MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015067	CCT	2	6	286308	286313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690408
5502	NC_015067	ATT	2	6	286360	286365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690408
5503	NC_015067	GC	3	6	286381	286386	0 %	0 %	50 %	50 %	322690408
5504	NC_015067	CAG	2	6	286429	286434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690408
5505	NC_015067	GC	3	6	286436	286441	0 %	0 %	50 %	50 %	322690408
5506	NC_015067	GGA	2	6	286495	286500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690408
5507	NC_015067	GGC	2	6	286504	286509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690408
5508	NC_015067	CGG	2	6	286545	286550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690408
5509	NC_015067	GAT	2	6	286609	286614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690408
5510	NC_015067	TCT	2	6	286623	286628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690408
5511	NC_015067	TCAT	2	8	286634	286641	25 %	50 %	0 %	25 %	322690408
5512	NC_015067	GGT	2	6	286642	286647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690408
5513	NC_015067	GAA	2	6	286961	286966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690409
5514	NC_015067	AAGG	2	8	286998	287005	50 %	0 %	50 %	0 %	322690409
5515	NC_015067	CGT	2	6	287084	287089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690409
5516	NC_015067	CCG	2	6	287101	287106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690409
5517	NC_015067	TTC	2	6	287173	287178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690409
5518	NC_015067	TCA	2	6	287262	287267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690410
5519	NC_015067	ACCA	2	8	287375	287382	50 %	0 %	0 %	50 %	322690410
5520	NC_015067	GAA	2	6	287458	287463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690410
5521	NC_015067	CAG	2	6	287495	287500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690410
5522	NC_015067	CGT	2	6	287536	287541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690410
5523	NC_015067	CCCT	2	8	287567	287574	0 %	25 %	0 %	75 %	322690410
5524	NC_015067	GTC	2	6	287605	287610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690410
5525	NC_015067	GGC	2	6	287618	287623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690410
5526	NC_015067	GGT	2	6	287639	287644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690410
5527	NC_015067	CAG	2	6	287657	287662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690410
5528	NC_015067	GGT	2	6	287696	287701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690410
5529	NC_015067	GTG	2	6	287742	287747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690410
5530	NC_015067	CAG	2	6	287762	287767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690410
5531	NC_015067	TCC	2	6	287861	287866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690410
5532	NC_015067	CGG	2	6	287872	287877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690410
5533	NC_015067	CGA	2	6	287878	287883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690410
5534	NC_015067	CAT	2	6	287959	287964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690411
5535	NC_015067	CCG	2	6	287984	287989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690411
5536	NC_015067	AAG	3	9	288002	288010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690411
5537	NC_015067	GCC	2	6	288026	288031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690411
5538	NC_015067	GCT	2	6	288064	288069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690411
5539	NC_015067	CGT	2	6	288107	288112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690411
5540	NC_015067	AGC	2	6	288135	288140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690411
5541	NC_015067	CTG	2	6	288182	288187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690411
5542	NC_015067	TCG	2	6	288379	288384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690412
5543	NC_015067	GC	3	6	288392	288397	0 %	0 %	50 %	50 %	322690412
5544	NC_015067	CGC	2	6	288437	288442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690412
5545	NC_015067	GCC	2	6	288447	288452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690412
5546	NC_015067	CGC	2	6	288476	288481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690412
5547	NC_015067	GGT	2	6	288510	288515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690412
5548	NC_015067	ACC	2	6	288597	288602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690412
5549	NC_015067	CTTC	2	8	288646	288653	0 %	50 %	0 %	50 %	322690412
5550	NC_015067	GAGT	2	8	288672	288679	25 %	25 %	50 %	0 %	322690412
5551	NC_015067	CGCC	2	8	289111	289118	0 %	0 %	25 %	75 %	322690413
5552	NC_015067	GGTT	2	8	289128	289135	0 %	50 %	50 %	0 %	322690413
5553	NC_015067	CAA	2	6	289232	289237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690413
5554	NC_015067	GCT	2	6	289283	289288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690413
5555	NC_015067	CGC	2	6	289386	289391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690414
5556	NC_015067	CGC	2	6	289411	289416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690414
5557	NC_015067	CGA	2	6	289422	289427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690414
5558	NC_015067	CG	3	6	289453	289458	0 %	0 %	50 %	50 %	322690414
5559	NC_015067	GCTCA	2	10	289477	289486	20 %	20 %	20 %	40 %	322690414
5560	NC_015067	CGC	2	6	289506	289511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690414
5561	NC_015067	GCC	2	6	289642	289647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690414
5562	NC_015067	CGC	2	6	289656	289661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690414
5563	NC_015067	CGC	2	6	289726	289731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690414
5564	NC_015067	TGA	2	6	289733	289738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690414
5565	NC_015067	TGC	2	6	289742	289747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690414
5566	NC_015067	CAT	2	6	289848	289853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690414
5567	NC_015067	GC	3	6	289960	289965	0 %	0 %	50 %	50 %	322690414
5568	NC_015067	GAT	2	6	290017	290022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690414
5569	NC_015067	GCGGT	2	10	290051	290060	0 %	20 %	60 %	20 %	322690414
5570	NC_015067	TCG	2	6	290063	290068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690414
5571	NC_015067	GAG	2	6	290119	290124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690414
5572	NC_015067	CCT	2	6	290133	290138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690414
5573	NC_015067	GCC	2	6	290224	290229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690414
5574	NC_015067	CCGA	2	8	290302	290309	25 %	0 %	25 %	50 %	322690414
5575	NC_015067	TCA	2	6	290366	290371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690414
5576	NC_015067	ACT	2	6	290408	290413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690414
5577	NC_015067	CCCG	2	8	290474	290481	0 %	0 %	25 %	75 %	322690414
5578	NC_015067	ATT	2	6	290508	290513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690414
5579	NC_015067	GC	3	6	290514	290519	0 %	0 %	50 %	50 %	322690414
5580	NC_015067	TGC	2	6	290546	290551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690414
5581	NC_015067	AGG	2	6	290570	290575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690414
5582	NC_015067	GAA	2	6	290599	290604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690414
5583	NC_015067	GCG	2	6	290621	290626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690414
5584	NC_015067	CGA	2	6	290697	290702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690414
5585	NC_015067	GCC	2	6	290707	290712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690414
5586	NC_015067	TCT	2	6	290723	290728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690414
5587	NC_015067	TGC	2	6	290822	290827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690414
5588	NC_015067	GCG	2	6	290885	290890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690414
5589	NC_015067	CGA	2	6	290940	290945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690414
5590	NC_015067	CCA	2	6	290960	290965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690414
5591	NC_015067	CT	3	6	291247	291252	0 %	50 %	0 %	50 %	322690415
5592	NC_015067	GCC	2	6	291264	291269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690415
5593	NC_015067	TTC	2	6	291273	291278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690415
5594	NC_015067	TGA	2	6	291292	291297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690415
5595	NC_015067	CCA	2	6	291347	291352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690415
5596	NC_015067	GGCT	2	8	291357	291364	0 %	25 %	50 %	25 %	322690415
5597	NC_015067	GC	3	6	291430	291435	0 %	0 %	50 %	50 %	322690415
5598	NC_015067	TGC	2	6	291496	291501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690415
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5600	NC_015067	GCT	2	6	291518	291523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690415
5601	NC_015067	TAC	2	6	291561	291566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690415
5602	NC_015067	CAC	2	6	291617	291622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690415
5603	NC_015067	ACT	2	6	291646	291651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690415
5604	NC_015067	TGC	2	6	291699	291704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690415
5605	NC_015067	CGC	3	9	291734	291742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690415
5606	NC_015067	TCG	3	9	291748	291756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690415
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5608	NC_015067	CTG	2	6	291840	291845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690415
5609	NC_015067	CTC	2	6	291875	291880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690415
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5611	NC_015067	ACT	2	6	292054	292059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690416
5612	NC_015067	CGC	2	6	292108	292113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690416
5613	NC_015067	CG	3	6	292141	292146	0 %	0 %	50 %	50 %	322690416
5614	NC_015067	GTG	2	6	292223	292228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690416
5615	NC_015067	TTG	2	6	292260	292265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690416
5616	NC_015067	ATT	2	6	292271	292276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690416
5617	NC_015067	GTG	2	6	292311	292316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690416
5618	NC_015067	TCG	2	6	292320	292325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690416
5619	NC_015067	ATG	2	6	292326	292331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690416
5620	NC_015067	GGC	2	6	292379	292384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690416
5621	NC_015067	CCG	2	6	292420	292425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690416
5622	NC_015067	TGC	3	9	292426	292434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690416
5623	NC_015067	CGG	2	6	292441	292446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690416
5624	NC_015067	GCA	2	6	292455	292460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690416
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5649	NC_015067	GAT	2	6	293375	293380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690416
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5981	NC_015067	GCC	2	6	308372	308377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690428
5982	NC_015067	AGG	2	6	308390	308395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690428
5983	NC_015067	TCG	2	6	308417	308422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690428
5984	NC_015067	GCCCG	2	10	308466	308475	0 %	0 %	40 %	60 %	322690428
5985	NC_015067	ACG	2	6	308477	308482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690428
5986	NC_015067	AAG	2	6	308506	308511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690428
5987	NC_015067	CCG	2	6	308571	308576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690428
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5991	NC_015067	CGC	2	6	308841	308846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690428
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