MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 46421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015052	GGC	2	6	149484	149489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688305
3002	NC_015052	TGG	2	6	149514	149519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688305
3003	NC_015052	CAC	3	9	149523	149531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688305
3004	NC_015052	GCGCAC	2	12	149583	149594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322688305
3005	NC_015052	ATC	2	6	149602	149607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688305
3006	NC_015052	GCTGT	2	10	149611	149620	0 %	40 %	40 %	20 %	322688305
3007	NC_015052	GGCG	2	8	149646	149653	0 %	0 %	75 %	25 %	322688305
3008	NC_015052	GTC	2	6	149680	149685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688305
3009	NC_015052	GC	3	6	149733	149738	0 %	0 %	50 %	50 %	322688305
3010	NC_015052	TGA	2	6	149754	149759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688305
3011	NC_015052	CGG	2	6	149835	149840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688305
3012	NC_015052	CAA	2	6	149859	149864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688305
3013	NC_015052	CAT	2	6	149865	149870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688305
3014	NC_015052	CAT	2	6	149889	149894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688305
3015	NC_015052	TCG	2	6	149909	149914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688305
3016	NC_015052	TGG	2	6	149927	149932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688305
3017	NC_015052	CAG	2	6	149966	149971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688305
3018	NC_015052	CGG	2	6	149978	149983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688305
3019	NC_015052	GCG	2	6	149998	150003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688305
3020	NC_015052	TGATG	2	10	150060	150069	20 %	40 %	40 %	0 %	322688306
3021	NC_015052	CG	3	6	150075	150080	0 %	0 %	50 %	50 %	322688306
3022	NC_015052	GC	3	6	150160	150165	0 %	0 %	50 %	50 %	322688306
3023	NC_015052	CGT	2	6	150205	150210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688306
3024	NC_015052	CCG	2	6	150265	150270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688306
3025	NC_015052	ACCG	2	8	150312	150319	25 %	0 %	25 %	50 %	322688306
3026	NC_015052	GGC	2	6	150361	150366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688306
3027	NC_015052	TCA	2	6	150440	150445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688306
3028	NC_015052	CTC	2	6	150507	150512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688306
3029	NC_015052	TGC	2	6	150544	150549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688306
3030	NC_015052	GT	3	6	150566	150571	0 %	50 %	50 %	0 %	322688306
3031	NC_015052	CGA	2	6	150576	150581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688306
3032	NC_015052	ATC	2	6	150604	150609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688306
3033	NC_015052	CCTT	2	8	150611	150618	0 %	50 %	0 %	50 %	322688306
3034	NC_015052	TCG	2	6	150664	150669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688306
3035	NC_015052	TATCTG	2	12	150673	150684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322688306
3036	NC_015052	GCATGA	2	12	150696	150707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322688306
3037	NC_015052	GTT	2	6	150738	150743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688306
3038	NC_015052	GGC	2	6	150751	150756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688306
3039	NC_015052	TGA	2	6	150798	150803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688306
3040	NC_015052	CCA	2	6	150831	150836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688306
3041	NC_015052	CGGA	2	8	151085	151092	25 %	0 %	50 %	25 %	322688306
3042	NC_015052	CTG	2	6	151096	151101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688306
3043	NC_015052	CAGGG	2	10	151102	151111	20 %	0 %	60 %	20 %	322688306
3044	NC_015052	TCA	2	6	151157	151162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688306
3045	NC_015052	TGA	2	6	151174	151179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688306
3046	NC_015052	AGC	2	6	151326	151331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3047	NC_015052	GCG	2	6	151435	151440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688307
3048	NC_015052	CTG	2	6	151451	151456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3049	NC_015052	CGT	2	6	151529	151534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3050	NC_015052	CGA	2	6	151582	151587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3051	NC_015052	G	6	6	151606	151611	0 %	0 %	100 %	0 %	322688307
3052	NC_015052	CTG	2	6	151700	151705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3053	NC_015052	GCA	2	6	151770	151775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3054	NC_015052	GGT	2	6	151813	151818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688307
3055	NC_015052	GCA	2	6	151837	151842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3056	NC_015052	TTC	2	6	151891	151896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688307
3057	NC_015052	ATTG	2	8	151909	151916	25 %	50 %	25 %	0 %	322688307
3058	NC_015052	GCT	2	6	152131	152136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3059	NC_015052	CAG	2	6	152156	152161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3060	NC_015052	GC	3	6	152216	152221	0 %	0 %	50 %	50 %	322688307
3061	NC_015052	TGAGA	2	10	152230	152239	40 %	20 %	40 %	0 %	322688307
3062	NC_015052	CGA	2	6	152329	152334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688307
3063	NC_015052	GTG	2	6	152378	152383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688307
3064	NC_015052	TTG	2	6	152396	152401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688307
3065	NC_015052	AGA	2	6	152411	152416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688307
3066	NC_015052	TGGC	2	8	152431	152438	0 %	25 %	50 %	25 %	322688307
3067	NC_015052	CAT	2	6	152561	152566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688307
3068	NC_015052	GC	3	6	152596	152601	0 %	0 %	50 %	50 %	322688307
3069	NC_015052	TTCG	2	8	152638	152645	0 %	50 %	25 %	25 %	322688307
3070	NC_015052	ATATGG	2	12	152646	152657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688307
3071	NC_015052	ATC	2	6	152776	152781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688308
3072	NC_015052	GTC	2	6	152845	152850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688308
3073	NC_015052	CGC	2	6	152868	152873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688308
3074	NC_015052	GC	3	6	152876	152881	0 %	0 %	50 %	50 %	322688308
3075	NC_015052	CGG	2	6	152994	152999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688308
3076	NC_015052	AAT	2	6	153016	153021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322688308
3077	NC_015052	ATC	2	6	153178	153183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688308
3078	NC_015052	GGC	2	6	153247	153252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688308
3079	NC_015052	CT	3	6	153270	153275	0 %	50 %	0 %	50 %	322688308
3080	NC_015052	GGC	2	6	153289	153294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688308
3081	NC_015052	CCA	2	6	153356	153361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688308
3082	NC_015052	GCC	2	6	153404	153409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688308
3083	NC_015052	GTT	2	6	153444	153449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688308
3084	NC_015052	TGG	2	6	153498	153503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688308
3085	NC_015052	TGC	2	6	153633	153638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688309
3086	NC_015052	TGAGAT	2	12	153703	153714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688309
3087	NC_015052	CAA	2	6	153721	153726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688309
3088	NC_015052	GGC	2	6	153728	153733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688309
3089	NC_015052	AGC	2	6	153840	153845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688309
3090	NC_015052	TGC	2	6	153909	153914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688309
3091	NC_015052	CATCC	2	10	153934	153943	20 %	20 %	0 %	60 %	322688309
3092	NC_015052	ACT	2	6	153953	153958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688309
3093	NC_015052	TCGCC	2	10	153959	153968	0 %	20 %	20 %	60 %	322688309
3094	NC_015052	CAT	2	6	153982	153987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688309
3095	NC_015052	TTGC	2	8	154004	154011	0 %	50 %	25 %	25 %	322688309
3096	NC_015052	GCG	2	6	154023	154028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688309
3097	NC_015052	GA	3	6	154079	154084	50 %	0 %	50 %	0 %	322688309
3098	NC_015052	GCC	2	6	154157	154162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688309
3099	NC_015052	CTGG	2	8	154188	154195	0 %	25 %	50 %	25 %	322688309
3100	NC_015052	TCA	2	6	154470	154475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688310
3101	NC_015052	CTG	2	6	154481	154486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688310
3102	NC_015052	GTG	2	6	154580	154585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688310
3103	NC_015052	TTC	2	6	154586	154591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688310
3104	NC_015052	TGT	2	6	154614	154619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688310
3105	NC_015052	CGGC	2	8	154623	154630	0 %	0 %	50 %	50 %	322688310
3106	NC_015052	TGC	2	6	154648	154653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688310
3107	NC_015052	TGC	2	6	154686	154691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688310
3108	NC_015052	GGT	2	6	154693	154698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688310
3109	NC_015052	GC	3	6	154704	154709	0 %	0 %	50 %	50 %	322688310
3110	NC_015052	ACT	2	6	154731	154736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688310
3111	NC_015052	GCC	2	6	154755	154760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688310
3112	NC_015052	TAT	2	6	154762	154767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322688310
3113	NC_015052	GCTG	2	8	154843	154850	0 %	25 %	50 %	25 %	322688310
3114	NC_015052	CTT	2	6	154864	154869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688310
3115	NC_015052	GTT	2	6	154972	154977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688310
3116	NC_015052	GCT	2	6	154981	154986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688310
3117	NC_015052	CTT	2	6	154993	154998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688310
3118	NC_015052	CTG	2	6	155051	155056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688310
3119	NC_015052	TCGC	2	8	155060	155067	0 %	25 %	25 %	50 %	322688310
3120	NC_015052	CAT	2	6	155074	155079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688310
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3122	NC_015052	TAAG	2	8	155173	155180	50 %	25 %	25 %	0 %	322688310
3123	NC_015052	TG	3	6	156219	156224	0 %	50 %	50 %	0 %	322688311
3124	NC_015052	GCTT	2	8	156285	156292	0 %	50 %	25 %	25 %	322688311
3125	NC_015052	CTT	2	6	156333	156338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688311
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3232	NC_015052	GCG	2	6	162450	162455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688320
3233	NC_015052	CGG	2	6	162484	162489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688320
3234	NC_015052	GAT	2	6	162542	162547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688320
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3236	NC_015052	GCA	2	6	162634	162639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688320
3237	NC_015052	GCT	2	6	162652	162657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688320
3238	NC_015052	GCC	2	6	162673	162678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688320
3239	NC_015052	CCA	2	6	162702	162707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688320
3240	NC_015052	CACC	2	8	162745	162752	25 %	0 %	0 %	75 %	322688320
3241	NC_015052	TCCGT	2	10	162757	162766	0 %	40 %	20 %	40 %	322688320
3242	NC_015052	AAGG	2	8	162815	162822	50 %	0 %	50 %	0 %	322688320
3243	NC_015052	AGCCCG	2	12	162828	162839	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322688320
3244	NC_015052	GC	3	6	162859	162864	0 %	0 %	50 %	50 %	322688320
3245	NC_015052	GGC	2	6	162869	162874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688320
3246	NC_015052	TGGT	2	8	162912	162919	0 %	50 %	50 %	0 %	322688320
3247	NC_015052	ATG	2	6	162942	162947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688320
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3249	NC_015052	TCG	2	6	163083	163088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688320
3250	NC_015052	CTG	2	6	163115	163120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688320
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3254	NC_015052	CG	3	6	163315	163320	0 %	0 %	50 %	50 %	322688320
3255	NC_015052	TTG	2	6	163322	163327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688320
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3263	NC_015052	CT	3	6	163609	163614	0 %	50 %	0 %	50 %	322688320
3264	NC_015052	CTG	2	6	163626	163631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688320
3265	NC_015052	CTG	3	9	163638	163646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688320
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3270	NC_015052	CGA	2	6	163753	163758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688320
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3272	NC_015052	CTTG	2	8	163863	163870	0 %	50 %	25 %	25 %	322688320
3273	NC_015052	AAG	2	6	163934	163939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688320
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3348	NC_015052	AGT	2	6	168353	168358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688323
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3350	NC_015052	ATGG	2	8	168435	168442	25 %	25 %	50 %	0 %	322688323
3351	NC_015052	GC	3	6	168489	168494	0 %	0 %	50 %	50 %	322688323
3352	NC_015052	TCT	2	6	168501	168506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688323
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3357	NC_015052	ATG	2	6	168874	168879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688323
3358	NC_015052	GCG	2	6	168930	168935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688323
3359	NC_015052	CCGT	2	8	168983	168990	0 %	25 %	25 %	50 %	322688323
3360	NC_015052	CAG	2	6	169435	169440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688324
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3362	NC_015052	TCG	2	6	169470	169475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688324
3363	NC_015052	GTT	2	6	169515	169520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688324
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3394	NC_015052	ACT	2	6	170907	170912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688326
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3462	NC_015052	G	6	6	175119	175124	0 %	0 %	100 %	0 %	322688329
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3470	NC_015052	GC	3	6	175547	175552	0 %	0 %	50 %	50 %	322688329
3471	NC_015052	AGG	2	6	175615	175620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688329
3472	NC_015052	AAG	2	6	175626	175631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688329
3473	NC_015052	CGC	2	6	175643	175648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688329
3474	NC_015052	TAC	2	6	175695	175700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688329
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3477	NC_015052	CCAC	2	8	175873	175880	25 %	0 %	0 %	75 %	322688329
3478	NC_015052	CGA	2	6	175883	175888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688329
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3480	NC_015052	CTCC	2	8	175907	175914	0 %	25 %	0 %	75 %	322688329
3481	NC_015052	ACG	2	6	175924	175929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688329
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3483	NC_015052	CTGC	2	8	175991	175998	0 %	25 %	25 %	50 %	322688329
3484	NC_015052	AAG	2	6	176211	176216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688329
3485	NC_015052	GCC	2	6	176238	176243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688329
3486	NC_015052	GC	3	6	176246	176251	0 %	0 %	50 %	50 %	322688329
3487	NC_015052	CGTA	2	8	176319	176326	25 %	25 %	25 %	25 %	322688329
3488	NC_015052	CAT	2	6	176333	176338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688329
3489	NC_015052	GGC	2	6	176364	176369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688329
3490	NC_015052	ACCA	2	8	176388	176395	50 %	0 %	0 %	50 %	322688329
3491	NC_015052	AAG	2	6	176466	176471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688329
3492	NC_015052	CCG	3	9	176542	176550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688329
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3499	NC_015052	CCG	2	6	177081	177086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688330
3500	NC_015052	CCG	2	6	177135	177140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688330

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