MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014722	GCT	2	6	149251	149256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3002	NC_014722	CG	3	6	149277	149282	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3003	NC_014722	CGC	2	6	149359	149364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3004	NC_014722	TGA	2	6	149376	149381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794903
3005	NC_014722	CG	3	6	149424	149429	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3006	NC_014722	GAT	2	6	149440	149445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794903
3007	NC_014722	GC	3	6	149567	149572	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3008	NC_014722	GGC	2	6	149605	149610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
3009	NC_014722	ACT	2	6	149634	149639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794903
3010	NC_014722	GGCG	2	8	149684	149691	0 %	0 %	75 %	25 %	312794903
3011	NC_014722	ACG	2	6	149700	149705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3012	NC_014722	CG	4	8	149751	149758	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3013	NC_014722	TGA	2	6	149772	149777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794903
3014	NC_014722	TGC	2	6	149784	149789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3015	NC_014722	GC	3	6	149807	149812	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3016	NC_014722	GC	3	6	149816	149821	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3017	NC_014722	GGA	2	6	149851	149856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794903
3018	NC_014722	GATC	2	8	149989	149996	25 %	25 %	25 %	25 %	312794903
3019	NC_014722	CGC	2	6	150002	150007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3020	NC_014722	CTG	2	6	150155	150160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3021	NC_014722	TAT	2	6	150245	150250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794903
3022	NC_014722	GCT	2	6	150397	150402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3023	NC_014722	TCGT	2	8	150422	150429	0 %	50 %	25 %	25 %	312794903
3024	NC_014722	TGG	2	6	150468	150473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794903
3025	NC_014722	CGA	2	6	150484	150489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3026	NC_014722	CG	4	8	150540	150547	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3027	NC_014722	GTC	2	6	150616	150621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3028	NC_014722	GGT	2	6	150682	150687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794903
3029	NC_014722	CGC	2	6	150696	150701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3030	NC_014722	CCG	2	6	150717	150722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3031	NC_014722	GGT	2	6	150745	150750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794903
3032	NC_014722	CAG	2	6	150759	150764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3033	NC_014722	CGCT	2	8	150780	150787	0 %	25 %	25 %	50 %	312794903
3034	NC_014722	GC	4	8	150833	150840	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3035	NC_014722	CGC	2	6	150856	150861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3036	NC_014722	GATT	2	8	150958	150965	25 %	50 %	25 %	0 %	312794903
3037	NC_014722	CTA	2	6	150973	150978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794903
3038	NC_014722	CGG	2	6	151089	151094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
3039	NC_014722	GCC	2	6	151100	151105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3040	NC_014722	CCG	2	6	151128	151133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3041	NC_014722	CGC	2	6	151140	151145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3042	NC_014722	CGC	2	6	151150	151155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3043	NC_014722	TGC	2	6	151209	151214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3044	NC_014722	GCGCT	2	10	151236	151245	0 %	20 %	40 %	40 %	312794903
3045	NC_014722	TCA	2	6	151305	151310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794903
3046	NC_014722	CGG	2	6	151372	151377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
3047	NC_014722	GAT	2	6	151387	151392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794903
3048	NC_014722	TCG	2	6	151400	151405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3049	NC_014722	GTC	2	6	151421	151426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3050	NC_014722	TGC	2	6	151434	151439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3051	NC_014722	CGGC	2	8	151455	151462	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3052	NC_014722	TGT	2	6	151485	151490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794903
3053	NC_014722	GCA	2	6	151510	151515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3054	NC_014722	CGA	2	6	151638	151643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3055	NC_014722	GCATG	2	10	151696	151705	20 %	20 %	40 %	20 %	312794903
3056	NC_014722	GCC	2	6	151711	151716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3057	NC_014722	GATTGA	2	12	151723	151734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794903
3058	NC_014722	CGA	2	6	151741	151746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3059	NC_014722	TGC	2	6	151773	151778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3060	NC_014722	CCG	2	6	151792	151797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794903
3061	NC_014722	GCT	2	6	151813	151818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3062	NC_014722	GGT	2	6	151948	151953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794903
3063	NC_014722	CGG	2	6	151969	151974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
3064	NC_014722	GGCG	2	8	152002	152009	0 %	0 %	75 %	25 %	312794903
3065	NC_014722	GCT	2	6	152029	152034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794903
3066	NC_014722	GAG	2	6	152084	152089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794903
3067	NC_014722	GCCG	2	8	152092	152099	0 %	0 %	50 %	50 %	312794903
3068	NC_014722	CGG	2	6	152101	152106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
3069	NC_014722	CGG	2	6	152109	152114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
3070	NC_014722	GCCACG	2	12	152210	152221	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312794903
3071	NC_014722	TAT	2	6	152277	152282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794903
3072	NC_014722	GCG	2	6	152301	152306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
3073	NC_014722	GGC	2	6	152320	152325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
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3075	NC_014722	GCG	2	6	152367	152372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
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3080	NC_014722	GGC	2	6	152519	152524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794903
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3083	NC_014722	CGA	2	6	152581	152586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794903
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3088	NC_014722	GTCG	2	8	152817	152824	0 %	25 %	50 %	25 %	312794904
3089	NC_014722	GCA	2	6	152844	152849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794904
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3091	NC_014722	TGA	2	6	153060	153065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794904
3092	NC_014722	GAC	2	6	153102	153107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794904
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3098	NC_014722	GCG	2	6	153253	153258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794904
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3102	NC_014722	CTA	2	6	153450	153455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794904
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3107	NC_014722	G	6	6	153630	153635	0 %	0 %	100 %	0 %	312794904
3108	NC_014722	AAG	2	6	153658	153663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794904
3109	NC_014722	GAA	2	6	153735	153740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794904
3110	NC_014722	GTC	2	6	153871	153876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794904
3111	NC_014722	GTAA	2	8	153911	153918	50 %	25 %	25 %	0 %	312794904
3112	NC_014722	CGC	2	6	153921	153926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794904
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3117	NC_014722	GCC	2	6	154252	154257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794905
3118	NC_014722	GC	3	6	154350	154355	0 %	0 %	50 %	50 %	312794905
3119	NC_014722	GCC	2	6	154358	154363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794905
3120	NC_014722	CGG	2	6	154452	154457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794905
3121	NC_014722	GTA	2	6	154510	154515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794905
3122	NC_014722	GCA	2	6	154518	154523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794905
3123	NC_014722	GAT	2	6	154531	154536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794905
3124	NC_014722	CGTT	2	8	154548	154555	0 %	50 %	25 %	25 %	312794905
3125	NC_014722	CAC	2	6	154564	154569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794905
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3127	NC_014722	CCG	2	6	154696	154701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794905
3128	NC_014722	CTG	2	6	154734	154739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794905
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3130	NC_014722	GCA	2	6	154797	154802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794905
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3142	NC_014722	CGAG	2	8	155271	155278	25 %	0 %	50 %	25 %	312794905
3143	NC_014722	GCA	2	6	155313	155318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794905
3144	NC_014722	CAG	2	6	155347	155352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794905
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3149	NC_014722	GC	3	6	155533	155538	0 %	0 %	50 %	50 %	312794906
3150	NC_014722	GGCA	2	8	155546	155553	25 %	0 %	50 %	25 %	312794906
3151	NC_014722	GCG	2	6	155555	155560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794906
3152	NC_014722	CGG	3	9	155566	155574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794906
3153	NC_014722	CG	3	6	155621	155626	0 %	0 %	50 %	50 %	312794906
3154	NC_014722	CGG	2	6	155688	155693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794906
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3157	NC_014722	GCGCT	2	10	155807	155816	0 %	20 %	40 %	40 %	312794906
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3223	NC_014722	GC	3	6	158423	158428	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3224	NC_014722	AGCG	2	8	158463	158470	25 %	0 %	50 %	25 %	312794908
3225	NC_014722	CGT	3	9	158529	158537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
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3227	NC_014722	CG	4	8	158558	158565	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
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3231	NC_014722	GCCG	2	8	158697	158704	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3232	NC_014722	CGC	2	6	158712	158717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
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3235	NC_014722	CGA	2	6	158912	158917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794908
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3237	NC_014722	GGC	2	6	159046	159051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794908
3238	NC_014722	CGG	3	9	159077	159085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794908
3239	NC_014722	CACG	2	8	159137	159144	25 %	0 %	25 %	50 %	312794908
3240	NC_014722	GCA	3	9	159167	159175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3241	NC_014722	GCC	3	9	159196	159204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
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3243	NC_014722	CAC	2	6	159255	159260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794908
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3365	NC_014722	GTG	2	6	164609	164614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794912
3366	NC_014722	GCC	2	6	164620	164625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794912
3367	NC_014722	GCA	2	6	164659	164664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794912
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3477	NC_014722	CGTCG	2	10	170803	170812	0 %	20 %	40 %	40 %	312794921
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3481	NC_014722	CA	3	6	170968	170973	50 %	0 %	0 %	50 %	312794921
3482	NC_014722	GCA	2	6	171031	171036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794921
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3484	NC_014722	CG	4	8	171067	171074	0 %	0 %	50 %	50 %	312794921
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3486	NC_014722	AGC	2	6	171123	171128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794921
3487	NC_014722	GCGT	2	8	171175	171182	0 %	25 %	50 %	25 %	312794921
3488	NC_014722	TG	3	6	171238	171243	0 %	50 %	50 %	0 %	312794921
3489	NC_014722	AGC	2	6	171255	171260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794921
3490	NC_014722	GCC	2	6	171272	171277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794921
3491	NC_014722	GCG	2	6	171303	171308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794921
3492	NC_014722	TG	3	6	171320	171325	0 %	50 %	50 %	0 %	312794921
3493	NC_014722	GGC	2	6	171332	171337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794921
3494	NC_014722	ACG	2	6	171344	171349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794921
3495	NC_014722	TCGC	2	8	171354	171361	0 %	25 %	25 %	50 %	312794921
3496	NC_014722	CAA	2	6	171472	171477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794921
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3498	NC_014722	CCGCG	2	10	171505	171514	0 %	0 %	40 %	60 %	312794921
3499	NC_014722	CGG	2	6	171615	171620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794921
3500	NC_014722	TCG	2	6	171700	171705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794921

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