MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014718	GGCG	2	8	136100	136107	0 %	0 %	75 %	25 %	312602227
2503	NC_014718	GGT	2	6	136109	136114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602227
2504	NC_014718	GAC	2	6	136122	136127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602227
2505	NC_014718	GAA	2	6	136225	136230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602228
2506	NC_014718	GCGT	2	8	136289	136296	0 %	25 %	50 %	25 %	312602228
2507	NC_014718	TGTGC	2	10	136297	136306	0 %	40 %	40 %	20 %	312602228
2508	NC_014718	CGT	2	6	136395	136400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602228
2509	NC_014718	GCC	2	6	136414	136419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602228
2510	NC_014718	GCG	2	6	136451	136456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602228
2511	NC_014718	CGTC	2	8	136871	136878	0 %	25 %	25 %	50 %	312602229
2512	NC_014718	TGT	2	6	136886	136891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602229
2513	NC_014718	GCCGG	2	10	137042	137051	0 %	0 %	60 %	40 %	312602229
2514	NC_014718	CGG	2	6	137075	137080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602229
2515	NC_014718	CG	3	6	137081	137086	0 %	0 %	50 %	50 %	312602229
2516	NC_014718	ACG	2	6	137131	137136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602229
2517	NC_014718	CGT	2	6	137148	137153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602229
2518	NC_014718	CGC	2	6	137159	137164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602229
2519	NC_014718	GC	3	6	137171	137176	0 %	0 %	50 %	50 %	312602229
2520	NC_014718	AAG	2	6	137224	137229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602229
2521	NC_014718	GAGC	2	8	137253	137260	25 %	0 %	50 %	25 %	312602229
2522	NC_014718	TGAC	2	8	137288	137295	25 %	25 %	25 %	25 %	312602229
2523	NC_014718	GC	3	6	137348	137353	0 %	0 %	50 %	50 %	312602229
2524	NC_014718	GAG	2	6	137377	137382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602229
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2529	NC_014718	GC	3	6	137464	137469	0 %	0 %	50 %	50 %	312602229
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2533	NC_014718	GCG	2	6	137607	137612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602229
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2545	NC_014718	GATGC	2	10	138049	138058	20 %	20 %	40 %	20 %	312602229
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2550	NC_014718	GGGCT	2	10	138253	138262	0 %	20 %	60 %	20 %	312602229
2551	NC_014718	GCG	2	6	138293	138298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602229
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2553	NC_014718	TGC	2	6	138389	138394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602229
2554	NC_014718	GCG	2	6	138400	138405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602229
2555	NC_014718	GGC	2	6	138412	138417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602229
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2560	NC_014718	GC	3	6	138613	138618	0 %	0 %	50 %	50 %	312602229
2561	NC_014718	GTTGC	2	10	138619	138628	0 %	40 %	40 %	20 %	312602229
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2589	NC_014718	TCGC	2	8	139830	139837	0 %	25 %	25 %	50 %	312602231
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2592	NC_014718	TCG	2	6	140027	140032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602232
2593	NC_014718	CGAC	2	8	140071	140078	25 %	0 %	25 %	50 %	312602232
2594	NC_014718	CCG	2	6	140099	140104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602232
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2605	NC_014718	CGCGA	2	10	140593	140602	20 %	0 %	40 %	40 %	312602232
2606	NC_014718	GTA	2	6	140610	140615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602232
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2621	NC_014718	TGCC	2	8	141108	141115	0 %	25 %	25 %	50 %	312602232
2622	NC_014718	CTCGG	2	10	141124	141133	0 %	20 %	40 %	40 %	312602232
2623	NC_014718	ACG	2	6	141145	141150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602232
2624	NC_014718	GGT	2	6	141189	141194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602232
2625	NC_014718	GCG	2	6	141195	141200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602232
2626	NC_014718	GCTT	2	8	141220	141227	0 %	50 %	25 %	25 %	312602232
2627	NC_014718	GCA	2	6	141308	141313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602232
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2631	NC_014718	CGAGT	2	10	141525	141534	20 %	20 %	40 %	20 %	312602232
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2641	NC_014718	GTC	2	6	141975	141980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602232
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2654	NC_014718	CCG	2	6	142523	142528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602232
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2683	NC_014718	CGC	2	6	144239	144244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602234
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2729	NC_014718	CGAT	2	8	146718	146725	25 %	25 %	25 %	25 %	312602238
2730	NC_014718	ATC	2	6	146814	146819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602238
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2734	NC_014718	TCA	2	6	146958	146963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602238
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2736	NC_014718	ATGT	2	8	146987	146994	25 %	50 %	25 %	0 %	312602238
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2742	NC_014718	CG	3	6	147254	147259	0 %	0 %	50 %	50 %	312602238
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2745	NC_014718	GAA	2	6	147374	147379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602238
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2857	NC_014718	GTG	2	6	153667	153672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
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2862	NC_014718	ACTG	2	8	153936	153943	25 %	25 %	25 %	25 %	312602240
2863	NC_014718	TGC	2	6	154079	154084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2864	NC_014718	TGC	2	6	154157	154162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2865	NC_014718	CAT	2	6	154216	154221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602240
2866	NC_014718	GTG	2	6	154228	154233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
2867	NC_014718	AAG	2	6	154268	154273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602240
2868	NC_014718	AGCA	2	8	154284	154291	50 %	0 %	25 %	25 %	312602240
2869	NC_014718	AAT	2	6	154357	154362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602240
2870	NC_014718	GAC	2	6	154404	154409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2871	NC_014718	CGA	3	9	154437	154445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2872	NC_014718	CGGC	2	8	154464	154471	0 %	0 %	50 %	50 %	312602240
2873	NC_014718	ACA	2	6	154478	154483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602240
2874	NC_014718	GC	3	6	154669	154674	0 %	0 %	50 %	50 %	312602240
2875	NC_014718	TCAAG	2	10	154719	154728	40 %	20 %	20 %	20 %	312602240
2876	NC_014718	TGG	2	6	154838	154843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
2877	NC_014718	TGG	2	6	154850	154855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
2878	NC_014718	GAT	2	6	154864	154869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602240
2879	NC_014718	GC	3	6	155020	155025	0 %	0 %	50 %	50 %	312602240
2880	NC_014718	CGACA	2	10	155110	155119	40 %	0 %	20 %	40 %	312602240
2881	NC_014718	GGGC	2	8	155133	155140	0 %	0 %	75 %	25 %	312602240
2882	NC_014718	GCT	2	6	155145	155150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2883	NC_014718	TGA	2	6	155162	155167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602240
2884	NC_014718	TGC	2	6	155214	155219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2885	NC_014718	GCA	2	6	155256	155261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2886	NC_014718	CA	3	6	155260	155265	50 %	0 %	0 %	50 %	312602240
2887	NC_014718	GCG	2	6	155275	155280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602240
2888	NC_014718	GCA	2	6	155334	155339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2889	NC_014718	GCGA	2	8	155371	155378	25 %	0 %	50 %	25 %	312602240
2890	NC_014718	TCATA	2	10	155380	155389	40 %	40 %	0 %	20 %	312602240
2891	NC_014718	CTGCGC	2	12	155401	155412	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312602240
2892	NC_014718	CGTGG	2	10	155427	155436	0 %	20 %	60 %	20 %	312602240
2893	NC_014718	GCGCT	2	10	155473	155482	0 %	20 %	40 %	40 %	312602240
2894	NC_014718	CCG	2	6	155528	155533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602240
2895	NC_014718	GCGCG	2	10	155565	155574	0 %	0 %	60 %	40 %	312602240
2896	NC_014718	CCGACG	2	12	155576	155587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312602240
2897	NC_014718	GTG	2	6	155692	155697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
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2899	NC_014718	CTG	2	6	155774	155779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
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2902	NC_014718	TGC	2	6	155921	155926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
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2904	NC_014718	CAA	2	6	155959	155964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602240
2905	NC_014718	GC	3	6	155975	155980	0 %	0 %	50 %	50 %	312602240
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2916	NC_014718	TGCT	2	8	156617	156624	0 %	50 %	25 %	25 %	312602240
2917	NC_014718	CTG	2	6	156640	156645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
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2923	NC_014718	GAG	2	6	156911	156916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602240
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2926	NC_014718	GACTT	2	10	157241	157250	20 %	40 %	20 %	20 %	312602240
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2942	NC_014718	GCT	2	6	158334	158339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
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2951	NC_014718	TGC	2	6	158510	158515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2952	NC_014718	GATC	2	8	158541	158548	25 %	25 %	25 %	25 %	312602240
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2954	NC_014718	CAT	2	6	158632	158637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602240
2955	NC_014718	CTG	2	6	158638	158643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2956	NC_014718	CTG	2	6	158665	158670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
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2958	NC_014718	CAG	2	6	158728	158733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2959	NC_014718	GTC	2	6	158734	158739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
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2972	NC_014718	GGC	2	6	159287	159292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602240
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2982	NC_014718	AGCG	2	8	159634	159641	25 %	0 %	50 %	25 %	312602240
2983	NC_014718	CGG	2	6	159671	159676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602240
2984	NC_014718	GGA	2	6	159711	159716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602240
2985	NC_014718	GCA	2	6	159789	159794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2986	NC_014718	GAG	2	6	159871	159876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602240
2987	NC_014718	CTG	3	9	159883	159891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2988	NC_014718	GCA	2	6	159909	159914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2989	NC_014718	CCA	2	6	159939	159944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602240
2990	NC_014718	CTGAA	2	10	160019	160028	40 %	20 %	20 %	20 %	312602240
2991	NC_014718	CG	3	6	160083	160088	0 %	0 %	50 %	50 %	312602240
2992	NC_014718	TG	3	6	160099	160104	0 %	50 %	50 %	0 %	312602240
2993	NC_014718	TGG	3	9	160121	160129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602240
2994	NC_014718	GCT	2	6	160131	160136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2995	NC_014718	GCGG	2	8	160150	160157	0 %	0 %	75 %	25 %	312602240
2996	NC_014718	GCG	2	6	160246	160251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602240
2997	NC_014718	TGC	2	6	160295	160300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602240
2998	NC_014718	TGA	2	6	160418	160423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602240
2999	NC_014718	GCTT	2	8	160448	160455	0 %	50 %	25 %	25 %	312602240
3000	NC_014718	CAA	2	6	160462	160467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602240

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