MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014718	GGC	2	6	289291	289296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5502	NC_014718	GC	3	6	289431	289436	0 %	0 %	50 %	50 %	312602351
5503	NC_014718	CGG	2	6	289447	289452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5504	NC_014718	CGG	2	6	289465	289470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5505	NC_014718	TGA	2	6	289550	289555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602351
5506	NC_014718	ACC	2	6	289596	289601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602351
5507	NC_014718	GTCGG	2	10	289682	289691	0 %	20 %	60 %	20 %	312602351
5508	NC_014718	GCC	2	6	289764	289769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602351
5509	NC_014718	CTACGA	2	12	289814	289825	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312602351
5510	NC_014718	GCT	2	6	289841	289846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5511	NC_014718	CGC	2	6	289860	289865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602351
5512	NC_014718	GA	3	6	290035	290040	50 %	0 %	50 %	0 %	312602351
5513	NC_014718	GCC	2	6	290053	290058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602351
5514	NC_014718	CGATC	2	10	290087	290096	20 %	20 %	20 %	40 %	312602351
5515	NC_014718	G	7	7	290134	290140	0 %	0 %	100 %	0 %	312602351
5516	NC_014718	T	7	7	290279	290285	0 %	100 %	0 %	0 %	312602351
5517	NC_014718	TTGCAG	2	12	290304	290315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312602351
5518	NC_014718	GAGC	2	8	290336	290343	25 %	0 %	50 %	25 %	312602351
5519	NC_014718	TCG	2	6	290368	290373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5520	NC_014718	GCA	2	6	290464	290469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5521	NC_014718	ACG	2	6	290517	290522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5522	NC_014718	CG	3	6	290521	290526	0 %	0 %	50 %	50 %	312602351
5523	NC_014718	GAC	2	6	290529	290534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5524	NC_014718	GAA	2	6	290541	290546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602351
5525	NC_014718	CCG	2	6	290563	290568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602351
5526	NC_014718	CG	3	6	290704	290709	0 %	0 %	50 %	50 %	312602351
5527	NC_014718	TAC	2	6	290715	290720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602351
5528	NC_014718	CGG	2	6	290726	290731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5529	NC_014718	GGC	2	6	290745	290750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5530	NC_014718	TAC	2	6	290820	290825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602351
5531	NC_014718	ATG	2	6	290907	290912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602351
5532	NC_014718	A	6	6	290990	290995	100 %	0 %	0 %	0 %	312602351
5533	NC_014718	GCG	2	6	291036	291041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5534	NC_014718	GGT	2	6	291068	291073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602351
5535	NC_014718	GCG	2	6	291087	291092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5536	NC_014718	GGGGC	2	10	291259	291268	0 %	0 %	80 %	20 %	312602351
5537	NC_014718	GCC	2	6	291270	291275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602351
5538	NC_014718	GCG	2	6	291294	291299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5539	NC_014718	CGGCG	2	10	291305	291314	0 %	0 %	60 %	40 %	312602351
5540	NC_014718	GTC	2	6	291321	291326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5541	NC_014718	GGC	2	6	291377	291382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5542	NC_014718	G	6	6	291437	291442	0 %	0 %	100 %	0 %	312602351
5543	NC_014718	AGCG	2	8	291587	291594	25 %	0 %	50 %	25 %	312602351
5544	NC_014718	GGC	2	6	291612	291617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5545	NC_014718	GGT	2	6	291708	291713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602351
5546	NC_014718	GGC	2	6	291764	291769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5547	NC_014718	GGA	2	6	291912	291917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602351
5548	NC_014718	GGC	2	6	291989	291994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5549	NC_014718	CGC	2	6	292076	292081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602351
5550	NC_014718	G	6	6	292104	292109	0 %	0 %	100 %	0 %	312602351
5551	NC_014718	GCG	2	6	292148	292153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
5552	NC_014718	AATC	2	8	292169	292176	50 %	25 %	0 %	25 %	312602351
5553	NC_014718	CGA	2	6	292180	292185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5554	NC_014718	TTGG	2	8	292190	292197	0 %	50 %	50 %	0 %	312602351
5555	NC_014718	CG	3	6	292762	292767	0 %	0 %	50 %	50 %	312602352
5556	NC_014718	CGC	2	6	292856	292861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602352
5557	NC_014718	CGC	2	6	292883	292888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602352
5558	NC_014718	GTTG	2	8	293046	293053	0 %	50 %	50 %	0 %	312602352
5559	NC_014718	ATTC	2	8	293069	293076	25 %	50 %	0 %	25 %	312602352
5560	NC_014718	GCC	2	6	293136	293141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602352
5561	NC_014718	CGGTCG	2	12	293213	293224	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602352
5562	NC_014718	TCA	2	6	293294	293299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602352
5563	NC_014718	GCG	2	6	293308	293313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602352
5564	NC_014718	CG	3	6	293312	293317	0 %	0 %	50 %	50 %	312602352
5565	NC_014718	TCG	2	6	293344	293349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602352
5566	NC_014718	GCC	2	6	293497	293502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602352
5567	NC_014718	CGG	2	6	293517	293522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602352
5568	NC_014718	CG	3	6	293644	293649	0 %	0 %	50 %	50 %	312602352
5569	NC_014718	CAC	2	6	293773	293778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602353
5570	NC_014718	TGG	2	6	293837	293842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602353
5571	NC_014718	GAT	2	6	293887	293892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602353
5572	NC_014718	CGT	2	6	293896	293901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602353
5573	NC_014718	CCGC	2	8	293903	293910	0 %	0 %	25 %	75 %	312602353
5574	NC_014718	GCC	2	6	293918	293923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602353
5575	NC_014718	TCA	2	6	293939	293944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602353
5576	NC_014718	GT	3	6	293981	293986	0 %	50 %	50 %	0 %	312602353
5577	NC_014718	GCC	2	6	293995	294000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602353
5578	NC_014718	TGC	2	6	294093	294098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602353
5579	NC_014718	GCC	2	6	294148	294153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602353
5580	NC_014718	CG	3	6	294322	294327	0 %	0 %	50 %	50 %	312602354
5581	NC_014718	CGGC	2	8	294363	294370	0 %	0 %	50 %	50 %	312602354
5582	NC_014718	AC	3	6	294407	294412	50 %	0 %	0 %	50 %	312602354
5583	NC_014718	ATGC	2	8	294413	294420	25 %	25 %	25 %	25 %	312602354
5584	NC_014718	GCCG	2	8	294466	294473	0 %	0 %	50 %	50 %	312602354
5585	NC_014718	GC	3	6	294618	294623	0 %	0 %	50 %	50 %	312602354
5586	NC_014718	CATC	2	8	294658	294665	25 %	25 %	0 %	50 %	312602354
5587	NC_014718	GCT	2	6	294720	294725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602354
5588	NC_014718	CG	4	8	294832	294839	0 %	0 %	50 %	50 %	312602354
5589	NC_014718	CCA	2	6	294847	294852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602354
5590	NC_014718	GCC	2	6	294890	294895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602354
5591	NC_014718	GTGC	2	8	294896	294903	0 %	25 %	50 %	25 %	312602354
5592	NC_014718	CGA	2	6	294952	294957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602354
5593	NC_014718	CAC	2	6	294994	294999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602354
5594	NC_014718	CAGG	2	8	295058	295065	25 %	0 %	50 %	25 %	312602354
5595	NC_014718	CGCT	2	8	295146	295153	0 %	25 %	25 %	50 %	312602354
5596	NC_014718	CAT	2	6	295253	295258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602354
5597	NC_014718	CGGT	2	8	295332	295339	0 %	25 %	50 %	25 %	312602354
5598	NC_014718	CGC	2	6	295453	295458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602354
5599	NC_014718	GCG	2	6	295507	295512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602354
5600	NC_014718	GCCA	2	8	295518	295525	25 %	0 %	25 %	50 %	312602354
5601	NC_014718	GCGAT	2	10	295537	295546	20 %	20 %	40 %	20 %	312602354
5602	NC_014718	GCC	2	6	295652	295657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602355
5603	NC_014718	CAGC	2	8	295698	295705	25 %	0 %	25 %	50 %	312602355
5604	NC_014718	TGGT	2	8	295748	295755	0 %	50 %	50 %	0 %	312602355
5605	NC_014718	CCG	2	6	295763	295768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602355
5606	NC_014718	ACG	2	6	295808	295813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602355
5607	NC_014718	GCC	2	6	295819	295824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602355
5608	NC_014718	CAGT	2	8	295830	295837	25 %	25 %	25 %	25 %	312602355
5609	NC_014718	TCCG	2	8	295852	295859	0 %	25 %	25 %	50 %	312602355
5610	NC_014718	CGA	2	6	295926	295931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602355
5611	NC_014718	CGA	2	6	296016	296021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602355
5612	NC_014718	GCA	2	6	296046	296051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602355
5613	NC_014718	GC	3	6	296065	296070	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
5614	NC_014718	TGC	2	6	296135	296140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602355
5615	NC_014718	GC	3	6	296139	296144	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
5616	NC_014718	CGG	2	6	296163	296168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602355
5617	NC_014718	GCC	3	9	296185	296193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602355
5618	NC_014718	GCCG	2	8	296208	296215	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
5619	NC_014718	GC	3	6	296358	296363	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
5620	NC_014718	CG	3	6	296369	296374	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
5621	NC_014718	GC	3	6	296405	296410	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
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5623	NC_014718	GTC	2	6	296461	296466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602355
5624	NC_014718	GCC	2	6	296503	296508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602355
5625	NC_014718	GC	3	6	296565	296570	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
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5631	NC_014718	TTG	2	6	296729	296734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602355
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5743	NC_014718	GC	3	6	303491	303496	0 %	0 %	50 %	50 %	312602366
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5857	NC_014718	AAAGC	2	10	311188	311197	60 %	0 %	20 %	20 %	312602378
5858	NC_014718	GCA	2	6	311199	311204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602378
5859	NC_014718	GGCC	2	8	311296	311303	0 %	0 %	50 %	50 %	312602378
5860	NC_014718	ATCT	2	8	311320	311327	25 %	50 %	0 %	25 %	312602378
5861	NC_014718	TGG	2	6	311382	311387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
5862	NC_014718	GT	3	6	311443	311448	0 %	50 %	50 %	0 %	312602378
5863	NC_014718	CGTT	2	8	311453	311460	0 %	50 %	25 %	25 %	312602378
5864	NC_014718	TGG	2	6	311681	311686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602378
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5988	NC_014718	CGGGC	2	10	317070	317079	0 %	0 %	60 %	40 %	312602379
5989	NC_014718	AGC	2	6	317139	317144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602379
5990	NC_014718	GGT	2	6	317254	317259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602379
5991	NC_014718	GTT	2	6	317263	317268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602379
5992	NC_014718	CGA	2	6	317296	317301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602379
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