MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 2823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014723	GCCA	2	8	63140	63147	25 %	0 %	25 %	50 %	330399523
1002	NC_014723	AGCG	2	8	63170	63177	25 %	0 %	50 %	25 %	330399523
1003	NC_014723	CGA	2	6	63259	63264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1004	NC_014723	AGA	2	6	63270	63275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399523
1005	NC_014723	CAA	2	6	63289	63294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399523
1006	NC_014723	ACC	2	6	63296	63301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399523
1007	NC_014723	ATG	2	6	63362	63367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399523
1008	NC_014723	CGGC	2	8	63373	63380	0 %	0 %	50 %	50 %	330399523
1009	NC_014723	CAAC	2	8	63412	63419	50 %	0 %	0 %	50 %	330399523
1010	NC_014723	TGGC	2	8	63441	63448	0 %	25 %	50 %	25 %	330399523
1011	NC_014723	GGT	2	6	63484	63489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399523
1012	NC_014723	GATG	2	8	63526	63533	25 %	25 %	50 %	0 %	330399523
1013	NC_014723	TCG	2	6	63555	63560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1014	NC_014723	TGGG	2	8	63626	63633	0 %	25 %	75 %	0 %	330399523
1015	NC_014723	GAT	2	6	63682	63687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399523
1016	NC_014723	CGC	2	6	63711	63716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399523
1017	NC_014723	TTAC	2	8	63808	63815	25 %	50 %	0 %	25 %	330399523
1018	NC_014723	AAC	2	6	63873	63878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399523
1019	NC_014723	AAGG	2	8	63893	63900	50 %	0 %	50 %	0 %	330399523
1020	NC_014723	TGG	2	6	63954	63959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399523
1021	NC_014723	ACTGGA	2	12	63961	63972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330399523
1022	NC_014723	GTG	2	6	64004	64009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399523
1023	NC_014723	TCGCAA	2	12	64054	64065	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330399523
1024	NC_014723	A	6	6	64064	64069	100 %	0 %	0 %	0 %	330399523
1025	NC_014723	TCG	2	6	64144	64149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1026	NC_014723	GC	3	6	64151	64156	0 %	0 %	50 %	50 %	330399523
1027	NC_014723	T	6	6	64170	64175	0 %	100 %	0 %	0 %	330399523
1028	NC_014723	ACA	2	6	64233	64238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399523
1029	NC_014723	CTG	2	6	64256	64261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1030	NC_014723	TGC	2	6	64335	64340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1031	NC_014723	TCG	2	6	64385	64390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1032	NC_014723	GCT	2	6	64435	64440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1033	NC_014723	GAC	2	6	64460	64465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1034	NC_014723	GCA	2	6	64489	64494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1035	NC_014723	ACG	2	6	64502	64507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399523
1036	NC_014723	TCA	2	6	64558	64563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399523
1037	NC_014723	A	6	6	64575	64580	100 %	0 %	0 %	0 %	330399523
1038	NC_014723	AAC	2	6	64592	64597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399523
1039	NC_014723	GGC	2	6	64618	64623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399524
1040	NC_014723	CTG	2	6	64676	64681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399524
1041	NC_014723	GCT	2	6	64696	64701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399525
1042	NC_014723	GCC	2	6	64741	64746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399525
1043	NC_014723	GAA	2	6	64781	64786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399525
1044	NC_014723	TGAC	2	8	64830	64837	25 %	25 %	25 %	25 %	330399525
1045	NC_014723	CAA	2	6	64936	64941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399525
1046	NC_014723	GCT	2	6	64948	64953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399525
1047	NC_014723	GCTG	2	8	65061	65068	0 %	25 %	50 %	25 %	330399526
1048	NC_014723	GGC	2	6	65146	65151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399526
1049	NC_014723	CGG	2	6	65190	65195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399526
1050	NC_014723	TAC	2	6	65214	65219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399526
1051	NC_014723	TCA	2	6	65222	65227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399526
1052	NC_014723	ACGGC	2	10	65267	65276	20 %	0 %	40 %	40 %	330399526
1053	NC_014723	T	6	6	65278	65283	0 %	100 %	0 %	0 %	330399526
1054	NC_014723	AT	3	6	65295	65300	50 %	50 %	0 %	0 %	330399526
1055	NC_014723	CAAG	2	8	65439	65446	50 %	0 %	25 %	25 %	330399526
1056	NC_014723	CTG	2	6	65517	65522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399527
1057	NC_014723	GC	3	6	65577	65582	0 %	0 %	50 %	50 %	330399527
1058	NC_014723	GAA	2	6	65596	65601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399527
1059	NC_014723	GAA	2	6	65632	65637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399527
1060	NC_014723	CCG	2	6	65706	65711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399527
1061	NC_014723	GC	3	6	65719	65724	0 %	0 %	50 %	50 %	330399527
1062	NC_014723	CGACC	2	10	65737	65746	20 %	0 %	20 %	60 %	330399527
1063	NC_014723	CAC	2	6	65767	65772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399527
1064	NC_014723	CGA	2	6	65773	65778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399527
1065	NC_014723	CGG	2	6	65796	65801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399527
1066	NC_014723	ATG	2	6	65825	65830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399527
1067	NC_014723	TGG	2	6	65934	65939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399527
1068	NC_014723	CTGG	2	8	65947	65954	0 %	25 %	50 %	25 %	330399527
1069	NC_014723	CGG	2	6	66011	66016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399527
1070	NC_014723	TGC	2	6	66063	66068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399527
1071	NC_014723	TCG	2	6	66069	66074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399527
1072	NC_014723	CTGCAC	2	12	66297	66308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330399528
1073	NC_014723	CGGCG	2	10	66350	66359	0 %	0 %	60 %	40 %	330399528
1074	NC_014723	GATC	2	8	66411	66418	25 %	25 %	25 %	25 %	330399528
1075	NC_014723	ACA	2	6	66461	66466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399528
1076	NC_014723	GTC	2	6	66693	66698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399528
1077	NC_014723	GCA	2	6	66710	66715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399528
1078	NC_014723	CTG	2	6	66808	66813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399528
1079	NC_014723	CGCAAA	2	12	66950	66961	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330399528
1080	NC_014723	A	6	6	66959	66964	100 %	0 %	0 %	0 %	330399528
1081	NC_014723	TGT	2	6	66976	66981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399528
1082	NC_014723	ACG	2	6	66997	67002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399528
1083	NC_014723	TGA	2	6	67099	67104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399528
1084	NC_014723	TGC	2	6	67126	67131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399529
1085	NC_014723	ACCG	2	8	67169	67176	25 %	0 %	25 %	50 %	330399529
1086	NC_014723	ACGCA	2	10	67212	67221	40 %	0 %	20 %	40 %	330399529
1087	NC_014723	CGAGCG	2	12	67292	67303	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330399529
1088	NC_014723	TGA	2	6	67474	67479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399529
1089	NC_014723	CG	3	6	67501	67506	0 %	0 %	50 %	50 %	330399529
1090	NC_014723	AGCCA	2	10	67527	67536	40 %	0 %	20 %	40 %	330399529
1091	NC_014723	AAT	2	6	67575	67580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330399529
1092	NC_014723	GCCG	2	8	67622	67629	0 %	0 %	50 %	50 %	330399529
1093	NC_014723	CAA	2	6	67658	67663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399529
1094	NC_014723	GTG	2	6	67677	67682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399529
1095	NC_014723	GGC	2	6	67703	67708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399529
1096	NC_014723	CG	3	6	67737	67742	0 %	0 %	50 %	50 %	330399529
1097	NC_014723	TC	3	6	67777	67782	0 %	50 %	0 %	50 %	330399529
1098	NC_014723	TGA	2	6	67796	67801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399529
1099	NC_014723	CAG	2	6	67851	67856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399529
1100	NC_014723	TGCT	2	8	67905	67912	0 %	50 %	25 %	25 %	330399530
1101	NC_014723	CG	3	6	67921	67926	0 %	0 %	50 %	50 %	330399530
1102	NC_014723	ATG	2	6	67986	67991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399530
1103	NC_014723	CGC	2	6	67999	68004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399530
1104	NC_014723	CAG	2	6	68036	68041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399530
1105	NC_014723	TAC	2	6	68048	68053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399530
1106	NC_014723	GC	3	6	68061	68066	0 %	0 %	50 %	50 %	330399530
1107	NC_014723	GGCG	2	8	68087	68094	0 %	0 %	75 %	25 %	330399530
1108	NC_014723	TGCC	2	8	68131	68138	0 %	25 %	25 %	50 %	330399530
1109	NC_014723	ATGCG	2	10	68176	68185	20 %	20 %	40 %	20 %	330399530
1110	NC_014723	T	6	6	68191	68196	0 %	100 %	0 %	0 %	330399530
1111	NC_014723	TTA	2	6	68252	68257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330399530
1112	NC_014723	TCA	2	6	68352	68357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399530
1113	NC_014723	GCG	2	6	68674	68679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399530
1114	NC_014723	GAA	2	6	68685	68690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399530
1115	NC_014723	ATG	3	9	68733	68741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399530
1116	NC_014723	GT	3	6	68763	68768	0 %	50 %	50 %	0 %	330399530
1117	NC_014723	CGC	2	6	68787	68792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399530
1118	NC_014723	AGG	2	6	68799	68804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399530
1119	NC_014723	TCG	2	6	68868	68873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399530
1120	NC_014723	GCTC	2	8	68901	68908	0 %	25 %	25 %	50 %	330399530
1121	NC_014723	GCT	2	6	68958	68963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399530
1122	NC_014723	GAT	2	6	68970	68975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399531
1123	NC_014723	AGG	2	6	69096	69101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399531
1124	NC_014723	TTG	2	6	69102	69107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399531
1125	NC_014723	TACC	2	8	69120	69127	25 %	25 %	0 %	50 %	330399531
1126	NC_014723	TGC	2	6	69138	69143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399531
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