MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 46371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015067	ACAAT	2	10	237357	237366	60 %	20 %	0 %	20 %	322690378
4502	NC_015067	GCA	2	6	237504	237509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690378
4503	NC_015067	TCG	2	6	237512	237517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690378
4504	NC_015067	CGG	2	6	237530	237535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690378
4505	NC_015067	CCT	2	6	237573	237578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690378
4506	NC_015067	CGC	2	6	237588	237593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690378
4507	NC_015067	CTA	2	6	237817	237822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690379
4508	NC_015067	GCG	2	6	237912	237917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690379
4509	NC_015067	CAG	2	6	237928	237933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4510	NC_015067	CGG	2	6	237939	237944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690379
4511	NC_015067	CGCA	2	8	237982	237989	25 %	0 %	25 %	50 %	322690379
4512	NC_015067	GACT	2	8	238023	238030	25 %	25 %	25 %	25 %	322690379
4513	NC_015067	CAC	2	6	238138	238143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690379
4514	NC_015067	GAA	2	6	238156	238161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690379
4515	NC_015067	GCCA	2	8	238178	238185	25 %	0 %	25 %	50 %	322690379
4516	NC_015067	ACA	2	6	238191	238196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690379
4517	NC_015067	CAG	2	6	238201	238206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4518	NC_015067	GCA	2	6	238266	238271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4519	NC_015067	GGT	2	6	238360	238365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690379
4520	NC_015067	CAC	2	6	238375	238380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690379
4521	NC_015067	CAG	2	6	238384	238389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4522	NC_015067	CCCA	2	8	238394	238401	25 %	0 %	0 %	75 %	322690379
4523	NC_015067	GCA	2	6	238407	238412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4524	NC_015067	CGA	2	6	238432	238437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4525	NC_015067	CGG	2	6	238605	238610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690379
4526	NC_015067	CGT	2	6	238671	238676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4527	NC_015067	GAC	2	6	238760	238765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4528	NC_015067	CGC	2	6	238903	238908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690379
4529	NC_015067	TGA	2	6	238965	238970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690379
4530	NC_015067	TCG	2	6	239066	239071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4531	NC_015067	GTG	2	6	239078	239083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690379
4532	NC_015067	CAT	2	6	239088	239093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690379
4533	NC_015067	GCT	2	6	239164	239169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4534	NC_015067	GGT	2	6	239182	239187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690379
4535	NC_015067	GCC	2	6	239242	239247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690379
4536	NC_015067	GGC	2	6	239254	239259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690379
4537	NC_015067	GCCG	2	8	239305	239312	0 %	0 %	50 %	50 %	322690379
4538	NC_015067	TG	3	6	239363	239368	0 %	50 %	50 %	0 %	322690379
4539	NC_015067	GTG	2	6	239489	239494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690379
4540	NC_015067	CCG	2	6	239502	239507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690379
4541	NC_015067	TTC	3	9	239552	239560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690379
4542	NC_015067	TGC	2	6	239588	239593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4543	NC_015067	CGT	2	6	239595	239600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690379
4544	NC_015067	GAA	2	6	239605	239610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690379
4545	NC_015067	TCA	2	6	239613	239618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690379
4546	NC_015067	GTA	2	6	239656	239661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690379
4547	NC_015067	GC	3	6	239729	239734	0 %	0 %	50 %	50 %	322690379
4548	NC_015067	CAC	2	6	239743	239748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690379
4549	NC_015067	TTC	2	6	239828	239833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690379
4550	NC_015067	ATC	2	6	239891	239896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690379
4551	NC_015067	GAT	3	9	239911	239919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690379
4552	NC_015067	CGTG	2	8	239983	239990	0 %	25 %	50 %	25 %	322690380
4553	NC_015067	CCTT	2	8	239995	240002	0 %	50 %	0 %	50 %	322690380
4554	NC_015067	CGG	2	6	240006	240011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690380
4555	NC_015067	GAT	2	6	240021	240026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690380
4556	NC_015067	GCG	2	6	240037	240042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690380
4557	NC_015067	CTT	2	6	240053	240058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690380
4558	NC_015067	CGG	2	6	240068	240073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690380
4559	NC_015067	TCG	2	6	240124	240129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4560	NC_015067	GGC	2	6	240152	240157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690380
4561	NC_015067	ATG	3	9	240199	240207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690380
4562	NC_015067	GCCA	2	8	240217	240224	25 %	0 %	25 %	50 %	322690380
4563	NC_015067	TGG	2	6	240251	240256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690380
4564	NC_015067	CGGC	2	8	240281	240288	0 %	0 %	50 %	50 %	322690380
4565	NC_015067	CAG	3	9	240315	240323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4566	NC_015067	GGC	2	6	240348	240353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690380
4567	NC_015067	TCG	2	6	240379	240384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4568	NC_015067	TGC	2	6	240396	240401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4569	NC_015067	CG	3	6	240481	240486	0 %	0 %	50 %	50 %	322690380
4570	NC_015067	CGT	2	6	240590	240595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4571	NC_015067	GCC	2	6	240600	240605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690380
4572	NC_015067	GCA	2	6	240644	240649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4573	NC_015067	GAA	2	6	240666	240671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690380
4574	NC_015067	CAT	2	6	240678	240683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690380
4575	NC_015067	GTG	2	6	240766	240771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690380
4576	NC_015067	TGA	2	6	240809	240814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690380
4577	NC_015067	CAGC	2	8	240899	240906	25 %	0 %	25 %	50 %	322690380
4578	NC_015067	TCG	2	6	240955	240960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4579	NC_015067	TCA	2	6	240967	240972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690380
4580	NC_015067	CCCA	2	8	241012	241019	25 %	0 %	0 %	75 %	322690380
4581	NC_015067	GTG	2	6	241030	241035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690380
4582	NC_015067	AGG	2	6	241061	241066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690380
4583	NC_015067	GGC	2	6	241128	241133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690380
4584	NC_015067	GTG	2	6	241270	241275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690380
4585	NC_015067	GCT	2	6	241279	241284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4586	NC_015067	TGAG	2	8	241322	241329	25 %	25 %	50 %	0 %	322690380
4587	NC_015067	TGC	2	6	241477	241482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4588	NC_015067	CGG	2	6	241490	241495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690380
4589	NC_015067	GTG	2	6	241519	241524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690380
4590	NC_015067	GAT	2	6	241641	241646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690380
4591	NC_015067	CCG	2	6	241673	241678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690380
4592	NC_015067	CTG	2	6	241698	241703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4593	NC_015067	GGC	2	6	241707	241712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690380
4594	NC_015067	TTGG	2	8	241743	241750	0 %	50 %	50 %	0 %	322690380
4595	NC_015067	TGC	2	6	241755	241760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
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4597	NC_015067	GC	3	6	241896	241901	0 %	0 %	50 %	50 %	322690380
4598	NC_015067	GTC	2	6	241902	241907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4599	NC_015067	GTGCG	2	10	241919	241928	0 %	20 %	60 %	20 %	322690380
4600	NC_015067	TGG	2	6	241955	241960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690380
4601	NC_015067	TGC	2	6	241976	241981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4602	NC_015067	GT	3	6	241982	241987	0 %	50 %	50 %	0 %	322690380
4603	NC_015067	TCG	2	6	241996	242001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4604	NC_015067	TGG	2	6	242036	242041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690380
4605	NC_015067	TGA	2	6	242078	242083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690380
4606	NC_015067	GCC	2	6	242226	242231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690380
4607	NC_015067	CAC	2	6	242235	242240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690380
4608	NC_015067	TCG	2	6	242251	242256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4609	NC_015067	ATG	3	9	242272	242280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690380
4610	NC_015067	CGT	2	6	242423	242428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690380
4611	NC_015067	TTG	2	6	242431	242436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690380
4612	NC_015067	CGA	2	6	242486	242491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690380
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4614	NC_015067	CGGC	2	8	242549	242556	0 %	0 %	50 %	50 %	322690380
4615	NC_015067	TGG	2	6	243052	243057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690381
4616	NC_015067	GAC	2	6	243069	243074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690381
4617	NC_015067	GC	3	6	243114	243119	0 %	0 %	50 %	50 %	322690381
4618	NC_015067	TGC	2	6	243136	243141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690381
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4620	NC_015067	CGATG	2	10	243224	243233	20 %	20 %	40 %	20 %	322690381
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4985	NC_015067	CAATCC	2	12	260092	260103	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322690393
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4989	NC_015067	CAG	2	6	260182	260187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690393
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4993	NC_015067	CGA	2	6	260301	260306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690393
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4997	NC_015067	GTA	2	6	260468	260473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690393
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