MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 46421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015052	CGG	2	6	300672	300677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688416
6002	NC_015052	CGC	2	6	300728	300733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688416
6003	NC_015052	GC	3	6	300742	300747	0 %	0 %	50 %	50 %	322688416
6004	NC_015052	GAC	2	6	300749	300754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688416
6005	NC_015052	GTA	2	6	300786	300791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688416
6006	NC_015052	GCA	2	6	300812	300817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688416
6007	NC_015052	GC	3	6	300823	300828	0 %	0 %	50 %	50 %	322688416
6008	NC_015052	GAG	2	6	300864	300869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322688416
6009	NC_015052	GTG	3	9	300976	300984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688416
6010	NC_015052	CGG	2	6	300989	300994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688416
6011	NC_015052	GCT	2	6	301003	301008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688416
6012	NC_015052	CAATCG	2	12	301041	301052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322688416
6013	NC_015052	ACC	2	6	301084	301089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688416
6014	NC_015052	GCC	2	6	301128	301133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688416
6015	NC_015052	CAGCAC	2	12	301140	301151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322688416
6016	NC_015052	GGC	2	6	301184	301189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688416
6017	NC_015052	ATC	2	6	301212	301217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688416
6018	NC_015052	GCTG	2	8	301263	301270	0 %	25 %	50 %	25 %	322688416
6019	NC_015052	CATC	2	8	301271	301278	25 %	25 %	0 %	50 %	322688416
6020	NC_015052	TCA	2	6	301349	301354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688416
6021	NC_015052	GAT	2	6	301537	301542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688417
6022	NC_015052	GCG	2	6	301565	301570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688417
6023	NC_015052	GAT	2	6	301702	301707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688417
6024	NC_015052	GA	3	6	301815	301820	50 %	0 %	50 %	0 %	322688417
6025	NC_015052	ACC	2	6	301877	301882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688417
6026	NC_015052	CAC	2	6	301885	301890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688417
6027	NC_015052	CAG	3	9	301891	301899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688417
6028	NC_015052	CGG	2	6	301960	301965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688417
6029	NC_015052	ACGAT	2	10	302030	302039	40 %	20 %	20 %	20 %	322688417
6030	NC_015052	TGC	2	6	302046	302051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688417
6031	NC_015052	GCG	2	6	302093	302098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688417
6032	NC_015052	GAT	2	6	302110	302115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688417
6033	NC_015052	GGGA	2	8	302130	302137	25 %	0 %	75 %	0 %	322688417
6034	NC_015052	CAA	2	6	302182	302187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688417
6035	NC_015052	TTC	2	6	302204	302209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688417
6036	NC_015052	CCT	2	6	302214	302219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688417
6037	NC_015052	CAC	2	6	302401	302406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688418
6038	NC_015052	GCC	2	6	302407	302412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688418
6039	NC_015052	CG	3	6	302449	302454	0 %	0 %	50 %	50 %	322688418
6040	NC_015052	TGC	2	6	302577	302582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688418
6041	NC_015052	TCT	2	6	302648	302653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688418
6042	NC_015052	GCC	2	6	302677	302682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688418
6043	NC_015052	GAT	2	6	302704	302709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688418
6044	NC_015052	CCG	2	6	302789	302794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688418
6045	NC_015052	GAATC	2	10	303154	303163	40 %	20 %	20 %	20 %	322688419
6046	NC_015052	CG	3	6	303190	303195	0 %	0 %	50 %	50 %	322688419
6047	NC_015052	CGG	2	6	303212	303217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688419
6048	NC_015052	CCAGT	2	10	303226	303235	20 %	20 %	20 %	40 %	322688419
6049	NC_015052	GAA	2	6	303285	303290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688419
6050	NC_015052	CGT	2	6	303323	303328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688419
6051	NC_015052	CGG	2	6	303359	303364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688419
6052	NC_015052	GCAC	2	8	303365	303372	25 %	0 %	25 %	50 %	322688419
6053	NC_015052	GTC	2	6	303381	303386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688419
6054	NC_015052	GCC	2	6	303387	303392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688419
6055	NC_015052	TCG	2	6	303397	303402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688419
6056	NC_015052	ATC	2	6	303466	303471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688419
6057	NC_015052	CG	3	6	303617	303622	0 %	0 %	50 %	50 %	322688419
6058	NC_015052	ACG	2	6	303634	303639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688419
6059	NC_015052	TCG	2	6	303975	303980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688420
6060	NC_015052	GCGG	2	8	303991	303998	0 %	0 %	75 %	25 %	322688420
6061	NC_015052	ATC	2	6	304035	304040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688420
6062	NC_015052	CGGC	2	8	304114	304121	0 %	0 %	50 %	50 %	322688420
6063	NC_015052	GCA	2	6	304162	304167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688420
6064	NC_015052	CGA	2	6	304206	304211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688420
6065	NC_015052	TTG	2	6	304215	304220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688420
6066	NC_015052	GCT	2	6	304324	304329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688420
6067	NC_015052	CGCA	3	12	304394	304405	25 %	0 %	25 %	50 %	322688420
6068	NC_015052	GTG	2	6	304455	304460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688420
6069	NC_015052	GTA	2	6	304481	304486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688420
6070	NC_015052	CGT	2	6	304489	304494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688420
6071	NC_015052	GC	3	6	304590	304595	0 %	0 %	50 %	50 %	322688420
6072	NC_015052	CGGG	2	8	304604	304611	0 %	0 %	75 %	25 %	322688420
6073	NC_015052	CTT	2	6	304646	304651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688420
6074	NC_015052	CGG	2	6	304657	304662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688420
6075	NC_015052	CGCC	2	8	304726	304733	0 %	0 %	25 %	75 %	322688420
6076	NC_015052	ATG	2	6	304749	304754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688420
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6078	NC_015052	CTT	2	6	304820	304825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688420
6079	NC_015052	CGG	2	6	304826	304831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688420
6080	NC_015052	GTT	2	6	305084	305089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688420
6081	NC_015052	CGG	2	6	305126	305131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688420
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6083	NC_015052	GGCC	2	8	305173	305180	0 %	0 %	50 %	50 %	322688420
6084	NC_015052	TGG	2	6	305230	305235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688420
6085	NC_015052	GAA	2	6	305252	305257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688420
6086	NC_015052	GCTG	2	8	305311	305318	0 %	25 %	50 %	25 %	322688420
6087	NC_015052	GCG	2	6	305358	305363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688420
6088	NC_015052	CGG	2	6	305380	305385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688420
6089	NC_015052	CGT	2	6	305533	305538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688420
6090	NC_015052	CGT	2	6	305563	305568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688420
6091	NC_015052	TCC	2	6	305652	305657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688420
6092	NC_015052	CGC	2	6	305680	305685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688420
6093	NC_015052	CG	3	6	305758	305763	0 %	0 %	50 %	50 %	322688420
6094	NC_015052	CACC	2	8	305785	305792	25 %	0 %	0 %	75 %	322688420
6095	NC_015052	CGGG	2	8	305853	305860	0 %	0 %	75 %	25 %	322688420
6096	NC_015052	CTC	2	6	305873	305878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688420
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6099	NC_015052	CT	3	6	306007	306012	0 %	50 %	0 %	50 %	322688420
6100	NC_015052	GTG	2	6	306066	306071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688420
6101	NC_015052	CG	3	6	306101	306106	0 %	0 %	50 %	50 %	322688420
6102	NC_015052	TGT	2	6	306108	306113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322688420
6103	NC_015052	CTG	2	6	306115	306120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688420
6104	NC_015052	ATG	2	6	306365	306370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688421
6105	NC_015052	GGC	2	6	306381	306386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688421
6106	NC_015052	ATA	2	6	306425	306430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322688421
6107	NC_015052	TGG	2	6	306432	306437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688421
6108	NC_015052	GTG	2	6	306440	306445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688421
6109	NC_015052	TCGGC	2	10	306447	306456	0 %	20 %	40 %	40 %	322688421
6110	NC_015052	CGCC	2	8	306483	306490	0 %	0 %	25 %	75 %	322688421
6111	NC_015052	CAA	2	6	306568	306573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688421
6112	NC_015052	TAC	2	6	306575	306580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688421
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6116	NC_015052	CAT	2	6	306718	306723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688421
6117	NC_015052	GGC	2	6	306811	306816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688421
6118	NC_015052	CGGC	2	8	306834	306841	0 %	0 %	50 %	50 %	322688421
6119	NC_015052	ACG	2	6	306857	306862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688421
6120	NC_015052	GTG	2	6	306914	306919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688421
6121	NC_015052	GCG	2	6	306974	306979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688421
6122	NC_015052	GGC	2	6	306992	306997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688421
6123	NC_015052	CGA	2	6	307017	307022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688421
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6125	NC_015052	GGC	2	6	307157	307162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688421
6126	NC_015052	CGA	2	6	307167	307172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688421
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6149	NC_015052	CCG	2	6	309208	309213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688422
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6152	NC_015052	ACT	2	6	309322	309327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688422
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6211	NC_015052	TGAC	2	8	312460	312467	25 %	25 %	25 %	25 %	322688426
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6222	NC_015052	GGT	2	6	312926	312931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688426
6223	NC_015052	CGACC	2	10	312932	312941	20 %	0 %	20 %	60 %	322688426
6224	NC_015052	CGA	2	6	312971	312976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688426
6225	NC_015052	ACA	2	6	312985	312990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688426
6226	NC_015052	CGA	2	6	313172	313177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688427
6227	NC_015052	GTC	2	6	313184	313189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688427
6228	NC_015052	CCCA	2	8	313209	313216	25 %	0 %	0 %	75 %	322688427
6229	NC_015052	GCT	2	6	313292	313297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688427
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6231	NC_015052	CGT	2	6	313457	313462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688427
6232	NC_015052	GTC	2	6	313516	313521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688427
6233	NC_015052	CGA	2	6	313568	313573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688427
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6235	NC_015052	TCA	2	6	313639	313644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688427
6236	NC_015052	CGAT	2	8	313678	313685	25 %	25 %	25 %	25 %	322688427
6237	NC_015052	CAT	2	6	313688	313693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688427
6238	NC_015052	GAA	2	6	313727	313732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688427
6239	NC_015052	CCA	2	6	313774	313779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688427
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6241	NC_015052	GCAG	2	8	313961	313968	25 %	0 %	50 %	25 %	322688427
6242	NC_015052	CTG	3	9	313989	313997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688427
6243	NC_015052	CGC	2	6	313998	314003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688427
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6246	NC_015052	TCG	2	6	314119	314124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688427
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6254	NC_015052	CCG	2	6	314608	314613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688427
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6261	NC_015052	GGCC	2	8	315023	315030	0 %	0 %	50 %	50 %	322688428
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6269	NC_015052	TGC	2	6	315337	315342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688428
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6352	NC_015052	ATC	2	6	320292	320297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688433
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6361	NC_015052	GAA	2	6	320638	320643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322688434
6362	NC_015052	CGAT	2	8	320667	320674	25 %	25 %	25 %	25 %	322688434
6363	NC_015052	GGGC	2	8	320719	320726	0 %	0 %	75 %	25 %	322688434
6364	NC_015052	GCG	3	9	320769	320777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688434
6365	NC_015052	GAC	2	6	320834	320839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688434
6366	NC_015052	CTCG	2	8	320847	320854	0 %	25 %	25 %	50 %	322688434
6367	NC_015052	ACC	3	9	320870	320878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688434
6368	NC_015052	CAG	2	6	320885	320890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688434
6369	NC_015052	CAG	2	6	320927	320932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688434
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6372	NC_015052	TGC	2	6	321081	321086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688434
6373	NC_015052	TGC	2	6	321132	321137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688434
6374	NC_015052	GCAAC	2	10	321181	321190	40 %	0 %	20 %	40 %	322688434
6375	NC_015052	TGC	2	6	321247	321252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688434
6376	NC_015052	TGG	2	6	321270	321275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688434
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6382	NC_015052	AGC	2	6	321753	321758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688435
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6384	NC_015052	TGG	2	6	321859	321864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688435
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6388	NC_015052	TGCAGG	2	12	322071	322082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322688435
6389	NC_015052	GC	3	6	322083	322088	0 %	0 %	50 %	50 %	322688435
6390	NC_015052	GCCG	2	8	322109	322116	0 %	0 %	50 %	50 %	322688435
6391	NC_015052	GAC	2	6	322148	322153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688435
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6481	NC_015052	ATG	2	6	327183	327188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688440
6482	NC_015052	CCG	2	6	327223	327228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688440
6483	NC_015052	GGT	2	6	327254	327259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688440
6484	NC_015052	GCC	2	6	327267	327272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688440
6485	NC_015052	GC	3	6	327306	327311	0 %	0 %	50 %	50 %	322688440
6486	NC_015052	CCG	3	9	327319	327327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688440
6487	NC_015052	CTTA	2	8	327357	327364	25 %	50 %	0 %	25 %	322688440
6488	NC_015052	CG	3	6	327385	327390	0 %	0 %	50 %	50 %	322688440
6489	NC_015052	CAG	2	6	327444	327449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688440
6490	NC_015052	GCC	3	9	327459	327467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688440
6491	NC_015052	CCG	2	6	327475	327480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688440
6492	NC_015052	TCG	2	6	327502	327507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688440
6493	NC_015052	ATC	2	6	327604	327609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688440
6494	NC_015052	ACG	2	6	327613	327618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688440
6495	NC_015052	GCCA	2	8	327660	327667	25 %	0 %	25 %	50 %	322688440
6496	NC_015052	TGCC	2	8	327676	327683	0 %	25 %	25 %	50 %	322688440
6497	NC_015052	CGTG	2	8	327710	327717	0 %	25 %	50 %	25 %	322688440
6498	NC_015052	CG	3	6	327729	327734	0 %	0 %	50 %	50 %	322688440
6499	NC_015052	TCA	2	6	327892	327897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688440
6500	NC_015052	GATT	2	8	327901	327908	25 %	50 %	25 %	0 %	322688440

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