2	6	157353	157358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690311
3023	NC_015067	GAT	2	6	157381	157386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690311
3024	NC_015067	GCC	2	6	157415	157420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3025	NC_015067	GCCG	2	8	157424	157431	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3026	NC_015067	GCC	3	9	157550	157558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3027	NC_015067	GCCGCG	2	12	157560	157571	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3028	NC_015067	CTT	2	6	157606	157611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690311
3029	NC_015067	GCC	2	6	157617	157622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3030	NC_015067	CGC	2	6	157639	157644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3031	NC_015067	GCC	2	6	157647	157652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3032	NC_015067	GCTC	2	8	157668	157675	0 %	25 %	25 %	50 %	322690311
3033	NC_015067	TCGT	2	8	157808	157815	0 %	50 %	25 %	25 %	322690311
3034	NC_015067	CCA	2	6	157845	157850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3035	NC_015067	GGGGC	2	10	157878	157887	0 %	0 %	80 %	20 %	322690311
3036	NC_015067	CCG	2	6	157938	157943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3037	NC_015067	CG	3	6	157953	157958	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3038	NC_015067	GCG	2	6	158004	158009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3039	NC_015067	ACG	2	6	158055	158060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3040	NC_015067	CGG	2	6	158131	158136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3041	NC_015067	CTG	2	6	158183	158188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3042	NC_015067	GC	3	6	158340	158345	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3043	NC_015067	GAA	2	6	158348	158353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690311
3044	NC_015067	CTG	2	6	158357	158362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3045	NC_015067	GCA	2	6	158789	158794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690312
3046	NC_015067	GCC	2	6	158825	158830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690312
3047	NC_015067	CGT	2	6	158838	158843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690312
3048	NC_015067	GCG	2	6	158893	158898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690312
3049	NC_015067	CAC	2	6	158907	158912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690312
3050	NC_015067	GC	4	8	159447	159454	0 %	0 %	50 %	50 %	322690313
3051	NC_015067	TGG	2	6	159468	159473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
3052	NC_015067	TCG	2	6	159498	159503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3053	NC_015067	TTC	2	6	159550	159555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690313
3054	NC_015067	AAG	2	6	159602	159607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690313
3055	NC_015067	TGA	2	6	159639	159644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690313
3056	NC_015067	TCA	2	6	159696	159701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690313
3057	NC_015067	CCA	2	6	159738	159743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3058	NC_015067	ATC	2	6	159782	159787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690313
3059	NC_015067	CGG	3	9	159865	159873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690313
3060	NC_015067	CTG	2	6	159890	159895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3061	NC_015067	GAC	2	6	159911	159916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3062	NC_015067	CCA	2	6	159924	159929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3063	NC_015067	TTCAGG	2	12	159930	159941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690313
3064	NC_015067	CCA	2	6	159942	159947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3065	NC_015067	ACC	2	6	159957	159962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3066	NC_015067	GGT	2	6	159965	159970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
3067	NC_015067	GAC	2	6	159971	159976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3068	NC_015067	AGA	2	6	159984	159989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690313
3069	NC_015067	GAAG	2	8	160069	160076	50 %	0 %	50 %	0 %	322690313
3070	NC_015067	GAA	2	6	160090	160095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690313
3071	NC_015067	CTC	3	9	160102	160110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690313
3072	NC_015067	CCA	2	6	160116	160121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3073	NC_015067	CTG	2	6	160220	160225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3074	NC_015067	CAA	2	6	160246	160251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690313
3075	NC_015067	TGC	2	6	160254	160259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3076	NC_015067	ACG	2	6	160260	160265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3077	NC_015067	GTG	2	6	160295	160300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
3078	NC_015067	TCG	2	6	160302	160307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3079	NC_015067	CCG	2	6	160326	160331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690313
3080	NC_015067	GGT	2	6	160358	160363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
3081	NC_015067	GCC	2	6	160412	160417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690313
3082	NC_015067	TCA	2	6	160431	160436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690313
3083	NC_015067	CAT	2	6	160507	160512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690313
3084	NC_015067	ATCG	2	8	160523	160530	25 %	25 %	25 %	25 %	322690313
3085	NC_015067	TCT	2	6	160563	160568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690313
3086	NC_015067	CCGT	2	8	160589	160596	0 %	25 %	25 %	50 %	322690313
3087	NC_015067	TCGC	2	8	160629	160636	0 %	25 %	25 %	50 %	322690313
3088	NC_015067	ACA	2	6	160638	160643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690313
3089	NC_015067	GCTCCG	2	12	160676	160687	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690313
3090	NC_015067	GGT	2	6	160796	160801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
3091	NC_015067	AAG	2	6	160868	160873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690313
3092	NC_015067	ACA	2	6	160944	160949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690313
3093	NC_015067	CGA	2	6	160963	160968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3094	NC_015067	GAAG	2	8	161005	161012	50 %	0 %	50 %	0 %	322690313
3095	NC_015067	GAC	2	6	161024	161029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3096	NC_015067	TGA	2	6	161061	161066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690313
3097	NC_015067	CCG	2	6	161067	161072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690313
3098	NC_015067	AGA	2	6	161076	161081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690313
3099	NC_015067	CAG	2	6	161102	161107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3100	NC_015067	TGC	2	6	161119	161124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3101	NC_015067	CGA	3	9	161173	161181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3102	NC_015067	GAC	2	6	161204	161209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3103	NC_015067	GAC	2	6	161213	161218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3104	NC_015067	ACA	2	6	161223	161228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690313
3105	NC_015067	CAA	2	6	161244	161249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690314
3106	NC_015067	GAC	2	6	161251	161256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690314
3107	NC_015067	CCG	2	6	161327	161332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690314
3108	NC_015067	GA	3	6	161411	161416	50 %	0 %	50 %	0 %	322690314
3109	NC_015067	AAG	2	6	161473	161478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690314
3110	NC_015067	TCA	2	6	161525	161530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690314
3111	NC_015067	CGCA	2	8	161542	161549	25 %	0 %	25 %	50 %	322690314
3112	NC_015067	AGGAGC	2	12	161552	161563	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322690314
3113	NC_015067	CAT	2	6	161580	161585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690314
3114	NC_015067	GCT	2	6	161601	161606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690314
3115	NC_015067	GCCC	2	8	161607	161614	0 %	0 %	25 %	75 %	322690314
3116	NC_015067	CGA	2	6	161616	161621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690314
3117	NC_015067	GAC	2	6	161653	161658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690314
3118	NC_015067	CCA	2	6	161675	161680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690314
3119	NC_015067	CCA	2	6	161747	161752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690314
3120	NC_015067	CGC	2	6	161853	161858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690314
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3231	NC_015067	GCT	2	6	167340	167345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690319
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3234	NC_015067	TGAGA	2	10	167439	167448	40 %	20 %	40 %	0 %	322690319
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3240	NC_015067	CAT	2	6	167770	167775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690319
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3242	NC_015067	TTCG	2	8	167847	167854	0 %	50 %	25 %	25 %	322690319
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3483	NC_015067	CAG	2	6	181874	181879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690332
3484	NC_015067	TGA	2	6	181888	181893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690332
3485	NC_015067	GTTGC	2	10	181910	181919	0 %	40 %	40 %	20 %	322690332
3486	NC_015067	TGC	2	6	181985	181990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690332
3487	NC_015067	GTT	2	6	182051	182056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690332
3488	NC_015067	TCG	2	6	182086	182091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690332
3489	NC_015067	GCA	2	6	182101	182106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690332
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3491	NC_015067	CGC	2	6	182703	182708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690333
3492	NC_015067	TC	3	6	182761	182766	0 %	50 %	0 %	50 %	322690333
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3496	NC_015067	TGA	2	6	183255	183260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690334
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