MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 35702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015052	GCC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688192
2	NC_015052	GTT	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688192
3	NC_015052	ACA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688192
4	NC_015052	CAG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688192
5	NC_015052	CGG	2	6	810	815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688192
6	NC_015052	TTC	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688192
7	NC_015052	GCC	2	6	975	980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688192
8	NC_015052	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688192
9	NC_015052	CTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688192
10	NC_015052	CAC	2	6	1191	1196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688192
11	NC_015052	CAT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688192
12	NC_015052	CAC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688192
13	NC_015052	GCA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688192
14	NC_015052	CCA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688193
15	NC_015052	GCT	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688193
16	NC_015052	GAA	2	6	2674	2679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688193
17	NC_015052	GTC	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688193
18	NC_015052	ACC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688193
19	NC_015052	GCT	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688193
20	NC_015052	CGG	2	6	2966	2971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688193
21	NC_015052	CGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688193
22	NC_015052	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688193
23	NC_015052	CCG	2	6	3116	3121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688193
24	NC_015052	CGA	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688193
25	NC_015052	CGA	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688193
26	NC_015052	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688193
27	NC_015052	CCG	2	6	3224	3229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688193
28	NC_015052	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688193
29	NC_015052	CAG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688193
30	NC_015052	CGA	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688193
31	NC_015052	AAC	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688193
32	NC_015052	TGG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688194
33	NC_015052	CCA	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688194
34	NC_015052	TGA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688194
35	NC_015052	GTG	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688194
36	NC_015052	GTC	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688194
37	NC_015052	ATC	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688194
38	NC_015052	CGC	2	6	3787	3792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688194
39	NC_015052	ATG	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688194
40	NC_015052	TTG	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688194
41	NC_015052	CAA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688194
42	NC_015052	CGA	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688194
43	NC_015052	CGA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688194
44	NC_015052	GAT	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688194
45	NC_015052	GAC	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688194
46	NC_015052	CGC	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688195
47	NC_015052	TGA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688195
48	NC_015052	CCA	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688195
49	NC_015052	GTG	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688195
50	NC_015052	GCC	2	6	5058	5063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688195
51	NC_015052	CGG	3	9	5085	5093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688195
52	NC_015052	AGC	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688196
53	NC_015052	GGC	2	6	5312	5317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688196
54	NC_015052	CAA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688196
55	NC_015052	CAC	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688196
56	NC_015052	TCG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688196
57	NC_015052	CGA	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688196
58	NC_015052	GTG	2	6	5580	5585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688196
59	NC_015052	TGA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688196
60	NC_015052	CGG	2	6	5669	5674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688196
61	NC_015052	CGG	4	12	5681	5692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688196
62	NC_015052	ACC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688196
63	NC_015052	CAG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688196
64	NC_015052	CGA	2	6	6020	6025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688196
65	NC_015052	CGC	2	6	6038	6043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
66	NC_015052	TCA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688196
67	NC_015052	CCG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
68	NC_015052	CCA	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688196
69	NC_015052	GAG	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688196
70	NC_015052	CGA	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688196
71	NC_015052	CCG	2	6	6403	6408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
72	NC_015052	TGA	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688196
73	NC_015052	CAT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688196
74	NC_015052	GCC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
75	NC_015052	CGC	2	6	6621	6626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
76	NC_015052	CCG	2	6	6643	6648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
77	NC_015052	TCC	2	6	6678	6683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688196
78	NC_015052	GGC	2	6	6729	6734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688196
79	NC_015052	ATG	2	6	6825	6830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688196
80	NC_015052	CGG	3	9	6866	6874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688196
81	NC_015052	TCA	3	9	6919	6927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688196
82	NC_015052	TTC	2	6	6981	6986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688196
83	NC_015052	GAT	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688196
84	NC_015052	GCC	2	6	7034	7039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
85	NC_015052	ACC	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688196
86	NC_015052	CGC	3	9	7259	7267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
87	NC_015052	CGA	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688196
88	NC_015052	CGC	2	6	7314	7319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688196
89	NC_015052	ACA	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688197
90	NC_015052	CGA	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
91	NC_015052	AGG	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688197
92	NC_015052	GCA	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
93	NC_015052	TCG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
94	NC_015052	CGC	2	6	7666	7671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688197
95	NC_015052	ACG	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
96	NC_015052	ACA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688197
97	NC_015052	ACC	2	6	7760	7765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688197
98	NC_015052	TCG	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
99	NC_015052	CGA	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
100	NC_015052	GCC	3	9	7879	7887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688197
101	NC_015052	ACG	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
102	NC_015052	TGC	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
103	NC_015052	CCG	2	6	8042	8047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688197
104	NC_015052	CCA	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688197
105	NC_015052	CGC	2	6	8078	8083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688197
106	NC_015052	ACA	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688197
107	NC_015052	ACC	2	6	8126	8131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688197
108	NC_015052	CTG	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
109	NC_015052	CAT	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688197
110	NC_015052	CCA	2	6	8204	8209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688197
111	NC_015052	GAG	2	6	8287	8292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688197
112	NC_015052	TGG	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688197
113	NC_015052	TCG	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
114	NC_015052	CGA	2	6	8415	8420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
115	NC_015052	GGT	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688197
116	NC_015052	AAC	2	6	8491	8496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688197
117	NC_015052	GCA	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
118	NC_015052	ACC	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688197
119	NC_015052	GCT	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
120	NC_015052	ATC	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688197
121	NC_015052	CGA	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
122	NC_015052	CGA	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
123	NC_015052	TCG	2	6	8963	8968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
124	NC_015052	CGA	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
125	NC_015052	CCG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688197
126	NC_015052	GTG	2	6	9052	9057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688197
127	NC_015052	CGA	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
128	NC_015052	CGG	2	6	9123	9128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688197
129	NC_015052	GAC	2	6	9160	9165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
130	NC_015052	GTG	2	6	9166	9171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688197
131	NC_015052	CTT	2	6	9177	9182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688197
132	NC_015052	GCT	2	6	9204	9209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
133	NC_015052	TTC	2	6	9211	9216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688197
134	NC_015052	CTG	2	6	9301	9306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
135	NC_015052	TGA	2	6	9318	9323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688197
136	NC_015052	AAG	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688197
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138	NC_015052	CGA	2	6	9471	9476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
139	NC_015052	CGA	2	6	9492	9497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
140	NC_015052	GAC	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
141	NC_015052	ATC	2	6	9535	9540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688197
142	NC_015052	CGA	3	9	9579	9587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
143	NC_015052	GCC	2	6	9605	9610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688197
144	NC_015052	CCG	2	6	9614	9619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688197
145	NC_015052	ACG	2	6	9644	9649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688197
146	NC_015052	CTG	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688197
147	NC_015052	GTG	2	6	9806	9811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688197
148	NC_015052	GTG	2	6	9829	9834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688197
149	NC_015052	CAT	2	6	9858	9863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688197
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151	NC_015052	GGC	2	6	10009	10014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688197
152	NC_015052	CCG	2	6	10034	10039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688197
153	NC_015052	AAC	2	6	10066	10071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688197
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155	NC_015052	CCG	2	6	10195	10200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688198
156	NC_015052	GAA	2	6	10291	10296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688198
157	NC_015052	CTT	2	6	10307	10312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688198
158	NC_015052	GCC	2	6	10318	10323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688198
159	NC_015052	CGC	2	6	10366	10371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688198
160	NC_015052	ATT	2	6	10447	10452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322688198
161	NC_015052	TGC	2	6	10481	10486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688198
162	NC_015052	ACC	2	6	10582	10587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688198
163	NC_015052	TCT	2	6	10607	10612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688198
164	NC_015052	GTG	2	6	10624	10629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688198
165	NC_015052	CTG	2	6	10639	10644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688198
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169	NC_015052	ATT	2	6	11418	11423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322688199
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237	NC_015052	AGT	2	6	15968	15973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688202
238	NC_015052	GCT	2	6	16016	16021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688202
239	NC_015052	GAT	2	6	16029	16034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688202
240	NC_015052	TGA	2	6	16049	16054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688202
241	NC_015052	GCG	2	6	16090	16095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688202
242	NC_015052	CTG	3	9	16445	16453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688203
243	NC_015052	CTG	2	6	16457	16462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688203
244	NC_015052	CCG	2	6	16505	16510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688203
245	NC_015052	GGC	2	6	16629	16634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688203
246	NC_015052	ATT	2	6	16837	16842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322688203
247	NC_015052	TTC	2	6	16852	16857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688203
248	NC_015052	GCG	2	6	16886	16891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688203
249	NC_015052	GCC	2	6	16892	16897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688203
250	NC_015052	CGG	2	6	16943	16948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688203
251	NC_015052	GCG	2	6	16957	16962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688203
252	NC_015052	ATC	2	6	16987	16992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688203
253	NC_015052	AGC	2	6	17063	17068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688203
254	NC_015052	CGA	2	6	17088	17093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688203
255	NC_015052	TGG	2	6	17204	17209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688203
256	NC_015052	CTG	2	6	17257	17262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688203
257	NC_015052	CTC	2	6	17313	17318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688203
258	NC_015052	GCA	2	6	17350	17355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688203
259	NC_015052	GCC	2	6	17380	17385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688203
260	NC_015052	CTG	2	6	17536	17541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688203
261	NC_015052	GAG	2	6	17584	17589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688203
262	NC_015052	GCC	2	6	17758	17763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688204
263	NC_015052	TCG	2	6	17773	17778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688204
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269	NC_015052	CTT	3	9	18201	18209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688204
270	NC_015052	AGA	2	6	18242	18247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688204
271	NC_015052	GTG	2	6	18325	18330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688204
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274	NC_015052	GGC	3	9	18564	18572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688204
275	NC_015052	TGA	2	6	18584	18589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688204
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279	NC_015052	CCG	2	6	19325	19330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688205
280	NC_015052	AAG	2	6	19343	19348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688205
281	NC_015052	TGG	2	6	19386	19391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688205
282	NC_015052	CCG	2	6	19422	19427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688205
283	NC_015052	CCA	2	6	19452	19457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688205
284	NC_015052	GTC	2	6	19466	19471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688205
285	NC_015052	GCA	2	6	19506	19511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688205
286	NC_015052	CAG	2	6	19534	19539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688205
287	NC_015052	GAC	2	6	19544	19549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688205
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292	NC_015052	CTA	2	6	19715	19720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688206
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