MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 46421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_015052	CAGG	2	8	1796835	1796842	25 %	0 %	50 %	25 %	322689717
35003	NC_015052	GAA	2	6	1796863	1796868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322689717
35004	NC_015052	GAT	2	6	1796875	1796880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689717
35005	NC_015052	CGA	2	6	1796967	1796972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689717
35006	NC_015052	CTT	3	9	1796995	1797003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322689717
35007	NC_015052	GCG	2	6	1797077	1797082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689717
35008	NC_015052	AGC	2	6	1797111	1797116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689717
35009	NC_015052	ATC	3	9	1797155	1797163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689717
35010	NC_015052	TTC	2	6	1797164	1797169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322689717
35011	NC_015052	GA	3	6	1797187	1797192	50 %	0 %	50 %	0 %	322689717
35012	NC_015052	TGGCC	2	10	1797258	1797267	0 %	20 %	40 %	40 %	322689717
35013	NC_015052	CTG	3	9	1797307	1797315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689717
35014	NC_015052	GAT	2	6	1797334	1797339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689717
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35017	NC_015052	GCGCC	2	10	1797549	1797558	0 %	0 %	40 %	60 %	322689718
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35019	NC_015052	TCG	2	6	1797620	1797625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689718
35020	NC_015052	GCCG	2	8	1797664	1797671	0 %	0 %	50 %	50 %	322689718
35021	NC_015052	GTG	2	6	1797674	1797679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322689718
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35024	NC_015052	CGCA	2	8	1797787	1797794	25 %	0 %	25 %	50 %	322689718
35025	NC_015052	TCT	2	6	1797818	1797823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322689718
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35028	NC_015052	GCA	3	9	1797993	1798001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689718
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35032	NC_015052	CAT	2	6	1798137	1798142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689718
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35114	NC_015052	TCG	2	6	1802035	1802040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689722
35115	NC_015052	CT	3	6	1802086	1802091	0 %	50 %	0 %	50 %	322689722
35116	NC_015052	GTC	2	6	1802097	1802102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689722
35117	NC_015052	ATC	2	6	1802208	1802213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689722
35118	NC_015052	ACGA	2	8	1802227	1802234	50 %	0 %	25 %	25 %	322689722
35119	NC_015052	TCC	3	9	1802283	1802291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322689722
35120	NC_015052	TGCG	2	8	1802320	1802327	0 %	25 %	50 %	25 %	322689722
35121	NC_015052	CTC	2	6	1802328	1802333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322689722
35122	NC_015052	GAT	2	6	1802358	1802363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689722
35123	NC_015052	CGA	2	6	1802381	1802386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689722
35124	NC_015052	GCC	2	6	1802408	1802413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322689723
35125	NC_015052	ATC	2	6	1802467	1802472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689723
35126	NC_015052	CCG	2	6	1802555	1802560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322689723
35127	NC_015052	GAT	2	6	1802563	1802568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689723
35128	NC_015052	GCACG	2	10	1802569	1802578	20 %	0 %	40 %	40 %	322689723
35129	NC_015052	GAT	2	6	1802590	1802595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689723
35130	NC_015052	GCA	2	6	1802648	1802653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689723
35131	NC_015052	GAA	2	6	1802674	1802679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322689723
35132	NC_015052	TCG	2	6	1802726	1802731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689723
35133	NC_015052	TCG	2	6	1802885	1802890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689723
35134	NC_015052	CGC	2	6	1803021	1803026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322689723
35135	NC_015052	TTCCT	2	10	1803102	1803111	0 %	60 %	0 %	40 %	322689724
35136	NC_015052	TGA	2	6	1803124	1803129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689724
35137	NC_015052	GCG	3	9	1803190	1803198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689724
35138	NC_015052	GT	3	6	1803217	1803222	0 %	50 %	50 %	0 %	322689724
35139	NC_015052	AGC	2	6	1803258	1803263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689724
35140	NC_015052	GAT	2	6	1803368	1803373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689724
35141	NC_015052	GGCG	2	8	1803382	1803389	0 %	0 %	75 %	25 %	322689724
35142	NC_015052	TCG	2	6	1803420	1803425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689724
35143	NC_015052	CAC	2	6	1803431	1803436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322689724
35144	NC_015052	CAT	2	6	1803446	1803451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689724
35145	NC_015052	TCT	2	6	1803478	1803483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322689724
35146	NC_015052	CGAATT	2	12	1803601	1803612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322689724
35147	NC_015052	TCG	2	6	1803642	1803647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689724
35148	NC_015052	CGG	2	6	1803685	1803690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689724
35149	NC_015052	TGC	2	6	1803691	1803696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689724
35150	NC_015052	ATCA	2	8	1803716	1803723	50 %	25 %	0 %	25 %	322689724
35151	NC_015052	CCT	2	6	1803912	1803917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322689725
35152	NC_015052	CTC	2	6	1803937	1803942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322689725
35153	NC_015052	CTCG	2	8	1804068	1804075	0 %	25 %	25 %	50 %	322689725
35154	NC_015052	ATG	2	6	1804130	1804135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689725
35155	NC_015052	GTG	2	6	1804208	1804213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322689725
35156	NC_015052	ATG	2	6	1804244	1804249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689725
35157	NC_015052	ATC	2	6	1804361	1804366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689725
35158	NC_015052	CGG	2	6	1804425	1804430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689725
35159	NC_015052	GCCCCC	2	12	1804538	1804549	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	322689725
35160	NC_015052	CGA	2	6	1804572	1804577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689725
35161	NC_015052	TGCC	2	8	1804599	1804606	0 %	25 %	25 %	50 %	322689725
35162	NC_015052	GAT	2	6	1804618	1804623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689725
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35164	NC_015052	CTA	2	6	1804716	1804721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689725
35165	NC_015052	CGG	2	6	1804842	1804847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689726
35166	NC_015052	ATGAC	2	10	1804947	1804956	40 %	20 %	20 %	20 %	322689726
35167	NC_015052	CCT	2	6	1805037	1805042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322689726
35168	NC_015052	CGT	2	6	1805057	1805062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689726
35169	NC_015052	GGT	2	6	1805161	1805166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322689726
35170	NC_015052	ATG	2	6	1805174	1805179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689726
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35172	NC_015052	CAC	3	9	1805209	1805217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322689726
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35174	NC_015052	TGA	2	6	1805520	1805525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689726
35175	NC_015052	CGA	2	6	1805536	1805541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689726
35176	NC_015052	TCT	3	9	1805555	1805563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322689727
35177	NC_015052	TCA	3	9	1805567	1805575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689727
35178	NC_015052	CAT	2	6	1805583	1805588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689727
35179	NC_015052	GCC	2	6	1805596	1805601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322689727
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35182	NC_015052	CGA	2	6	1805707	1805712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689727
35183	NC_015052	CCG	2	6	1805795	1805800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322689727
35184	NC_015052	CCAG	2	8	1805853	1805860	25 %	0 %	25 %	50 %	322689727
35185	NC_015052	ACG	2	6	1805867	1805872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689727
35186	NC_015052	CTT	2	6	1805878	1805883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322689727
35187	NC_015052	CGA	2	6	1805913	1805918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689727
35188	NC_015052	CCG	2	6	1805940	1805945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322689727
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35190	NC_015052	CGA	3	9	1806039	1806047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689727
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35192	NC_015052	CGCA	2	8	1806475	1806482	25 %	0 %	25 %	50 %	322689728
35193	NC_015052	AAG	2	6	1806557	1806562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322689728
35194	NC_015052	TGC	3	9	1806642	1806650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689728
35195	NC_015052	CAT	2	6	1806685	1806690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689728
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35198	NC_015052	CTG	2	6	1806866	1806871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689728
35199	NC_015052	CGG	2	6	1806886	1806891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689728
35200	NC_015052	AAG	2	6	1806918	1806923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322689728
35201	NC_015052	GCCT	2	8	1806974	1806981	0 %	25 %	25 %	50 %	322689728
35202	NC_015052	CGC	2	6	1806995	1807000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322689728
35203	NC_015052	CCTG	2	8	1807029	1807036	0 %	25 %	25 %	50 %	322689728
35204	NC_015052	ATC	2	6	1807041	1807046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689728
35205	NC_015052	CGA	2	6	1807060	1807065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689728
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35210	NC_015052	AGC	2	6	1807353	1807358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689728
35211	NC_015052	TCGT	2	8	1807364	1807371	0 %	50 %	25 %	25 %	322689728
35212	NC_015052	ACA	2	6	1807389	1807394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322689728
35213	NC_015052	GTC	2	6	1807442	1807447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689728
35214	NC_015052	GCA	2	6	1807449	1807454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689728
35215	NC_015052	CCA	2	6	1807512	1807517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322689728
35216	NC_015052	CGG	2	6	1807521	1807526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689728
35217	NC_015052	TC	3	6	1807753	1807758	0 %	50 %	0 %	50 %	322689728
35218	NC_015052	AACG	2	8	1807799	1807806	50 %	0 %	25 %	25 %	322689728
35219	NC_015052	TCG	2	6	1807947	1807952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689728
35220	NC_015052	ATC	2	6	1807994	1807999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689728
35221	NC_015052	GGA	2	6	1808020	1808025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322689728
35222	NC_015052	TCT	2	6	1808038	1808043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322689728
35223	NC_015052	CGCGG	2	10	1808048	1808057	0 %	0 %	60 %	40 %	322689728
35224	NC_015052	GCT	2	6	1808088	1808093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689728
35225	NC_015052	TCA	2	6	1808175	1808180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689728
35226	NC_015052	GC	3	6	1808181	1808186	0 %	0 %	50 %	50 %	322689728
35227	NC_015052	GCC	2	6	1808246	1808251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322689728
35228	NC_015052	ACT	2	6	1808462	1808467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689729
35229	NC_015052	GTA	2	6	1808496	1808501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689729
35230	NC_015052	GAT	2	6	1808544	1808549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689729
35231	NC_015052	TCA	2	6	1808633	1808638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689729
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35340	NC_015052	CGG	3	9	1813329	1813337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689732
35341	NC_015052	CGG	2	6	1813341	1813346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689732
35342	NC_015052	CG	3	6	1813543	1813548	0 %	0 %	50 %	50 %	322689732
35343	NC_015052	TCG	2	6	1813550	1813555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689732
35344	NC_015052	GGCGAC	2	12	1813744	1813755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322689732
35345	NC_015052	GTA	2	6	1813828	1813833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689732
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35443	NC_015052	CAC	2	6	1818837	1818842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322689735
35444	NC_015052	GTT	2	6	1818922	1818927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322689735
35445	NC_015052	CGGC	2	8	1818935	1818942	0 %	0 %	50 %	50 %	322689735
35446	NC_015052	GGA	2	6	1818963	1818968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322689735
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35449	NC_015052	GTC	2	6	1819011	1819016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689735
35450	NC_015052	CGA	2	6	1819333	1819338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689736
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35456	NC_015052	ATG	2	6	1819521	1819526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322689736
35457	NC_015052	GAC	2	6	1819532	1819537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689736
35458	NC_015052	CAG	2	6	1819637	1819642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689736
35459	NC_015052	CTT	2	6	1819667	1819672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322689736
35460	NC_015052	CGG	2	6	1819696	1819701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322689736
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35476	NC_015052	GAC	2	6	1820328	1820333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322689736
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35484	NC_015052	GCT	2	6	1820742	1820747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689737
35485	NC_015052	TGC	2	6	1820756	1820761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689737
35486	NC_015052	CTG	2	6	1820845	1820850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322689737
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35489	NC_015052	GC	3	6	1820925	1820930	0 %	0 %	50 %	50 %	322689737
35490	NC_015052	TAC	2	6	1820965	1820970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322689737
35491	NC_015052	GC	4	8	1820991	1820998	0 %	0 %	50 %	50 %	322689737
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35499	NC_015052	GTGA	2	8	1822121	1822128	25 %	25 %	50 %	0 %	322689739
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