MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014718	CTG	2	6	25496	25501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
502	NC_014718	GGC	2	6	25636	25641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
503	NC_014718	GGCA	2	8	25867	25874	25 %	0 %	50 %	25 %	312602137
504	NC_014718	TGT	2	6	25929	25934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602137
505	NC_014718	TTCC	2	8	25938	25945	0 %	50 %	0 %	50 %	312602137
506	NC_014718	TGC	2	6	25974	25979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
507	NC_014718	TGG	2	6	25982	25987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
508	NC_014718	AACG	2	8	26052	26059	50 %	0 %	25 %	25 %	312602137
509	NC_014718	TCAA	2	8	26142	26149	50 %	25 %	0 %	25 %	312602137
510	NC_014718	CGGC	2	8	26221	26228	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
511	NC_014718	ATA	2	6	26235	26240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602137
512	NC_014718	ACAG	2	8	26265	26272	50 %	0 %	25 %	25 %	312602137
513	NC_014718	CGGT	2	8	26289	26296	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
514	NC_014718	TGG	2	6	26308	26313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
515	NC_014718	GGT	2	6	26557	26562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
516	NC_014718	TGG	2	6	26607	26612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
517	NC_014718	TGA	2	6	26620	26625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
518	NC_014718	TTAG	2	8	26630	26637	25 %	50 %	25 %	0 %	312602137
519	NC_014718	CTGC	2	8	26750	26757	0 %	25 %	25 %	50 %	312602137
520	NC_014718	GAC	2	6	26815	26820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
521	NC_014718	CGA	2	6	26826	26831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
522	NC_014718	CTT	2	6	26878	26883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602137
523	NC_014718	GCT	2	6	26902	26907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
524	NC_014718	TGA	2	6	26919	26924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
525	NC_014718	CAA	2	6	27020	27025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602137
526	NC_014718	CAG	2	6	27092	27097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
527	NC_014718	TGC	2	6	27156	27161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
528	NC_014718	GC	3	6	27218	27223	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
529	NC_014718	GCGCT	2	10	27230	27239	0 %	20 %	40 %	40 %	312602137
530	NC_014718	TGC	2	6	27279	27284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
531	NC_014718	CGG	2	6	27285	27290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
532	NC_014718	CGCTG	2	10	27303	27312	0 %	20 %	40 %	40 %	312602137
533	NC_014718	GCG	2	6	27324	27329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
534	NC_014718	GC	3	6	27412	27417	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
535	NC_014718	TGC	2	6	27453	27458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
536	NC_014718	AGCCG	2	10	27550	27559	20 %	0 %	40 %	40 %	312602137
537	NC_014718	GCC	2	6	27562	27567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602137
538	NC_014718	GCG	2	6	27593	27598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
539	NC_014718	GC	3	6	27652	27657	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
540	NC_014718	ACCG	2	8	27691	27698	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
541	NC_014718	CCA	2	6	27762	27767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602137
542	NC_014718	CA	3	6	27766	27771	50 %	0 %	0 %	50 %	312602137
543	NC_014718	ACG	2	6	27803	27808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
544	NC_014718	CG	3	6	27847	27852	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
545	NC_014718	GTCAG	2	10	27856	27865	20 %	20 %	40 %	20 %	312602137
546	NC_014718	ACG	2	6	27867	27872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
547	NC_014718	CTT	2	6	27931	27936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602137
548	NC_014718	GCT	2	6	27991	27996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
549	NC_014718	CG	4	8	27997	28004	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
550	NC_014718	GCG	2	6	28006	28011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
551	NC_014718	GTG	2	6	28058	28063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
552	NC_014718	GCC	2	6	28075	28080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602137
553	NC_014718	GTT	2	6	28102	28107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602137
554	NC_014718	AGGC	2	8	28230	28237	25 %	0 %	50 %	25 %	312602137
555	NC_014718	ATC	2	6	28244	28249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602137
556	NC_014718	GC	3	6	28327	28332	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
557	NC_014718	TGG	2	6	28335	28340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
558	NC_014718	CAG	2	6	28349	28354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
559	NC_014718	TGC	2	6	28398	28403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
560	NC_014718	GTT	2	6	28459	28464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602137
561	NC_014718	GTG	2	6	28584	28589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
562	NC_014718	TGC	2	6	28774	28779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
563	NC_014718	TCC	2	6	28910	28915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602137
564	NC_014718	GTG	2	6	28952	28957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
565	NC_014718	GTG	2	6	29008	29013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
566	NC_014718	TCTG	2	8	29042	29049	0 %	50 %	25 %	25 %	312602137
567	NC_014718	TGG	2	6	29074	29079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
568	NC_014718	GCTC	2	8	29108	29115	0 %	25 %	25 %	50 %	312602137
569	NC_014718	GCCA	2	8	29198	29205	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
570	NC_014718	CA	3	6	29208	29213	50 %	0 %	0 %	50 %	312602137
571	NC_014718	CACG	2	8	29293	29300	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
572	NC_014718	GCA	2	6	29377	29382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
573	NC_014718	ATCT	2	8	29435	29442	25 %	50 %	0 %	25 %	312602137
574	NC_014718	GGC	2	6	29498	29503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
575	NC_014718	GGT	2	6	29746	29751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
576	NC_014718	TGG	2	6	29784	29789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
577	NC_014718	GC	3	6	29833	29838	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
578	NC_014718	GGC	2	6	29845	29850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
579	NC_014718	GAT	2	6	29951	29956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
580	NC_014718	GAC	2	6	30004	30009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
581	NC_014718	CGA	2	6	30015	30020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
582	NC_014718	CTT	2	6	30067	30072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602137
583	NC_014718	GCT	2	6	30091	30096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
584	NC_014718	TGA	2	6	30108	30113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
585	NC_014718	GGC	2	6	30175	30180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
586	NC_014718	GCA	2	6	30208	30213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
587	NC_014718	CAG	2	6	30281	30286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
588	NC_014718	TGC	2	6	30345	30350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
589	NC_014718	TGC	2	6	30468	30473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
590	NC_014718	CGG	2	6	30474	30479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
591	NC_014718	GC	5	10	30563	30572	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
592	NC_014718	GC	3	6	30601	30606	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
593	NC_014718	CGT	2	6	30610	30615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
594	NC_014718	GT	3	6	30640	30645	0 %	50 %	50 %	0 %	312602137
595	NC_014718	CCGCTG	2	12	30746	30757	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312602137
596	NC_014718	GCG	2	6	30782	30787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
597	NC_014718	GC	3	6	30841	30846	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
598	NC_014718	TGC	2	6	30867	30872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
599	NC_014718	ACCG	2	8	30880	30887	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
600	NC_014718	ACG	2	6	30992	30997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
601	NC_014718	ACG	2	6	31056	31061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
602	NC_014718	T	6	6	31121	31126	0 %	100 %	0 %	0 %	312602137
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604	NC_014718	CG	4	8	31186	31193	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
605	NC_014718	GCG	2	6	31195	31200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
606	NC_014718	GTG	2	6	31247	31252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
607	NC_014718	GCC	2	6	31264	31269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602137
608	NC_014718	CGC	2	6	31287	31292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602137
609	NC_014718	CGA	2	6	31426	31431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
610	NC_014718	GC	3	6	31516	31521	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
611	NC_014718	TGG	2	6	31524	31529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
612	NC_014718	TGC	3	9	31587	31595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
613	NC_014718	CGG	2	6	31855	31860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
614	NC_014718	TGC	2	6	31960	31965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
615	NC_014718	GGC	2	6	31975	31980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
616	NC_014718	GTG	2	6	32138	32143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
617	NC_014718	CAGC	3	12	32180	32191	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
618	NC_014718	CGT	2	6	32208	32213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
619	NC_014718	GCG	2	6	32259	32264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
620	NC_014718	GGC	2	6	32287	32292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
621	NC_014718	ACGC	2	8	32342	32349	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
622	NC_014718	GTG	2	6	32529	32534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
623	NC_014718	GGCC	2	8	32564	32571	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
624	NC_014718	ATCT	2	8	32588	32595	25 %	50 %	0 %	25 %	312602137
625	NC_014718	CGGT	2	8	32631	32638	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
626	NC_014718	TGG	2	6	32650	32655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
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628	NC_014718	GGA	2	6	32851	32856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602137
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760	NC_014718	GTT	2	6	38792	38797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602137
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1000	NC_014718	GGT	2	6	50925	50930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602144

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