MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 46421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015052	TGCA	2	8	52656	52663	25 %	25 %	25 %	25 %	322688231
1002	NC_015052	GGT	2	6	52704	52709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688231
1003	NC_015052	TGA	2	6	52714	52719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688231
1004	NC_015052	TTG	2	6	52732	52737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688231
1005	NC_015052	CGTG	2	8	52738	52745	0 %	25 %	50 %	25 %	322688231
1006	NC_015052	TTG	2	6	52767	52772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688231
1007	NC_015052	GGC	2	6	52820	52825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688231
1008	NC_015052	TGG	2	6	52837	52842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688231
1009	NC_015052	TCA	2	6	52858	52863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688231
1010	NC_015052	GGC	2	6	53001	53006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688231
1011	NC_015052	CAT	2	6	53104	53109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688231
1012	NC_015052	TGG	2	6	53113	53118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688231
1013	NC_015052	GTGGC	3	15	53197	53211	0 %	20 %	60 %	20 %	322688231
1014	NC_015052	CGG	2	6	53222	53227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688231
1015	NC_015052	GTGG	2	8	53235	53242	0 %	25 %	75 %	0 %	322688231
1016	NC_015052	GCT	2	6	53255	53260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688231
1017	NC_015052	GGTG	2	8	53261	53268	0 %	25 %	75 %	0 %	322688231
1018	NC_015052	TGG	2	6	53329	53334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688231
1019	NC_015052	TGT	2	6	53356	53361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688231
1020	NC_015052	ATGT	2	8	53503	53510	25 %	50 %	25 %	0 %	322688232
1021	NC_015052	CGA	2	6	53519	53524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688232
1022	NC_015052	TCG	2	6	53548	53553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688232
1023	NC_015052	GT	3	6	53566	53571	0 %	50 %	50 %	0 %	322688232
1024	NC_015052	GC	3	6	53602	53607	0 %	0 %	50 %	50 %	322688232
1025	NC_015052	CCATC	2	10	54085	54094	20 %	20 %	0 %	60 %	322688233
1026	NC_015052	TCA	2	6	54096	54101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688233
1027	NC_015052	GTA	2	6	54187	54192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688233
1028	NC_015052	CAC	2	6	54193	54198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688233
1029	NC_015052	GAT	2	6	54214	54219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688233
1030	NC_015052	TTC	2	6	54280	54285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688233
1031	NC_015052	TCA	2	6	54315	54320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688233
1032	NC_015052	GTT	2	6	54511	54516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688233
1033	NC_015052	GTG	2	6	54685	54690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688234
1034	NC_015052	TCG	2	6	54700	54705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688234
1035	NC_015052	CTG	2	6	54726	54731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688234
1036	NC_015052	GCC	2	6	54762	54767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688234
1037	NC_015052	TGG	2	6	54787	54792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688234
1038	NC_015052	GCA	2	6	54821	54826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688234
1039	NC_015052	CA	3	6	54905	54910	50 %	0 %	0 %	50 %	322688234
1040	NC_015052	CAAGG	2	10	54915	54924	40 %	0 %	40 %	20 %	322688234
1041	NC_015052	TGC	2	6	54952	54957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688234
1042	NC_015052	CAGCGG	2	12	54965	54976	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322688234
1043	NC_015052	GTAACG	2	12	54978	54989	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322688234
1044	NC_015052	GAT	2	6	54993	54998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688234
1045	NC_015052	CAA	3	9	55022	55030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688234
1046	NC_015052	CCA	2	6	55064	55069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688234
1047	NC_015052	GGT	2	6	55085	55090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688234
1048	NC_015052	CGG	2	6	55106	55111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688234
1049	NC_015052	TGA	2	6	55123	55128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688234
1050	NC_015052	CGG	2	6	55156	55161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688234
1051	NC_015052	CGC	2	6	55207	55212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688234
1052	NC_015052	CCG	2	6	55360	55365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688234
1053	NC_015052	TGC	2	6	55369	55374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688234
1054	NC_015052	GAG	2	6	55419	55424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688234
1055	NC_015052	GGC	2	6	55534	55539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688235
1056	NC_015052	CGT	2	6	55571	55576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688235
1057	NC_015052	GGCA	2	8	55620	55627	25 %	0 %	50 %	25 %	322688235
1058	NC_015052	CTG	2	6	55646	55651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688235
1059	NC_015052	TGG	2	6	55697	55702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688235
1060	NC_015052	GAGC	2	8	55718	55725	25 %	0 %	50 %	25 %	322688235
1061	NC_015052	ACC	2	6	55736	55741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688235
1062	NC_015052	CAA	2	6	55768	55773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688235
1063	NC_015052	AGG	2	6	55803	55808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688235
1064	NC_015052	CAC	2	6	55912	55917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688235
1065	NC_015052	AGC	2	6	55923	55928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688235
1066	NC_015052	ACC	2	6	55958	55963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688235
1067	NC_015052	TCGCCG	2	12	55989	56000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322688235
1068	NC_015052	CAT	2	6	56062	56067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688235
1069	NC_015052	TGC	2	6	56121	56126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688235
1070	NC_015052	CCA	2	6	56178	56183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688235
1071	NC_015052	ACC	2	6	56201	56206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688235
1072	NC_015052	CCACCC	2	12	56223	56234	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	322688235
1073	NC_015052	CTA	2	6	56304	56309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688235
1074	NC_015052	CCA	2	6	56337	56342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688235
1075	NC_015052	GGT	2	6	56386	56391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688235
1076	NC_015052	GC	3	6	56397	56402	0 %	0 %	50 %	50 %	322688235
1077	NC_015052	TGC	2	6	56457	56462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688235
1078	NC_015052	CG	3	6	56471	56476	0 %	0 %	50 %	50 %	322688235
1079	NC_015052	TGC	2	6	56556	56561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688235
1080	NC_015052	CTG	3	9	56567	56575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688235
1081	NC_015052	GCC	2	6	56582	56587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688235
1082	NC_015052	GCG	2	6	56588	56593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688235
1083	NC_015052	GCC	3	9	56618	56626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688235
1084	NC_015052	CAG	2	6	56642	56647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688235
1085	NC_015052	TGG	3	9	56747	56755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688236
1086	NC_015052	ACG	2	6	56831	56836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688236
1087	NC_015052	GCG	2	6	56957	56962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688236
1088	NC_015052	GT	3	6	56975	56980	0 %	50 %	50 %	0 %	322688236
1089	NC_015052	CAT	2	6	57039	57044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688236
1090	NC_015052	TGG	2	6	57062	57067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688236
1091	NC_015052	TGG	2	6	57167	57172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688236
1092	NC_015052	ATT	2	6	57199	57204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322688236
1093	NC_015052	GCGT	2	8	57209	57216	0 %	25 %	50 %	25 %	322688236
1094	NC_015052	TGA	2	6	57263	57268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688236
1095	NC_015052	CTG	2	6	57286	57291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688236
1096	NC_015052	CCG	2	6	57338	57343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688236
1097	NC_015052	TCAC	2	8	57593	57600	25 %	25 %	0 %	50 %	322688237
1098	NC_015052	CCGGTA	2	12	57639	57650	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322688237
1099	NC_015052	CCG	2	6	57651	57656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688237
1100	NC_015052	TGC	2	6	57661	57666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688237
1101	NC_015052	TGC	2	6	57748	57753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688237
1102	NC_015052	CGG	2	6	57805	57810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688237
1103	NC_015052	TGA	2	6	57880	57885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688237
1104	NC_015052	CTG	2	6	57998	58003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688237
1105	NC_015052	GACC	2	8	58024	58031	25 %	0 %	25 %	50 %	322688237
1106	NC_015052	GGT	2	6	58046	58051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688237
1107	NC_015052	GAA	2	6	58059	58064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688237
1108	NC_015052	AT	3	6	58067	58072	50 %	50 %	0 %	0 %	322688237
1109	NC_015052	TGG	2	6	58078	58083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688237
1110	NC_015052	CGG	2	6	58105	58110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688237
1111	NC_015052	CGG	2	6	58168	58173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688237
1112	NC_015052	TGC	2	6	58204	58209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688237
1113	NC_015052	GC	3	6	58208	58213	0 %	0 %	50 %	50 %	322688237
1114	NC_015052	TTG	2	6	58476	58481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688237
1115	NC_015052	CAA	2	6	58528	58533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688237
1116	NC_015052	ACCGA	2	10	58545	58554	40 %	0 %	20 %	40 %	322688237
1117	NC_015052	TGA	2	6	58555	58560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688237
1118	NC_015052	TCT	2	6	58561	58566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688237
1119	NC_015052	CTT	2	6	58571	58576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688237
1120	NC_015052	GCC	3	9	58584	58592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688237
1121	NC_015052	GCT	2	6	58597	58602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688237
1122	NC_015052	CGC	2	6	58619	58624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688237
1123	NC_015052	TGGG	2	8	58686	58693	0 %	25 %	75 %	0 %	322688237
1124	NC_015052	GTG	2	6	58716	58721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688237
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1242	NC_015052	CTT	2	6	63919	63924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688241
1243	NC_015052	GGC	2	6	63925	63930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688241
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1246	NC_015052	TGG	2	6	64074	64079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688241
1247	NC_015052	GTA	2	6	64165	64170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688241
1248	NC_015052	CAGC	2	8	64199	64206	25 %	0 %	25 %	50 %	322688241
1249	NC_015052	TAA	2	6	64239	64244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322688241
1250	NC_015052	GCG	2	6	64261	64266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688241
1251	NC_015052	CTT	2	6	64267	64272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688241
1252	NC_015052	CTT	2	6	64285	64290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688241
1253	NC_015052	CGG	2	6	64344	64349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688241
1254	NC_015052	CAC	2	6	64372	64377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688241
1255	NC_015052	CAC	2	6	64441	64446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688241
1256	NC_015052	GAC	2	6	64454	64459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688241
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1260	NC_015052	ATC	2	6	64540	64545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688241
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1265	NC_015052	CCGC	2	8	64719	64726	0 %	0 %	25 %	75 %	322688241
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1270	NC_015052	ACG	2	6	64919	64924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688241
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1300	NC_015052	GGCCTT	2	12	65795	65806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688242
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1303	NC_015052	GCCA	2	8	65889	65896	25 %	0 %	25 %	50 %	322688242
1304	NC_015052	CAG	2	6	65909	65914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688242
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1316	NC_015052	GATCAC	2	12	66379	66390	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322688243
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1339	NC_015052	CAC	2	6	68039	68044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688244
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1341	NC_015052	CCAG	2	8	68090	68097	25 %	0 %	25 %	50 %	322688244
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1363	NC_015052	CGA	2	6	68998	69003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688244
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1366	NC_015052	CGG	2	6	69033	69038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688244
1367	NC_015052	CGGC	2	8	69049	69056	0 %	0 %	50 %	50 %	322688244
1368	NC_015052	CGG	2	6	69070	69075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688244
1369	NC_015052	CAG	2	6	69083	69088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688244
1370	NC_015052	CG	3	6	69091	69096	0 %	0 %	50 %	50 %	322688244
1371	NC_015052	TCG	2	6	69132	69137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688244
1372	NC_015052	GC	3	6	69260	69265	0 %	0 %	50 %	50 %	322688244
1373	NC_015052	CAT	2	6	69301	69306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688244
1374	NC_015052	GAT	2	6	69449	69454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688245
1375	NC_015052	CGA	2	6	69455	69460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688245
1376	NC_015052	GTG	2	6	69489	69494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688245
1377	NC_015052	TGC	2	6	69513	69518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688245
1378	NC_015052	GAG	2	6	69519	69524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688245
1379	NC_015052	TCCG	2	8	69536	69543	0 %	25 %	25 %	50 %	322688245
1380	NC_015052	CCG	3	9	69541	69549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688245
1381	NC_015052	CGG	2	6	69593	69598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688245
1382	NC_015052	GCCACC	2	12	69666	69677	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322688245
1383	NC_015052	TCA	2	6	69694	69699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688245
1384	NC_015052	ACG	2	6	69730	69735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688245
1385	NC_015052	GT	4	8	69771	69778	0 %	50 %	50 %	0 %	322688245
1386	NC_015052	CG	4	8	69806	69813	0 %	0 %	50 %	50 %	322688245
1387	NC_015052	TGA	2	6	69842	69847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688245
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1389	NC_015052	CGGC	2	8	69907	69914	0 %	0 %	50 %	50 %	322688245
1390	NC_015052	GCG	2	6	69946	69951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688245
1391	NC_015052	CT	3	6	70005	70010	0 %	50 %	0 %	50 %	322688245
1392	NC_015052	GAT	2	6	70016	70021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688245
1393	NC_015052	GC	3	6	70069	70074	0 %	0 %	50 %	50 %	322688245
1394	NC_015052	AAG	2	6	70095	70100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688245
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1396	NC_015052	TCCG	2	8	70280	70287	0 %	25 %	25 %	50 %	322688245
1397	NC_015052	TGC	2	6	70312	70317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688245
1398	NC_015052	CGG	3	9	70388	70396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688245
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1401	NC_015052	AAT	2	6	70694	70699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322688246
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1405	NC_015052	GTCGCC	2	12	70817	70828	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322688246
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1482	NC_015052	GCC	2	6	74177	74182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688250
1483	NC_015052	CAG	2	6	74240	74245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688250
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1488	NC_015052	ACG	2	6	74786	74791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688251
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1490	NC_015052	CAA	2	6	74841	74846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688251
1491	NC_015052	CACCGG	2	12	75493	75504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322688252
1492	NC_015052	CGG	2	6	75518	75523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688252
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1494	NC_015052	CG	4	8	75536	75543	0 %	0 %	50 %	50 %	322688252
1495	NC_015052	CTG	2	6	75570	75575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688252
1496	NC_015052	CGG	2	6	75656	75661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688252
1497	NC_015052	CTG	3	9	75666	75674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688252
1498	NC_015052	CGG	2	6	75728	75733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688252
1499	NC_015052	TGT	2	6	75736	75741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688252
1500	NC_015052	TCG	2	6	75756	75761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688252

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