MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014718	AGC	2	6	317760	317765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602380
6002	NC_014718	GC	3	6	317816	317821	0 %	0 %	50 %	50 %	312602380
6003	NC_014718	TGG	2	6	318087	318092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602380
6004	NC_014718	TGG	2	6	318099	318104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602380
6005	NC_014718	GGC	2	6	318148	318153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602380
6006	NC_014718	TGCCGG	2	12	318243	318254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602380
6007	NC_014718	GCA	2	6	318271	318276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602380
6008	NC_014718	CGG	2	6	318318	318323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602380
6009	NC_014718	GCT	2	6	318334	318339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602380
6010	NC_014718	GGTC	2	8	318352	318359	0 %	25 %	50 %	25 %	312602380
6011	NC_014718	CTT	2	6	318370	318375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602380
6012	NC_014718	GCT	2	6	318394	318399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602380
6013	NC_014718	GAC	2	6	318451	318456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602380
6014	NC_014718	GTT	2	6	318457	318462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602380
6015	NC_014718	GCC	2	6	318464	318469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602380
6016	NC_014718	GAT	2	6	318521	318526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602380
6017	NC_014718	TAC	2	6	318537	318542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602380
6018	NC_014718	GAT	2	6	318680	318685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602380
6019	NC_014718	GGCGAT	2	12	318712	318723	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312602380
6020	NC_014718	CTG	2	6	318773	318778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602380
6021	NC_014718	GTG	2	6	318800	318805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602380
6022	NC_014718	AAC	2	6	318828	318833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602380
6023	NC_014718	GCGA	2	8	318837	318844	25 %	0 %	50 %	25 %	312602380
6024	NC_014718	GTT	2	6	318850	318855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602380
6025	NC_014718	TGC	2	6	318886	318891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602380
6026	NC_014718	TGC	2	6	319109	319114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602382
6027	NC_014718	CG	3	6	319152	319157	0 %	0 %	50 %	50 %	312602382
6028	NC_014718	CG	3	6	319194	319199	0 %	0 %	50 %	50 %	312602382
6029	NC_014718	ATC	2	6	319210	319215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602382
6030	NC_014718	CCAA	2	8	319316	319323	50 %	0 %	0 %	50 %	312602382
6031	NC_014718	CCG	3	9	319413	319421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602383
6032	NC_014718	CAGC	2	8	319424	319431	25 %	0 %	25 %	50 %	312602383
6033	NC_014718	ACAA	2	8	319433	319440	75 %	0 %	0 %	25 %	312602383
6034	NC_014718	AAG	2	6	319478	319483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602383
6035	NC_014718	ACC	2	6	319506	319511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602383
6036	NC_014718	GCG	2	6	319597	319602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602384
6037	NC_014718	TGT	2	6	319632	319637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602384
6038	NC_014718	CGT	2	6	319696	319701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602384
6039	NC_014718	CGG	2	6	319732	319737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602384
6040	NC_014718	CCAT	2	8	319823	319830	25 %	25 %	0 %	50 %	312602384
6041	NC_014718	GCG	2	6	319841	319846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602384
6042	NC_014718	GAT	2	6	319863	319868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602384
6043	NC_014718	T	6	6	319886	319891	0 %	100 %	0 %	0 %	312602384
6044	NC_014718	GTT	2	6	319906	319911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602384
6045	NC_014718	CGG	2	6	319940	319945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602384
6046	NC_014718	ACG	2	6	320011	320016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
6047	NC_014718	TGT	2	6	320018	320023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602385
6048	NC_014718	CAC	2	6	320088	320093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602385
6049	NC_014718	GCA	2	6	320263	320268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
6050	NC_014718	ACG	2	6	320269	320274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
6051	NC_014718	CAG	2	6	320352	320357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
6052	NC_014718	GCC	2	6	320366	320371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602385
6053	NC_014718	CGA	2	6	320399	320404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602385
6054	NC_014718	GCTGGC	2	12	320433	320444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602385
6055	NC_014718	CGC	2	6	320451	320456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602385
6056	NC_014718	CG	3	6	320469	320474	0 %	0 %	50 %	50 %	312602385
6057	NC_014718	TGC	2	6	320518	320523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602385
6058	NC_014718	CCT	2	6	320537	320542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602385
6059	NC_014718	GGC	2	6	320703	320708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602386
6060	NC_014718	CAG	2	6	320745	320750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602386
6061	NC_014718	CG	3	6	320760	320765	0 %	0 %	50 %	50 %	312602386
6062	NC_014718	TCCAT	2	10	320866	320875	20 %	40 %	0 %	40 %	312602386
6063	NC_014718	GCC	2	6	320889	320894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602386
6064	NC_014718	CGT	2	6	320912	320917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602386
6065	NC_014718	GTG	2	6	321047	321052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602386
6066	NC_014718	CGG	2	6	321168	321173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602386
6067	NC_014718	CTT	2	6	321185	321190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602386
6068	NC_014718	GTG	2	6	321393	321398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602386
6069	NC_014718	CAG	2	6	321461	321466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602386
6070	NC_014718	CGC	2	6	321475	321480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602386
6071	NC_014718	CGC	2	6	321607	321612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602386
6072	NC_014718	TTC	2	6	321782	321787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602386
6073	NC_014718	CGC	2	6	321836	321841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602386
6074	NC_014718	GCAG	2	8	321882	321889	25 %	0 %	50 %	25 %	312602386
6075	NC_014718	TCG	3	9	321909	321917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602386
6076	NC_014718	CGC	2	6	321950	321955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602386
6077	NC_014718	GCG	2	6	321966	321971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602386
6078	NC_014718	CTTC	2	8	322057	322064	0 %	50 %	0 %	50 %	312602386
6079	NC_014718	CGT	2	6	322132	322137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602387
6080	NC_014718	ACC	2	6	322154	322159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602387
6081	NC_014718	TCGTT	2	10	322180	322189	0 %	60 %	20 %	20 %	312602387
6082	NC_014718	GAT	2	6	322244	322249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602387
6083	NC_014718	ATCG	2	8	322284	322291	25 %	25 %	25 %	25 %	312602387
6084	NC_014718	AGG	2	6	322345	322350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602387
6085	NC_014718	GCG	2	6	322358	322363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602387
6086	NC_014718	GC	3	6	322388	322393	0 %	0 %	50 %	50 %	312602388
6087	NC_014718	GC	3	6	322423	322428	0 %	0 %	50 %	50 %	312602388
6088	NC_014718	ATC	2	6	322449	322454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602388
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6090	NC_014718	GTG	2	6	322490	322495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602388
6091	NC_014718	AGC	2	6	322512	322517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602388
6092	NC_014718	CTA	2	6	322693	322698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602389
6093	NC_014718	GATGG	2	10	322701	322710	20 %	20 %	60 %	0 %	312602389
6094	NC_014718	GGC	2	6	322714	322719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602389
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6096	NC_014718	GC	3	6	322832	322837	0 %	0 %	50 %	50 %	312602389
6097	NC_014718	GCA	2	6	322878	322883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602389
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6099	NC_014718	GACG	2	8	322945	322952	25 %	0 %	50 %	25 %	312602389
6100	NC_014718	CCG	2	6	322963	322968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602389
6101	NC_014718	CGG	2	6	322977	322982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602389
6102	NC_014718	ATC	2	6	323014	323019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602389
6103	NC_014718	GTG	2	6	323055	323060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602389
6104	NC_014718	CGG	2	6	323061	323066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602389
6105	NC_014718	CACG	2	8	323505	323512	25 %	0 %	25 %	50 %	312602390
6106	NC_014718	CGC	2	6	323538	323543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602390
6107	NC_014718	AC	3	6	323601	323606	50 %	0 %	0 %	50 %	312602390
6108	NC_014718	ACC	2	6	323626	323631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602390
6109	NC_014718	CCG	2	6	323672	323677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602390
6110	NC_014718	TCGAAA	2	12	323702	323713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312602390
6111	NC_014718	ATCCGT	2	12	323734	323745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312602390
6112	NC_014718	CGT	2	6	323752	323757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602390
6113	NC_014718	AAG	2	6	323776	323781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602390
6114	NC_014718	GAGCAG	2	12	323824	323835	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312602390
6115	NC_014718	TGA	2	6	323896	323901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602391
6116	NC_014718	GAA	2	6	323913	323918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602391
6117	NC_014718	CGT	2	6	323996	324001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602391
6118	NC_014718	CGAAC	2	10	324010	324019	40 %	0 %	20 %	40 %	312602391
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6120	NC_014718	GCA	2	6	324084	324089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602391
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6239	NC_014718	ATG	2	6	331179	331184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602406
6240	NC_014718	TGC	2	6	331192	331197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602406
6241	NC_014718	TTAT	2	8	331272	331279	25 %	75 %	0 %	0 %	312602406
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6366	NC_014718	TGAC	2	8	339148	339155	25 %	25 %	25 %	25 %	312602421
6367	NC_014718	TTGG	2	8	339170	339177	0 %	50 %	50 %	0 %	312602421
6368	NC_014718	TACG	2	8	339225	339232	25 %	25 %	25 %	25 %	312602421
6369	NC_014718	CTG	2	6	339241	339246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602421
6370	NC_014718	CTG	2	6	339287	339292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602421
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6373	NC_014718	GCA	2	6	339393	339398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602421
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6379	NC_014718	GTC	2	6	339747	339752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602422
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6382	NC_014718	CG	3	6	339881	339886	0 %	0 %	50 %	50 %	312602423
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6394	NC_014718	A	6	6	340750	340755	100 %	0 %	0 %	0 %	312602425
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6402	NC_014718	TCGGG	2	10	341828	341837	0 %	20 %	60 %	20 %	312602427
6403	NC_014718	TTG	2	6	341928	341933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602427
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6440	NC_014718	TGC	2	6	343841	343846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602429
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6475	NC_014718	TGC	2	6	346522	346527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602432
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6485	NC_014718	CGT	2	6	347224	347229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602433
6486	NC_014718	GTC	2	6	347248	347253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602433
6487	NC_014718	GCG	2	6	347349	347354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602433
6488	NC_014718	GCCA	2	8	347388	347395	25 %	0 %	25 %	50 %	312602433
6489	NC_014718	CTGG	2	8	347432	347439	0 %	25 %	50 %	25 %	312602433
6490	NC_014718	GCT	2	6	347474	347479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602433
6491	NC_014718	CG	3	6	347515	347520	0 %	0 %	50 %	50 %	312602433
6492	NC_014718	TCG	2	6	347557	347562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602433
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6499	NC_014718	CAAT	2	8	347713	347720	50 %	25 %	0 %	25 %	312602434
6500	NC_014718	TCG	2	6	347733	347738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602434

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