MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014722	CAGA	2	8	99305	99312	50 %	0 %	25 %	25 %	312794845
2003	NC_014722	CGTG	2	8	99315	99322	0 %	25 %	50 %	25 %	312794845
2004	NC_014722	ACC	2	6	99342	99347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794845
2005	NC_014722	CG	3	6	99416	99421	0 %	0 %	50 %	50 %	312794845
2006	NC_014722	CTG	2	6	99477	99482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794845
2007	NC_014722	TGA	2	6	99539	99544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794845
2008	NC_014722	GC	3	6	99562	99567	0 %	0 %	50 %	50 %	312794845
2009	NC_014722	GGC	2	6	99577	99582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794845
2010	NC_014722	GCAT	2	8	99616	99623	25 %	25 %	25 %	25 %	312794845
2011	NC_014722	CG	3	6	99646	99651	0 %	0 %	50 %	50 %	312794846
2012	NC_014722	GCG	2	6	99655	99660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794846
2013	NC_014722	GCG	2	6	99670	99675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794846
2014	NC_014722	CG	3	6	99674	99679	0 %	0 %	50 %	50 %	312794846
2015	NC_014722	CG	3	6	99704	99709	0 %	0 %	50 %	50 %	312794846
2016	NC_014722	CAG	2	6	99710	99715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794846
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2022	NC_014722	GGA	2	6	99937	99942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794846
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2063	NC_014722	TGCGG	2	10	101932	101941	0 %	20 %	60 %	20 %	312794850
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2123	NC_014722	GC	3	6	104137	104142	0 %	0 %	50 %	50 %	312794852
2124	NC_014722	ATG	2	6	104226	104231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794852
2125	NC_014722	CGT	2	6	104273	104278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794852
2126	NC_014722	CG	3	6	104426	104431	0 %	0 %	50 %	50 %	312794852
2127	NC_014722	CCG	2	6	104481	104486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794852
2128	NC_014722	CGTC	2	8	104502	104509	0 %	25 %	25 %	50 %	312794852
2129	NC_014722	CAC	2	6	104597	104602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794852
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2131	NC_014722	AGC	2	6	104700	104705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794852
2132	NC_014722	ATC	2	6	104712	104717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794852
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2137	NC_014722	GTCAGC	2	12	104895	104906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312794852
2138	NC_014722	GC	3	6	104905	104910	0 %	0 %	50 %	50 %	312794852
2139	NC_014722	GC	3	6	105014	105019	0 %	0 %	50 %	50 %	312794852
2140	NC_014722	CG	3	6	105039	105044	0 %	0 %	50 %	50 %	312794852
2141	NC_014722	ACGGCG	2	12	105049	105060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312794852
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2143	NC_014722	CACC	2	8	105240	105247	25 %	0 %	0 %	75 %	312794853
2144	NC_014722	TCG	2	6	105387	105392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794853
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2149	NC_014722	GC	3	6	105587	105592	0 %	0 %	50 %	50 %	312794853
2150	NC_014722	ACT	2	6	105622	105627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794853
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2152	NC_014722	CGT	2	6	105807	105812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794853
2153	NC_014722	AC	3	6	105852	105857	50 %	0 %	0 %	50 %	312794853
2154	NC_014722	TTG	2	6	105880	105885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794853
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2224	NC_014722	CGA	2	6	109238	109243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794856
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2226	NC_014722	TTCGAT	2	12	109350	109361	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312794856
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2228	NC_014722	GC	3	6	109372	109377	0 %	0 %	50 %	50 %	312794856
2229	NC_014722	GGCT	2	8	109380	109387	0 %	25 %	50 %	25 %	312794856
2230	NC_014722	ATC	2	6	109405	109410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794856
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2232	NC_014722	TGC	2	6	109492	109497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794856
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2234	NC_014722	TGC	2	6	109522	109527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794856
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2236	NC_014722	T	6	6	109538	109543	0 %	100 %	0 %	0 %	312794856
2237	NC_014722	GCCG	2	8	109610	109617	0 %	0 %	50 %	50 %	312794856
2238	NC_014722	GTG	2	6	109622	109627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794856
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2240	NC_014722	CG	3	6	109639	109644	0 %	0 %	50 %	50 %	312794856
2241	NC_014722	GAC	2	6	109659	109664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794856
2242	NC_014722	CGA	2	6	109714	109719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794856
2243	NC_014722	TCG	2	6	109727	109732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794856
2244	NC_014722	GC	3	6	109753	109758	0 %	0 %	50 %	50 %	312794856
2245	NC_014722	CCCG	2	8	109922	109929	0 %	0 %	25 %	75 %	312794856
2246	NC_014722	GAC	2	6	110088	110093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794857
2247	NC_014722	GCCG	2	8	110109	110116	0 %	0 %	50 %	50 %	312794857
2248	NC_014722	GC	3	6	110181	110186	0 %	0 %	50 %	50 %	312794857
2249	NC_014722	CG	3	6	110187	110192	0 %	0 %	50 %	50 %	312794857
2250	NC_014722	AGC	2	6	110269	110274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794857
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2252	NC_014722	TGTT	2	8	110344	110351	0 %	75 %	25 %	0 %	312794857
2253	NC_014722	TTGCG	2	10	110727	110736	0 %	40 %	40 %	20 %	312794858
2254	NC_014722	CGA	2	6	110767	110772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794858
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2256	NC_014722	TCG	2	6	110820	110825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794858
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2261	NC_014722	GC	3	6	111184	111189	0 %	0 %	50 %	50 %	312794858
2262	NC_014722	ACG	2	6	111228	111233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794858
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2264	NC_014722	CCG	3	9	111437	111445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794858
2265	NC_014722	CG	3	6	111444	111449	0 %	0 %	50 %	50 %	312794858
2266	NC_014722	GCTG	3	12	111490	111501	0 %	25 %	50 %	25 %	312794858
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2268	NC_014722	GC	3	6	111524	111529	0 %	0 %	50 %	50 %	312794858
2269	NC_014722	GCT	2	6	111544	111549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794858
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2274	NC_014722	GGCA	2	8	111681	111688	25 %	0 %	50 %	25 %	312794858
2275	NC_014722	CTG	2	6	111731	111736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794858
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2294	NC_014722	GGTC	2	8	112423	112430	0 %	25 %	50 %	25 %	312794858
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2300	NC_014722	CTG	2	6	112802	112807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794859
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2304	NC_014722	TACAG	2	10	113221	113230	40 %	20 %	20 %	20 %	312794860
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2336	NC_014722	GTC	2	6	115294	115299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794862
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2340	NC_014722	GTG	2	6	115876	115881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794862
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2343	NC_014722	GCA	2	6	115981	115986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794862
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2346	NC_014722	GAC	2	6	116053	116058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794862
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2348	NC_014722	CGC	2	6	116175	116180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794862
2349	NC_014722	CG	3	6	116197	116202	0 %	0 %	50 %	50 %	312794862
2350	NC_014722	TCGA	2	8	116209	116216	25 %	25 %	25 %	25 %	312794862
2351	NC_014722	CTGA	2	8	116221	116228	25 %	25 %	25 %	25 %	312794862
2352	NC_014722	CG	3	6	116241	116246	0 %	0 %	50 %	50 %	312794862
2353	NC_014722	GGC	2	6	116248	116253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794862
2354	NC_014722	GTG	2	6	116311	116316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794862
2355	NC_014722	GCA	2	6	116319	116324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794862
2356	NC_014722	GTG	2	6	116430	116435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794863
2357	NC_014722	TTG	2	6	116605	116610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794864
2358	NC_014722	ACA	2	6	116614	116619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794864
2359	NC_014722	A	6	6	116664	116669	100 %	0 %	0 %	0 %	312794864
2360	NC_014722	ATA	2	6	116696	116701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794864
2361	NC_014722	CTA	2	6	116757	116762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794864
2362	NC_014722	TCG	2	6	116763	116768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794864
2363	NC_014722	CG	4	8	116838	116845	0 %	0 %	50 %	50 %	312794864
2364	NC_014722	ATC	2	6	116855	116860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794864
2365	NC_014722	CG	3	6	117234	117239	0 %	0 %	50 %	50 %	312794865
2366	NC_014722	CCA	3	9	117260	117268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794865
2367	NC_014722	AG	3	6	117288	117293	50 %	0 %	50 %	0 %	312794865
2368	NC_014722	CG	3	6	117316	117321	0 %	0 %	50 %	50 %	312794865
2369	NC_014722	GGGC	2	8	117331	117338	0 %	0 %	75 %	25 %	312794865
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2483	NC_014722	GC	3	6	122897	122902	0 %	0 %	50 %	50 %	312794874
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2485	NC_014722	CG	3	6	123022	123027	0 %	0 %	50 %	50 %	312794874
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2487	NC_014722	TGC	2	6	123143	123148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794874
2488	NC_014722	GGCGA	2	10	123169	123178	20 %	0 %	60 %	20 %	312794874
2489	NC_014722	CG	3	6	123237	123242	0 %	0 %	50 %	50 %	312794874
2490	NC_014722	GCG	2	6	123270	123275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794874
2491	NC_014722	CAT	2	6	123308	123313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794875
2492	NC_014722	CGCTG	2	10	123322	123331	0 %	20 %	40 %	40 %	312794875
2493	NC_014722	GCA	2	6	123376	123381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794875
2494	NC_014722	GCG	2	6	123400	123405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794875
2495	NC_014722	TCG	2	6	123418	123423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794875
2496	NC_014722	GCG	2	6	123429	123434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794875
2497	NC_014722	CAT	2	6	123469	123474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794875
2498	NC_014722	CAT	2	6	123505	123510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794875
2499	NC_014722	CAC	2	6	123512	123517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794875
2500	NC_014722	GTT	2	6	123532	123537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794875

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