MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 56553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014722	GAAG	2	8	328224	328231	50 %	0 %	50 %	0 %	312795090
6502	NC_014722	GCCG	2	8	328233	328240	0 %	0 %	50 %	50 %	312795091
6503	NC_014722	GTCA	2	8	328252	328259	25 %	25 %	25 %	25 %	312795091
6504	NC_014722	GAT	2	6	328281	328286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795091
6505	NC_014722	CGC	2	6	328288	328293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795091
6506	NC_014722	CGG	2	6	328299	328304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795091
6507	NC_014722	GAG	2	6	328366	328371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795091
6508	NC_014722	CG	3	6	328378	328383	0 %	0 %	50 %	50 %	312795091
6509	NC_014722	TGC	2	6	328469	328474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795091
6510	NC_014722	TCG	3	9	328502	328510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795091
6511	NC_014722	CG	3	6	328542	328547	0 %	0 %	50 %	50 %	312795091
6512	NC_014722	TCA	2	6	328655	328660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795091
6513	NC_014722	ATTC	2	8	328673	328680	25 %	50 %	0 %	25 %	312795091
6514	NC_014722	AGA	2	6	328715	328720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795091
6515	NC_014722	ACG	2	6	328724	328729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795091
6516	NC_014722	GCC	2	6	328894	328899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795091
6517	NC_014722	CG	3	6	328924	328929	0 %	0 %	50 %	50 %	312795091
6518	NC_014722	CGAG	2	8	328934	328941	25 %	0 %	50 %	25 %	312795091
6519	NC_014722	GAA	2	6	328950	328955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795091
6520	NC_014722	CCGAC	2	10	329060	329069	20 %	0 %	20 %	60 %	312795091
6521	NC_014722	GCT	4	12	329076	329087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795091
6522	NC_014722	GCG	2	6	329090	329095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795091
6523	NC_014722	TGAAC	2	10	329100	329109	40 %	20 %	20 %	20 %	312795091
6524	NC_014722	GC	3	6	329186	329191	0 %	0 %	50 %	50 %	312795091
6525	NC_014722	C	6	6	329191	329196	0 %	0 %	0 %	100 %	312795091
6526	NC_014722	GGT	2	6	329235	329240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312795091
6527	NC_014722	TCG	3	9	329273	329281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795091
6528	NC_014722	ACG	2	6	329305	329310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795091
6529	NC_014722	GCCGGA	2	12	329334	329345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312795091
6530	NC_014722	GAT	3	9	329511	329519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795091
6531	NC_014722	CGGCG	2	10	329553	329562	0 %	0 %	60 %	40 %	312795091
6532	NC_014722	CGA	2	6	329577	329582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795091
6533	NC_014722	CAT	2	6	329589	329594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795091
6534	NC_014722	GAC	2	6	329725	329730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795091
6535	NC_014722	AGG	2	6	329816	329821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312795091
6536	NC_014722	GCC	2	6	329840	329845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795091
6537	NC_014722	GGC	2	6	329880	329885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795091
6538	NC_014722	GTGG	2	8	329889	329896	0 %	25 %	75 %	0 %	312795091
6539	NC_014722	GC	3	6	329907	329912	0 %	0 %	50 %	50 %	312795091
6540	NC_014722	CTG	2	6	329971	329976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795092
6541	NC_014722	ATT	2	6	330009	330014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312795092
6542	NC_014722	AGCGGC	2	12	330038	330049	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312795092
6543	NC_014722	CGTT	2	8	330083	330090	0 %	50 %	25 %	25 %	312795092
6544	NC_014722	TCC	2	6	330092	330097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795092
6545	NC_014722	ATG	2	6	330133	330138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795092
6546	NC_014722	GGCG	2	8	330165	330172	0 %	0 %	75 %	25 %	312795092
6547	NC_014722	TGC	2	6	330314	330319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795092
6548	NC_014722	GC	3	6	330359	330364	0 %	0 %	50 %	50 %	312795092
6549	NC_014722	TGC	3	9	330395	330403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795092
6550	NC_014722	GCA	2	6	330445	330450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795092
6551	NC_014722	GAT	2	6	330495	330500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795092
6552	NC_014722	GC	3	6	330608	330613	0 %	0 %	50 %	50 %	312795093
6553	NC_014722	CG	3	6	330763	330768	0 %	0 %	50 %	50 %	312795093
6554	NC_014722	CGC	2	6	330795	330800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795093
6555	NC_014722	GTC	2	6	330825	330830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795093
6556	NC_014722	CGG	2	6	330863	330868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795093
6557	NC_014722	CG	3	6	330896	330901	0 %	0 %	50 %	50 %	312795093
6558	NC_014722	GCA	3	9	330962	330970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795093
6559	NC_014722	CGT	2	6	331034	331039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795093
6560	NC_014722	CTG	2	6	331056	331061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795093
6561	NC_014722	CGC	2	6	331068	331073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795093
6562	NC_014722	ACGAT	2	10	331085	331094	40 %	20 %	20 %	20 %	312795093
6563	NC_014722	CTC	2	6	331095	331100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795093
6564	NC_014722	CTT	2	6	331124	331129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312795093
6565	NC_014722	AG	3	6	331164	331169	50 %	0 %	50 %	0 %	312795093
6566	NC_014722	TG	3	6	331170	331175	0 %	50 %	50 %	0 %	312795093
6567	NC_014722	A	6	6	331180	331185	100 %	0 %	0 %	0 %	312795093
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6569	NC_014722	T	6	6	331281	331286	0 %	100 %	0 %	0 %	312795094
6570	NC_014722	GCC	2	6	331294	331299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
6571	NC_014722	CTT	2	6	331306	331311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312795094
6572	NC_014722	CAT	2	6	331312	331317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795094
6573	NC_014722	CCT	2	6	331356	331361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795094
6574	NC_014722	CGCCGG	2	12	331371	331382	0 %	0 %	50 %	50 %	312795094
6575	NC_014722	GCTT	2	8	331402	331409	0 %	50 %	25 %	25 %	312795094
6576	NC_014722	GC	3	6	331427	331432	0 %	0 %	50 %	50 %	312795094
6577	NC_014722	CGGC	2	8	331434	331441	0 %	0 %	50 %	50 %	312795094
6578	NC_014722	TGA	2	6	331452	331457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312795094
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6580	NC_014722	GCC	2	6	331558	331563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
6581	NC_014722	TTC	2	6	331568	331573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312795094
6582	NC_014722	GCC	2	6	331615	331620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
6583	NC_014722	TTC	2	6	331622	331627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312795094
6584	NC_014722	CGC	2	6	331665	331670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
6585	NC_014722	CCT	2	6	331677	331682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312795094
6586	NC_014722	CGCCGA	2	12	331767	331778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312795094
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6588	NC_014722	CGC	2	6	331819	331824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
6589	NC_014722	GCC	2	6	331825	331830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
6590	NC_014722	ACG	2	6	331859	331864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795094
6591	NC_014722	GCATC	2	10	331923	331932	20 %	20 %	20 %	40 %	312795094
6592	NC_014722	GAC	2	6	331933	331938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795094
6593	NC_014722	CGGC	2	8	331950	331957	0 %	0 %	50 %	50 %	312795094
6594	NC_014722	CAT	2	6	331990	331995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312795094
6595	NC_014722	GCCGA	2	10	332008	332017	20 %	0 %	40 %	40 %	312795094
6596	NC_014722	CCG	2	6	332019	332024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
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6598	NC_014722	GAA	2	6	332116	332121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312795094
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6605	NC_014722	CGC	2	6	332343	332348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
6606	NC_014722	GCT	2	6	332407	332412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795094
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6609	NC_014722	ACG	2	6	332570	332575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795094
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6611	NC_014722	TG	3	6	332588	332593	0 %	50 %	50 %	0 %	312795094
6612	NC_014722	CGC	2	6	332625	332630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795094
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6614	NC_014722	GGC	2	6	332775	332780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795095
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6616	NC_014722	GCACG	2	10	332822	332831	20 %	0 %	40 %	40 %	312795095
6617	NC_014722	CTG	2	6	332832	332837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795095
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6619	NC_014722	GC	4	8	332907	332914	0 %	0 %	50 %	50 %	312795095
6620	NC_014722	CGC	2	6	332924	332929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795095
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6622	NC_014722	TGC	3	9	332947	332955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795095
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6867	NC_014722	GTCGAT	2	12	343505	343516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312795107
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6988	NC_014722	CGG	2	6	349626	349631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795114
6989	NC_014722	C	6	6	349708	349713	0 %	0 %	0 %	100 %	312795115
6990	NC_014722	CTG	2	6	349731	349736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795115
6991	NC_014722	CGC	2	6	349798	349803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312795115
6992	NC_014722	GCTG	2	8	349817	349824	0 %	25 %	50 %	25 %	312795115
6993	NC_014722	GC	3	6	349865	349870	0 %	0 %	50 %	50 %	312795115
6994	NC_014722	TGGG	2	8	349900	349907	0 %	25 %	75 %	0 %	312795115
6995	NC_014722	T	6	6	349908	349913	0 %	100 %	0 %	0 %	312795115
6996	NC_014722	TGGC	2	8	349937	349944	0 %	25 %	50 %	25 %	312795115
6997	NC_014722	TGC	2	6	349951	349956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312795115
6998	NC_014722	CGG	2	6	349963	349968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795115
6999	NC_014722	AGC	2	6	350005	350010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312795115
7000	NC_014722	GGC	2	6	350025	350030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312795115

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