MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014723	TTGA	2	8	585	592	25 %	50 %	25 %	0 %	330399457
2	NC_014723	TCAG	2	8	1266	1273	25 %	25 %	25 %	25 %	330399458
3	NC_014723	AACC	2	8	2050	2057	50 %	0 %	0 %	50 %	330399458
4	NC_014723	GCCA	2	8	2346	2353	25 %	0 %	25 %	50 %	330399458
5	NC_014723	CGTC	2	8	2451	2458	0 %	25 %	25 %	50 %	330399458
6	NC_014723	ATCC	2	8	2934	2941	25 %	25 %	0 %	50 %	330399458
7	NC_014723	GAAC	2	8	3025	3032	50 %	0 %	25 %	25 %	330399458
8	NC_014723	ATTC	2	8	3351	3358	25 %	50 %	0 %	25 %	330399458
9	NC_014723	CCAT	2	8	4575	4582	25 %	25 %	0 %	50 %	330399458
10	NC_014723	CAAC	2	8	4745	4752	50 %	0 %	0 %	50 %	330399458
11	NC_014723	GAAG	2	8	4991	4998	50 %	0 %	50 %	0 %	330399459
12	NC_014723	ACAA	2	8	5118	5125	75 %	0 %	0 %	25 %	330399459
13	NC_014723	AAGG	2	8	5238	5245	50 %	0 %	50 %	0 %	330399459
14	NC_014723	GCTG	2	8	6905	6912	0 %	25 %	50 %	25 %	330399459
15	NC_014723	GCTA	2	8	7482	7489	25 %	25 %	25 %	25 %	330399459
16	NC_014723	TGCC	2	8	7570	7577	0 %	25 %	25 %	50 %	330399459
17	NC_014723	GCTG	2	8	8622	8629	0 %	25 %	50 %	25 %	330399460
18	NC_014723	CGTT	2	8	8851	8858	0 %	50 %	25 %	25 %	330399460
19	NC_014723	CCAA	2	8	10571	10578	50 %	0 %	0 %	50 %	330399460
20	NC_014723	CCGC	2	8	11509	11516	0 %	0 %	25 %	75 %	330399460
21	NC_014723	CTGG	2	8	11754	11761	0 %	25 %	50 %	25 %	330399460
22	NC_014723	CAAC	2	8	12162	12169	50 %	0 %	0 %	50 %	330399460
23	NC_014723	GCTG	2	8	12192	12199	0 %	25 %	50 %	25 %	330399460
24	NC_014723	GCCG	2	8	12660	12667	0 %	0 %	50 %	50 %	330399460
25	NC_014723	CAGC	2	8	13091	13098	25 %	0 %	25 %	50 %	330399460
26	NC_014723	GGCA	2	8	13284	13291	25 %	0 %	50 %	25 %	330399460
27	NC_014723	TCCT	2	8	13387	13394	0 %	50 %	0 %	50 %	330399460
28	NC_014723	TCAA	2	8	13462	13469	50 %	25 %	0 %	25 %	330399460
29	NC_014723	GCAG	2	8	14127	14134	25 %	0 %	50 %	25 %	330399460
30	NC_014723	CCAG	2	8	15855	15862	25 %	0 %	25 %	50 %	330399460
31	NC_014723	GACC	2	8	15898	15905	25 %	0 %	25 %	50 %	330399460
32	NC_014723	GACC	2	8	16862	16869	25 %	0 %	25 %	50 %	330399462
33	NC_014723	CAGC	2	8	16909	16916	25 %	0 %	25 %	50 %	330399462
34	NC_014723	GCCC	2	8	16920	16927	0 %	0 %	25 %	75 %	330399462
35	NC_014723	TGGA	2	8	18274	18281	25 %	25 %	50 %	0 %	330399463
36	NC_014723	TGGC	2	8	18952	18959	0 %	25 %	50 %	25 %	330399465
37	NC_014723	CGCC	2	8	19018	19025	0 %	0 %	25 %	75 %	330399465
38	NC_014723	AGCG	2	8	19094	19101	25 %	0 %	50 %	25 %	330399465
39	NC_014723	AACC	2	8	19381	19388	50 %	0 %	0 %	50 %	330399466
40	NC_014723	GCTC	2	8	21145	21152	0 %	25 %	25 %	50 %	330399468
41	NC_014723	TGGT	2	8	21870	21877	0 %	50 %	50 %	0 %	330399468
42	NC_014723	TGTT	2	8	21893	21900	0 %	75 %	25 %	0 %	330399468
43	NC_014723	TGTC	2	8	22252	22259	0 %	50 %	25 %	25 %	330399469
44	NC_014723	CTGA	2	8	22896	22903	25 %	25 %	25 %	25 %	330399470
45	NC_014723	CCTT	2	8	23029	23036	0 %	50 %	0 %	50 %	330399470
46	NC_014723	CAGC	2	8	23305	23312	25 %	0 %	25 %	50 %	330399471
47	NC_014723	TCAT	2	8	23444	23451	25 %	50 %	0 %	25 %	330399472
48	NC_014723	CCAT	2	8	23625	23632	25 %	25 %	0 %	50 %	330399472
49	NC_014723	CGTA	2	8	25439	25446	25 %	25 %	25 %	25 %	330399476
50	NC_014723	CCTT	2	8	25597	25604	0 %	50 %	0 %	50 %	330399476
51	NC_014723	AGCG	2	8	26389	26396	25 %	0 %	50 %	25 %	330399477
52	NC_014723	AGCC	2	8	26534	26541	25 %	0 %	25 %	50 %	330399477
53	NC_014723	ATGG	2	8	26597	26604	25 %	25 %	50 %	0 %	330399477
54	NC_014723	TGCC	2	8	26752	26759	0 %	25 %	25 %	50 %	330399477
55	NC_014723	ATGA	2	8	27235	27242	50 %	25 %	25 %	0 %	330399477
56	NC_014723	GCGA	2	8	27767	27774	25 %	0 %	50 %	25 %	330399478
57	NC_014723	ATTG	2	8	28107	28114	25 %	50 %	25 %	0 %	330399478
58	NC_014723	CTGC	2	8	28267	28274	0 %	25 %	25 %	50 %	330399478
59	NC_014723	GAAC	2	8	29206	29213	50 %	0 %	25 %	25 %	330399479
60	NC_014723	GCAA	2	8	29606	29613	50 %	0 %	25 %	25 %	330399479
61	NC_014723	GCAC	2	8	30570	30577	25 %	0 %	25 %	50 %	330399480
62	NC_014723	CGGC	2	8	30688	30695	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
63	NC_014723	AGGA	2	8	31486	31493	50 %	0 %	50 %	0 %	330399480
64	NC_014723	CAGA	2	8	31588	31595	50 %	0 %	25 %	25 %	330399480
65	NC_014723	CAAG	2	8	31815	31822	50 %	0 %	25 %	25 %	330399481
66	NC_014723	TCGA	2	8	31912	31919	25 %	25 %	25 %	25 %	330399481
67	NC_014723	ATAA	2	8	32000	32007	75 %	25 %	0 %	0 %	330399481
68	NC_014723	GGGC	2	8	32040	32047	0 %	0 %	75 %	25 %	330399481
69	NC_014723	GGTA	2	8	32374	32381	25 %	25 %	50 %	0 %	330399482
70	NC_014723	GATT	2	8	33342	33349	25 %	50 %	25 %	0 %	330399484
71	NC_014723	ACTG	2	8	33468	33475	25 %	25 %	25 %	25 %	330399485
72	NC_014723	GTAC	2	8	34314	34321	25 %	25 %	25 %	25 %	330399486
73	NC_014723	CAGT	2	8	36199	36206	25 %	25 %	25 %	25 %	330399490
74	NC_014723	GCTT	2	8	36541	36548	0 %	50 %	25 %	25 %	330399491
75	NC_014723	TTAA	2	8	36637	36644	50 %	50 %	0 %	0 %	330399491
76	NC_014723	TTCG	2	8	37467	37474	0 %	50 %	25 %	25 %	330399492
77	NC_014723	ACGT	2	8	37693	37700	25 %	25 %	25 %	25 %	330399492
78	NC_014723	CCTT	2	8	38570	38577	0 %	50 %	0 %	50 %	330399493
79	NC_014723	GTTG	2	8	38708	38715	0 %	50 %	50 %	0 %	330399493
80	NC_014723	GCCG	2	8	38835	38842	0 %	0 %	50 %	50 %	330399493
81	NC_014723	GCCG	2	8	40677	40684	0 %	0 %	50 %	50 %	330399495
82	NC_014723	AGTC	2	8	40801	40808	25 %	25 %	25 %	25 %	330399495
83	NC_014723	CACG	2	8	41814	41821	25 %	0 %	25 %	50 %	330399496
84	NC_014723	GAAG	2	8	42492	42499	50 %	0 %	50 %	0 %	330399497
85	NC_014723	GCAG	2	8	43211	43218	25 %	0 %	50 %	25 %	330399498
86	NC_014723	CGCC	2	8	43501	43508	0 %	0 %	25 %	75 %	330399498
87	NC_014723	TCTG	2	8	43801	43808	0 %	50 %	25 %	25 %	330399499
88	NC_014723	CATC	2	8	43991	43998	25 %	25 %	0 %	50 %	330399500
89	NC_014723	GCCG	2	8	44049	44056	0 %	0 %	50 %	50 %	330399500
90	NC_014723	CGCC	2	8	44181	44188	0 %	0 %	25 %	75 %	330399500
91	NC_014723	CCGA	2	8	44843	44850	25 %	0 %	25 %	50 %	330399501
92	NC_014723	CGTG	2	8	44940	44947	0 %	25 %	50 %	25 %	330399501
93	NC_014723	ACGC	2	8	45811	45818	25 %	0 %	25 %	50 %	330399503
94	NC_014723	AGGA	2	8	45930	45937	50 %	0 %	50 %	0 %	330399503
95	NC_014723	TGCT	2	8	47111	47118	0 %	50 %	25 %	25 %	330399505
96	NC_014723	CGTG	2	8	47380	47387	0 %	25 %	50 %	25 %	330399506
97	NC_014723	CTAC	2	8	47415	47422	25 %	25 %	0 %	50 %	330399506
98	NC_014723	GAGT	2	8	48402	48409	25 %	25 %	50 %	0 %	330399508
99	NC_014723	TGGG	2	8	48519	48526	0 %	25 %	75 %	0 %	330399508
100	NC_014723	TGTT	2	8	48754	48761	0 %	75 %	25 %	0 %	330399509
101	NC_014723	TCTT	2	8	49057	49064	0 %	75 %	0 %	25 %	330399509
102	NC_014723	AAGA	2	8	49437	49444	75 %	0 %	25 %	0 %	330399509
103	NC_014723	GAAG	2	8	50165	50172	50 %	0 %	50 %	0 %	330399509
104	NC_014723	GCAG	2	8	50474	50481	25 %	0 %	50 %	25 %	330399509
105	NC_014723	GGCC	2	8	50503	50510	0 %	0 %	50 %	50 %	330399509
106	NC_014723	TGGA	2	8	50864	50871	25 %	25 %	50 %	0 %	330399510
107	NC_014723	ACTG	2	8	51880	51887	25 %	25 %	25 %	25 %	330399510
108	NC_014723	TGGC	2	8	52284	52291	0 %	25 %	50 %	25 %	330399510
109	NC_014723	TGAT	2	8	52875	52882	25 %	50 %	25 %	0 %	330399510
110	NC_014723	AACA	2	8	53440	53447	75 %	0 %	0 %	25 %	330399511
111	NC_014723	GCAA	2	8	53546	53553	50 %	0 %	25 %	25 %	330399511
112	NC_014723	CGGC	2	8	53744	53751	0 %	0 %	50 %	50 %	330399511
113	NC_014723	AGCA	2	8	54660	54667	50 %	0 %	25 %	25 %	330399512
114	NC_014723	CGGT	2	8	56487	56494	0 %	25 %	50 %	25 %	330399514
115	NC_014723	TACG	2	8	56729	56736	25 %	25 %	25 %	25 %	330399514
116	NC_014723	GCTA	2	8	56807	56814	25 %	25 %	25 %	25 %	330399514
117	NC_014723	GCAA	2	8	57297	57304	50 %	0 %	25 %	25 %	330399516
118	NC_014723	AGGA	2	8	57520	57527	50 %	0 %	50 %	0 %	330399516
119	NC_014723	AGAA	2	8	57639	57646	75 %	0 %	25 %	0 %	330399517
120	NC_014723	GGCA	2	8	57744	57751	25 %	0 %	50 %	25 %	330399517
121	NC_014723	CCAC	2	8	57845	57852	25 %	0 %	0 %	75 %	330399517
122	NC_014723	CGAG	2	8	57964	57971	25 %	0 %	50 %	25 %	330399518
123	NC_014723	GCTT	2	8	58017	58024	0 %	50 %	25 %	25 %	330399518
124	NC_014723	TGTA	2	8	58467	58474	25 %	50 %	25 %	0 %	330399518
125	NC_014723	CCGA	2	8	58558	58565	25 %	0 %	25 %	50 %	330399519
126	NC_014723	GGAA	2	8	58984	58991	50 %	0 %	50 %	0 %	330399519
127	NC_014723	TGAT	2	8	59195	59202	25 %	50 %	25 %	0 %	330399519
128	NC_014723	TGGC	2	8	59252	59259	0 %	25 %	50 %	25 %	330399520
129	NC_014723	AGGC	2	8	59498	59505	25 %	0 %	50 %	25 %	330399520
130	NC_014723	ATGG	2	8	59725	59732	25 %	25 %	50 %	0 %	330399520
131	NC_014723	GCGT	2	8	60146	60153	0 %	25 %	50 %	25 %	330399520
132	NC_014723	ACGG	2	8	60400	60407	25 %	0 %	50 %	25 %	330399520
133	NC_014723	CCTT	2	8	60963	60970	0 %	50 %	0 %	50 %	330399521
134	NC_014723	GCCG	2	8	61198	61205	0 %	0 %	50 %	50 %	330399521
135	NC_014723	CCTG	2	8	61440	61447	0 %	25 %	25 %	50 %	330399522
136	NC_014723	TTAC	2	8	61626	61633	25 %	50 %	0 %	25 %	330399522
137	NC_014723	AACG	2	8	62351	62358	50 %	0 %	25 %	25 %	330399523
138	NC_014723	TCAT	2	8	62601	62608	25 %	50 %	0 %	25 %	330399523
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.