MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015067	CAT	2	6	57716	57721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690237
1002	NC_015067	TTC	2	6	57743	57748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690237
1003	NC_015067	ATG	2	6	58338	58343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690238
1004	NC_015067	GTT	2	6	58428	58433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690238
1005	NC_015067	CTG	2	6	58447	58452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1006	NC_015067	CGA	2	6	58516	58521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1007	NC_015067	GCC	2	6	58560	58565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1008	NC_015067	CGA	2	6	58574	58579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1009	NC_015067	ACC	2	6	58581	58586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690238
1010	NC_015067	TCA	2	6	58678	58683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690238
1011	NC_015067	CCG	3	9	58693	58701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1012	NC_015067	GCGCC	2	10	58736	58745	0 %	0 %	40 %	60 %	322690238
1013	NC_015067	GTG	2	6	58773	58778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690238
1014	NC_015067	CGA	3	9	58808	58816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1015	NC_015067	CCG	2	6	58906	58911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1016	NC_015067	GCT	2	6	59007	59012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1017	NC_015067	CTG	2	6	59028	59033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1018	NC_015067	CGC	2	6	59051	59056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1019	NC_015067	GTG	2	6	59067	59072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690238
1020	NC_015067	CGGC	2	8	59128	59135	0 %	0 %	50 %	50 %	322690238
1021	NC_015067	GCC	2	6	59184	59189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1022	NC_015067	CGGA	2	8	59269	59276	25 %	0 %	50 %	25 %	322690238
1023	NC_015067	CGC	2	6	59356	59361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1024	NC_015067	TGCC	2	8	59411	59418	0 %	25 %	25 %	50 %	322690238
1025	NC_015067	CGA	2	6	59429	59434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1026	NC_015067	CGC	2	6	59462	59467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1027	NC_015067	CACG	2	8	59468	59475	25 %	0 %	25 %	50 %	322690238
1028	NC_015067	GATC	2	8	59482	59489	25 %	25 %	25 %	25 %	322690238
1029	NC_015067	GCA	2	6	59564	59569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1030	NC_015067	TCA	2	6	59590	59595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690238
1031	NC_015067	CGGC	2	8	59614	59621	0 %	0 %	50 %	50 %	322690238
1032	NC_015067	ACG	2	6	59647	59652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1033	NC_015067	TGGC	2	8	59706	59713	0 %	25 %	50 %	25 %	322690238
1034	NC_015067	CCG	3	9	59719	59727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1035	NC_015067	CGC	2	6	59879	59884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690238
1036	NC_015067	GC	3	6	59903	59908	0 %	0 %	50 %	50 %	322690238
1037	NC_015067	CGT	2	6	59921	59926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690238
1038	NC_015067	CGTA	2	8	59949	59956	25 %	25 %	25 %	25 %	322690238
1039	NC_015067	GC	3	6	60199	60204	0 %	0 %	50 %	50 %	322690239
1040	NC_015067	TTG	2	6	60205	60210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690239
1041	NC_015067	CGT	2	6	60212	60217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690239
1042	NC_015067	CGGCG	2	10	60257	60266	0 %	0 %	60 %	40 %	322690239
1043	NC_015067	GC	3	6	60320	60325	0 %	0 %	50 %	50 %	322690239
1044	NC_015067	CGG	2	6	60386	60391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690239
1045	NC_015067	CAG	2	6	60396	60401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690239
1046	NC_015067	GCGG	2	8	60413	60420	0 %	0 %	75 %	25 %	322690239
1047	NC_015067	GCG	2	6	60441	60446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690239
1048	NC_015067	TCGG	2	8	60454	60461	0 %	25 %	50 %	25 %	322690239
1049	NC_015067	CTT	2	6	60465	60470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690239
1050	NC_015067	CGG	2	6	60491	60496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690239
1051	NC_015067	ATG	2	6	60508	60513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690239
1052	NC_015067	CAGA	2	8	60572	60579	50 %	0 %	25 %	25 %	322690239
1053	NC_015067	GGC	2	6	60582	60587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690239
1054	NC_015067	TTC	2	6	60607	60612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690239
1055	NC_015067	CGG	2	6	60634	60639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690239
1056	NC_015067	AGA	2	6	60707	60712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690239
1057	NC_015067	AGC	2	6	60745	60750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690239
1058	NC_015067	GCA	2	6	60842	60847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690239
1059	NC_015067	CGGC	2	8	60860	60867	0 %	0 %	50 %	50 %	322690239
1060	NC_015067	CGG	2	6	60869	60874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690239
1061	NC_015067	CAT	2	6	60885	60890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690239
1062	NC_015067	CGG	2	6	60911	60916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690239
1063	NC_015067	GGT	2	6	60963	60968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690239
1064	NC_015067	CGGT	2	8	60973	60980	0 %	25 %	50 %	25 %	322690239
1065	NC_015067	GAT	3	9	60999	61007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690239
1066	NC_015067	CGC	2	6	61019	61024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690239
1067	NC_015067	AGT	2	6	61061	61066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690239
1068	NC_015067	GCCG	2	8	61079	61086	0 %	0 %	50 %	50 %	322690239
1069	NC_015067	GAC	2	6	61117	61122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690239
1070	NC_015067	CTCAT	2	10	61186	61195	20 %	40 %	0 %	40 %	322690239
1071	NC_015067	TGCC	2	8	61196	61203	0 %	25 %	25 %	50 %	322690239
1072	NC_015067	TGC	2	6	61213	61218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690239
1073	NC_015067	TCG	2	6	61219	61224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690239
1074	NC_015067	CAG	2	6	61390	61395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690240
1075	NC_015067	ACC	2	6	61423	61428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690240
1076	NC_015067	GAGC	2	8	61461	61468	25 %	0 %	50 %	25 %	322690240
1077	NC_015067	GCT	2	6	61543	61548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690240
1078	NC_015067	GCC	2	6	61567	61572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690240
1079	NC_015067	AGG	2	6	61592	61597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690240
1080	NC_015067	CGA	2	6	61605	61610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690240
1081	NC_015067	GCC	2	6	61633	61638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690240
1082	NC_015067	GCG	2	6	61652	61657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690240
1083	NC_015067	AAG	2	6	61741	61746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690240
1084	NC_015067	GCA	2	6	61866	61871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690241
1085	NC_015067	GTC	2	6	61882	61887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690241
1086	NC_015067	CGG	2	6	61993	61998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690241
1087	NC_015067	C	6	6	62046	62051	0 %	0 %	0 %	100 %	322690241
1088	NC_015067	GC	3	6	62087	62092	0 %	0 %	50 %	50 %	322690241
1089	NC_015067	CAG	2	6	62098	62103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690241
1090	NC_015067	GT	3	6	62175	62180	0 %	50 %	50 %	0 %	322690241
1091	NC_015067	CAT	2	6	62272	62277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690241
1092	NC_015067	CACCG	2	10	62496	62505	20 %	0 %	20 %	60 %	322690242
1093	NC_015067	CGG	2	6	62519	62524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690242
1094	NC_015067	CGA	2	6	62535	62540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1095	NC_015067	AAC	2	6	62549	62554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690242
1096	NC_015067	CAC	2	6	62574	62579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690242
1097	NC_015067	CTG	2	6	62594	62599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1098	NC_015067	CGC	2	6	62610	62615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690242
1099	NC_015067	ACC	2	6	62633	62638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690242
1100	NC_015067	AGC	2	6	62729	62734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1101	NC_015067	GCT	2	6	62745	62750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1102	NC_015067	CGT	2	6	62814	62819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1103	NC_015067	CGG	2	6	62850	62855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690242
1104	NC_015067	GCC	2	6	62869	62874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690242
1105	NC_015067	CTCGC	2	10	62890	62899	0 %	20 %	20 %	60 %	322690242
1106	NC_015067	ACT	2	6	62993	62998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690242
1107	NC_015067	CGG	2	6	63060	63065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690242
1108	NC_015067	GTC	2	6	63070	63075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1109	NC_015067	GC	3	6	63120	63125	0 %	0 %	50 %	50 %	322690242
1110	NC_015067	ACG	2	6	63203	63208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1111	NC_015067	CCA	2	6	63308	63313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690242
1112	NC_015067	AGC	2	6	63338	63343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1113	NC_015067	CTT	2	6	63348	63353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690242
1114	NC_015067	ACG	2	6	63371	63376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1115	NC_015067	TCT	2	6	63386	63391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690242
1116	NC_015067	GAC	2	6	63417	63422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1117	NC_015067	ACCC	2	8	63457	63464	25 %	0 %	0 %	75 %	322690242
1118	NC_015067	CAC	2	6	63540	63545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690242
1119	NC_015067	CTG	2	6	63574	63579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1120	NC_015067	GGCC	2	8	63599	63606	0 %	0 %	50 %	50 %	322690242
1121	NC_015067	GCT	2	6	63621	63626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690242
1122	NC_015067	ATC	2	6	63643	63648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690242
1123	NC_015067	CGG	2	6	63768	63773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690242
1124	NC_015067	TCA	2	6	63932	63937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690242
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1231	NC_015067	TGC	2	6	69425	69430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690248
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1245	NC_015067	GCGT	2	8	70078	70085	0 %	25 %	50 %	25 %	322690249
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1487	NC_015067	CAC	2	6	80806	80811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690257
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1491	NC_015067	GAGC	2	8	80923	80930	25 %	0 %	50 %	25 %	322690257
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1494	NC_015067	CTC	2	6	81001	81006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690257
1495	NC_015067	CCG	2	6	81039	81044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690257
1496	NC_015067	CGG	2	6	81080	81085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690257
1497	NC_015067	GCACCA	2	12	81090	81101	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322690257
1498	NC_015067	CGG	2	6	81129	81134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690257
1499	NC_015067	GC	4	8	81258	81265	0 %	0 %	50 %	50 %	322690257
1500	NC_015067	GCG	2	6	81271	81276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690257

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