MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 2823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014723	GCCGA	2	10	92857	92866	20 %	0 %	40 %	40 %	330399559
1502	NC_014723	ACG	2	6	92873	92878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399559
1503	NC_014723	CG	3	6	92910	92915	0 %	0 %	50 %	50 %	330399559
1504	NC_014723	TCG	2	6	92924	92929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399559
1505	NC_014723	GCT	2	6	92949	92954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399559
1506	NC_014723	GC	3	6	92967	92972	0 %	0 %	50 %	50 %	330399559
1507	NC_014723	ACCG	2	8	93018	93025	25 %	0 %	25 %	50 %	330399559
1508	NC_014723	CG	3	6	93054	93059	0 %	0 %	50 %	50 %	330399559
1509	NC_014723	ATC	2	6	93101	93106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399559
1510	NC_014723	GCC	2	6	93118	93123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399559
1511	NC_014723	GGC	2	6	93153	93158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399559
1512	NC_014723	GCC	2	6	93165	93170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399559
1513	NC_014723	CTA	2	6	93193	93198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399559
1514	NC_014723	ACC	2	6	93227	93232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399559
1515	NC_014723	CGC	2	6	93248	93253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399559
1516	NC_014723	TAC	2	6	93352	93357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399559
1517	NC_014723	GC	4	8	93380	93387	0 %	0 %	50 %	50 %	330399559
1518	NC_014723	AGCAC	2	10	93389	93398	40 %	0 %	20 %	40 %	330399559
1519	NC_014723	GCATC	2	10	93515	93524	20 %	20 %	20 %	40 %	330399560
1520	NC_014723	GAG	2	6	93527	93532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399560
1521	NC_014723	CGCGC	2	10	93542	93551	0 %	0 %	40 %	60 %	330399560
1522	NC_014723	CGA	2	6	93580	93585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1523	NC_014723	GC	4	8	93607	93614	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1524	NC_014723	GC	3	6	93654	93659	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1525	NC_014723	GC	3	6	93705	93710	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1526	NC_014723	TCA	2	6	93750	93755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399560
1527	NC_014723	GCG	2	6	93771	93776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399560
1528	NC_014723	GGC	2	6	94003	94008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399560
1529	NC_014723	GTG	2	6	94025	94030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399560
1530	NC_014723	GCA	3	9	94147	94155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1531	NC_014723	CG	3	6	94191	94196	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1532	NC_014723	ACG	2	6	94301	94306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1533	NC_014723	GC	3	6	94332	94337	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1534	NC_014723	GCA	3	9	94372	94380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1535	NC_014723	GC	3	6	94460	94465	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1536	NC_014723	CGG	2	6	94497	94502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399560
1537	NC_014723	CCG	2	6	94509	94514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399560
1538	NC_014723	GC	3	6	94550	94555	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1539	NC_014723	GACATC	2	12	94607	94618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330399560
1540	NC_014723	GAA	2	6	94640	94645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399560
1541	NC_014723	GC	3	6	94681	94686	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1542	NC_014723	CGG	3	9	94695	94703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399560
1543	NC_014723	ACC	2	6	94706	94711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399560
1544	NC_014723	GC	3	6	94725	94730	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1545	NC_014723	TCGCG	2	10	94777	94786	0 %	20 %	40 %	40 %	330399560
1546	NC_014723	GCT	2	6	94819	94824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1547	NC_014723	GCA	2	6	94924	94929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1548	NC_014723	GCT	2	6	95047	95052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1549	NC_014723	GC	4	8	95095	95102	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1550	NC_014723	GCG	2	6	95124	95129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399560
1551	NC_014723	CCG	2	6	95154	95159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399560
1552	NC_014723	GAT	2	6	95179	95184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399560
1553	NC_014723	GCT	2	6	95262	95267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1554	NC_014723	GGC	2	6	95318	95323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399560
1555	NC_014723	GC	3	6	95402	95407	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1556	NC_014723	GCC	2	6	95459	95464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399560
1557	NC_014723	GGC	2	6	95525	95530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399560
1558	NC_014723	CG	3	6	95571	95576	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1559	NC_014723	AATC	2	8	95598	95605	50 %	25 %	0 %	25 %	330399560
1560	NC_014723	GCT	2	6	95668	95673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1561	NC_014723	GCCG	2	8	95707	95714	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1562	NC_014723	GC	3	6	95724	95729	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1563	NC_014723	GC	3	6	95783	95788	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1564	NC_014723	TGC	2	6	95805	95810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1565	NC_014723	CG	3	6	95920	95925	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1566	NC_014723	GTGCG	2	10	95940	95949	0 %	20 %	60 %	20 %	330399560
1567	NC_014723	GGCGC	2	10	95974	95983	0 %	0 %	60 %	40 %	330399560
1568	NC_014723	GC	4	8	95980	95987	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1569	NC_014723	CGC	2	6	96053	96058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399560
1570	NC_014723	GCG	2	6	96059	96064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399560
1571	NC_014723	CGC	2	6	96079	96084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399560
1572	NC_014723	CTG	2	6	96101	96106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1573	NC_014723	CG	3	6	96182	96187	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1574	NC_014723	GCT	2	6	96220	96225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1575	NC_014723	GC	3	6	96226	96231	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1576	NC_014723	TGC	2	6	96252	96257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1577	NC_014723	GC	4	8	96296	96303	0 %	0 %	50 %	50 %	330399560
1578	NC_014723	CGGCA	2	10	96334	96343	20 %	0 %	40 %	40 %	330399560
1579	NC_014723	ATT	2	6	96395	96400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330399560
1580	NC_014723	ACT	2	6	96409	96414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399560
1581	NC_014723	AGG	2	6	96429	96434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399560
1582	NC_014723	GCT	2	6	96448	96453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399560
1583	NC_014723	TGG	2	6	96513	96518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399560
1584	NC_014723	TTG	2	6	96565	96570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399560
1585	NC_014723	GAAC	2	8	96844	96851	50 %	0 %	25 %	25 %	330399561
1586	NC_014723	GGC	2	6	97010	97015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399561
1587	NC_014723	AGCG	2	8	97060	97067	25 %	0 %	50 %	25 %	330399561
1588	NC_014723	GGC	2	6	97108	97113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399561
1589	NC_014723	A	6	6	97798	97803	100 %	0 %	0 %	0 %	330399562
1590	NC_014723	ATT	2	6	97808	97813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330399562
1591	NC_014723	AGTA	2	8	97890	97897	50 %	25 %	25 %	0 %	330399562
1592	NC_014723	GAT	2	6	97981	97986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399562
1593	NC_014723	GAGCA	2	10	98057	98066	40 %	0 %	40 %	20 %	330399562
1594	NC_014723	GA	3	6	98080	98085	50 %	0 %	50 %	0 %	330399562
1595	NC_014723	ACA	2	6	98093	98098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399562
1596	NC_014723	ATTAA	2	10	98110	98119	60 %	40 %	0 %	0 %	330399562
1597	NC_014723	TGC	2	6	98159	98164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399562
1598	NC_014723	CCA	2	6	98166	98171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399562
1599	NC_014723	ATA	2	6	98221	98226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330399562
1600	NC_014723	GGA	2	6	98247	98252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399562
1601	NC_014723	TGA	2	6	98289	98294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399562
1602	NC_014723	GATA	2	8	98295	98302	50 %	25 %	25 %	0 %	330399562
1603	NC_014723	CGA	2	6	98436	98441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399563
1604	NC_014723	CGA	2	6	98450	98455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399563
1605	NC_014723	TG	3	6	98467	98472	0 %	50 %	50 %	0 %	330399563
1606	NC_014723	GCC	2	6	98477	98482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399563
1607	NC_014723	CCA	2	6	98503	98508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399563
1608	NC_014723	TCG	2	6	98570	98575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399563
1609	NC_014723	A	6	6	98632	98637	100 %	0 %	0 %	0 %	330399563
1610	NC_014723	CAA	2	6	98664	98669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399563
1611	NC_014723	ATG	2	6	98774	98779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399563
1612	NC_014723	AGCGCC	2	12	98837	98848	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330399563
1613	NC_014723	GCG	2	6	98987	98992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399563
1614	NC_014723	GCT	2	6	99059	99064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399563
1615	NC_014723	GTAG	2	8	99079	99086	25 %	25 %	50 %	0 %	330399563
1616	NC_014723	GT	3	6	99093	99098	0 %	50 %	50 %	0 %	330399563
1617	NC_014723	TTGG	2	8	99241	99248	0 %	50 %	50 %	0 %	330399563
1618	NC_014723	GTC	2	6	99280	99285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399563
1619	NC_014723	CAG	2	6	99304	99309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399563
1620	NC_014723	TCA	2	6	99324	99329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399563
1621	NC_014723	GCC	2	6	99365	99370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399563
1622	NC_014723	GTA	2	6	99423	99428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399563
1623	NC_014723	ATCG	2	8	99454	99461	25 %	25 %	25 %	25 %	330399563
1624	NC_014723	ATC	2	6	99491	99496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399563
1625	NC_014723	ACA	2	6	99509	99514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399563
1626	NC_014723	ATG	2	6	99565	99570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399563
1627	NC_014723	ATC	2	6	99572	99577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399563
1628	NC_014723	TG	3	6	99627	99632	0 %	50 %	50 %	0 %	330399563
1629	NC_014723	TCTG	2	8	99641	99648	0 %	50 %	25 %	25 %	330399563
1630	NC_014723	TGC	2	6	99697	99702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399563
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1745	NC_014723	G	7	7	107299	107305	0 %	0 %	100 %	0 %	330399571
1746	NC_014723	GCAG	2	8	107316	107323	25 %	0 %	50 %	25 %	330399571
1747	NC_014723	GCTTGA	2	12	107424	107435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
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1871	NC_014723	TGAG	2	8	115313	115320	25 %	25 %	50 %	0 %	330399583
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1874	NC_014723	GCT	2	6	116118	116123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399584
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1989	NC_014723	TGC	2	6	122980	122985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399600
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1991	NC_014723	TGG	2	6	123061	123066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399600
1992	NC_014723	GCA	2	6	123421	123426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399602
1993	NC_014723	GGT	2	6	123471	123476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399602
1994	NC_014723	GC	3	6	123501	123506	0 %	0 %	50 %	50 %	330399602
1995	NC_014723	AC	3	6	123511	123516	50 %	0 %	0 %	50 %	330399602
1996	NC_014723	GCT	2	6	123576	123581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399602
1997	NC_014723	GCC	3	9	123605	123613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399602
1998	NC_014723	GCCG	2	8	123673	123680	0 %	0 %	50 %	50 %	330399602
1999	NC_014723	CGC	2	6	124349	124354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399603
2000	NC_014723	TGT	2	6	124370	124375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399603

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