MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014718	ACG	2	6	185574	185579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3502	NC_014718	TGC	2	6	185611	185616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3503	NC_014718	CGG	2	6	185617	185622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602269
3504	NC_014718	GCG	2	6	185669	185674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602269
3505	NC_014718	CGA	2	6	185714	185719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3506	NC_014718	GTC	2	6	185730	185735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3507	NC_014718	GC	3	6	185766	185771	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3508	NC_014718	TGC	2	6	185806	185811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3509	NC_014718	CCA	2	6	185836	185841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602269
3510	NC_014718	GGGGC	2	10	185873	185882	0 %	0 %	80 %	20 %	312602269
3511	NC_014718	CG	3	6	185912	185917	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3512	NC_014718	GAT	2	6	185945	185950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602269
3513	NC_014718	GC	4	8	185951	185958	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3514	NC_014718	CAG	2	6	185984	185989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3515	NC_014718	GGC	2	6	185997	186002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602269
3516	NC_014718	GCC	2	6	186005	186010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602269
3517	NC_014718	TCG	2	6	186025	186030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3518	NC_014718	GC	3	6	186067	186072	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3519	NC_014718	GAT	2	6	186092	186097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602269
3520	NC_014718	CG	3	6	186143	186148	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3521	NC_014718	TTGGG	2	10	186178	186187	0 %	40 %	60 %	0 %	312602269
3522	NC_014718	GCA	2	6	186201	186206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3523	NC_014718	CCT	2	6	186210	186215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602269
3524	NC_014718	TCC	2	6	186250	186255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602269
3525	NC_014718	AAT	2	6	186259	186264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602269
3526	NC_014718	TGT	2	6	186273	186278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602270
3527	NC_014718	GC	3	6	186279	186284	0 %	0 %	50 %	50 %	312602270
3528	NC_014718	CCG	2	6	186286	186291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602270
3529	NC_014718	CG	3	6	186290	186295	0 %	0 %	50 %	50 %	312602270
3530	NC_014718	TCGATG	2	12	186324	186335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312602270
3531	NC_014718	TAA	2	6	186441	186446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602270
3532	NC_014718	ATTAAT	2	12	186449	186460	50 %	50 %	0 %	0 %	312602270
3533	NC_014718	AAT	2	6	186462	186467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602270
3534	NC_014718	CGG	2	6	186581	186586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602271
3535	NC_014718	CG	3	6	186618	186623	0 %	0 %	50 %	50 %	312602271
3536	NC_014718	GT	3	6	186693	186698	0 %	50 %	50 %	0 %	312602272
3537	NC_014718	GCG	2	6	186739	186744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602272
3538	NC_014718	CGG	2	6	186745	186750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602272
3539	NC_014718	TTA	2	6	186782	186787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602272
3540	NC_014718	GCA	2	6	186979	186984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602273
3541	NC_014718	GAT	2	6	187021	187026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602274
3542	NC_014718	GAG	2	6	187060	187065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602274
3543	NC_014718	CGA	2	6	187134	187139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602274
3544	NC_014718	TGT	2	6	187184	187189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602274
3545	NC_014718	GGA	2	6	187197	187202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602274
3546	NC_014718	CGG	3	9	187266	187274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602274
3547	NC_014718	GCA	2	6	187301	187306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602274
3548	NC_014718	TGT	2	6	187385	187390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602274
3549	NC_014718	TGA	2	6	187403	187408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602274
3550	NC_014718	CAG	2	6	187522	187527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602274
3551	NC_014718	GGC	2	6	187572	187577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602274
3552	NC_014718	GCC	2	6	187714	187719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602274
3553	NC_014718	GCCG	2	8	187755	187762	0 %	0 %	50 %	50 %	312602274
3554	NC_014718	TGC	2	6	187799	187804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602274
3555	NC_014718	TGGC	2	8	187893	187900	0 %	25 %	50 %	25 %	312602275
3556	NC_014718	CTGA	2	8	187932	187939	25 %	25 %	25 %	25 %	312602275
3557	NC_014718	TGG	2	6	187954	187959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602275
3558	NC_014718	GCT	2	6	187979	187984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602275
3559	NC_014718	TTG	2	6	188040	188045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602275
3560	NC_014718	CTTG	2	8	188058	188065	0 %	50 %	25 %	25 %	312602275
3561	NC_014718	GGT	2	6	188072	188077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602275
3562	NC_014718	GCA	2	6	188113	188118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602275
3563	NC_014718	CGG	2	6	188146	188151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602275
3564	NC_014718	GCG	2	6	188161	188166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602275
3565	NC_014718	TGC	2	6	188170	188175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602275
3566	NC_014718	GTT	2	6	188186	188191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602275
3567	NC_014718	CA	3	6	188235	188240	50 %	0 %	0 %	50 %	312602275
3568	NC_014718	ATC	2	6	188248	188253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602275
3569	NC_014718	ATGC	2	8	188293	188300	25 %	25 %	25 %	25 %	312602276
3570	NC_014718	CGA	2	6	188337	188342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602276
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3572	NC_014718	CGTG	2	8	188415	188422	0 %	25 %	50 %	25 %	312602276
3573	NC_014718	CGG	2	6	188424	188429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602276
3574	NC_014718	CGTG	2	8	188487	188494	0 %	25 %	50 %	25 %	312602276
3575	NC_014718	TCAG	2	8	188555	188562	25 %	25 %	25 %	25 %	312602276
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3579	NC_014718	CCCGG	2	10	188731	188740	0 %	0 %	40 %	60 %	312602276
3580	NC_014718	CAAA	2	8	188748	188755	75 %	0 %	0 %	25 %	312602276
3581	NC_014718	AGC	2	6	188822	188827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602276
3582	NC_014718	TGGTG	2	10	188829	188838	0 %	40 %	60 %	0 %	312602276
3583	NC_014718	TGC	2	6	188930	188935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602276
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3585	NC_014718	ACG	2	6	188981	188986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602276
3586	NC_014718	TCCG	2	8	189032	189039	0 %	25 %	25 %	50 %	312602276
3587	NC_014718	ATTTG	2	10	189117	189126	20 %	60 %	20 %	0 %	312602276
3588	NC_014718	TACA	2	8	189130	189137	50 %	25 %	0 %	25 %	312602276
3589	NC_014718	CGAT	2	8	189224	189231	25 %	25 %	25 %	25 %	312602277
3590	NC_014718	TGC	2	6	189264	189269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602277
3591	NC_014718	GAAA	2	8	189281	189288	75 %	0 %	25 %	0 %	312602277
3592	NC_014718	CGC	2	6	189308	189313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602277
3593	NC_014718	CG	3	6	189320	189325	0 %	0 %	50 %	50 %	312602277
3594	NC_014718	CCAG	2	8	189332	189339	25 %	0 %	25 %	50 %	312602277
3595	NC_014718	GCAT	2	8	189454	189461	25 %	25 %	25 %	25 %	312602277
3596	NC_014718	ACG	2	6	189486	189491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602277
3597	NC_014718	ACG	2	6	189496	189501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602277
3598	NC_014718	GC	6	12	189558	189569	0 %	0 %	50 %	50 %	312602277
3599	NC_014718	ACG	2	6	189628	189633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602277
3600	NC_014718	GGC	2	6	189675	189680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602277
3601	NC_014718	GCG	2	6	189684	189689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602277
3602	NC_014718	CAG	3	9	189747	189755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602277
3603	NC_014718	CGC	2	6	189815	189820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602277
3604	NC_014718	TCT	2	6	189832	189837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602277
3605	NC_014718	TGT	2	6	189895	189900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602277
3606	NC_014718	CAGC	2	8	189962	189969	25 %	0 %	25 %	50 %	312602277
3607	NC_014718	CGG	2	6	190058	190063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602277
3608	NC_014718	GGC	2	6	190107	190112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602277
3609	NC_014718	CGAT	2	8	190123	190130	25 %	25 %	25 %	25 %	312602277
3610	NC_014718	CCGGA	2	10	190203	190212	20 %	0 %	40 %	40 %	312602277
3611	NC_014718	CCGG	2	8	190323	190330	0 %	0 %	50 %	50 %	312602277
3612	NC_014718	ATC	2	6	190347	190352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602277
3613	NC_014718	GGA	2	6	190409	190414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602277
3614	NC_014718	AAG	2	6	190422	190427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602277
3615	NC_014718	GCTA	2	8	190428	190435	25 %	25 %	25 %	25 %	312602277
3616	NC_014718	GCCG	2	8	190439	190446	0 %	0 %	50 %	50 %	312602277
3617	NC_014718	ACA	2	6	190447	190452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602277
3618	NC_014718	ATG	2	6	190494	190499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602277
3619	NC_014718	CGT	2	6	190532	190537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602277
3620	NC_014718	GCACC	2	10	190546	190555	20 %	0 %	20 %	60 %	312602277
3621	NC_014718	GCT	2	6	190557	190562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602277
3622	NC_014718	CTGGT	2	10	190614	190623	0 %	40 %	40 %	20 %	312602277
3623	NC_014718	CGT	2	6	190747	190752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602278
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3862	NC_014718	GCGCG	2	10	201132	201141	0 %	0 %	60 %	40 %	312602285
3863	NC_014718	GATC	2	8	201167	201174	25 %	25 %	25 %	25 %	312602285
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3988	NC_014718	CAC	2	6	206277	206282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602290
3989	NC_014718	TCG	2	6	206371	206376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602290
3990	NC_014718	CCG	2	6	206395	206400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602290
3991	NC_014718	CG	3	6	206557	206562	0 %	0 %	50 %	50 %	312602290
3992	NC_014718	CCA	2	6	206663	206668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602290
3993	NC_014718	GCA	2	6	206674	206679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602290
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