MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015067	GCC	2	6	28636	28641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690217
502	NC_015067	TGA	2	6	28679	28684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690217
503	NC_015067	CGT	2	6	28740	28745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690217
504	NC_015067	TGC	2	6	28754	28759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690217
505	NC_015067	CAG	2	6	28763	28768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690217
506	NC_015067	CAT	2	6	28887	28892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690217
507	NC_015067	TCA	2	6	29001	29006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690217
508	NC_015067	AAT	2	6	29036	29041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690217
509	NC_015067	TGA	2	6	29112	29117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690217
510	NC_015067	CAG	2	6	29152	29157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690217
511	NC_015067	GCA	2	6	29214	29219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690217
512	NC_015067	GAT	2	6	29515	29520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690218
513	NC_015067	GTC	2	6	29569	29574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690218
514	NC_015067	CGT	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690218
515	NC_015067	CTC	2	6	29617	29622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690218
516	NC_015067	GCC	2	6	29701	29706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690218
517	NC_015067	CGG	2	6	29724	29729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690218
518	NC_015067	TCG	2	6	29732	29737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690218
519	NC_015067	GTGC	2	8	29817	29824	0 %	25 %	50 %	25 %	322690218
520	NC_015067	CCT	2	6	29841	29846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690218
521	NC_015067	GATGGC	2	12	29872	29883	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322690218
522	NC_015067	TCA	2	6	29900	29905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690218
523	NC_015067	CAA	2	6	29916	29921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690218
524	NC_015067	TCG	2	6	30041	30046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690219
525	NC_015067	CGGC	2	8	30057	30064	0 %	0 %	50 %	50 %	322690219
526	NC_015067	GCG	2	6	30066	30071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690219
527	NC_015067	GCG	2	6	30115	30120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690219
528	NC_015067	GAC	2	6	30136	30141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690219
529	NC_015067	TGT	2	6	30144	30149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690219
530	NC_015067	CGT	2	6	30153	30158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690219
531	NC_015067	GCA	2	6	30165	30170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690219
532	NC_015067	AAG	2	6	30206	30211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690219
533	NC_015067	TCC	2	6	30239	30244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690219
534	NC_015067	TGG	2	6	30327	30332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690219
535	NC_015067	CGC	2	6	30339	30344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690219
536	NC_015067	CTC	2	6	30391	30396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690219
537	NC_015067	CCGT	2	8	30422	30429	0 %	25 %	25 %	50 %	322690219
538	NC_015067	GCC	2	6	30430	30435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690219
539	NC_015067	TCG	2	6	30440	30445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690219
540	NC_015067	GATG	2	8	30459	30466	25 %	25 %	50 %	0 %	322690219
541	NC_015067	GCA	2	6	30477	30482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690219
542	NC_015067	GCA	2	6	30495	30500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690219
543	NC_015067	CAC	2	6	30535	30540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690219
544	NC_015067	CAG	2	6	30577	30582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690219
545	NC_015067	CGT	2	6	30609	30614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690219
546	NC_015067	CGG	2	6	30669	30674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690219
547	NC_015067	CGA	2	6	30738	30743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690219
548	NC_015067	TCG	3	9	30830	30838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690219
549	NC_015067	CTG	2	6	30856	30861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690219
550	NC_015067	GAT	2	6	30916	30921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690219
551	NC_015067	GGC	2	6	30924	30929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690219
552	NC_015067	CGG	2	6	30933	30938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690219
553	NC_015067	CAC	2	6	30958	30963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690219
554	NC_015067	GC	4	8	30965	30972	0 %	0 %	50 %	50 %	322690219
555	NC_015067	GAT	2	6	31042	31047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690219
556	NC_015067	GAT	2	6	31057	31062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690219
557	NC_015067	GCC	2	6	31072	31077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690219
558	NC_015067	CCG	2	6	31110	31115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690219
559	NC_015067	TCC	2	6	31250	31255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690219
560	NC_015067	AG	3	6	31286	31291	50 %	0 %	50 %	0 %	322690219
561	NC_015067	AGG	2	6	31349	31354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690219
562	NC_015067	CGA	2	6	31684	31689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690220
563	NC_015067	GCG	2	6	31704	31709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690220
564	NC_015067	CTG	2	6	31715	31720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690220
565	NC_015067	CCA	2	6	31738	31743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690220
566	NC_015067	AAT	2	6	31751	31756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690220
567	NC_015067	CG	3	6	31807	31812	0 %	0 %	50 %	50 %	322690220
568	NC_015067	AAT	2	6	31844	31849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690220
569	NC_015067	CGG	3	9	31855	31863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690220
570	NC_015067	TCG	2	6	31872	31877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690220
571	NC_015067	GTC	2	6	31880	31885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690220
572	NC_015067	GTC	2	6	31943	31948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690220
573	NC_015067	CGG	2	6	31960	31965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690220
574	NC_015067	CA	3	6	31997	32002	50 %	0 %	0 %	50 %	322690220
575	NC_015067	CGG	2	6	32074	32079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690220
576	NC_015067	CG	3	6	32134	32139	0 %	0 %	50 %	50 %	322690220
577	NC_015067	ATGG	2	8	32215	32222	25 %	25 %	50 %	0 %	322690220
578	NC_015067	GCA	2	6	32257	32262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690220
579	NC_015067	GAT	2	6	32519	32524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690221
580	NC_015067	GCA	2	6	32534	32539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690221
581	NC_015067	TTC	3	9	32628	32636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690221
582	NC_015067	ACG	2	6	32770	32775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690221
583	NC_015067	CCGAC	2	10	32815	32824	20 %	0 %	20 %	60 %	322690221
584	NC_015067	CTG	2	6	32829	32834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690221
585	NC_015067	TCC	2	6	32934	32939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690221
586	NC_015067	GAG	2	6	32958	32963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690221
587	NC_015067	CTG	2	6	32964	32969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690221
588	NC_015067	CGC	2	6	32970	32975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690221
589	NC_015067	TCG	2	6	33070	33075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690221
590	NC_015067	CAA	2	6	33266	33271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690222
591	NC_015067	CGT	3	9	33281	33289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690222
592	NC_015067	TGG	2	6	33293	33298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690222
593	NC_015067	CGGC	2	8	33316	33323	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
594	NC_015067	CGCT	2	8	33338	33345	0 %	25 %	25 %	50 %	322690222
595	NC_015067	GAT	2	6	33369	33374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690222
596	NC_015067	CGG	2	6	33377	33382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690222
597	NC_015067	ATCACC	2	12	33387	33398	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322690222
598	NC_015067	GTC	2	6	33405	33410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690222
599	NC_015067	CAC	2	6	33431	33436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690222
600	NC_015067	CG	3	6	33441	33446	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
601	NC_015067	CAG	2	6	33465	33470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690222
602	NC_015067	CCG	2	6	33499	33504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
603	NC_015067	GCCG	2	8	33639	33646	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
604	NC_015067	TTC	2	6	33681	33686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690222
605	NC_015067	TGG	2	6	33703	33708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690222
606	NC_015067	CGG	3	9	33710	33718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690222
607	NC_015067	CGC	2	6	33722	33727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
608	NC_015067	GCC	2	6	33816	33821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
609	NC_015067	AAC	2	6	33831	33836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690222
610	NC_015067	CCG	2	6	33880	33885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
611	NC_015067	AGG	2	6	33890	33895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690222
612	NC_015067	CCG	2	6	33952	33957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
613	NC_015067	GCG	2	6	34018	34023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690222
614	NC_015067	TGG	2	6	34024	34029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690222
615	NC_015067	CGA	2	6	34034	34039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690222
616	NC_015067	CACG	2	8	34055	34062	25 %	0 %	25 %	50 %	322690222
617	NC_015067	CGGC	2	8	34096	34103	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
618	NC_015067	GGT	2	6	34130	34135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690222
619	NC_015067	CACCGC	2	12	34136	34147	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322690222
620	NC_015067	GCC	2	6	34161	34166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
621	NC_015067	GCC	2	6	34217	34222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
622	NC_015067	GAG	2	6	34245	34250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690222
623	NC_015067	GCC	2	6	34263	34268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
624	NC_015067	CCG	2	6	34270	34275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690222
625	NC_015067	ACG	2	6	34290	34295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690222
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752	NC_015067	CTG	2	6	41671	41676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690227
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1000	NC_015067	TCG	2	6	57710	57715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690237

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