MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_015067	CCAAG	2	10	108157	108166	40 %	0 %	20 %	40 %	322690276
2003	NC_015067	GCCGC	2	10	108197	108206	0 %	0 %	40 %	60 %	322690276
2004	NC_015067	CGT	2	6	108217	108222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690276
2005	NC_015067	CCTG	2	8	108226	108233	0 %	25 %	25 %	50 %	322690276
2006	NC_015067	TGC	2	6	108250	108255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690276
2007	NC_015067	GCC	3	9	108308	108316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690276
2008	NC_015067	CTG	2	6	108410	108415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690276
2009	NC_015067	GC	3	6	108532	108537	0 %	0 %	50 %	50 %	322690276
2010	NC_015067	GCC	2	6	108548	108553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690276
2011	NC_015067	CCG	2	6	108624	108629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690276
2012	NC_015067	GGTGCT	2	12	108718	108729	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322690276
2013	NC_015067	GCT	2	6	108745	108750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690276
2014	NC_015067	CGC	2	6	108754	108759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690276
2015	NC_015067	CGC	2	6	108793	108798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690276
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2017	NC_015067	AGC	2	6	108891	108896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690276
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2022	NC_015067	GGAT	2	8	109228	109235	25 %	25 %	50 %	0 %	322690276
2023	NC_015067	GCT	2	6	109297	109302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690276
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2033	NC_015067	CGC	2	6	109705	109710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690276
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2043	NC_015067	GGA	2	6	110133	110138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690277
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2052	NC_015067	GAT	2	6	110593	110598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690277
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2057	NC_015067	CGGTT	2	10	110779	110788	0 %	40 %	40 %	20 %	322690277
2058	NC_015067	GC	3	6	110808	110813	0 %	0 %	50 %	50 %	322690277
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2105	NC_015067	GTGCT	2	10	113492	113501	0 %	40 %	40 %	20 %	322690281
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2110	NC_015067	CGCAG	2	10	113643	113652	20 %	0 %	40 %	40 %	322690281
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2113	NC_015067	GCTG	2	8	113813	113820	0 %	25 %	50 %	25 %	322690281
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2119	NC_015067	GGA	2	6	114198	114203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690281
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2121	NC_015067	GGT	2	6	114397	114402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690281
2122	NC_015067	CGG	2	6	114408	114413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690281
2123	NC_015067	ATGA	2	8	114415	114422	50 %	25 %	25 %	0 %	322690281
2124	NC_015067	TGG	2	6	114428	114433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690281
2125	NC_015067	CAAGGA	2	12	114450	114461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322690281
2126	NC_015067	CAA	2	6	114543	114548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2127	NC_015067	TCG	2	6	114578	114583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2128	NC_015067	GATGCT	2	12	114622	114633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690281
2129	NC_015067	GTAT	2	8	114689	114696	25 %	50 %	25 %	0 %	322690281
2130	NC_015067	GGT	2	6	114703	114708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690281
2131	NC_015067	ACA	2	6	114791	114796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2132	NC_015067	TAT	2	6	114853	114858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690281
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2134	NC_015067	ACA	2	6	115067	115072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2135	NC_015067	GGA	3	9	115158	115166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690281
2136	NC_015067	CGA	2	6	115172	115177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690281
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2138	NC_015067	TCG	2	6	115337	115342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690281
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2143	NC_015067	TCA	2	6	115538	115543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690281
2144	NC_015067	CGA	2	6	115551	115556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2145	NC_015067	ACA	2	6	115580	115585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690281
2146	NC_015067	GATG	2	8	115701	115708	25 %	25 %	50 %	0 %	322690281
2147	NC_015067	GGGC	2	8	115715	115722	0 %	0 %	75 %	25 %	322690281
2148	NC_015067	GC	3	6	115721	115726	0 %	0 %	50 %	50 %	322690281
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2152	NC_015067	GCT	2	6	115794	115799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690281
2153	NC_015067	GGT	2	6	115818	115823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690281
2154	NC_015067	TAT	2	6	115943	115948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690282
2155	NC_015067	ACT	2	6	115962	115967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690282
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2157	NC_015067	GCT	2	6	116027	116032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2158	NC_015067	TCT	2	6	116044	116049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690282
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2161	NC_015067	CTG	2	6	116173	116178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690282
2162	NC_015067	CTA	2	6	116306	116311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690282
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2230	NC_015067	GAC	2	6	120459	120464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690284
2231	NC_015067	GAC	2	6	120474	120479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690284
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2233	NC_015067	GAC	2	6	120570	120575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690284
2234	NC_015067	CCGA	2	8	120604	120611	25 %	0 %	25 %	50 %	322690284
2235	NC_015067	TAC	2	6	120615	120620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690284
2236	NC_015067	GCACC	2	10	120719	120728	20 %	0 %	20 %	60 %	322690284
2237	NC_015067	CCG	2	6	120784	120789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690284
2238	NC_015067	ACG	2	6	120808	120813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690284
2239	NC_015067	GCCAAC	2	12	120831	120842	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322690284
2240	NC_015067	CAC	2	6	120857	120862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690284
2241	NC_015067	CGG	2	6	120872	120877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690284
2242	NC_015067	CCA	2	6	120943	120948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690284
2243	NC_015067	CGAC	2	8	121046	121053	25 %	0 %	25 %	50 %	322690284
2244	NC_015067	GAA	2	6	121097	121102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690284
2245	NC_015067	GC	3	6	121118	121123	0 %	0 %	50 %	50 %	322690284
2246	NC_015067	AAGG	2	8	121134	121141	50 %	0 %	50 %	0 %	322690284
2247	NC_015067	AAG	2	6	121152	121157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690284
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2249	NC_015067	CAT	3	9	121448	121456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690285
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2253	NC_015067	CCA	2	6	121678	121683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690285
2254	NC_015067	AACG	2	8	121713	121720	50 %	0 %	25 %	25 %	322690285
2255	NC_015067	CTG	2	6	121733	121738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690285
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2257	NC_015067	GGC	2	6	121899	121904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690285
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2263	NC_015067	CCGA	2	8	122214	122221	25 %	0 %	25 %	50 %	322690285
2264	NC_015067	CG	3	6	122296	122301	0 %	0 %	50 %	50 %	322690285
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2269	NC_015067	CG	4	8	122877	122884	0 %	0 %	50 %	50 %	322690286
2270	NC_015067	GACG	2	8	122914	122921	25 %	0 %	50 %	25 %	322690286
2271	NC_015067	CGG	2	6	123010	123015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690286
2272	NC_015067	CGG	2	6	123065	123070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690286
2273	NC_015067	CCG	2	6	123088	123093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690286
2274	NC_015067	CGATTT	2	12	123101	123112	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322690286
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2363	NC_015067	GGC	2	6	126801	126806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690289
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2482	NC_015067	CTG	2	6	132574	132579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690293
2483	NC_015067	CGG	2	6	132597	132602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690293
2484	NC_015067	CGC	2	6	132622	132627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690293
2485	NC_015067	CCG	2	6	132713	132718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690293
2486	NC_015067	CGC	2	6	132735	132740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690293
2487	NC_015067	GCC	2	6	132748	132753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690293
2488	NC_015067	GATC	2	8	132765	132772	25 %	25 %	25 %	25 %	322690293
2489	NC_015067	TGG	2	6	132785	132790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690293
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2491	NC_015067	CTA	2	6	132891	132896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690293
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2493	NC_015067	AGG	2	6	132911	132916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690293
2494	NC_015067	CG	3	6	132923	132928	0 %	0 %	50 %	50 %	322690293
2495	NC_015067	TCA	2	6	132971	132976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690293
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2499	NC_015067	ACG	2	6	133028	133033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690293
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