MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014718	CAC	2	6	262449	262454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602340
5002	NC_014718	CGC	2	6	262559	262564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602340
5003	NC_014718	TCCG	2	8	262612	262619	0 %	25 %	25 %	50 %	312602340
5004	NC_014718	CGG	2	6	262625	262630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602340
5005	NC_014718	CAG	2	6	262674	262679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5006	NC_014718	CGA	2	6	262724	262729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5007	NC_014718	CG	3	6	262733	262738	0 %	0 %	50 %	50 %	312602340
5008	NC_014718	GC	3	6	262760	262765	0 %	0 %	50 %	50 %	312602340
5009	NC_014718	AC	3	6	262787	262792	50 %	0 %	0 %	50 %	312602340
5010	NC_014718	GTT	2	6	262895	262900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602340
5011	NC_014718	CTGGA	2	10	262965	262974	20 %	20 %	40 %	20 %	312602340
5012	NC_014718	GCA	2	6	263138	263143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5013	NC_014718	TGC	2	6	263149	263154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5014	NC_014718	CGCT	2	8	263251	263258	0 %	25 %	25 %	50 %	312602340
5015	NC_014718	TCAG	2	8	263287	263294	25 %	25 %	25 %	25 %	312602340
5016	NC_014718	GAC	2	6	263342	263347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5017	NC_014718	GCT	2	6	263411	263416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5018	NC_014718	GC	3	6	263430	263435	0 %	0 %	50 %	50 %	312602340
5019	NC_014718	CG	3	6	263530	263535	0 %	0 %	50 %	50 %	312602340
5020	NC_014718	ATT	2	6	263657	263662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602340
5021	NC_014718	GCT	2	6	263705	263710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5022	NC_014718	GAC	2	6	263747	263752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5023	NC_014718	AAC	2	6	263761	263766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602340
5024	NC_014718	GAT	2	6	263774	263779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602340
5025	NC_014718	CTG	2	6	263794	263799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5026	NC_014718	TCG	2	6	263855	263860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5027	NC_014718	CGC	2	6	263926	263931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602341
5028	NC_014718	CGG	2	6	263969	263974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602341
5029	NC_014718	TGC	2	6	264020	264025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5030	NC_014718	CAG	2	6	264078	264083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5031	NC_014718	GGA	2	6	264135	264140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602341
5032	NC_014718	T	6	6	264168	264173	0 %	100 %	0 %	0 %	312602341
5033	NC_014718	ACA	2	6	264374	264379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602341
5034	NC_014718	AT	3	6	264396	264401	50 %	50 %	0 %	0 %	312602341
5035	NC_014718	T	6	6	264436	264441	0 %	100 %	0 %	0 %	312602341
5036	NC_014718	GGA	2	6	264504	264509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602341
5037	NC_014718	CCAATC	2	12	264520	264531	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	312602341
5038	NC_014718	TGA	2	6	264651	264656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602341
5039	NC_014718	ATA	2	6	264692	264697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602341
5040	NC_014718	A	6	6	264719	264724	100 %	0 %	0 %	0 %	312602341
5041	NC_014718	GA	3	6	264751	264756	50 %	0 %	50 %	0 %	312602341
5042	NC_014718	ATT	2	6	264836	264841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602341
5043	NC_014718	TGA	2	6	264897	264902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602341
5044	NC_014718	ATT	2	6	264913	264918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602341
5045	NC_014718	TA	3	6	264943	264948	50 %	50 %	0 %	0 %	312602341
5046	NC_014718	TAA	2	6	264954	264959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602341
5047	NC_014718	A	6	6	264972	264977	100 %	0 %	0 %	0 %	312602341
5048	NC_014718	ATT	2	6	265019	265024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602341
5049	NC_014718	TAC	2	6	265113	265118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602341
5050	NC_014718	GAA	2	6	265150	265155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602341
5051	NC_014718	AAT	2	6	265174	265179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602341
5052	NC_014718	TGA	2	6	265200	265205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602341
5053	NC_014718	ATG	2	6	265211	265216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602341
5054	NC_014718	TTTC	2	8	265299	265306	0 %	75 %	0 %	25 %	312602341
5055	NC_014718	AAC	2	6	265343	265348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602341
5056	NC_014718	CAG	2	6	265389	265394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5057	NC_014718	ACA	2	6	265433	265438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602341
5058	NC_014718	TGC	2	6	265460	265465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5059	NC_014718	ACC	2	6	265507	265512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602341
5060	NC_014718	TTG	2	6	265582	265587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602341
5061	NC_014718	TAT	2	6	265651	265656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602341
5062	NC_014718	GCA	2	6	265665	265670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5063	NC_014718	GC	3	6	265778	265783	0 %	0 %	50 %	50 %	312602341
5064	NC_014718	GTTG	2	8	265796	265803	0 %	50 %	50 %	0 %	312602341
5065	NC_014718	GCC	2	6	265845	265850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602341
5066	NC_014718	CAG	2	6	265990	265995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5067	NC_014718	CGA	2	6	266004	266009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5068	NC_014718	AGC	2	6	266014	266019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5069	NC_014718	TGA	2	6	266024	266029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602341
5070	NC_014718	CG	4	8	266077	266084	0 %	0 %	50 %	50 %	312602341
5071	NC_014718	GCA	2	6	266114	266119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5072	NC_014718	A	6	6	266153	266158	100 %	0 %	0 %	0 %	312602341
5073	NC_014718	GTT	2	6	266163	266168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602341
5074	NC_014718	GCA	3	9	266178	266186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5075	NC_014718	ACA	2	6	266199	266204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602341
5076	NC_014718	CAG	2	6	266215	266220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5077	NC_014718	GCA	2	6	266238	266243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5078	NC_014718	GC	3	6	266252	266257	0 %	0 %	50 %	50 %	312602341
5079	NC_014718	AGCC	2	8	266262	266269	25 %	0 %	25 %	50 %	312602341
5080	NC_014718	TTGA	2	8	266308	266315	25 %	50 %	25 %	0 %	312602341
5081	NC_014718	CGG	2	6	266330	266335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602341
5082	NC_014718	GCA	2	6	266357	266362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5083	NC_014718	GAC	2	6	266370	266375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5084	NC_014718	CAGC	2	8	266549	266556	25 %	0 %	25 %	50 %	312602341
5085	NC_014718	GCC	2	6	266564	266569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602341
5086	NC_014718	AAG	2	6	266570	266575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602341
5087	NC_014718	TA	3	6	266753	266758	50 %	50 %	0 %	0 %	312602341
5088	NC_014718	CTGG	2	8	266760	266767	0 %	25 %	50 %	25 %	312602341
5089	NC_014718	TAT	2	6	266788	266793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602341
5090	NC_014718	ACG	2	6	266801	266806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5091	NC_014718	GT	3	6	266876	266881	0 %	50 %	50 %	0 %	312602341
5092	NC_014718	GGCG	2	8	266922	266929	0 %	0 %	75 %	25 %	312602341
5093	NC_014718	TGGC	2	8	266968	266975	0 %	25 %	50 %	25 %	312602341
5094	NC_014718	GCG	2	6	267095	267100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602341
5095	NC_014718	ACA	2	6	267119	267124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602341
5096	NC_014718	GT	3	6	267149	267154	0 %	50 %	50 %	0 %	312602341
5097	NC_014718	ACA	2	6	267173	267178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602341
5098	NC_014718	GCT	2	6	267228	267233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602341
5099	NC_014718	TGG	2	6	267437	267442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602341
5100	NC_014718	ATC	2	6	267457	267462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602341
5101	NC_014718	TACAT	2	10	267470	267479	40 %	40 %	0 %	20 %	312602341
5102	NC_014718	ATA	2	6	267492	267497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602341
5103	NC_014718	CG	3	6	267757	267762	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5104	NC_014718	GGC	3	9	267795	267803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602342
5105	NC_014718	CGG	2	6	267836	267841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602342
5106	NC_014718	CGT	2	6	267856	267861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5107	NC_014718	GGT	2	6	267891	267896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602342
5108	NC_014718	CAG	2	6	267923	267928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5109	NC_014718	TACGGA	2	12	268016	268027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312602342
5110	NC_014718	TCACG	2	10	268106	268115	20 %	20 %	20 %	40 %	312602342
5111	NC_014718	AGT	2	6	268137	268142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602342
5112	NC_014718	GAC	2	6	268173	268178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5113	NC_014718	GCC	2	6	268206	268211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602342
5114	NC_014718	GCA	2	6	268220	268225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5115	NC_014718	GGC	2	6	268244	268249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602342
5116	NC_014718	GC	3	6	268248	268253	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5117	NC_014718	CGC	2	6	268312	268317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602342
5118	NC_014718	GCG	2	6	268400	268405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602342
5119	NC_014718	CG	3	6	268404	268409	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5120	NC_014718	TGA	2	6	268468	268473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602342
5121	NC_014718	CG	3	6	268572	268577	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5122	NC_014718	GC	4	8	268582	268589	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5123	NC_014718	GGCT	2	8	268613	268620	0 %	25 %	50 %	25 %	312602342
5124	NC_014718	ACGC	2	8	268628	268635	25 %	0 %	25 %	50 %	312602342
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5231	NC_014718	ATG	2	6	274037	274042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602343
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5234	NC_014718	TAAT	2	8	274208	274215	50 %	50 %	0 %	0 %	312602343
5235	NC_014718	GAAA	2	8	274225	274232	75 %	0 %	25 %	0 %	312602343
5236	NC_014718	AT	3	6	274244	274249	50 %	50 %	0 %	0 %	312602343
5237	NC_014718	CTA	2	6	274376	274381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602343
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5240	NC_014718	A	6	6	274473	274478	100 %	0 %	0 %	0 %	312602343
5241	NC_014718	CGA	2	6	274502	274507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602343
5242	NC_014718	GCT	2	6	274543	274548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602343
5243	NC_014718	AGA	2	6	274560	274565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602343
5244	NC_014718	GCA	2	6	274633	274638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602343
5245	NC_014718	TGG	2	6	274698	274703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602343
5246	NC_014718	AAG	2	6	274751	274756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602343
5247	NC_014718	G	6	6	274820	274825	0 %	0 %	100 %	0 %	312602343
5248	NC_014718	AGG	2	6	274854	274859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602343
5249	NC_014718	GC	4	8	275174	275181	0 %	0 %	50 %	50 %	312602344
5250	NC_014718	GGCG	2	8	275246	275253	0 %	0 %	75 %	25 %	312602344
5251	NC_014718	GCT	3	9	275266	275274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602344
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5254	NC_014718	GGC	2	6	275388	275393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602345
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5257	NC_014718	GAA	2	6	275650	275655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602346
5258	NC_014718	GCA	2	6	276109	276114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602347
5259	NC_014718	CGTTT	2	10	276120	276129	0 %	60 %	20 %	20 %	312602347
5260	NC_014718	GCG	2	6	276136	276141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602347
5261	NC_014718	GCA	2	6	276157	276162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602347
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5265	NC_014718	CCAT	2	8	276345	276352	25 %	25 %	0 %	50 %	312602347
5266	NC_014718	CGC	2	6	276365	276370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602347
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5269	NC_014718	CAG	2	6	276605	276610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602347
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5274	NC_014718	TGC	2	6	276913	276918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602347
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5278	NC_014718	GC	3	6	277099	277104	0 %	0 %	50 %	50 %	312602347
5279	NC_014718	T	7	7	277108	277114	0 %	100 %	0 %	0 %	312602347
5280	NC_014718	GCA	2	6	277123	277128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602347
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5282	NC_014718	TAC	2	6	277207	277212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602347
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5340	NC_014718	A	7	7	280696	280702	100 %	0 %	0 %	0 %	312602348
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5346	NC_014718	ACA	2	6	281013	281018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602348
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5350	NC_014718	T	7	7	281246	281252	0 %	100 %	0 %	0 %	312602348
5351	NC_014718	A	6	6	281385	281390	100 %	0 %	0 %	0 %	312602348
5352	NC_014718	GTG	2	6	281393	281398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602348
5353	NC_014718	GCAA	2	8	281399	281406	50 %	0 %	25 %	25 %	312602348
5354	NC_014718	TGC	2	6	281427	281432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602348
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5359	NC_014718	AGTTG	2	10	281581	281590	20 %	40 %	40 %	0 %	312602348
5360	NC_014718	AC	3	6	281601	281606	50 %	0 %	0 %	50 %	312602348
5361	NC_014718	TTA	2	6	281664	281669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602348
5362	NC_014718	ACG	2	6	281729	281734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602348
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5366	NC_014718	CCCG	2	8	282040	282047	0 %	0 %	25 %	75 %	312602348
5367	NC_014718	TATC	2	8	282163	282170	25 %	50 %	0 %	25 %	312602348
5368	NC_014718	CG	4	8	282259	282266	0 %	0 %	50 %	50 %	312602348
5369	NC_014718	TGGC	2	8	282410	282417	0 %	25 %	50 %	25 %	312602348
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5371	NC_014718	GCCA	2	8	282659	282666	25 %	0 %	25 %	50 %	312602348
5372	NC_014718	GCT	2	6	282694	282699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602348
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5481	NC_014718	GCG	2	6	288370	288375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
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5485	NC_014718	CTG	2	6	288577	288582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
5486	NC_014718	TCG	3	9	288592	288600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
5487	NC_014718	CAC	2	6	288640	288645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602350
5488	NC_014718	ACA	2	6	288676	288681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602350
5489	NC_014718	ATGA	2	8	288717	288724	50 %	25 %	25 %	0 %	312602350
5490	NC_014718	ACC	2	6	288774	288779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602350
5491	NC_014718	TAC	2	6	288780	288785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602350
5492	NC_014718	CGT	2	6	288809	288814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
5493	NC_014718	GTC	2	6	288861	288866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
5494	NC_014718	CGGC	2	8	288886	288893	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
5495	NC_014718	AGC	2	6	289038	289043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5496	NC_014718	GCA	2	6	289076	289081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5497	NC_014718	GCA	3	9	289133	289141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
5498	NC_014718	TGCGT	2	10	289165	289174	0 %	40 %	40 %	20 %	312602351
5499	NC_014718	CG	3	6	289191	289196	0 %	0 %	50 %	50 %	312602351
5500	NC_014718	CGT	2	6	289200	289205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602351

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