MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014718	GCC	2	6	106693	106698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602197
2002	NC_014718	TGG	2	6	106755	106760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602197
2003	NC_014718	GC	4	8	106782	106789	0 %	0 %	50 %	50 %	312602197
2004	NC_014718	TAC	2	6	106994	106999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602198
2005	NC_014718	TGGG	2	8	107030	107037	0 %	25 %	75 %	0 %	312602198
2006	NC_014718	GCT	2	6	107087	107092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602198
2007	NC_014718	GCG	2	6	107151	107156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602198
2008	NC_014718	CCA	2	6	107247	107252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602198
2009	NC_014718	GAT	2	6	107292	107297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602198
2010	NC_014718	GTA	2	6	107566	107571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602199
2011	NC_014718	CTC	2	6	107602	107607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602199
2012	NC_014718	TAG	2	6	107630	107635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602199
2013	NC_014718	GAA	2	6	107656	107661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602199
2014	NC_014718	GGC	2	6	107733	107738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602199
2015	NC_014718	CGTC	2	8	107952	107959	0 %	25 %	25 %	50 %	312602199
2016	NC_014718	TCG	2	6	108094	108099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602199
2017	NC_014718	TGAT	2	8	108110	108117	25 %	50 %	25 %	0 %	312602199
2018	NC_014718	CCG	2	6	108130	108135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602199
2019	NC_014718	CCG	2	6	108151	108156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602199
2020	NC_014718	GT	3	6	108173	108178	0 %	50 %	50 %	0 %	312602199
2021	NC_014718	CTG	2	6	108244	108249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602199
2022	NC_014718	TGC	2	6	108261	108266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602199
2023	NC_014718	GC	3	6	108265	108270	0 %	0 %	50 %	50 %	312602199
2024	NC_014718	TTG	2	6	108307	108312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602199
2025	NC_014718	TC	5	10	108337	108346	0 %	50 %	0 %	50 %	312602199
2026	NC_014718	GCTC	2	8	108356	108363	0 %	25 %	25 %	50 %	312602199
2027	NC_014718	T	6	6	108385	108390	0 %	100 %	0 %	0 %	312602199
2028	NC_014718	TGG	2	6	108439	108444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602200
2029	NC_014718	CAT	2	6	108452	108457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602200
2030	NC_014718	TTG	2	6	108462	108467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602200
2031	NC_014718	TTTGT	2	10	108471	108480	0 %	80 %	20 %	0 %	312602200
2032	NC_014718	TTC	2	6	108490	108495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602200
2033	NC_014718	TGC	2	6	108559	108564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602200
2034	NC_014718	AAT	2	6	108576	108581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602200
2035	NC_014718	GCG	2	6	108607	108612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602200
2036	NC_014718	CTC	2	6	108633	108638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602200
2037	NC_014718	CTT	2	6	108690	108695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602200
2038	NC_014718	AGCC	2	8	108791	108798	25 %	0 %	25 %	50 %	312602200
2039	NC_014718	AGT	2	6	108809	108814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602200
2040	NC_014718	TAGCT	2	10	108828	108837	20 %	40 %	20 %	20 %	312602200
2041	NC_014718	CTG	3	9	108921	108929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602200
2042	NC_014718	CA	3	6	108965	108970	50 %	0 %	0 %	50 %	312602201
2043	NC_014718	TCA	2	6	109098	109103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602201
2044	NC_014718	AAGG	2	8	109118	109125	50 %	0 %	50 %	0 %	312602201
2045	NC_014718	GCT	2	6	109132	109137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602201
2046	NC_014718	CGC	2	6	109142	109147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602201
2047	NC_014718	CTGG	2	8	109226	109233	0 %	25 %	50 %	25 %	312602202
2048	NC_014718	ATGCTC	2	12	109256	109267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312602202
2049	NC_014718	CGAT	2	8	110048	110055	25 %	25 %	25 %	25 %	312602203
2050	NC_014718	CAT	2	6	110146	110151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602203
2051	NC_014718	TGC	2	6	110160	110165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602203
2052	NC_014718	AAG	2	6	110174	110179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602203
2053	NC_014718	CCG	3	9	110228	110236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602203
2054	NC_014718	TCA	2	6	110288	110293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602203
2055	NC_014718	TC	3	6	110309	110314	0 %	50 %	0 %	50 %	312602203
2056	NC_014718	ATGT	2	8	110317	110324	25 %	50 %	25 %	0 %	312602203
2057	NC_014718	CGG	2	6	110351	110356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602203
2058	NC_014718	TAT	2	6	110377	110382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602203
2059	NC_014718	ATA	2	6	110414	110419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602203
2060	NC_014718	CAGCA	2	10	110491	110500	40 %	0 %	20 %	40 %	312602203
2061	NC_014718	CG	4	8	110508	110515	0 %	0 %	50 %	50 %	312602203
2062	NC_014718	TCG	2	6	110546	110551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602203
2063	NC_014718	CG	3	6	110584	110589	0 %	0 %	50 %	50 %	312602203
2064	NC_014718	GAA	2	6	110704	110709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602203
2065	NC_014718	GTG	2	6	110914	110919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602203
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2067	NC_014718	CA	3	6	111097	111102	50 %	0 %	0 %	50 %	312602204
2068	NC_014718	T	7	7	111119	111125	0 %	100 %	0 %	0 %	312602204
2069	NC_014718	ACC	2	6	111155	111160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602204
2070	NC_014718	ACTG	2	8	111169	111176	25 %	25 %	25 %	25 %	312602204
2071	NC_014718	CAT	2	6	111205	111210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602204
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2075	NC_014718	TAT	2	6	111637	111642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602204
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2082	NC_014718	CGC	2	6	112287	112292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602205
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2087	NC_014718	GCA	2	6	112937	112942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602206
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2089	NC_014718	TGC	2	6	113027	113032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602206
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2092	NC_014718	TCA	2	6	113184	113189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602206
2093	NC_014718	CAG	2	6	113196	113201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602206
2094	NC_014718	GCG	2	6	113258	113263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602206
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2099	NC_014718	GTT	2	6	113497	113502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602206
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2105	NC_014718	GAC	2	6	114168	114173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602206
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2108	NC_014718	TCG	2	6	114329	114334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
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2112	NC_014718	CTG	2	6	114481	114486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
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2114	NC_014718	CGA	2	6	114581	114586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
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2117	NC_014718	GAA	2	6	114625	114630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602207
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2119	NC_014718	TACT	2	8	114670	114677	25 %	50 %	0 %	25 %	312602207
2120	NC_014718	CGTG	2	8	114744	114751	0 %	25 %	50 %	25 %	312602207
2121	NC_014718	CTT	2	6	114786	114791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602207
2122	NC_014718	AGC	2	6	114975	114980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
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2124	NC_014718	GTG	2	6	115027	115032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
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2126	NC_014718	CGCGCT	2	12	115191	115202	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312602207
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2133	NC_014718	TGA	2	6	115424	115429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602207
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2230	NC_014718	TGC	2	6	120020	120025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
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2232	NC_014718	GC	4	8	120190	120197	0 %	0 %	50 %	50 %	312602207
2233	NC_014718	GTC	2	6	120283	120288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2234	NC_014718	GGCG	2	8	120309	120316	0 %	0 %	75 %	25 %	312602207
2235	NC_014718	GCG	2	6	120406	120411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602207
2236	NC_014718	GGC	2	6	120417	120422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602207
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2238	NC_014718	CGA	2	6	120636	120641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
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2240	NC_014718	TCA	2	6	120728	120733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602207
2241	NC_014718	GCCA	2	8	120841	120848	25 %	0 %	25 %	50 %	312602207
2242	NC_014718	TGG	2	6	120891	120896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
2243	NC_014718	GCAGA	2	10	120943	120952	40 %	0 %	40 %	20 %	312602207
2244	NC_014718	CAG	2	6	121099	121104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2245	NC_014718	TGG	2	6	121140	121145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
2246	NC_014718	GC	3	6	121231	121236	0 %	0 %	50 %	50 %	312602207
2247	NC_014718	TCAAG	2	10	121308	121317	40 %	20 %	20 %	20 %	312602207
2248	NC_014718	ACG	2	6	121382	121387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
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2251	NC_014718	GCT	2	6	121674	121679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
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2273	NC_014718	ATTT	2	8	122880	122887	25 %	75 %	0 %	0 %	312602208
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2284	NC_014718	GC	3	6	123808	123813	0 %	0 %	50 %	50 %	312602209
2285	NC_014718	GTC	2	6	123876	123881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602209
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2348	NC_014718	GCCG	2	8	127554	127561	0 %	0 %	50 %	50 %	312602212
2349	NC_014718	AAC	2	6	127613	127618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602212
2350	NC_014718	AGCGA	2	10	127740	127749	40 %	0 %	40 %	20 %	312602212
2351	NC_014718	A	7	7	127765	127771	100 %	0 %	0 %	0 %	312602212
2352	NC_014718	GAA	2	6	127795	127800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602212
2353	NC_014718	GTCT	2	8	127812	127819	0 %	50 %	25 %	25 %	312602212
2354	NC_014718	CTTTG	2	10	127888	127897	0 %	60 %	20 %	20 %	312602212
2355	NC_014718	AAAG	2	8	127967	127974	75 %	0 %	25 %	0 %	312602212
2356	NC_014718	GAA	2	6	128009	128014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602212
2357	NC_014718	CTC	2	6	128071	128076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602212
2358	NC_014718	TGCT	2	8	128369	128376	0 %	50 %	25 %	25 %	312602213
2359	NC_014718	GGTA	2	8	128398	128405	25 %	25 %	50 %	0 %	312602213
2360	NC_014718	ATC	2	6	128409	128414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602213
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2362	NC_014718	CCG	2	6	128499	128504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602213
2363	NC_014718	GCTGG	2	10	128603	128612	0 %	20 %	60 %	20 %	312602214
2364	NC_014718	AGC	2	6	128626	128631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602214
2365	NC_014718	ACA	2	6	129185	129190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602215
2366	NC_014718	CGG	2	6	129263	129268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602215
2367	NC_014718	AGG	2	6	129398	129403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602216
2368	NC_014718	GTC	2	6	129442	129447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602216
2369	NC_014718	GGC	2	6	129463	129468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602216
2370	NC_014718	GCC	2	6	129539	129544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602216
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2375	NC_014718	TGC	2	6	130262	130267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602217
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2423	NC_014718	TCG	2	6	132356	132361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602221
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2431	NC_014718	GCT	2	6	132817	132822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602223
2432	NC_014718	TCG	2	6	132837	132842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602223
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2434	NC_014718	CGA	2	6	132871	132876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602223
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2438	NC_014718	CAG	2	6	133157	133162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602223
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2442	NC_014718	TCG	2	6	133281	133286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602223
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2450	NC_014718	TGC	2	6	133851	133856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602224
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2474	NC_014718	CG	3	6	134698	134703	0 %	0 %	50 %	50 %	312602225
2475	NC_014718	GCGCT	2	10	134758	134767	0 %	20 %	40 %	40 %	312602225
2476	NC_014718	TGC	2	6	134774	134779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602225
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2482	NC_014718	GCC	2	6	135423	135428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602226
2483	NC_014718	GTA	2	6	135429	135434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602226
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2485	NC_014718	GCA	2	6	135476	135481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602226
2486	NC_014718	GGC	2	6	135494	135499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602226
2487	NC_014718	CGT	2	6	135521	135526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602226
2488	NC_014718	GCC	2	6	135543	135548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602226
2489	NC_014718	AGT	2	6	135553	135558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602226
2490	NC_014718	ACG	2	6	135643	135648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602226
2491	NC_014718	GCG	2	6	135697	135702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602226
2492	NC_014718	CAG	2	6	135753	135758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602226
2493	NC_014718	CGGC	2	8	135776	135783	0 %	0 %	50 %	50 %	312602226
2494	NC_014718	GGC	2	6	135820	135825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602226
2495	NC_014718	CAG	2	6	135903	135908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602227
2496	NC_014718	CGA	2	6	135947	135952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602227
2497	NC_014718	GCCGCG	2	12	135971	135982	0 %	0 %	50 %	50 %	312602227
2498	NC_014718	CGGC	2	8	136039	136046	0 %	0 %	50 %	50 %	312602227
2499	NC_014718	AAGA	2	8	136050	136057	75 %	0 %	25 %	0 %	312602227
2500	NC_014718	GGC	2	6	136073	136078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602227

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