MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 10139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014718	TGG	2	6	323	328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602095
2	NC_014718	GCG	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602095
3	NC_014718	GCG	2	6	486	491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602096
4	NC_014718	CAC	2	6	577	582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602096
5	NC_014718	CGT	2	6	642	647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602096
6	NC_014718	GGC	2	6	648	653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602096
7	NC_014718	GCC	2	6	702	707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602096
8	NC_014718	CGC	2	6	720	725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602096
9	NC_014718	CGC	2	6	761	766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602096
10	NC_014718	CGG	3	9	771	779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602096
11	NC_014718	GCG	2	6	959	964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602097
12	NC_014718	AGG	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602097
13	NC_014718	GCA	2	6	1068	1073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602097
14	NC_014718	GCG	2	6	1128	1133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602097
15	NC_014718	CGC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602097
16	NC_014718	AGC	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602097
17	NC_014718	TCG	2	6	1333	1338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602098
18	NC_014718	TCG	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602098
19	NC_014718	TGT	2	6	1390	1395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602098
20	NC_014718	GTC	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602098
21	NC_014718	TGG	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602098
22	NC_014718	GCT	2	6	1666	1671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602099
23	NC_014718	GCT	2	6	1680	1685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602099
24	NC_014718	GCG	2	6	1974	1979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602101
25	NC_014718	CGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602101
26	NC_014718	TCA	2	6	2416	2421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602102
27	NC_014718	TGC	2	6	2429	2434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602102
28	NC_014718	GTC	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602102
29	NC_014718	AGA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602102
30	NC_014718	TTC	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602102
31	NC_014718	AGA	2	6	2573	2578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602102
32	NC_014718	GCG	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602102
33	NC_014718	GTT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602102
34	NC_014718	AGC	2	6	2726	2731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
35	NC_014718	AGC	2	6	2756	2761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
36	NC_014718	AGC	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
37	NC_014718	AGC	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
38	NC_014718	AGC	2	6	2846	2851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
39	NC_014718	AGC	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
40	NC_014718	AGC	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
41	NC_014718	AGC	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
42	NC_014718	AGC	2	6	2966	2971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
43	NC_014718	AGC	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
44	NC_014718	AGC	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
45	NC_014718	AGC	2	6	3056	3061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
46	NC_014718	AGC	2	6	3086	3091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
47	NC_014718	AGC	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
48	NC_014718	AGC	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
49	NC_014718	AGC	2	6	3176	3181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
50	NC_014718	AGC	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
51	NC_014718	AGC	2	6	3236	3241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
52	NC_014718	AGG	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602102
53	NC_014718	GCA	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
54	NC_014718	CGA	2	6	3393	3398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
55	NC_014718	CGA	2	6	3411	3416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
56	NC_014718	TGG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602102
57	NC_014718	AAC	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602102
58	NC_014718	GCA	2	6	3680	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
59	NC_014718	ACG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
60	NC_014718	CAT	2	6	4089	4094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602102
61	NC_014718	AGC	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602102
62	NC_014718	CGG	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602102
63	NC_014718	CCG	2	6	4428	4433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602102
64	NC_014718	GTG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602102
65	NC_014718	TTC	2	6	4480	4485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602102
66	NC_014718	ACT	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602103
67	NC_014718	CAG	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602103
68	NC_014718	GTG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602103
69	NC_014718	CCA	2	6	5017	5022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602104
70	NC_014718	GCG	2	6	5259	5264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602105
71	NC_014718	TGC	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602105
72	NC_014718	GCC	2	6	5419	5424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602105
73	NC_014718	ACG	2	6	5433	5438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602105
74	NC_014718	CGG	2	6	5564	5569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602105
75	NC_014718	TGC	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602106
76	NC_014718	ACG	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602106
77	NC_014718	ACG	2	6	5901	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602106
78	NC_014718	GTG	3	9	5999	6007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602106
79	NC_014718	GCC	2	6	6053	6058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602106
80	NC_014718	GCT	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602106
81	NC_014718	GGT	2	6	6094	6099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602106
82	NC_014718	CCG	2	6	6139	6144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602106
83	NC_014718	CGA	2	6	6161	6166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602106
84	NC_014718	TGA	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602106
85	NC_014718	AAG	2	6	6252	6257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602107
86	NC_014718	CTG	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602107
87	NC_014718	GCG	2	6	6303	6308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602107
88	NC_014718	ATC	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602107
89	NC_014718	TCG	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602107
90	NC_014718	GGC	2	6	6607	6612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602108
91	NC_014718	GCG	2	6	6725	6730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602108
92	NC_014718	TGG	2	6	6812	6817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602108
93	NC_014718	CGG	2	6	6830	6835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602108
94	NC_014718	GCG	2	6	6859	6864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602108
95	NC_014718	TCG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602109
96	NC_014718	GGC	2	6	7018	7023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602109
97	NC_014718	GCC	2	6	7049	7054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602109
98	NC_014718	TTG	2	6	7070	7075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602109
99	NC_014718	GCC	2	6	7118	7123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602109
100	NC_014718	CTG	2	6	7127	7132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602109
101	NC_014718	CGC	2	6	7206	7211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602109
102	NC_014718	TCG	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602109
103	NC_014718	ACG	2	6	7373	7378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602109
104	NC_014718	TCG	3	9	7383	7391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602109
105	NC_014718	AGA	2	6	7449	7454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602109
106	NC_014718	GTT	2	6	7691	7696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602110
107	NC_014718	GCA	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602110
108	NC_014718	TCG	2	6	7735	7740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602110
109	NC_014718	GCC	2	6	7747	7752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602110
110	NC_014718	GAC	2	6	7782	7787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602110
111	NC_014718	TGG	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602110
112	NC_014718	TGG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602110
113	NC_014718	CGG	2	6	8201	8206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602110
114	NC_014718	CGC	2	6	8216	8221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602110
115	NC_014718	GCC	2	6	8235	8240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602110
116	NC_014718	GGC	2	6	8282	8287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602110
117	NC_014718	GCG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602110
118	NC_014718	GCC	3	9	8361	8369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602110
119	NC_014718	GAG	2	6	8373	8378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602110
120	NC_014718	GCG	2	6	8397	8402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602110
121	NC_014718	TGA	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602110
122	NC_014718	CGA	2	6	8549	8554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602110
123	NC_014718	CGC	2	6	8676	8681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602110
124	NC_014718	GGC	2	6	8742	8747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602111
125	NC_014718	CGG	2	6	8798	8803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602111
126	NC_014718	CGC	2	6	8808	8813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602111
127	NC_014718	CGT	2	6	8818	8823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602111
128	NC_014718	CGA	2	6	8929	8934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602111
129	NC_014718	CGC	2	6	9066	9071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602112
130	NC_014718	CGC	2	6	9104	9109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602112
131	NC_014718	CGC	2	6	9130	9135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602112
132	NC_014718	GCA	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602112
133	NC_014718	TTG	2	6	9187	9192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602112
134	NC_014718	CGA	2	6	9375	9380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602113
135	NC_014718	TGA	2	6	9396	9401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602113
136	NC_014718	GCG	2	6	9493	9498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602113
137	NC_014718	TGC	2	6	9558	9563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602113
138	NC_014718	ATT	2	6	9596	9601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602113
139	NC_014718	ATC	2	6	9692	9697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602113
140	NC_014718	TCA	2	6	9855	9860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602113
141	NC_014718	ACG	2	6	9864	9869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602113
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143	NC_014718	TGC	2	6	9888	9893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602113
144	NC_014718	CGG	2	6	9894	9899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602113
145	NC_014718	GCA	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602113
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147	NC_014718	TGC	2	6	10077	10082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602113
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149	NC_014718	ATC	2	6	10233	10238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602113
150	NC_014718	ATG	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602113
151	NC_014718	CGG	2	6	10351	10356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602113
152	NC_014718	ATC	2	6	10550	10555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602113
153	NC_014718	CTG	2	6	10586	10591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602113
154	NC_014718	CGC	2	6	10632	10637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602113
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156	NC_014718	CGA	2	6	10759	10764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602114
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158	NC_014718	CTG	2	6	11002	11007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602115
159	NC_014718	CTG	2	6	11081	11086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602115
160	NC_014718	GTC	2	6	11094	11099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602115
161	NC_014718	GCG	2	6	11126	11131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602115
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163	NC_014718	CAT	2	6	11471	11476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602116
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168	NC_014718	CGG	3	9	12109	12117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602118
169	NC_014718	CAG	2	6	12172	12177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602118
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171	NC_014718	CGA	2	6	12312	12317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602118
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239	NC_014718	CGG	2	6	18795	18800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602128
240	NC_014718	TCA	2	6	18851	18856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602128
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244	NC_014718	GCC	2	6	18956	18961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602128
245	NC_014718	TGA	2	6	19025	19030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602128
246	NC_014718	ACT	2	6	19067	19072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602128
247	NC_014718	CGG	2	6	19224	19229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602128
248	NC_014718	GCA	2	6	19260	19265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602128
249	NC_014718	TGG	2	6	19328	19333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602128
250	NC_014718	ACG	2	6	19349	19354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602128
251	NC_014718	GCG	2	6	19355	19360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602128
252	NC_014718	CGC	2	6	19434	19439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602128
253	NC_014718	GGC	3	9	19455	19463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602128
254	NC_014718	TGC	2	6	19685	19690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602128
255	NC_014718	TCG	2	6	20080	20085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602129
256	NC_014718	TCG	3	9	20101	20109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602129
257	NC_014718	GGC	2	6	20169	20174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602129
258	NC_014718	CGG	3	9	20231	20239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602129
259	NC_014718	CGG	2	6	20312	20317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602129
260	NC_014718	GTG	2	6	20326	20331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602129
261	NC_014718	GAC	2	6	20343	20348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602129
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272	NC_014718	CGG	2	6	21194	21199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602129
273	NC_014718	TGA	2	6	21281	21286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602129
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289	NC_014718	GGC	2	6	22165	22170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602132
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375	NC_014718	TGG	2	6	29784	29789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
376	NC_014718	GGC	2	6	29845	29850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
377	NC_014718	GAT	2	6	29951	29956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
378	NC_014718	GAC	2	6	30004	30009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
379	NC_014718	CGA	2	6	30015	30020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
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381	NC_014718	GCT	2	6	30091	30096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
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497	NC_014718	ACC	2	6	38414	38419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602137
498	NC_014718	GCA	2	6	38593	38598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
499	NC_014718	GCT	2	6	38761	38766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
500	NC_014718	TCA	2	6	38770	38775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602137

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