MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014722	AATCG	2	10	26631	26640	40 %	20 %	20 %	20 %	312794768
502	NC_014722	TA	3	6	26673	26678	50 %	50 %	0 %	0 %	312794768
503	NC_014722	TTTG	2	8	26679	26686	0 %	75 %	25 %	0 %	312794768
504	NC_014722	ATAAA	2	10	26720	26729	80 %	20 %	0 %	0 %	312794768
505	NC_014722	CG	3	6	26785	26790	0 %	0 %	50 %	50 %	312794768
506	NC_014722	T	7	7	26870	26876	0 %	100 %	0 %	0 %	312794768
507	NC_014722	CAG	2	6	26911	26916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794768
508	NC_014722	TTG	2	6	27019	27024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794768
509	NC_014722	CGT	2	6	27084	27089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794768
510	NC_014722	CTG	2	6	27198	27203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794769
511	NC_014722	CGC	2	6	27234	27239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
512	NC_014722	CAA	2	6	27313	27318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794769
513	NC_014722	CAG	2	6	27369	27374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
514	NC_014722	CGG	2	6	27378	27383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
515	NC_014722	GAT	2	6	27585	27590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
516	NC_014722	ATC	2	6	27622	27627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
517	NC_014722	CCG	2	6	27656	27661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
518	NC_014722	CTC	2	6	27710	27715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794769
519	NC_014722	TCCT	2	8	27718	27725	0 %	50 %	0 %	50 %	312794769
520	NC_014722	CTT	2	6	27765	27770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
521	NC_014722	CGG	2	6	27897	27902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
522	NC_014722	AATGGC	2	12	28012	28023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312794769
523	NC_014722	CTG	2	6	28126	28131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794769
524	NC_014722	ACGT	2	8	28152	28159	25 %	25 %	25 %	25 %	312794769
525	NC_014722	AGCA	2	8	28270	28277	50 %	0 %	25 %	25 %	312794769
526	NC_014722	TAG	2	6	28283	28288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
527	NC_014722	GAC	2	6	28579	28584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
528	NC_014722	ATC	2	6	28615	28620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
529	NC_014722	G	6	6	28635	28640	0 %	0 %	100 %	0 %	312794769
530	NC_014722	TTC	2	6	28765	28770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
531	NC_014722	GCC	2	6	28780	28785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
532	NC_014722	TG	3	6	28802	28807	0 %	50 %	50 %	0 %	312794769
533	NC_014722	CAG	2	6	28854	28859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
534	NC_014722	GAT	2	6	28875	28880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
535	NC_014722	ACC	2	6	28990	28995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794769
536	NC_014722	GGC	2	6	29024	29029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
537	NC_014722	TGG	2	6	29078	29083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794769
538	NC_014722	CAG	2	6	29171	29176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
539	NC_014722	CTT	2	6	29179	29184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
540	NC_014722	ACA	2	6	29214	29219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794769
541	NC_014722	GCTG	2	8	29309	29316	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
542	NC_014722	GCG	2	6	29433	29438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
543	NC_014722	TCT	2	6	29472	29477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
544	NC_014722	GAT	2	6	29584	29589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
545	NC_014722	ATT	2	6	29758	29763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794769
546	NC_014722	TTG	2	6	29909	29914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794769
547	NC_014722	GCT	2	6	29941	29946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794769
548	NC_014722	CGA	2	6	30079	30084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
549	NC_014722	CAT	2	6	30088	30093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
550	NC_014722	ATC	3	9	30187	30195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
551	NC_014722	TC	3	6	30234	30239	0 %	50 %	0 %	50 %	312794769
552	NC_014722	CT	3	6	30262	30267	0 %	50 %	0 %	50 %	312794769
553	NC_014722	GCCC	2	8	30309	30316	0 %	0 %	25 %	75 %	312794769
554	NC_014722	GGCT	2	8	30386	30393	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
555	NC_014722	TGT	2	6	30394	30399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794769
556	NC_014722	ACA	2	6	30411	30416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794769
557	NC_014722	GGA	2	6	30446	30451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794769
558	NC_014722	TCT	2	6	30474	30479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
559	NC_014722	GCG	2	6	30486	30491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
560	NC_014722	CGA	2	6	30492	30497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
561	NC_014722	ATG	2	6	30587	30592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
562	NC_014722	CGG	3	9	30640	30648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
563	NC_014722	CGA	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
564	NC_014722	ATT	2	6	30739	30744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794769
565	NC_014722	CCG	2	6	30758	30763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
566	NC_014722	GCC	2	6	30793	30798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
567	NC_014722	TTG	2	6	30890	30895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794769
568	NC_014722	CAT	2	6	30997	31002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
569	NC_014722	GGC	2	6	31175	31180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
570	NC_014722	GAT	2	6	31186	31191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
571	NC_014722	CAGC	2	8	31317	31324	25 %	0 %	25 %	50 %	312794769
572	NC_014722	CAC	2	6	31351	31356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794769
573	NC_014722	CAC	2	6	31441	31446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794769
574	NC_014722	CA	3	6	31538	31543	50 %	0 %	0 %	50 %	312794769
575	NC_014722	CCGG	2	8	31607	31614	0 %	0 %	50 %	50 %	312794769
576	NC_014722	TGGC	2	8	31627	31634	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
577	NC_014722	CAG	2	6	31668	31673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
578	NC_014722	TAA	2	6	31703	31708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794769
579	NC_014722	GC	3	6	31710	31715	0 %	0 %	50 %	50 %	312794769
580	NC_014722	GCA	2	6	31800	31805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
581	NC_014722	TAAG	2	8	31830	31837	50 %	25 %	25 %	0 %	312794769
582	NC_014722	A	8	8	31880	31887	100 %	0 %	0 %	0 %	312794769
583	NC_014722	CTT	2	6	31888	31893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
584	NC_014722	ATC	2	6	31939	31944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
585	NC_014722	GCA	2	6	31950	31955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
586	NC_014722	TGCCA	2	10	31985	31994	20 %	20 %	20 %	40 %	312794769
587	NC_014722	TCT	2	6	32037	32042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
588	NC_014722	ATA	2	6	32051	32056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794769
589	NC_014722	CCCT	2	8	32119	32126	0 %	25 %	0 %	75 %	312794770
590	NC_014722	ACC	2	6	32149	32154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794770
591	NC_014722	TGC	2	6	32159	32164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794770
592	NC_014722	ATC	2	6	32291	32296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794770
593	NC_014722	GC	3	6	32369	32374	0 %	0 %	50 %	50 %	312794770
594	NC_014722	CTTT	2	8	32417	32424	0 %	75 %	0 %	25 %	312794770
595	NC_014722	CAT	2	6	32446	32451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794770
596	NC_014722	GCT	2	6	32459	32464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794770
597	NC_014722	TCC	2	6	32549	32554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794770
598	NC_014722	GCC	2	6	32583	32588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794771
599	NC_014722	CTT	2	6	32696	32701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794771
600	NC_014722	T	7	7	32717	32723	0 %	100 %	0 %	0 %	312794771
601	NC_014722	CTT	2	6	32741	32746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794771
602	NC_014722	TCT	2	6	32789	32794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794771
603	NC_014722	GCTCG	2	10	32898	32907	0 %	20 %	40 %	40 %	312794771
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606	NC_014722	GGCC	2	8	33241	33248	0 %	0 %	50 %	50 %	312794771
607	NC_014722	CGT	2	6	33249	33254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794771
608	NC_014722	GCATC	2	10	33503	33512	20 %	20 %	20 %	40 %	312794771
609	NC_014722	GCA	2	6	33517	33522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794771
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611	NC_014722	AAT	2	6	33605	33610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794771
612	NC_014722	CGC	2	6	33690	33695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794771
613	NC_014722	TCA	2	6	33800	33805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794771
614	NC_014722	TGCG	2	8	33843	33850	0 %	25 %	50 %	25 %	312794771
615	NC_014722	T	6	6	33870	33875	0 %	100 %	0 %	0 %	312794771
616	NC_014722	ACC	2	6	33994	33999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794771
617	NC_014722	CCATC	2	10	34055	34064	20 %	20 %	0 %	60 %	312794771
618	NC_014722	CG	3	6	34076	34081	0 %	0 %	50 %	50 %	312794771
619	NC_014722	GCC	2	6	34124	34129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794771
620	NC_014722	TCT	2	6	34174	34179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794771
621	NC_014722	T	6	6	34299	34304	0 %	100 %	0 %	0 %	312794771
622	NC_014722	C	6	6	34330	34335	0 %	0 %	0 %	100 %	312794772
623	NC_014722	GATA	2	8	34410	34417	50 %	25 %	25 %	0 %	312794772
624	NC_014722	TCGC	2	8	34419	34426	0 %	25 %	25 %	50 %	312794772
625	NC_014722	CGT	2	6	34427	34432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794772
626	NC_014722	GCCC	2	8	34495	34502	0 %	0 %	25 %	75 %	312794772
627	NC_014722	ACA	2	6	34507	34512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794772
628	NC_014722	TAC	2	6	34528	34533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794772
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1000	NC_014722	A	6	6	55777	55782	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800

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