MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015067	TCG	2	6	81329	81334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690257
1502	NC_015067	TGC	2	6	81362	81367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690257
1503	NC_015067	CCA	2	6	81379	81384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690257
1504	NC_015067	CGT	2	6	81390	81395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690257
1505	NC_015067	TTC	2	6	81406	81411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690257
1506	NC_015067	TCC	2	6	81473	81478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690257
1507	NC_015067	CGC	2	6	81519	81524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690257
1508	NC_015067	GTG	2	6	81554	81559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690257
1509	NC_015067	GGC	2	6	81711	81716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690257
1510	NC_015067	CGT	2	6	81744	81749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690257
1511	NC_015067	CGA	2	6	81765	81770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690257
1512	NC_015067	GCC	2	6	81778	81783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690257
1513	NC_015067	CG	3	6	81786	81791	0 %	0 %	50 %	50 %	322690257
1514	NC_015067	CGG	2	6	81800	81805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690257
1515	NC_015067	CGGC	2	8	81816	81823	0 %	0 %	50 %	50 %	322690257
1516	NC_015067	CGG	2	6	81837	81842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690257
1517	NC_015067	CAG	2	6	81850	81855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690257
1518	NC_015067	CG	3	6	81858	81863	0 %	0 %	50 %	50 %	322690257
1519	NC_015067	TCG	2	6	81899	81904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690257
1520	NC_015067	GC	3	6	82027	82032	0 %	0 %	50 %	50 %	322690257
1521	NC_015067	CAT	2	6	82068	82073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690257
1522	NC_015067	GAT	2	6	82216	82221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690258
1523	NC_015067	CGA	2	6	82222	82227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690258
1524	NC_015067	GTG	2	6	82256	82261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690258
1525	NC_015067	TGC	2	6	82280	82285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690258
1526	NC_015067	GAG	2	6	82286	82291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690258
1527	NC_015067	TCCG	2	8	82303	82310	0 %	25 %	25 %	50 %	322690258
1528	NC_015067	CCG	3	9	82308	82316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690258
1529	NC_015067	CGG	2	6	82360	82365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690258
1530	NC_015067	GCCACC	2	12	82433	82444	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322690258
1531	NC_015067	TCA	2	6	82461	82466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690258
1532	NC_015067	ACG	2	6	82497	82502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690258
1533	NC_015067	GT	4	8	82538	82545	0 %	50 %	50 %	0 %	322690258
1534	NC_015067	CG	4	8	82573	82580	0 %	0 %	50 %	50 %	322690258
1535	NC_015067	TGA	2	6	82609	82614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690258
1536	NC_015067	CAG	2	6	82664	82669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690258
1537	NC_015067	CGGC	2	8	82674	82681	0 %	0 %	50 %	50 %	322690258
1538	NC_015067	GCG	2	6	82713	82718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690258
1539	NC_015067	CT	3	6	82772	82777	0 %	50 %	0 %	50 %	322690258
1540	NC_015067	GAT	2	6	82783	82788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690258
1541	NC_015067	GC	3	6	82836	82841	0 %	0 %	50 %	50 %	322690258
1542	NC_015067	AAG	2	6	82862	82867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690258
1543	NC_015067	GCG	2	6	82994	82999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690258
1544	NC_015067	TCCG	2	8	83047	83054	0 %	25 %	25 %	50 %	322690258
1545	NC_015067	TGC	2	6	83079	83084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690258
1546	NC_015067	CGG	3	9	83155	83163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690258
1547	NC_015067	TCT	2	6	83205	83210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690258
1548	NC_015067	ACG	2	6	83262	83267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690258
1549	NC_015067	TCT	2	6	83388	83393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690259
1550	NC_015067	CCG	3	9	83396	83404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690259
1551	NC_015067	CGC	3	9	83405	83413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690259
1552	NC_015067	AAT	2	6	83469	83474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690259
1553	NC_015067	ACGGCA	2	12	83494	83505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690259
1554	NC_015067	CCA	2	6	83512	83517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690259
1555	NC_015067	CGG	2	6	83537	83542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690259
1556	NC_015067	GTCGCC	2	12	83592	83603	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690259
1557	NC_015067	CGG	2	6	83687	83692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690259
1558	NC_015067	ACG	2	6	83701	83706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690259
1559	NC_015067	GCCT	2	8	83714	83721	0 %	25 %	25 %	50 %	322690259
1560	NC_015067	CCA	2	6	83782	83787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690259
1561	NC_015067	GGCTG	2	10	83832	83841	0 %	20 %	60 %	20 %	322690259
1562	NC_015067	GCC	2	6	83853	83858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690259
1563	NC_015067	CGC	2	6	83885	83890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690259
1564	NC_015067	GC	3	6	83944	83949	0 %	0 %	50 %	50 %	322690259
1565	NC_015067	GGT	2	6	83996	84001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690259
1566	NC_015067	AAG	2	6	84084	84089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690259
1567	NC_015067	GCG	2	6	84109	84114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690259
1568	NC_015067	CTG	2	6	84189	84194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690259
1569	NC_015067	GCG	2	6	84220	84225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690259
1570	NC_015067	CTG	2	6	84246	84251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690259
1571	NC_015067	GC	3	6	84253	84258	0 %	0 %	50 %	50 %	322690259
1572	NC_015067	CGA	2	6	84260	84265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690259
1573	NC_015067	ACC	2	6	84297	84302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690259
1574	NC_015067	ATC	2	6	84340	84345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690259
1575	NC_015067	CG	3	6	84373	84378	0 %	0 %	50 %	50 %	322690259
1576	NC_015067	TCT	2	6	84394	84399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690259
1577	NC_015067	CAT	2	6	84401	84406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690259
1578	NC_015067	CAGC	2	8	84425	84432	25 %	0 %	25 %	50 %	322690259
1579	NC_015067	TC	3	6	84438	84443	0 %	50 %	0 %	50 %	322690259
1580	NC_015067	CGC	2	6	84491	84496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690259
1581	NC_015067	CTG	2	6	84560	84565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690260
1582	NC_015067	CGG	3	9	84592	84600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690260
1583	NC_015067	CGC	2	6	84649	84654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690260
1584	NC_015067	AGA	2	6	84720	84725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690260
1585	NC_015067	CCG	2	6	84726	84731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690260
1586	NC_015067	CTCAA	2	10	84753	84762	40 %	20 %	0 %	40 %	322690260
1587	NC_015067	CAAG	2	8	84781	84788	50 %	0 %	25 %	25 %	322690260
1588	NC_015067	CGC	2	6	84829	84834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690260
1589	NC_015067	ACGTGG	2	12	84942	84953	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322690260
1590	NC_015067	CCG	3	9	85029	85037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690260
1591	NC_015067	ATGG	2	8	85115	85122	25 %	25 %	50 %	0 %	322690260
1592	NC_015067	ACG	3	9	85125	85133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690260
1593	NC_015067	GCT	2	6	85160	85165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690260
1594	NC_015067	GGC	2	6	85202	85207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690260
1595	NC_015067	CGG	2	6	86163	86168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690261
1596	NC_015067	CG	3	6	86201	86206	0 %	0 %	50 %	50 %	322690261
1597	NC_015067	CAA	2	6	86290	86295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690261
1598	NC_015067	TCA	2	6	86313	86318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690261
1599	NC_015067	AAG	2	6	86432	86437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690261
1600	NC_015067	GAGGCC	2	12	86477	86488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322690261
1601	NC_015067	GCC	3	9	86486	86494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690261
1602	NC_015067	GAA	2	6	86524	86529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690261
1603	NC_015067	CGA	2	6	86566	86571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690261
1604	NC_015067	CGC	2	6	86607	86612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690261
1605	NC_015067	ATC	2	6	86621	86626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690261
1606	NC_015067	GACCA	2	10	86636	86645	40 %	0 %	20 %	40 %	322690261
1607	NC_015067	ACC	2	6	86663	86668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690261
1608	NC_015067	CCA	2	6	86673	86678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690261
1609	NC_015067	CGA	2	6	86761	86766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690261
1610	NC_015067	CAA	2	6	86773	86778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690261
1611	NC_015067	GCT	2	6	86779	86784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690261
1612	NC_015067	GCC	2	6	86798	86803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690261
1613	NC_015067	GTG	2	6	86849	86854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690261
1614	NC_015067	GAAG	2	8	86923	86930	50 %	0 %	50 %	0 %	322690261
1615	NC_015067	GCC	2	6	86948	86953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690261
1616	NC_015067	CAG	2	6	87011	87016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690261
1617	NC_015067	TGA	2	6	87422	87427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690262
1618	NC_015067	GAT	2	6	87454	87459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690262
1619	NC_015067	ACA	2	6	87488	87493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690262
1620	NC_015067	ATG	2	6	87520	87525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690262
1621	NC_015067	ACG	2	6	87557	87562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690262
1622	NC_015067	AAG	2	6	87586	87591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690262
1623	NC_015067	CAA	2	6	87612	87617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690262
1624	NC_015067	CACCGG	2	12	88264	88275	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322690263
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1991	NC_015067	GTC	2	6	107215	107220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690275
1992	NC_015067	AAC	2	6	107273	107278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690275
1993	NC_015067	AATGGC	2	12	107309	107320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322690275
1994	NC_015067	GGC	2	6	107330	107335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690275
1995	NC_015067	CGG	3	9	107344	107352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690275
1996	NC_015067	ATG	2	6	107789	107794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690276
1997	NC_015067	TCA	2	6	107802	107807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690276
1998	NC_015067	TTC	2	6	107810	107815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690276
1999	NC_015067	GTC	3	9	107858	107866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690276
2000	NC_015067	CGC	2	6	107869	107874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690276

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