MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014718	CG	3	6	528000	528005	0 %	0 %	50 %	50 %	312602587
10002	NC_014718	GGC	2	6	528042	528047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602587
10003	NC_014718	CGC	2	6	528089	528094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602587
10004	NC_014718	CGG	2	6	528128	528133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602587
10005	NC_014718	TGA	2	6	528167	528172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602587
10006	NC_014718	AGCGC	2	10	528179	528188	20 %	0 %	40 %	40 %	312602587
10007	NC_014718	TTG	2	6	528219	528224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602587
10008	NC_014718	TCGC	2	8	528283	528290	0 %	25 %	25 %	50 %	312602587
10009	NC_014718	CCG	2	6	528292	528297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602587
10010	NC_014718	TGC	2	6	528322	528327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602587
10011	NC_014718	CG	3	6	528396	528401	0 %	0 %	50 %	50 %	312602587
10012	NC_014718	GCA	2	6	528442	528447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602587
10013	NC_014718	AAC	2	6	528448	528453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602587
10014	NC_014718	TCA	2	6	528494	528499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602587
10015	NC_014718	GAA	2	6	528534	528539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602587
10016	NC_014718	CCGA	2	8	528549	528556	25 %	0 %	25 %	50 %	312602587
10017	NC_014718	GCG	2	6	528672	528677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602587
10018	NC_014718	GCC	2	6	528757	528762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602587
10019	NC_014718	TGCG	2	8	528766	528773	0 %	25 %	50 %	25 %	312602587
10020	NC_014718	CCA	2	6	528806	528811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602587
10021	NC_014718	CCA	2	6	528818	528823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602587
10022	NC_014718	CAC	2	6	528855	528860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602587
10023	NC_014718	GCT	2	6	529145	529150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602587
10024	NC_014718	AAAT	2	8	529165	529172	75 %	25 %	0 %	0 %	312602587
10025	NC_014718	CGGC	2	8	529188	529195	0 %	0 %	50 %	50 %	312602587
10026	NC_014718	CGT	2	6	529242	529247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602587
10027	NC_014718	CGT	2	6	529254	529259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602587
10028	NC_014718	TCGG	2	8	529264	529271	0 %	25 %	50 %	25 %	312602587
10029	NC_014718	ATTA	2	8	529281	529288	50 %	50 %	0 %	0 %	312602587
10030	NC_014718	TTG	2	6	529290	529295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602587
10031	NC_014718	CCA	2	6	529322	529327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602587
10032	NC_014718	TCC	2	6	529347	529352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602587
10033	NC_014718	CAAT	2	8	529355	529362	50 %	25 %	0 %	25 %	312602587
10034	NC_014718	AAC	2	6	529399	529404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602587
10035	NC_014718	AGC	2	6	529470	529475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602587
10036	NC_014718	GAC	2	6	529503	529508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602587
10037	NC_014718	AGC	2	6	529509	529514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602587
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10043	NC_014718	CAG	2	6	529938	529943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602587
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10046	NC_014718	TCAGC	2	10	530048	530057	20 %	20 %	20 %	40 %	312602587
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10050	NC_014718	CGA	2	6	530418	530423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602587
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10052	NC_014718	CTTCG	2	10	530601	530610	0 %	40 %	20 %	40 %	312602587
10053	NC_014718	GGC	2	6	530847	530852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602587
10054	NC_014718	TC	3	6	530918	530923	0 %	50 %	0 %	50 %	312602587
10055	NC_014718	GC	3	6	531014	531019	0 %	0 %	50 %	50 %	312602587
10056	NC_014718	AGCAC	2	10	531049	531058	40 %	0 %	20 %	40 %	312602587
10057	NC_014718	CCAT	2	8	531064	531071	25 %	25 %	0 %	50 %	312602587
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10061	NC_014718	TGT	2	6	531398	531403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602587
10062	NC_014718	GCT	2	6	531425	531430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602587
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10070	NC_014718	GGC	2	6	532883	532888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602588
10071	NC_014718	CTG	2	6	532964	532969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602588
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10073	NC_014718	GTCG	2	8	533854	533861	0 %	25 %	50 %	25 %	312602589
10074	NC_014718	TCCC	2	8	533881	533888	0 %	25 %	0 %	75 %	312602589
10075	NC_014718	GCC	3	9	533903	533911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602589
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10078	NC_014718	CAG	2	6	533971	533976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602589
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10080	NC_014718	CGATGC	2	12	534119	534130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312602590
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10082	NC_014718	CG	4	8	534237	534244	0 %	0 %	50 %	50 %	312602590
10083	NC_014718	CCGC	2	8	534273	534280	0 %	0 %	25 %	75 %	312602590
10084	NC_014718	CG	4	8	534341	534348	0 %	0 %	50 %	50 %	312602590
10085	NC_014718	CGC	2	6	534371	534376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602590
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10088	NC_014718	CG	3	6	534451	534456	0 %	0 %	50 %	50 %	312602590
10089	NC_014718	GCT	2	6	534518	534523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602590
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10091	NC_014718	GCAA	2	8	534598	534605	50 %	0 %	25 %	25 %	312602590
10092	NC_014718	GCG	2	6	534655	534660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602590
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10100	NC_014718	GC	4	8	534913	534920	0 %	0 %	50 %	50 %	312602590
10101	NC_014718	ATCC	2	8	534996	535003	25 %	25 %	0 %	50 %	312602590
10102	NC_014718	CGA	2	6	535079	535084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602590
10103	NC_014718	CG	3	6	535115	535120	0 %	0 %	50 %	50 %	312602590
10104	NC_014718	GCA	2	6	535360	535365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602591
10105	NC_014718	T	6	6	535374	535379	0 %	100 %	0 %	0 %	312602591
10106	NC_014718	CG	3	6	535451	535456	0 %	0 %	50 %	50 %	312602592
10107	NC_014718	C	6	6	535457	535462	0 %	0 %	0 %	100 %	312602592
10108	NC_014718	CTCC	2	8	535492	535499	0 %	25 %	0 %	75 %	312602592
10109	NC_014718	CGC	2	6	535616	535621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602592
10110	NC_014718	CGA	2	6	535631	535636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602592
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10112	NC_014718	CCA	2	6	535710	535715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602592
10113	NC_014718	GCC	2	6	535718	535723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602592
10114	NC_014718	CGC	2	6	535775	535780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602592
10115	NC_014718	CGGCG	2	10	535787	535796	0 %	0 %	60 %	40 %	312602592
10116	NC_014718	G	6	6	535799	535804	0 %	0 %	100 %	0 %	312602592
10117	NC_014718	ACGCA	2	10	535908	535917	40 %	0 %	20 %	40 %	312602592
10118	NC_014718	GC	3	6	535933	535938	0 %	0 %	50 %	50 %	312602592
10119	NC_014718	CGA	2	6	535982	535987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602592
10120	NC_014718	ACT	2	6	536003	536008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602592
10121	NC_014718	CGA	2	6	536027	536032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602592
10122	NC_014718	GGCCT	2	10	536046	536055	0 %	20 %	40 %	40 %	312602592
10123	NC_014718	GTT	2	6	536066	536071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602592
10124	NC_014718	CGCGA	2	10	536124	536133	20 %	0 %	40 %	40 %	312602592
10125	NC_014718	GCC	2	6	536151	536156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602592
10126	NC_014718	CGT	2	6	536165	536170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602592
10127	NC_014718	CGC	2	6	536194	536199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602592
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10132	NC_014718	GCC	2	6	536340	536345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602592
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10142	NC_014718	CGA	2	6	536744	536749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602592
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10145	NC_014718	CTT	2	6	536795	536800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602592
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10157	NC_014718	TTA	2	6	537200	537205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602592
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10228	NC_014718	GCT	2	6	541185	541190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602595
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10232	NC_014718	CGC	2	6	541575	541580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602595
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10236	NC_014718	GC	3	6	541789	541794	0 %	0 %	50 %	50 %	312602595
10237	NC_014718	CGG	2	6	541806	541811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602595
10238	NC_014718	TGA	2	6	541837	541842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602595
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10240	NC_014718	GCG	2	6	542086	542091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602596
10241	NC_014718	TGT	3	9	542115	542123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602596
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10243	NC_014718	TCG	2	6	542290	542295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602597
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10249	NC_014718	CG	4	8	543077	543084	0 %	0 %	50 %	50 %	312602598
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10329	NC_014718	ATCG	2	8	546648	546655	25 %	25 %	25 %	25 %	312602602
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10342	NC_014718	CG	3	6	547319	547324	0 %	0 %	50 %	50 %	312602604
10343	NC_014718	CG	3	6	547329	547334	0 %	0 %	50 %	50 %	312602604
10344	NC_014718	CACG	2	8	547409	547416	25 %	0 %	25 %	50 %	312602604
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10356	NC_014718	GCGCC	2	10	547985	547994	0 %	0 %	40 %	60 %	312602604
10357	NC_014718	ACG	2	6	548030	548035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602604
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10360	NC_014718	GC	3	6	548163	548168	0 %	0 %	50 %	50 %	312602604
10361	NC_014718	GAT	2	6	548202	548207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602604
10362	NC_014718	CAT	2	6	548244	548249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602604
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10365	NC_014718	CTG	2	6	548507	548512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602605
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10462	NC_014718	CGA	2	6	554396	554401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602615
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10464	NC_014718	GCTC	2	8	554447	554454	0 %	25 %	25 %	50 %	312602615
10465	NC_014718	AAGC	2	8	554457	554464	50 %	0 %	25 %	25 %	312602615
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10469	NC_014718	TAACG	2	10	554584	554593	40 %	20 %	20 %	20 %	312602616
10470	NC_014718	CTG	2	6	554651	554656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602616
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10474	NC_014718	C	6	6	554791	554796	0 %	0 %	0 %	100 %	312602616
10475	NC_014718	CAT	2	6	554837	554842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602616
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10477	NC_014718	CGC	2	6	554868	554873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602616
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10479	NC_014718	TCGGCG	2	12	554976	554987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602616
10480	NC_014718	CGA	2	6	555043	555048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602616
10481	NC_014718	GCG	2	6	555070	555075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602616
10482	NC_014718	CCG	2	6	555090	555095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602616
10483	NC_014718	CG	3	6	555158	555163	0 %	0 %	50 %	50 %	312602616
10484	NC_014718	GTG	2	6	555178	555183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602616
10485	NC_014718	CGG	2	6	555208	555213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602616
10486	NC_014718	CG	3	6	555224	555229	0 %	0 %	50 %	50 %	312602616
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