MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014722	CAA	2	6	55822	55827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794800
1002	NC_014722	A	6	6	55855	55860	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1003	NC_014722	TGC	2	6	55878	55883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794800
1004	NC_014722	AAG	2	6	55952	55957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794800
1005	NC_014722	A	6	6	55974	55979	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1006	NC_014722	GGAA	2	8	55992	55999	50 %	0 %	50 %	0 %	312794800
1007	NC_014722	GAA	2	6	56007	56012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794800
1008	NC_014722	AGG	2	6	56027	56032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794800
1009	NC_014722	A	7	7	56053	56059	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1010	NC_014722	AAG	2	6	56077	56082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794800
1011	NC_014722	AT	3	6	56172	56177	50 %	50 %	0 %	0 %	312794800
1012	NC_014722	CA	3	6	56201	56206	50 %	0 %	0 %	50 %	312794800
1013	NC_014722	GCA	2	6	56212	56217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794800
1014	NC_014722	TAT	2	6	56220	56225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794800
1015	NC_014722	AATC	2	8	56269	56276	50 %	25 %	0 %	25 %	312794800
1016	NC_014722	CAG	2	6	56342	56347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794800
1017	NC_014722	CAC	2	6	56375	56380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794800
1018	NC_014722	CAA	2	6	56392	56397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794800
1019	NC_014722	TAT	2	6	56431	56436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794800
1020	NC_014722	ATTA	2	8	56597	56604	50 %	50 %	0 %	0 %	312794801
1021	NC_014722	GA	3	6	56656	56661	50 %	0 %	50 %	0 %	312794801
1022	NC_014722	ATTTTT	2	12	56696	56707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312794801
1023	NC_014722	T	6	6	56728	56733	0 %	100 %	0 %	0 %	312794802
1024	NC_014722	CA	3	6	56781	56786	50 %	0 %	0 %	50 %	312794802
1025	NC_014722	AAT	2	6	56818	56823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794802
1026	NC_014722	GAAAT	2	10	56849	56858	60 %	20 %	20 %	0 %	312794803
1027	NC_014722	T	7	7	56884	56890	0 %	100 %	0 %	0 %	312794803
1028	NC_014722	A	6	6	56892	56897	100 %	0 %	0 %	0 %	312794803
1029	NC_014722	ACAA	2	8	56906	56913	75 %	0 %	0 %	25 %	312794803
1030	NC_014722	T	7	7	57067	57073	0 %	100 %	0 %	0 %	312794804
1031	NC_014722	G	6	6	57195	57200	0 %	0 %	100 %	0 %	312794805
1032	NC_014722	CAAA	2	8	57231	57238	75 %	0 %	0 %	25 %	312794805
1033	NC_014722	TA	4	8	57242	57249	50 %	50 %	0 %	0 %	312794805
1034	NC_014722	ATG	2	6	57270	57275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794805
1035	NC_014722	ATC	2	6	57381	57386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794805
1036	NC_014722	AGCA	2	8	57426	57433	50 %	0 %	25 %	25 %	312794805
1037	NC_014722	GAA	2	6	57449	57454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794805
1038	NC_014722	AGT	2	6	57866	57871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794806
1039	NC_014722	ACC	2	6	57907	57912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794806
1040	NC_014722	TTG	2	6	57913	57918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794806
1041	NC_014722	TTC	2	6	57949	57954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794806
1042	NC_014722	TCG	2	6	57965	57970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794806
1043	NC_014722	GCG	2	6	57976	57981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794806
1044	NC_014722	CCT	2	6	57995	58000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794806
1045	NC_014722	CGT	2	6	58069	58074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794806
1046	NC_014722	AGA	2	6	58251	58256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794806
1047	NC_014722	TCGAC	2	10	58320	58329	20 %	20 %	20 %	40 %	312794806
1048	NC_014722	GCG	2	6	58359	58364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794806
1049	NC_014722	CTT	2	6	58365	58370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794806
1050	NC_014722	CGGC	2	8	58413	58420	0 %	0 %	50 %	50 %	312794806
1051	NC_014722	ACC	2	6	58482	58487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794806
1052	NC_014722	CG	3	6	58560	58565	0 %	0 %	50 %	50 %	312794806
1053	NC_014722	CAG	2	6	58609	58614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794806
1054	NC_014722	CTG	2	6	58724	58729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794806
1055	NC_014722	CCA	2	6	58774	58779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794807
1056	NC_014722	TTC	2	6	58815	58820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794807
1057	NC_014722	CG	3	6	58846	58851	0 %	0 %	50 %	50 %	312794807
1058	NC_014722	AGC	2	6	58872	58877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1059	NC_014722	ACG	2	6	58890	58895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1060	NC_014722	GCC	2	6	58937	58942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794807
1061	NC_014722	GAA	2	6	59009	59014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794807
1062	NC_014722	GAT	2	6	59015	59020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794807
1063	NC_014722	TCA	2	6	59028	59033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794807
1064	NC_014722	TGA	2	6	59056	59061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794807
1065	NC_014722	ACC	2	6	59267	59272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794807
1066	NC_014722	ACGC	2	8	59303	59310	25 %	0 %	25 %	50 %	312794807
1067	NC_014722	GTA	2	6	59357	59362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794807
1068	NC_014722	TGCT	2	8	59394	59401	0 %	50 %	25 %	25 %	312794807
1069	NC_014722	CAGG	2	8	59428	59435	25 %	0 %	50 %	25 %	312794807
1070	NC_014722	TCG	2	6	59481	59486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1071	NC_014722	GTC	2	6	59507	59512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1072	NC_014722	AGA	2	6	59521	59526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794807
1073	NC_014722	CGG	2	6	59534	59539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794807
1074	NC_014722	GCT	2	6	59569	59574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1075	NC_014722	CG	3	6	59578	59583	0 %	0 %	50 %	50 %	312794807
1076	NC_014722	TCG	2	6	59625	59630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1077	NC_014722	CAG	2	6	59696	59701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
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1080	NC_014722	TCAGCA	2	12	59805	59816	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312794807
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1082	NC_014722	TCG	2	6	59898	59903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1083	NC_014722	CCA	2	6	59990	59995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794807
1084	NC_014722	GAA	2	6	60014	60019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794807
1085	NC_014722	CAC	2	6	60120	60125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794807
1086	NC_014722	GAG	2	6	60178	60183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794807
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1089	NC_014722	AAAC	2	8	60343	60350	75 %	0 %	0 %	25 %	312794807
1090	NC_014722	GCA	2	6	60493	60498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1091	NC_014722	GAT	2	6	60527	60532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794807
1092	NC_014722	CGG	2	6	60550	60555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794807
1093	NC_014722	ATG	2	6	60567	60572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794807
1094	NC_014722	TGG	2	6	60590	60595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794807
1095	NC_014722	CCA	2	6	60665	60670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794807
1096	NC_014722	CGC	3	9	60680	60688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794807
1097	NC_014722	GC	3	6	60770	60775	0 %	0 %	50 %	50 %	312794807
1098	NC_014722	GCCCA	2	10	60896	60905	20 %	0 %	20 %	60 %	312794807
1099	NC_014722	CAG	2	6	60944	60949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1100	NC_014722	CTT	2	6	60971	60976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794807
1101	NC_014722	TGC	2	6	61017	61022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
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1103	NC_014722	GCCA	2	8	61088	61095	25 %	0 %	25 %	50 %	312794807
1104	NC_014722	GCC	2	6	61183	61188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794807
1105	NC_014722	GGAT	2	8	61242	61249	25 %	25 %	50 %	0 %	312794807
1106	NC_014722	CG	3	6	61263	61268	0 %	0 %	50 %	50 %	312794807
1107	NC_014722	GCA	2	6	61344	61349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
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1109	NC_014722	T	7	7	61384	61390	0 %	100 %	0 %	0 %	312794807
1110	NC_014722	GCT	2	6	61436	61441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1111	NC_014722	CGA	2	6	61446	61451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1112	NC_014722	TAC	2	6	61454	61459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794807
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1114	NC_014722	CAA	2	6	61511	61516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794807
1115	NC_014722	CGA	2	6	61619	61624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1116	NC_014722	TTAA	2	8	61728	61735	50 %	50 %	0 %	0 %	312794807
1117	NC_014722	GCT	2	6	61762	61767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1118	NC_014722	ATC	2	6	61913	61918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794807
1119	NC_014722	ACG	2	6	61936	61941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1120	NC_014722	TGC	2	6	61962	61967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1121	NC_014722	AGC	2	6	61977	61982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1122	NC_014722	CGT	4	12	61999	62010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1123	NC_014722	CGGA	2	8	62034	62041	25 %	0 %	50 %	25 %	312794807
1124	NC_014722	AAC	2	6	62049	62054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794807
1125	NC_014722	CT	3	6	62106	62111	0 %	50 %	0 %	50 %	312794807
1126	NC_014722	CTT	2	6	62158	62163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794807
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1128	NC_014722	TGA	2	6	62233	62238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794807
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1130	NC_014722	GTCG	2	8	62258	62265	0 %	25 %	50 %	25 %	312794807
1131	NC_014722	GCC	2	6	62280	62285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794807
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1237	NC_014722	GCG	2	6	67765	67770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794812
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1241	NC_014722	GC	3	6	67915	67920	0 %	0 %	50 %	50 %	312794813
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1244	NC_014722	TCGCC	2	10	68029	68038	0 %	20 %	20 %	60 %	312794813
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1248	NC_014722	GC	3	6	68305	68310	0 %	0 %	50 %	50 %	312794813
1249	NC_014722	C	6	6	68352	68357	0 %	0 %	0 %	100 %	312794813
1250	NC_014722	GCC	2	6	68361	68366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794813
1251	NC_014722	CAA	2	6	68407	68412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794813
1252	NC_014722	CTT	2	6	68494	68499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794813
1253	NC_014722	AGC	2	6	68550	68555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794813
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1255	NC_014722	CCG	2	6	68677	68682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794813
1256	NC_014722	GTC	2	6	68794	68799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794813
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1343	NC_014722	CG	3	6	73045	73050	0 %	0 %	50 %	50 %	312794819
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1359	NC_014722	GC	3	6	73837	73842	0 %	0 %	50 %	50 %	312794820
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1366	NC_014722	ACG	2	6	74169	74174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794820
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1372	NC_014722	GAC	2	6	74302	74307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794820
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