MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014718	A	6	6	160502	160507	100 %	0 %	0 %	0 %	312602240
3002	NC_014718	GGC	2	6	160578	160583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602240
3003	NC_014718	ACC	2	6	160642	160647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602240
3004	NC_014718	GTG	2	6	160733	160738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
3005	NC_014718	TA	3	6	160796	160801	50 %	50 %	0 %	0 %	312602240
3006	NC_014718	GCC	2	6	160886	160891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602240
3007	NC_014718	ATCT	2	8	160909	160916	25 %	50 %	0 %	25 %	312602240
3008	NC_014718	TA	3	6	160964	160969	50 %	50 %	0 %	0 %	312602240
3009	NC_014718	G	7	7	160972	160978	0 %	0 %	100 %	0 %	312602240
3010	NC_014718	GC	3	6	160987	160992	0 %	0 %	50 %	50 %	312602240
3011	NC_014718	ACG	2	6	161132	161137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
3012	NC_014718	GGT	2	6	161220	161225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
3013	NC_014718	TGG	2	6	161258	161263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
3014	NC_014718	TGG	2	6	161270	161275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
3015	NC_014718	GCT	2	6	161505	161510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
3016	NC_014718	GGC	2	6	161554	161559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602240
3017	NC_014718	CTG	2	6	161566	161571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
3018	NC_014718	AGC	2	6	161819	161824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
3019	NC_014718	CA	3	6	161988	161993	50 %	0 %	0 %	50 %	312602240
3020	NC_014718	AGG	2	6	162089	162094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602240
3021	NC_014718	ATG	3	9	162116	162124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602240
3022	NC_014718	A	6	6	162161	162166	100 %	0 %	0 %	0 %	312602240
3023	NC_014718	GTT	2	6	162175	162180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602240
3024	NC_014718	AAT	2	6	162184	162189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602240
3025	NC_014718	C	6	6	162212	162217	0 %	0 %	0 %	100 %	312602240
3026	NC_014718	GGC	2	6	162299	162304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602240
3027	NC_014718	CAT	2	6	162349	162354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602240
3028	NC_014718	AT	3	6	162413	162418	50 %	50 %	0 %	0 %	312602240
3029	NC_014718	A	7	7	162433	162439	100 %	0 %	0 %	0 %	312602240
3030	NC_014718	GTT	2	6	162446	162451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602240
3031	NC_014718	CGC	2	6	162829	162834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602241
3032	NC_014718	CTC	2	6	162847	162852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602241
3033	NC_014718	GC	4	8	162907	162914	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3034	NC_014718	GCC	2	6	162946	162951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602241
3035	NC_014718	GCA	2	6	162954	162959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3036	NC_014718	AAGCCG	2	12	162989	163000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3037	NC_014718	CGT	2	6	163083	163088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3038	NC_014718	GC	3	6	163107	163112	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3039	NC_014718	GTC	2	6	163124	163129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3040	NC_014718	TAA	2	6	163183	163188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602241
3041	NC_014718	CG	3	6	163189	163194	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3042	NC_014718	GC	3	6	163230	163235	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3043	NC_014718	AGC	2	6	163307	163312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3044	NC_014718	GCT	2	6	163353	163358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3045	NC_014718	TCG	2	6	163394	163399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3046	NC_014718	CGT	2	6	163425	163430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3047	NC_014718	GCG	2	6	163500	163505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602241
3048	NC_014718	CAT	2	6	163531	163536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602241
3049	NC_014718	TGC	2	6	163544	163549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3050	NC_014718	GCG	2	6	163667	163672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602241
3051	NC_014718	GC	3	6	163682	163687	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3052	NC_014718	GCTC	2	8	163824	163831	0 %	25 %	25 %	50 %	312602241
3053	NC_014718	CG	3	6	163838	163843	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3054	NC_014718	TGCT	2	8	163898	163905	0 %	50 %	25 %	25 %	312602241
3055	NC_014718	CG	3	6	163909	163914	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3056	NC_014718	GC	3	6	163925	163930	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3057	NC_014718	GC	3	6	163993	163998	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3058	NC_014718	GC	3	6	164009	164014	0 %	0 %	50 %	50 %	312602241
3059	NC_014718	A	6	6	164019	164024	100 %	0 %	0 %	0 %	312602241
3060	NC_014718	GAC	2	6	164033	164038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3061	NC_014718	GGC	2	6	164056	164061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602241
3062	NC_014718	CGA	3	9	164067	164075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602241
3063	NC_014718	CGAA	2	8	164101	164108	50 %	0 %	25 %	25 %	312602241
3064	NC_014718	CTC	2	6	164116	164121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602242
3065	NC_014718	CGC	2	6	164145	164150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602242
3066	NC_014718	GAA	2	6	164183	164188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602242
3067	NC_014718	CGC	2	6	164280	164285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602242
3068	NC_014718	GCG	2	6	164307	164312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602242
3069	NC_014718	CCG	2	6	164364	164369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602242
3070	NC_014718	GCTG	2	8	164375	164382	0 %	25 %	50 %	25 %	312602242
3071	NC_014718	GCG	2	6	164386	164391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602242
3072	NC_014718	CG	3	6	164408	164413	0 %	0 %	50 %	50 %	312602242
3073	NC_014718	AGC	2	6	164417	164422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602242
3074	NC_014718	GAG	2	6	164431	164436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602242
3075	NC_014718	GCACG	2	10	164514	164523	20 %	0 %	40 %	40 %	312602242
3076	NC_014718	GCG	2	6	164541	164546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602242
3077	NC_014718	CGG	2	6	164571	164576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602243
3078	NC_014718	ATC	2	6	164590	164595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602243
3079	NC_014718	GCGCA	2	10	164613	164622	20 %	0 %	40 %	40 %	312602243
3080	NC_014718	GTC	2	6	164706	164711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602243
3081	NC_014718	CAG	2	6	164721	164726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602243
3082	NC_014718	TCTT	2	8	164759	164766	0 %	75 %	0 %	25 %	312602243
3083	NC_014718	CAC	2	6	164859	164864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602244
3084	NC_014718	GC	3	6	165103	165108	0 %	0 %	50 %	50 %	312602245
3085	NC_014718	GAC	2	6	165203	165208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602246
3086	NC_014718	GC	3	6	165211	165216	0 %	0 %	50 %	50 %	312602246
3087	NC_014718	CACCG	2	10	165224	165233	20 %	0 %	20 %	60 %	312602246
3088	NC_014718	CG	3	6	165619	165624	0 %	0 %	50 %	50 %	312602247
3089	NC_014718	GC	3	6	165725	165730	0 %	0 %	50 %	50 %	312602247
3090	NC_014718	GCG	2	6	165746	165751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602247
3091	NC_014718	TCG	2	6	165806	165811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602247
3092	NC_014718	TGG	2	6	165833	165838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602247
3093	NC_014718	CG	3	6	165841	165846	0 %	0 %	50 %	50 %	312602247
3094	NC_014718	CG	3	6	165898	165903	0 %	0 %	50 %	50 %	312602247
3095	NC_014718	CAC	2	6	165931	165936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602247
3096	NC_014718	CGG	2	6	165952	165957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602247
3097	NC_014718	TCG	2	6	166013	166018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602247
3098	NC_014718	ACG	2	6	166031	166036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602247
3099	NC_014718	TTC	2	6	166073	166078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602247
3100	NC_014718	CG	4	8	166110	166117	0 %	0 %	50 %	50 %	312602247
3101	NC_014718	CAT	2	6	166140	166145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602247
3102	NC_014718	CGA	2	6	166182	166187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602247
3103	NC_014718	GCA	2	6	166191	166196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602247
3104	NC_014718	GC	3	6	166310	166315	0 %	0 %	50 %	50 %	312602247
3105	NC_014718	GCATC	2	10	166326	166335	20 %	20 %	20 %	40 %	312602247
3106	NC_014718	GCC	2	6	166345	166350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602247
3107	NC_014718	GTA	2	6	166363	166368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602247
3108	NC_014718	GGT	2	6	166413	166418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602247
3109	NC_014718	GCC	2	6	166504	166509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602247
3110	NC_014718	GCC	2	6	166533	166538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602247
3111	NC_014718	GC	5	10	166541	166550	0 %	0 %	50 %	50 %	312602247
3112	NC_014718	GTT	2	6	166572	166577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602247
3113	NC_014718	GGATC	2	10	166773	166782	20 %	20 %	40 %	20 %	312602247
3114	NC_014718	CCG	2	6	166853	166858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602248
3115	NC_014718	GCCA	2	8	166913	166920	25 %	0 %	25 %	50 %	312602248
3116	NC_014718	CGG	2	6	166951	166956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602248
3117	NC_014718	TGC	2	6	167066	167071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602248
3118	NC_014718	GAT	2	6	167086	167091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602248
3119	NC_014718	CAG	2	6	167113	167118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602248
3120	NC_014718	TAAT	2	8	167171	167178	50 %	50 %	0 %	0 %	312602248
3121	NC_014718	GCG	2	6	167219	167224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602248
3122	NC_014718	CGC	2	6	167232	167237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602248
3123	NC_014718	GC	3	6	167258	167263	0 %	0 %	50 %	50 %	312602248
3124	NC_014718	TGC	2	6	167276	167281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602248
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3233	NC_014718	TGT	2	6	171920	171925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602252
3234	NC_014718	AT	3	6	171941	171946	50 %	50 %	0 %	0 %	312602252
3235	NC_014718	CGG	2	6	171996	172001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602252
3236	NC_014718	CGCC	2	8	172036	172043	0 %	0 %	25 %	75 %	312602252
3237	NC_014718	ACG	2	6	172045	172050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602252
3238	NC_014718	GCTC	2	8	172051	172058	0 %	25 %	25 %	50 %	312602253
3239	NC_014718	CG	3	6	172072	172077	0 %	0 %	50 %	50 %	312602253
3240	NC_014718	CTG	2	6	172113	172118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602253
3241	NC_014718	GGC	2	6	172151	172156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602253
3242	NC_014718	CGA	2	6	172277	172282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602253
3243	NC_014718	CGT	2	6	172288	172293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602253
3244	NC_014718	CGCA	2	8	172355	172362	25 %	0 %	25 %	50 %	312602253
3245	NC_014718	AGC	2	6	172519	172524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602253
3246	NC_014718	CG	3	6	172593	172598	0 %	0 %	50 %	50 %	312602253
3247	NC_014718	CG	4	8	172624	172631	0 %	0 %	50 %	50 %	312602253
3248	NC_014718	GGC	2	6	172647	172652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602253
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3250	NC_014718	GCGTC	2	10	172736	172745	0 %	20 %	40 %	40 %	312602253
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3281	NC_014718	GTC	2	6	174176	174181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602254
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3354	NC_014718	TG	3	6	177314	177319	0 %	50 %	50 %	0 %	312602256
3355	NC_014718	GAA	2	6	177336	177341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602256
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3358	NC_014718	CTGC	2	8	177575	177582	0 %	25 %	25 %	50 %	312602257
3359	NC_014718	ATCG	2	8	177638	177645	25 %	25 %	25 %	25 %	312602257
3360	NC_014718	ATC	2	6	177651	177656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602257
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3362	NC_014718	CGA	2	6	177679	177684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602257
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3364	NC_014718	G	6	6	177725	177730	0 %	0 %	100 %	0 %	312602257
3365	NC_014718	GGCG	2	8	177818	177825	0 %	0 %	75 %	25 %	312602257
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3367	NC_014718	GCA	2	6	177939	177944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602258
3368	NC_014718	GCG	2	6	178027	178032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602258
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3370	NC_014718	CGA	2	6	178084	178089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602258
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3488	NC_014718	CGA	2	6	185004	185009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602268
3489	NC_014718	ATG	2	6	185019	185024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602268
3490	NC_014718	GGC	2	6	185035	185040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602269
3491	NC_014718	CG	3	6	185057	185062	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3492	NC_014718	CGG	2	6	185093	185098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602269
3493	NC_014718	GCCG	2	8	185132	185139	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3494	NC_014718	GCT	2	6	185159	185164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3495	NC_014718	CG	3	6	185204	185209	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3496	NC_014718	GC	4	8	185331	185338	0 %	0 %	50 %	50 %	312602269
3497	NC_014718	GAT	2	6	185354	185359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602269
3498	NC_014718	TGC	2	6	185395	185400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3499	NC_014718	TGC	2	6	185431	185436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602269
3500	NC_014718	TGC	2	6	185530	185535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602269

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