MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 46421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015052	CG	3	6	227537	227542	0 %	0 %	50 %	50 %	322688363
4502	NC_015052	CAAT	2	8	227545	227552	50 %	25 %	0 %	25 %	322688363
4503	NC_015052	CAGC	2	8	227558	227565	25 %	0 %	25 %	50 %	322688363
4504	NC_015052	GC	3	6	227696	227701	0 %	0 %	50 %	50 %	322688363
4505	NC_015052	ATC	2	6	227710	227715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688363
4506	NC_015052	TGA	2	6	228012	228017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688364
4507	NC_015052	GCG	2	6	228046	228051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688364
4508	NC_015052	CGG	2	6	228312	228317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688364
4509	NC_015052	GCG	2	6	228330	228335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688364
4510	NC_015052	GC	3	6	228362	228367	0 %	0 %	50 %	50 %	322688364
4511	NC_015052	GCG	2	6	228418	228423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688364
4512	NC_015052	ATT	2	6	228448	228453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322688364
4513	NC_015052	CGG	2	6	228520	228525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688364
4514	NC_015052	CCA	2	6	228535	228540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688364
4515	NC_015052	AGC	2	6	228566	228571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688364
4516	NC_015052	GGT	2	6	228591	228596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688364
4517	NC_015052	CG	3	6	228609	228614	0 %	0 %	50 %	50 %	322688364
4518	NC_015052	GAT	3	9	228622	228630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688364
4519	NC_015052	CACCGG	2	12	228633	228644	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322688364
4520	NC_015052	CGG	2	6	228747	228752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688364
4521	NC_015052	GTTCG	2	10	228766	228775	0 %	40 %	40 %	20 %	322688364
4522	NC_015052	TAC	2	6	228811	228816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688364
4523	NC_015052	AGC	2	6	228902	228907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688364
4524	NC_015052	CGC	2	6	228933	228938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688364
4525	NC_015052	CTC	2	6	228940	228945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688364
4526	NC_015052	CGGGTG	2	12	228977	228988	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322688364
4527	NC_015052	GAT	2	6	229000	229005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688364
4528	NC_015052	TCC	2	6	229013	229018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688365
4529	NC_015052	GGC	2	6	229022	229027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4530	NC_015052	CG	3	6	229031	229036	0 %	0 %	50 %	50 %	322688365
4531	NC_015052	TCG	2	6	229045	229050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688365
4532	NC_015052	GGT	2	6	229158	229163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688365
4533	NC_015052	AAC	2	6	229168	229173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688365
4534	NC_015052	AGC	2	6	229186	229191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688365
4535	NC_015052	TCACG	2	10	229265	229274	20 %	20 %	20 %	40 %	322688365
4536	NC_015052	TGG	2	6	229283	229288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688365
4537	NC_015052	GCC	2	6	229290	229295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688365
4538	NC_015052	TCG	2	6	229330	229335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688365
4539	NC_015052	CGG	2	6	229379	229384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4540	NC_015052	GC	3	6	229408	229413	0 %	0 %	50 %	50 %	322688365
4541	NC_015052	CCAGC	2	10	229483	229492	20 %	0 %	20 %	60 %	322688365
4542	NC_015052	GGC	2	6	229518	229523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4543	NC_015052	GTG	2	6	229534	229539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688365
4544	NC_015052	TCC	2	6	229561	229566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688365
4545	NC_015052	CG	4	8	229616	229623	0 %	0 %	50 %	50 %	322688365
4546	NC_015052	GGC	2	6	229629	229634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4547	NC_015052	CGG	2	6	229655	229660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4548	NC_015052	CGG	2	6	229679	229684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4549	NC_015052	CTC	2	6	229713	229718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688365
4550	NC_015052	GGT	2	6	229748	229753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688365
4551	NC_015052	GCG	2	6	229771	229776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4552	NC_015052	CGT	2	6	229784	229789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688365
4553	NC_015052	GCC	2	6	229803	229808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688365
4554	NC_015052	CAG	2	6	229902	229907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688365
4555	NC_015052	GAT	2	6	230031	230036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688365
4556	NC_015052	GGC	2	6	230079	230084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4557	NC_015052	GCT	2	6	230087	230092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688365
4558	NC_015052	GC	3	6	230110	230115	0 %	0 %	50 %	50 %	322688365
4559	NC_015052	GGC	2	6	230116	230121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4560	NC_015052	CGCGGT	2	12	230156	230167	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322688365
4561	NC_015052	GTC	2	6	230211	230216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688365
4562	NC_015052	CGG	2	6	230243	230248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4563	NC_015052	CGG	2	6	230300	230305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4564	NC_015052	CGG	2	6	230344	230349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4565	NC_015052	CGG	2	6	230373	230378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688365
4566	NC_015052	AGT	2	6	230416	230421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688365
4567	NC_015052	CG	3	6	230498	230503	0 %	0 %	50 %	50 %	322688365
4568	NC_015052	CAC	2	6	230874	230879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688366
4569	NC_015052	ACG	2	6	230906	230911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4570	NC_015052	CCA	2	6	230915	230920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688366
4571	NC_015052	TCGGGC	2	12	230941	230952	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322688366
4572	NC_015052	TCG	2	6	230972	230977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4573	NC_015052	CGA	2	6	230988	230993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4574	NC_015052	AAT	2	6	231085	231090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322688366
4575	NC_015052	CGGC	2	8	231202	231209	0 %	0 %	50 %	50 %	322688366
4576	NC_015052	AGC	2	6	231245	231250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4577	NC_015052	CGG	2	6	231252	231257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688366
4578	NC_015052	CAT	2	6	231273	231278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688366
4579	NC_015052	TGC	2	6	231287	231292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4580	NC_015052	CAC	2	6	231300	231305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688366
4581	NC_015052	CG	4	8	231306	231313	0 %	0 %	50 %	50 %	322688366
4582	NC_015052	CG	3	6	231321	231326	0 %	0 %	50 %	50 %	322688366
4583	NC_015052	ATT	2	6	231376	231381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322688366
4584	NC_015052	CGG	2	6	231417	231422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688366
4585	NC_015052	CCA	2	6	231423	231428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688366
4586	NC_015052	CGCC	2	8	231435	231442	0 %	0 %	25 %	75 %	322688366
4587	NC_015052	CGA	2	6	231450	231455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4588	NC_015052	CGA	2	6	231489	231494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4589	NC_015052	AGC	2	6	231521	231526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4590	NC_015052	AAC	2	6	231642	231647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688366
4591	NC_015052	ACA	2	6	231716	231721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688366
4592	NC_015052	CGC	2	6	231722	231727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688366
4593	NC_015052	CGC	2	6	231745	231750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688366
4594	NC_015052	GCCG	2	8	231777	231784	0 %	0 %	50 %	50 %	322688366
4595	NC_015052	CGA	2	6	231804	231809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4596	NC_015052	GTG	2	6	231816	231821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688366
4597	NC_015052	CTG	2	6	231865	231870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4598	NC_015052	CGG	2	6	231920	231925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688366
4599	NC_015052	TGG	2	6	231974	231979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688366
4600	NC_015052	GTCC	2	8	231988	231995	0 %	25 %	25 %	50 %	322688366
4601	NC_015052	CGG	2	6	232004	232009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688366
4602	NC_015052	CCG	3	9	232055	232063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688366
4603	NC_015052	GCCT	2	8	232092	232099	0 %	25 %	25 %	50 %	322688366
4604	NC_015052	CGT	2	6	232164	232169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4605	NC_015052	GC	3	6	232227	232232	0 %	0 %	50 %	50 %	322688366
4606	NC_015052	TTGC	2	8	232270	232277	0 %	50 %	25 %	25 %	322688366
4607	NC_015052	GGC	2	6	232324	232329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688366
4608	NC_015052	ACG	2	6	232382	232387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4609	NC_015052	CA	3	6	232411	232416	50 %	0 %	0 %	50 %	322688366
4610	NC_015052	GCT	2	6	232422	232427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4611	NC_015052	ACG	2	6	232430	232435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688366
4612	NC_015052	CGA	2	6	232585	232590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322688367
4613	NC_015052	GC	3	6	232654	232659	0 %	0 %	50 %	50 %	322688367
4614	NC_015052	CG	3	6	232756	232761	0 %	0 %	50 %	50 %	322688367
4615	NC_015052	TCA	2	6	232867	232872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688367
4616	NC_015052	ATC	2	6	232908	232913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688367
4617	NC_015052	AGT	2	6	232951	232956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688367
4618	NC_015052	CAC	2	6	233069	233074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688367
4619	NC_015052	TGCG	2	8	233076	233083	0 %	25 %	50 %	25 %	322688367
4620	NC_015052	GCAT	2	8	233094	233101	25 %	25 %	25 %	25 %	322688367
4621	NC_015052	GAT	2	6	233102	233107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688367
4622	NC_015052	CGGC	2	8	233154	233161	0 %	0 %	50 %	50 %	322688367
4623	NC_015052	CGG	2	6	233172	233177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688367
4624	NC_015052	TCG	2	6	233250	233255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688367
4625	NC_015052	ATC	2	6	233315	233320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322688367
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4629	NC_015052	TGA	2	6	233400	233405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688367
4630	NC_015052	CG	3	6	233408	233413	0 %	0 %	50 %	50 %	322688367
4631	NC_015052	GC	3	6	233444	233449	0 %	0 %	50 %	50 %	322688367
4632	NC_015052	CGT	2	6	233476	233481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688367
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4635	NC_015052	CCT	2	6	233835	233840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688368
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4733	NC_015052	CG	3	6	238311	238316	0 %	0 %	50 %	50 %	322688372
4734	NC_015052	CGC	2	6	238351	238356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688372
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4741	NC_015052	CGC	2	6	238585	238590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688372
4742	NC_015052	TGGC	2	8	238595	238602	0 %	25 %	50 %	25 %	322688372
4743	NC_015052	CCGC	2	8	238606	238613	0 %	0 %	25 %	75 %	322688372
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4746	NC_015052	TGG	2	6	238671	238676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322688372
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4750	NC_015052	TTC	2	6	238898	238903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688372
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4859	NC_015052	CTC	2	6	243729	243734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322688375
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4982	NC_015052	ACC	2	6	249862	249867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688380
4983	NC_015052	CCA	2	6	249965	249970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322688380
4984	NC_015052	CGG	2	6	249996	250001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688380
4985	NC_015052	AAGG	2	8	250036	250043	50 %	0 %	50 %	0 %	322688380
4986	NC_015052	CGG	2	6	250062	250067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322688380
4987	NC_015052	GAAG	2	8	250152	250159	50 %	0 %	50 %	0 %	322688380
4988	NC_015052	CGC	2	6	250311	250316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322688380
4989	NC_015052	GCT	2	6	250332	250337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688380
4990	NC_015052	ACA	2	6	250379	250384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688380
4991	NC_015052	AAGGCG	2	12	250752	250763	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322688381
4992	NC_015052	CTG	2	6	250782	250787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688381
4993	NC_015052	TGA	2	6	250807	250812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322688381
4994	NC_015052	TTC	2	6	250824	250829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322688381
4995	NC_015052	GTC	2	6	250848	250853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688381
4996	NC_015052	CTG	2	6	250875	250880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688381
4997	NC_015052	AAC	2	6	251049	251054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322688381
4998	NC_015052	TGC	2	6	251056	251061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688381
4999	NC_015052	CTG	2	6	251073	251078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322688381
5000	NC_015052	GCGTCC	2	12	251097	251108	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322688381

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