MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 46421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015052	TCG	2	6	28599	28604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688214
502	NC_015052	GCG	2	6	28673	28678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688214
503	NC_015052	TGA	2	6	28693	28698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688214
504	NC_015052	TGT	2	6	28702	28707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688214
505	NC_015052	CGT	2	6	28711	28716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688214
506	NC_015052	GCA	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688214
507	NC_015052	TCC	2	6	28797	28802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688214
508	NC_015052	GTG	2	6	28887	28892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688214
509	NC_015052	CGC	2	6	28897	28902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688214
510	NC_015052	CTC	2	6	28949	28954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688214
511	NC_015052	CCGT	2	8	28980	28987	0 %	25 %	25 %	50 %	322688214
512	NC_015052	TCG	2	6	28998	29003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688214
513	NC_015052	GATG	2	8	29017	29024	25 %	25 %	50 %	0 %	322688214
514	NC_015052	GCA	2	6	29035	29040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688214
515	NC_015052	GCA	2	6	29053	29058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688214
516	NC_015052	CAC	2	6	29093	29098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688214
517	NC_015052	CAG	2	6	29135	29140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688214
518	NC_015052	CGT	2	6	29167	29172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688214
519	NC_015052	CGG	2	6	29227	29232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688214
520	NC_015052	GC	3	6	29274	29279	0 %	0 %	50 %	50 %	322688214
521	NC_015052	CGA	2	6	29296	29301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688214
522	NC_015052	TCG	2	6	29325	29330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688214
523	NC_015052	CTG	2	6	29414	29419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688214
524	NC_015052	GAT	2	6	29474	29479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688214
525	NC_015052	GGC	2	6	29482	29487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688214
526	NC_015052	CGG	2	6	29491	29496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688214
527	NC_015052	CAC	2	6	29516	29521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688214
528	NC_015052	GC	4	8	29523	29530	0 %	0 %	50 %	50 %	322688214
529	NC_015052	GAT	2	6	29600	29605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688214
530	NC_015052	GAT	2	6	29615	29620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688214
531	NC_015052	GCC	2	6	29630	29635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688214
532	NC_015052	CCG	2	6	29668	29673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688214
533	NC_015052	GGA	2	6	29693	29698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688214
534	NC_015052	TCC	2	6	29808	29813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688214
535	NC_015052	AG	3	6	29844	29849	50 %	0 %	50 %	0 %	322688214
536	NC_015052	AGG	2	6	29907	29912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688214
537	NC_015052	CGA	2	6	30241	30246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688215
538	NC_015052	GCG	2	6	30261	30266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688215
539	NC_015052	CTG	2	6	30272	30277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688215
540	NC_015052	CCA	2	6	30295	30300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688215
541	NC_015052	AAT	2	6	30308	30313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322688215
542	NC_015052	CG	3	6	30364	30369	0 %	0 %	50 %	50 %	322688215
543	NC_015052	AAT	2	6	30401	30406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322688215
544	NC_015052	CGG	3	9	30412	30420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688215
545	NC_015052	TCG	2	6	30429	30434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688215
546	NC_015052	GTC	2	6	30437	30442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688215
547	NC_015052	GTC	2	6	30500	30505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688215
548	NC_015052	CGG	2	6	30517	30522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688215
549	NC_015052	CA	3	6	30554	30559	50 %	0 %	0 %	50 %	322688215
550	NC_015052	CGG	2	6	30631	30636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688215
551	NC_015052	CG	3	6	30691	30696	0 %	0 %	50 %	50 %	322688215
552	NC_015052	AGC	2	6	30741	30746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688215
553	NC_015052	GGT	2	6	30775	30780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688215
554	NC_015052	GCA	2	6	30814	30819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688215
555	NC_015052	CTGA	2	8	30862	30869	25 %	25 %	25 %	25 %	322688215
556	NC_015052	GAT	2	6	31076	31081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688216
557	NC_015052	GCA	2	6	31091	31096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688216
558	NC_015052	AAC	2	6	31131	31136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688216
559	NC_015052	TTC	3	9	31185	31193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688216
560	NC_015052	ACG	2	6	31327	31332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688216
561	NC_015052	CCGAC	2	10	31372	31381	20 %	0 %	20 %	60 %	322688216
562	NC_015052	CTG	2	6	31386	31391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688216
563	NC_015052	ATGGC	2	10	31423	31432	20 %	20 %	40 %	20 %	322688216
564	NC_015052	GCG	2	6	31438	31443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688216
565	NC_015052	TCC	2	6	31491	31496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688216
566	NC_015052	GAG	2	6	31515	31520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688216
567	NC_015052	CTG	2	6	31521	31526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688216
568	NC_015052	CGC	2	6	31527	31532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688216
569	NC_015052	TCG	2	6	31627	31632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688216
570	NC_015052	CAA	2	6	31823	31828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688217
571	NC_015052	CGT	3	9	31838	31846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688217
572	NC_015052	TGG	2	6	31850	31855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688217
573	NC_015052	CTG	2	6	31861	31866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688217
574	NC_015052	CGGC	2	8	31873	31880	0 %	0 %	50 %	50 %	322688217
575	NC_015052	CGCT	2	8	31895	31902	0 %	25 %	25 %	50 %	322688217
576	NC_015052	CGG	2	6	31934	31939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688217
577	NC_015052	ATCACC	2	12	31944	31955	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322688217
578	NC_015052	GTC	2	6	31962	31967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688217
579	NC_015052	CAC	2	6	31988	31993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688217
580	NC_015052	CAG	2	6	32022	32027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688217
581	NC_015052	CCG	2	6	32056	32061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
582	NC_015052	GCCG	2	8	32196	32203	0 %	0 %	50 %	50 %	322688217
583	NC_015052	TTC	2	6	32238	32243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688217
584	NC_015052	TGG	2	6	32260	32265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688217
585	NC_015052	CGG	3	9	32267	32275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688217
586	NC_015052	CGC	2	6	32279	32284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
587	NC_015052	GCC	2	6	32373	32378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
588	NC_015052	AAC	2	6	32388	32393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688217
589	NC_015052	CCG	2	6	32437	32442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
590	NC_015052	AGG	2	6	32447	32452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688217
591	NC_015052	CCG	2	6	32509	32514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
592	NC_015052	GCG	2	6	32575	32580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688217
593	NC_015052	TGG	2	6	32581	32586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688217
594	NC_015052	CGA	2	6	32591	32596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688217
595	NC_015052	CACG	2	8	32612	32619	25 %	0 %	25 %	50 %	322688217
596	NC_015052	CGGC	2	8	32653	32660	0 %	0 %	50 %	50 %	322688217
597	NC_015052	CACCGC	2	12	32693	32704	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322688217
598	NC_015052	GCC	2	6	32718	32723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
599	NC_015052	GCC	2	6	32774	32779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
600	NC_015052	GAG	2	6	32802	32807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688217
601	NC_015052	GCC	2	6	32820	32825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
602	NC_015052	CCG	2	6	32827	32832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
603	NC_015052	ACG	2	6	32847	32852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688217
604	NC_015052	GCCGCA	2	12	32886	32897	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322688217
605	NC_015052	GCC	2	6	32904	32909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
606	NC_015052	AAG	2	6	32910	32915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688217
607	NC_015052	CCG	3	9	32932	32940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688217
608	NC_015052	AGC	3	9	32944	32952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688217
609	NC_015052	CCCG	2	8	32977	32984	0 %	0 %	25 %	75 %	322688217
610	NC_015052	CGCT	2	8	32989	32996	0 %	25 %	25 %	50 %	322688217
611	NC_015052	CGG	2	6	33022	33027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688217
612	NC_015052	CGG	2	6	33065	33070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688217
613	NC_015052	CGG	2	6	33112	33117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688217
614	NC_015052	CTT	2	6	33139	33144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688217
615	NC_015052	TGG	2	6	33145	33150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688217
616	NC_015052	GGTCT	2	10	33345	33354	0 %	40 %	40 %	20 %	322688217
617	NC_015052	TCGT	2	8	33402	33409	0 %	50 %	25 %	25 %	322688217
618	NC_015052	CGA	2	6	33452	33457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688217
619	NC_015052	CG	3	6	33468	33473	0 %	0 %	50 %	50 %	322688217
620	NC_015052	CAT	2	6	33497	33502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688217
621	NC_015052	TGCT	2	8	33544	33551	0 %	50 %	25 %	25 %	322688217
622	NC_015052	GC	3	6	33584	33589	0 %	0 %	50 %	50 %	322688217
623	NC_015052	ACG	2	6	33598	33603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688217
624	NC_015052	TCA	2	6	33661	33666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688217
625	NC_015052	GCTGAT	2	12	33917	33928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322688218
626	NC_015052	GCG	2	6	33969	33974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688218
627	NC_015052	ACGA	2	8	34008	34015	50 %	0 %	25 %	25 %	322688218
628	NC_015052	CGTG	2	8	34069	34076	0 %	25 %	50 %	25 %	322688218
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631	NC_015052	CAG	2	6	34184	34189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688218
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634	NC_015052	GCG	2	6	34271	34276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688218
635	NC_015052	GGT	2	6	34282	34287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688218
636	NC_015052	GAT	2	6	34355	34360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688218
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639	NC_015052	CTT	2	6	34517	34522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688218
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641	NC_015052	TGA	2	6	34585	34590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688218
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647	NC_015052	CCA	2	6	34939	34944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688218
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659	NC_015052	CCTT	2	8	35889	35896	0 %	50 %	0 %	50 %	322688220
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661	NC_015052	CGA	2	6	36004	36009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688220
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700	NC_015052	GCC	2	6	37830	37835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688221
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702	NC_015052	GAG	2	6	37945	37950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688221
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747	NC_015052	A	7	7	39987	39993	100 %	0 %	0 %	0 %	322688222
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751	NC_015052	ATG	2	6	40188	40193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688222
752	NC_015052	GCT	2	6	40337	40342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688222
753	NC_015052	GGC	2	6	40511	40516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688222
754	NC_015052	GAA	2	6	40605	40610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688222
755	NC_015052	ACG	2	6	40681	40686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688222
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757	NC_015052	CTG	2	6	40765	40770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688222
758	NC_015052	CGA	2	6	40835	40840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688222
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765	NC_015052	CAT	2	6	41291	41296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688222
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768	NC_015052	TGC	2	6	41395	41400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688222
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770	NC_015052	TCG	2	6	41416	41421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688222
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774	NC_015052	CCG	2	6	41622	41627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688222
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782	NC_015052	GGCCT	2	10	42287	42296	0 %	20 %	40 %	40 %	322688223
783	NC_015052	CCG	2	6	42327	42332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688223
784	NC_015052	CGA	2	6	42406	42411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688223
785	NC_015052	CTT	2	6	42430	42435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688223
786	NC_015052	AAG	2	6	42455	42460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688223
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872	NC_015052	CGA	2	6	46387	46392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688225
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