MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015067	TGG	2	6	309215	309220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690428
6002	NC_015067	GAG	2	6	309253	309258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690428
6003	NC_015067	CGC	2	6	309352	309357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690428
6004	NC_015067	GAG	2	6	309358	309363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690428
6005	NC_015067	TCA	2	6	309365	309370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690428
6006	NC_015067	CTG	2	6	309412	309417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690428
6007	NC_015067	GGC	2	6	309418	309423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690428
6008	NC_015067	AAG	2	6	309466	309471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690428
6009	NC_015067	CCA	2	6	309476	309481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690428
6010	NC_015067	CGC	2	6	309495	309500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690428
6011	NC_015067	GCA	2	6	309507	309512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690428
6012	NC_015067	AT	3	6	309683	309688	50 %	50 %	0 %	0 %	322690429
6013	NC_015067	GTG	2	6	309735	309740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690429
6014	NC_015067	GCCA	2	8	309764	309771	25 %	0 %	25 %	50 %	322690429
6015	NC_015067	AGC	2	6	309866	309871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690430
6016	NC_015067	ACC	2	6	309884	309889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690430
6017	NC_015067	GGC	3	9	309904	309912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690430
6018	NC_015067	GC	3	6	309938	309943	0 %	0 %	50 %	50 %	322690430
6019	NC_015067	CGG	2	6	309981	309986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690430
6020	NC_015067	AAG	2	6	310178	310183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690430
6021	NC_015067	CCA	2	6	310186	310191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690430
6022	NC_015067	GGT	2	6	310208	310213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690430
6023	NC_015067	AGATG	2	10	310363	310372	40 %	20 %	40 %	0 %	322690431
6024	NC_015067	CGG	2	6	310418	310423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690431
6025	NC_015067	GCG	2	6	310543	310548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690431
6026	NC_015067	CCG	2	6	310651	310656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
6027	NC_015067	GAT	2	6	310833	310838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690431
6028	NC_015067	CGC	2	6	310892	310897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
6029	NC_015067	GCT	2	6	310930	310935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6030	NC_015067	CAG	2	6	310997	311002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6031	NC_015067	TGC	2	6	311036	311041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6032	NC_015067	TGC	2	6	311045	311050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6033	NC_015067	CTG	2	6	311059	311064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6034	NC_015067	GCC	2	6	311097	311102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
6035	NC_015067	AACAGC	2	12	311140	311151	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	322690431
6036	NC_015067	AGC	2	6	311158	311163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6037	NC_015067	AACG	2	8	311181	311188	50 %	0 %	25 %	25 %	322690431
6038	NC_015067	CGGC	2	8	311335	311342	0 %	0 %	50 %	50 %	322690431
6039	NC_015067	AAC	2	6	311400	311405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690431
6040	NC_015067	CGC	2	6	311460	311465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
6041	NC_015067	CAG	2	6	311469	311474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6042	NC_015067	CAC	2	6	311480	311485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690431
6043	NC_015067	TGG	2	6	311491	311496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690431
6044	NC_015067	TGATC	2	10	311498	311507	20 %	40 %	20 %	20 %	322690431
6045	NC_015067	GGA	2	6	311519	311524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690431
6046	NC_015067	CCG	2	6	311572	311577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
6047	NC_015067	CGG	2	6	311639	311644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690431
6048	NC_015067	AGCCA	2	10	311673	311682	40 %	0 %	20 %	40 %	322690431
6049	NC_015067	GGC	2	6	311829	311834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690431
6050	NC_015067	GTGATG	2	12	311854	311865	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322690431
6051	NC_015067	TCGCAA	2	12	311931	311942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322690431
6052	NC_015067	CAAGC	2	10	311970	311979	40 %	0 %	20 %	40 %	322690431
6053	NC_015067	GCC	2	6	311991	311996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
6054	NC_015067	CAG	3	9	312021	312029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6055	NC_015067	GCA	2	6	312032	312037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6056	NC_015067	CCATGT	2	12	312064	312075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322690431
6057	NC_015067	CTG	2	6	312076	312081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6058	NC_015067	TGA	2	6	312088	312093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690431
6059	NC_015067	GGT	2	6	312102	312107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690431
6060	NC_015067	GGT	3	9	312123	312131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690431
6061	NC_015067	GAAC	2	8	312166	312173	50 %	0 %	25 %	25 %	322690431
6062	NC_015067	CGGCAA	2	12	312206	312217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690431
6063	NC_015067	CAA	2	6	312242	312247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690431
6064	NC_015067	GGC	2	6	312285	312290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690431
6065	NC_015067	CAA	2	6	312399	312404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690431
6066	NC_015067	A	6	6	312403	312408	100 %	0 %	0 %	0 %	322690431
6067	NC_015067	CCG	2	6	312409	312414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690431
6068	NC_015067	CTT	2	6	312687	312692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690432
6069	NC_015067	GGC	2	6	312697	312702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6070	NC_015067	CGG	3	9	312752	312760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6071	NC_015067	CCA	2	6	312779	312784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
6072	NC_015067	GGC	2	6	312831	312836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6073	NC_015067	AGC	2	6	312861	312866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6074	NC_015067	GCT	2	6	312932	312937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6075	NC_015067	CAG	2	6	312960	312965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6076	NC_015067	GGC	2	6	312984	312989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6077	NC_015067	GGC	2	6	313017	313022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6078	NC_015067	CGGAAC	2	12	313031	313042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6079	NC_015067	CAG	2	6	313095	313100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6080	NC_015067	CCCAGA	2	12	313120	313131	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322690432
6081	NC_015067	GCGG	2	8	313137	313144	0 %	0 %	75 %	25 %	322690432
6082	NC_015067	GTC	2	6	313224	313229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
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6085	NC_015067	CGG	2	6	313385	313390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6086	NC_015067	TGG	2	6	313442	313447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690432
6087	NC_015067	CAG	2	6	313452	313457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6088	NC_015067	GCG	3	9	313525	313533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6089	NC_015067	CAC	2	6	313584	313589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
6090	NC_015067	TCT	2	6	313613	313618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690432
6091	NC_015067	GGCA	2	8	313666	313673	25 %	0 %	50 %	25 %	322690432
6092	NC_015067	GC	3	6	313688	313693	0 %	0 %	50 %	50 %	322690432
6093	NC_015067	GAT	2	6	313722	313727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690432
6094	NC_015067	ATG	2	6	313852	313857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690432
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6096	NC_015067	ACC	2	6	313875	313880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
6097	NC_015067	TCG	2	6	313900	313905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6098	NC_015067	GGTCG	2	10	313926	313935	0 %	20 %	60 %	20 %	322690432
6099	NC_015067	CGGA	2	8	313952	313959	25 %	0 %	50 %	25 %	322690432
6100	NC_015067	GAA	2	6	314028	314033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690432
6101	NC_015067	ACGC	2	8	314088	314095	25 %	0 %	25 %	50 %	322690432
6102	NC_015067	CCG	2	6	314167	314172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690432
6103	NC_015067	TTC	2	6	314173	314178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690432
6104	NC_015067	GGTCGG	2	12	314250	314261	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322690432
6105	NC_015067	CGA	2	6	314297	314302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6106	NC_015067	GCGG	2	8	314310	314317	0 %	0 %	75 %	25 %	322690432
6107	NC_015067	CGGC	2	8	314356	314363	0 %	0 %	50 %	50 %	322690432
6108	NC_015067	GAT	2	6	314415	314420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690432
6109	NC_015067	CGGG	2	8	314421	314428	0 %	0 %	75 %	25 %	322690432
6110	NC_015067	CCA	2	6	314448	314453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690432
6111	NC_015067	CGG	2	6	314516	314521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6112	NC_015067	ACCTTG	2	12	314542	314553	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322690432
6113	NC_015067	TCG	2	6	314599	314604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
6114	NC_015067	GCC	2	6	314632	314637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690432
6115	NC_015067	GGT	2	6	314652	314657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690432
6116	NC_015067	CG	3	6	314723	314728	0 %	0 %	50 %	50 %	322690432
6117	NC_015067	CGG	2	6	314750	314755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
6118	NC_015067	CTG	2	6	314790	314795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690432
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6120	NC_015067	CGG	2	6	315033	315038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690432
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6241	NC_015067	CGA	2	6	321523	321528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690439
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6353	NC_015067	CAT	2	6	328130	328135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690442
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6481	NC_015067	CGA	2	6	334433	334438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690448
6482	NC_015067	A	6	6	334494	334499	100 %	0 %	0 %	0 %	322690449
6483	NC_015067	TCG	2	6	334518	334523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690449
6484	NC_015067	ACC	2	6	334530	334535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690449
6485	NC_015067	TG	3	6	334537	334542	0 %	50 %	50 %	0 %	322690449
6486	NC_015067	GGCGA	2	10	334547	334556	20 %	0 %	60 %	20 %	322690449
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