MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014718	TGT	2	6	50933	50938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602144
1002	NC_014718	CGG	2	6	51006	51011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602144
1003	NC_014718	TGC	2	6	51026	51031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1004	NC_014718	CTG	2	6	51060	51065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1005	NC_014718	ACC	2	6	51265	51270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602144
1006	NC_014718	GCG	3	9	51272	51280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602144
1007	NC_014718	GCTT	2	8	51292	51299	0 %	50 %	25 %	25 %	312602144
1008	NC_014718	ACA	2	6	51341	51346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602144
1009	NC_014718	CGA	2	6	51371	51376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1010	NC_014718	GC	3	6	51401	51406	0 %	0 %	50 %	50 %	312602144
1011	NC_014718	CGA	2	6	51440	51445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1012	NC_014718	GCA	2	6	51473	51478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1013	NC_014718	CAG	2	6	51582	51587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1014	NC_014718	GTT	2	6	51612	51617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602144
1015	NC_014718	GGAC	2	8	51747	51754	25 %	0 %	50 %	25 %	312602144
1016	NC_014718	GT	3	6	51813	51818	0 %	50 %	50 %	0 %	312602144
1017	NC_014718	TTC	2	6	51844	51849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602144
1018	NC_014718	TCG	2	6	51877	51882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1019	NC_014718	TCG	2	6	51919	51924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1020	NC_014718	CG	3	6	51977	51982	0 %	0 %	50 %	50 %	312602145
1021	NC_014718	CGA	2	6	52129	52134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602145
1022	NC_014718	ACG	2	6	52153	52158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602145
1023	NC_014718	CG	3	6	52157	52162	0 %	0 %	50 %	50 %	312602145
1024	NC_014718	GCCC	2	8	52189	52196	0 %	0 %	25 %	75 %	312602145
1025	NC_014718	CGC	2	6	52537	52542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602146
1026	NC_014718	CGC	2	6	52547	52552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602146
1027	NC_014718	TCGCG	2	10	52555	52564	0 %	20 %	40 %	40 %	312602146
1028	NC_014718	CGA	2	6	52579	52584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602146
1029	NC_014718	GAC	2	6	52613	52618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602146
1030	NC_014718	CGT	2	6	52750	52755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602146
1031	NC_014718	GC	4	8	52785	52792	0 %	0 %	50 %	50 %	312602146
1032	NC_014718	GAA	2	6	52796	52801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602146
1033	NC_014718	GAT	2	6	52918	52923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602147
1034	NC_014718	GCT	2	6	52938	52943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602147
1035	NC_014718	ATG	2	6	52946	52951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602147
1036	NC_014718	CCAG	2	8	52960	52967	25 %	0 %	25 %	50 %	312602147
1037	NC_014718	GC	3	6	52972	52977	0 %	0 %	50 %	50 %	312602147
1038	NC_014718	GCG	2	6	52989	52994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602147
1039	NC_014718	TCA	2	6	53016	53021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602147
1040	NC_014718	GGT	2	6	53022	53027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602147
1041	NC_014718	TCT	2	6	53064	53069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602147
1042	NC_014718	CCT	2	6	53130	53135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602147
1043	NC_014718	CTT	2	6	53154	53159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602147
1044	NC_014718	GCG	2	6	53236	53241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602147
1045	NC_014718	GCC	2	6	53311	53316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602147
1046	NC_014718	GC	3	6	53334	53339	0 %	0 %	50 %	50 %	312602147
1047	NC_014718	GCATC	2	10	53451	53460	20 %	20 %	20 %	40 %	312602147
1048	NC_014718	ACC	2	6	53509	53514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602147
1049	NC_014718	GTC	2	6	53521	53526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602147
1050	NC_014718	AGT	2	6	53562	53567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602147
1051	NC_014718	CAG	2	6	53578	53583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602147
1052	NC_014718	GCA	2	6	53658	53663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602147
1053	NC_014718	GGAT	2	8	53721	53728	25 %	25 %	50 %	0 %	312602147
1054	NC_014718	CAG	2	6	53827	53832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602147
1055	NC_014718	CTT	2	6	53841	53846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602147
1056	NC_014718	CGG	2	6	53940	53945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602147
1057	NC_014718	CGAC	2	8	53961	53968	25 %	0 %	25 %	50 %	312602147
1058	NC_014718	TTC	2	6	53969	53974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602147
1059	NC_014718	TTG	3	9	53999	54007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602147
1060	NC_014718	GTT	2	6	54057	54062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602148
1061	NC_014718	GCG	2	6	54064	54069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602148
1062	NC_014718	GC	3	6	54127	54132	0 %	0 %	50 %	50 %	312602148
1063	NC_014718	GCA	2	6	54173	54178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602148
1064	NC_014718	GCT	2	6	54199	54204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602148
1065	NC_014718	GCA	2	6	54228	54233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602148
1066	NC_014718	GTC	2	6	54354	54359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602148
1067	NC_014718	GCTC	2	8	54418	54425	0 %	25 %	25 %	50 %	312602148
1068	NC_014718	GCG	2	6	54451	54456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602148
1069	NC_014718	GC	3	6	54465	54470	0 %	0 %	50 %	50 %	312602148
1070	NC_014718	ATG	2	6	54472	54477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602148
1071	NC_014718	TCG	2	6	54487	54492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602148
1072	NC_014718	GC	3	6	54495	54500	0 %	0 %	50 %	50 %	312602148
1073	NC_014718	CCG	2	6	54506	54511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602148
1074	NC_014718	CA	3	6	54543	54548	50 %	0 %	0 %	50 %	312602148
1075	NC_014718	GCC	2	6	54607	54612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602148
1076	NC_014718	TGA	2	6	54623	54628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602148
1077	NC_014718	GC	3	6	54642	54647	0 %	0 %	50 %	50 %	312602148
1078	NC_014718	CGC	2	6	54659	54664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602148
1079	NC_014718	CAG	2	6	54687	54692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602148
1080	NC_014718	GCG	2	6	54717	54722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602148
1081	NC_014718	CGC	2	6	54783	54788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602148
1082	NC_014718	CGC	3	9	54791	54799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602148
1083	NC_014718	CGC	2	6	54843	54848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602148
1084	NC_014718	GCG	2	6	54898	54903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602148
1085	NC_014718	TGGGG	2	10	54931	54940	0 %	20 %	80 %	0 %	312602148
1086	NC_014718	AAC	2	6	54965	54970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602149
1087	NC_014718	TCGGC	2	10	55037	55046	0 %	20 %	40 %	40 %	312602149
1088	NC_014718	CGTTT	2	10	55080	55089	0 %	60 %	20 %	20 %	312602150
1089	NC_014718	TCGC	2	8	55181	55188	0 %	25 %	25 %	50 %	312602150
1090	NC_014718	CG	3	6	55283	55288	0 %	0 %	50 %	50 %	312602150
1091	NC_014718	GC	3	6	55381	55386	0 %	0 %	50 %	50 %	312602150
1092	NC_014718	ATCC	2	8	55408	55415	25 %	25 %	0 %	50 %	312602150
1093	NC_014718	ATGC	2	8	55432	55439	25 %	25 %	25 %	25 %	312602150
1094	NC_014718	AC	3	6	55483	55488	50 %	0 %	0 %	50 %	312602150
1095	NC_014718	TCGG	2	8	55557	55564	0 %	25 %	50 %	25 %	312602150
1096	NC_014718	GGT	2	6	55617	55622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602150
1097	NC_014718	GCC	2	6	55648	55653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602150
1098	NC_014718	GCAT	2	8	55661	55668	25 %	25 %	25 %	25 %	312602150
1099	NC_014718	TGCG	2	8	55693	55700	0 %	25 %	50 %	25 %	312602150
1100	NC_014718	GCGCC	2	10	55755	55764	0 %	0 %	40 %	60 %	312602150
1101	NC_014718	CTG	2	6	55777	55782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1102	NC_014718	GTG	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602150
1103	NC_014718	GGC	2	6	55881	55886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602150
1104	NC_014718	GCT	2	6	55896	55901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1105	NC_014718	CCGACG	2	12	55934	55945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312602150
1106	NC_014718	GCG	2	6	56012	56017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602150
1107	NC_014718	GGC	2	6	56023	56028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602150
1108	NC_014718	CG	4	8	56051	56058	0 %	0 %	50 %	50 %	312602150
1109	NC_014718	GCA	2	6	56100	56105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1110	NC_014718	GAC	2	6	56128	56133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1111	NC_014718	GC	3	6	56147	56152	0 %	0 %	50 %	50 %	312602150
1112	NC_014718	GCGCGT	2	12	56160	56171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602150
1113	NC_014718	CGT	2	6	56179	56184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1114	NC_014718	CGTGCT	2	12	56205	56216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1115	NC_014718	GCGCG	2	10	56272	56281	0 %	0 %	60 %	40 %	312602150
1116	NC_014718	GCT	2	6	56325	56330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1117	NC_014718	GC	4	8	56372	56379	0 %	0 %	50 %	50 %	312602150
1118	NC_014718	G	7	7	56381	56387	0 %	0 %	100 %	0 %	312602150
1119	NC_014718	CGTTGC	2	12	56453	56464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1120	NC_014718	TGC	2	6	56474	56479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1121	NC_014718	GTG	2	6	56500	56505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602150
1122	NC_014718	CGC	2	6	56550	56555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602150
1123	NC_014718	TAT	2	6	56611	56616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602150
1124	NC_014718	GTGAT	2	10	56666	56675	20 %	40 %	40 %	0 %	312602150
1125	NC_014718	GCT	2	6	56676	56681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
1126	NC_014718	GCT	2	6	56694	56699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602150
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1130	NC_014718	GCCGC	2	10	56779	56788	0 %	0 %	40 %	60 %	312602150
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1236	NC_014718	ATC	2	6	63003	63008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602158
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1242	NC_014718	GCCT	2	8	63223	63230	0 %	25 %	25 %	50 %	312602158
1243	NC_014718	CGA	2	6	63314	63319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602158
1244	NC_014718	GCG	2	6	63392	63397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602158
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1247	NC_014718	C	6	6	63730	63735	0 %	0 %	0 %	100 %	312602159
1248	NC_014718	GCGCGA	2	12	63737	63748	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312602159
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1369	NC_014718	CCAG	2	8	70558	70565	25 %	0 %	25 %	50 %	312602165
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1374	NC_014718	GAAT	2	8	71799	71806	50 %	25 %	25 %	0 %	312602167
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1479	NC_014718	GCGT	2	8	78797	78804	0 %	25 %	50 %	25 %	312602181
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1495	NC_014718	GCA	2	6	80866	80871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602183
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1497	NC_014718	CGCC	2	8	80948	80955	0 %	0 %	25 %	75 %	312602183
1498	NC_014718	GCG	2	6	80958	80963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602183
1499	NC_014718	TGA	2	6	81027	81032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602183
1500	NC_014718	TGG	2	6	81040	81045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602183

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