MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015052	A	6	6	4583	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	322688194
2	NC_015052	A	7	7	39987	39993	100 %	0 %	0 %	0 %	322688222
3	NC_015052	C	6	6	49004	49009	0 %	0 %	0 %	100 %	322688228
4	NC_015052	T	6	6	66663	66668	0 %	100 %	0 %	0 %	322688243
5	NC_015052	C	10	10	72795	72804	0 %	0 %	0 %	100 %	322688249
6	NC_015052	T	6	6	84042	84047	0 %	100 %	0 %	0 %	322688258
7	NC_015052	T	6	6	87603	87608	0 %	100 %	0 %	0 %	322688260
8	NC_015052	C	6	6	96424	96429	0 %	0 %	0 %	100 %	322688266
9	NC_015052	C	6	6	103279	103284	0 %	0 %	0 %	100 %	322688271
10	NC_015052	T	7	7	115873	115879	0 %	100 %	0 %	0 %	322688281
11	NC_015052	G	6	6	151606	151611	0 %	0 %	100 %	0 %	322688307
12	NC_015052	A	6	6	165068	165073	100 %	0 %	0 %	0 %	322688320
13	NC_015052	G	6	6	175119	175124	0 %	0 %	100 %	0 %	322688329
14	NC_015052	G	6	6	238550	238555	0 %	0 %	100 %	0 %	322688372
15	NC_015052	A	6	6	277339	277344	100 %	0 %	0 %	0 %	322688398
16	NC_015052	A	6	6	295086	295091	100 %	0 %	0 %	0 %	322688412
17	NC_015052	A	6	6	317177	317182	100 %	0 %	0 %	0 %	322688430
18	NC_015052	C	6	6	322798	322803	0 %	0 %	0 %	100 %	322688436
19	NC_015052	A	6	6	347441	347446	100 %	0 %	0 %	0 %	322688455
20	NC_015052	A	6	6	385536	385541	100 %	0 %	0 %	0 %	322688486
21	NC_015052	A	6	6	424352	424357	100 %	0 %	0 %	0 %	322688522
22	NC_015052	A	6	6	439438	439443	100 %	0 %	0 %	0 %	322688535
23	NC_015052	T	6	6	446975	446980	0 %	100 %	0 %	0 %	322688538
24	NC_015052	T	6	6	457125	457130	0 %	100 %	0 %	0 %	322688545
25	NC_015052	T	6	6	457203	457208	0 %	100 %	0 %	0 %	322688545
26	NC_015052	A	6	6	465273	465278	100 %	0 %	0 %	0 %	322688551
27	NC_015052	T	6	6	480682	480687	0 %	100 %	0 %	0 %	322688567
28	NC_015052	T	7	7	484831	484837	0 %	100 %	0 %	0 %	322688569
29	NC_015052	A	8	8	484868	484875	100 %	0 %	0 %	0 %	322688569
30	NC_015052	T	6	6	486608	486613	0 %	100 %	0 %	0 %	322688570
31	NC_015052	A	7	7	486849	486855	100 %	0 %	0 %	0 %	322688570
32	NC_015052	A	7	7	487457	487463	100 %	0 %	0 %	0 %	322688570
33	NC_015052	T	7	7	487470	487476	0 %	100 %	0 %	0 %	322688570
34	NC_015052	A	7	7	487576	487582	100 %	0 %	0 %	0 %	322688571
35	NC_015052	T	6	6	488041	488046	0 %	100 %	0 %	0 %	322688571
36	NC_015052	A	7	7	488258	488264	100 %	0 %	0 %	0 %	322688571
37	NC_015052	T	6	6	488474	488479	0 %	100 %	0 %	0 %	322688571
38	NC_015052	T	6	6	488615	488620	0 %	100 %	0 %	0 %	322688571
39	NC_015052	A	7	7	488888	488894	100 %	0 %	0 %	0 %	322688571
40	NC_015052	G	7	7	490576	490582	0 %	0 %	100 %	0 %	322688573
41	NC_015052	T	6	6	503515	503520	0 %	100 %	0 %	0 %	322688583
42	NC_015052	C	6	6	506259	506264	0 %	0 %	0 %	100 %	322688585
43	NC_015052	T	6	6	546894	546899	0 %	100 %	0 %	0 %	322688615
44	NC_015052	A	6	6	548043	548048	100 %	0 %	0 %	0 %	322688616
45	NC_015052	C	6	6	570046	570051	0 %	0 %	0 %	100 %	322688624
46	NC_015052	T	6	6	606298	606303	0 %	100 %	0 %	0 %	322688653
47	NC_015052	A	7	7	607701	607707	100 %	0 %	0 %	0 %	322688655
48	NC_015052	A	6	6	644346	644351	100 %	0 %	0 %	0 %	322688684
49	NC_015052	A	6	6	644805	644810	100 %	0 %	0 %	0 %	322688684
50	NC_015052	A	6	6	669494	669499	100 %	0 %	0 %	0 %	322688704
51	NC_015052	G	6	6	682117	682122	0 %	0 %	100 %	0 %	322688713
52	NC_015052	T	7	7	712095	712101	0 %	100 %	0 %	0 %	322688739
53	NC_015052	T	6	6	720950	720955	0 %	100 %	0 %	0 %	322688749
54	NC_015052	T	6	6	721013	721018	0 %	100 %	0 %	0 %	322688749
55	NC_015052	T	6	6	765842	765847	0 %	100 %	0 %	0 %	322688791
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57	NC_015052	A	6	6	776152	776157	100 %	0 %	0 %	0 %	322688798
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59	NC_015052	A	6	6	781232	781237	100 %	0 %	0 %	0 %	322688801
60	NC_015052	G	6	6	794642	794647	0 %	0 %	100 %	0 %	322688815
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62	NC_015052	A	6	6	816157	816162	100 %	0 %	0 %	0 %	322688833
63	NC_015052	A	6	6	821586	821591	100 %	0 %	0 %	0 %	322688838
64	NC_015052	T	7	7	862848	862854	0 %	100 %	0 %	0 %	322688873
65	NC_015052	A	6	6	889237	889242	100 %	0 %	0 %	0 %	322688893
66	NC_015052	A	6	6	923706	923711	100 %	0 %	0 %	0 %	322688920
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69	NC_015052	A	6	6	975153	975158	100 %	0 %	0 %	0 %	322688965
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71	NC_015052	A	6	6	1038490	1038495	100 %	0 %	0 %	0 %	322689023
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81	NC_015052	A	6	6	1160432	1160437	100 %	0 %	0 %	0 %	322689167
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84	NC_015052	A	6	6	1190432	1190437	100 %	0 %	0 %	0 %	322689200
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91	NC_015052	C	6	6	1244134	1244139	0 %	0 %	0 %	100 %	322689266
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132	NC_015052	A	6	6	1787747	1787752	100 %	0 %	0 %	0 %	322689710
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.