MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 15482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014718	GACC	2	8	233008	233015	25 %	0 %	25 %	50 %	312602321
4502	NC_014718	CTG	2	6	233155	233160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4503	NC_014718	CAC	2	6	233165	233170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602321
4504	NC_014718	GTT	2	6	233204	233209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602321
4505	NC_014718	CGT	2	6	233213	233218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4506	NC_014718	TGA	2	6	233371	233376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602321
4507	NC_014718	CGA	2	6	233485	233490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4508	NC_014718	TCA	2	6	233491	233496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602321
4509	NC_014718	GCA	2	6	233521	233526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4510	NC_014718	GCC	2	6	233550	233555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602321
4511	NC_014718	GCC	2	6	233571	233576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602321
4512	NC_014718	CGCGAT	2	12	233645	233656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4513	NC_014718	CAG	2	6	233735	233740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4514	NC_014718	CAA	2	6	233744	233749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602321
4515	NC_014718	GCA	2	6	233785	233790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4516	NC_014718	ATA	2	6	233795	233800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602321
4517	NC_014718	GTC	2	6	233837	233842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4518	NC_014718	GC	3	6	233869	233874	0 %	0 %	50 %	50 %	312602321
4519	NC_014718	ACA	2	6	233880	233885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602321
4520	NC_014718	ACG	2	6	233892	233897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4521	NC_014718	GCG	2	6	233901	233906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602321
4522	NC_014718	AGC	2	6	233907	233912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4523	NC_014718	GCCA	2	8	234030	234037	25 %	0 %	25 %	50 %	312602321
4524	NC_014718	GATCGC	2	12	234116	234127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4525	NC_014718	ATG	2	6	234132	234137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602321
4526	NC_014718	CCT	2	6	234178	234183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602321
4527	NC_014718	GCCG	2	8	234196	234203	0 %	0 %	50 %	50 %	312602321
4528	NC_014718	CCG	2	6	234222	234227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602321
4529	NC_014718	CGA	2	6	234235	234240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4530	NC_014718	ACG	2	6	234271	234276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4531	NC_014718	AGA	2	6	234328	234333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602321
4532	NC_014718	CGCT	2	8	234394	234401	0 %	25 %	25 %	50 %	312602321
4533	NC_014718	CAG	2	6	234431	234436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4534	NC_014718	CA	3	6	234445	234450	50 %	0 %	0 %	50 %	312602321
4535	NC_014718	GC	4	8	234496	234503	0 %	0 %	50 %	50 %	312602321
4536	NC_014718	GC	3	6	234559	234564	0 %	0 %	50 %	50 %	312602321
4537	NC_014718	GCCGG	2	10	234572	234581	0 %	0 %	60 %	40 %	312602321
4538	NC_014718	ATG	2	6	234626	234631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602321
4539	NC_014718	CCGT	2	8	234661	234668	0 %	25 %	25 %	50 %	312602321
4540	NC_014718	AGT	2	6	234714	234719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602321
4541	NC_014718	CAG	2	6	234722	234727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4542	NC_014718	TGCC	2	8	234741	234748	0 %	25 %	25 %	50 %	312602321
4543	NC_014718	CCA	2	6	234773	234778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602321
4544	NC_014718	ACGG	2	8	234786	234793	25 %	0 %	50 %	25 %	312602321
4545	NC_014718	GGC	2	6	234929	234934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602321
4546	NC_014718	CGG	2	6	234935	234940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602321
4547	NC_014718	GCG	2	6	234964	234969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602321
4548	NC_014718	CGC	2	6	234995	235000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602321
4549	NC_014718	GC	3	6	235030	235035	0 %	0 %	50 %	50 %	312602321
4550	NC_014718	GCA	2	6	235143	235148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602321
4551	NC_014718	GGAGTG	2	12	235155	235166	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	312602321
4552	NC_014718	GCGCT	2	10	235168	235177	0 %	20 %	40 %	40 %	312602321
4553	NC_014718	GACA	2	8	235190	235197	50 %	0 %	25 %	25 %	312602321
4554	NC_014718	ACC	2	6	235203	235208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602321
4555	NC_014718	GGGT	2	8	235246	235253	0 %	25 %	75 %	0 %	312602321
4556	NC_014718	GCG	2	6	235261	235266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602321
4557	NC_014718	GAAA	2	8	235271	235278	75 %	0 %	25 %	0 %	312602321
4558	NC_014718	TAA	3	9	235731	235739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602322
4559	NC_014718	GC	3	6	235760	235765	0 %	0 %	50 %	50 %	312602322
4560	NC_014718	TCA	2	6	235931	235936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602322
4561	NC_014718	GCG	2	6	235984	235989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602322
4562	NC_014718	GAA	2	6	236058	236063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602322
4563	NC_014718	GC	3	6	236078	236083	0 %	0 %	50 %	50 %	312602322
4564	NC_014718	GCT	2	6	236221	236226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602322
4565	NC_014718	CCG	2	6	236276	236281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602322
4566	NC_014718	GCT	2	6	236411	236416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602322
4567	NC_014718	TAA	2	6	236418	236423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602322
4568	NC_014718	CCG	2	6	236467	236472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602322
4569	NC_014718	ATA	2	6	236476	236481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602322
4570	NC_014718	ACA	2	6	236485	236490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602322
4571	NC_014718	AATGC	2	10	236524	236533	40 %	20 %	20 %	20 %	312602322
4572	NC_014718	GCCA	2	8	236544	236551	25 %	0 %	25 %	50 %	312602322
4573	NC_014718	GCA	2	6	236554	236559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602322
4574	NC_014718	ACG	2	6	236575	236580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602322
4575	NC_014718	GCC	2	6	236683	236688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602322
4576	NC_014718	TTG	2	6	236717	236722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602322
4577	NC_014718	TGA	3	9	236731	236739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602322
4578	NC_014718	TAA	2	6	236754	236759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602322
4579	NC_014718	ACC	2	6	236778	236783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602322
4580	NC_014718	GCA	2	6	236792	236797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602322
4581	NC_014718	GCG	2	6	236848	236853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602322
4582	NC_014718	GC	3	6	236897	236902	0 %	0 %	50 %	50 %	312602322
4583	NC_014718	AAG	2	6	237009	237014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602322
4584	NC_014718	GGC	2	6	237055	237060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602322
4585	NC_014718	TGGCT	2	10	237068	237077	0 %	40 %	40 %	20 %	312602322
4586	NC_014718	AGT	2	6	237631	237636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602323
4587	NC_014718	ACA	2	6	237639	237644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602323
4588	NC_014718	GGC	2	6	237687	237692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602323
4589	NC_014718	GTC	2	6	237764	237769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602323
4590	NC_014718	AGT	2	6	237822	237827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602323
4591	NC_014718	GT	3	6	237826	237831	0 %	50 %	50 %	0 %	312602323
4592	NC_014718	CGA	2	6	237887	237892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602323
4593	NC_014718	CTATC	2	10	238027	238036	20 %	40 %	0 %	40 %	312602323
4594	NC_014718	ACA	2	6	238047	238052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602323
4595	NC_014718	GCG	2	6	238074	238079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602323
4596	NC_014718	CAC	2	6	238100	238105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602323
4597	NC_014718	TCG	2	6	238155	238160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602323
4598	NC_014718	GGC	2	6	238219	238224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602323
4599	NC_014718	CGC	2	6	238249	238254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602323
4600	NC_014718	CGA	2	6	238273	238278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602323
4601	NC_014718	TGC	2	6	238330	238335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602324
4602	NC_014718	CCG	2	6	238348	238353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602324
4603	NC_014718	TGG	2	6	238377	238382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602324
4604	NC_014718	GC	3	6	238430	238435	0 %	0 %	50 %	50 %	312602324
4605	NC_014718	GACGA	2	10	238527	238536	40 %	0 %	40 %	20 %	312602324
4606	NC_014718	AGC	2	6	238570	238575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602324
4607	NC_014718	CACG	2	8	238703	238710	25 %	0 %	25 %	50 %	312602324
4608	NC_014718	AGC	2	6	238711	238716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602324
4609	NC_014718	TCA	2	6	238726	238731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602324
4610	NC_014718	CGA	2	6	238757	238762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602324
4611	NC_014718	GCC	2	6	238770	238775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602324
4612	NC_014718	GTC	2	6	238866	238871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602324
4613	NC_014718	GCG	2	6	238879	238884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602324
4614	NC_014718	GAC	2	6	238911	238916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602324
4615	NC_014718	GCC	2	6	238981	238986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602324
4616	NC_014718	GGT	2	6	238987	238992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602324
4617	NC_014718	CGC	2	6	239010	239015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602324
4618	NC_014718	GC	3	6	239017	239022	0 %	0 %	50 %	50 %	312602324
4619	NC_014718	CAAG	2	8	239024	239031	50 %	0 %	25 %	25 %	312602324
4620	NC_014718	CCG	2	6	239132	239137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602324
4621	NC_014718	CTC	2	6	239292	239297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602324
4622	NC_014718	GCTG	2	8	239351	239358	0 %	25 %	50 %	25 %	312602324
4623	NC_014718	CGGC	2	8	239405	239412	0 %	0 %	50 %	50 %	312602324
4624	NC_014718	CGC	2	6	239417	239422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602324
4625	NC_014718	GC	3	6	239540	239545	0 %	0 %	50 %	50 %	312602324
4626	NC_014718	TTGA	2	8	239583	239590	25 %	50 %	25 %	0 %	312602324
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4629	NC_014718	CGG	2	6	239792	239797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602324
4630	NC_014718	ACG	2	6	239839	239844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602324
4631	NC_014718	ACG	2	6	239935	239940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602324
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4637	NC_014718	TGC	2	6	240254	240259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602324
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4642	NC_014718	AAG	2	6	240483	240488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602324
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4647	NC_014718	CACCGA	2	12	240749	240760	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	312602325
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4653	NC_014718	CG	3	6	241007	241012	0 %	0 %	50 %	50 %	312602325
4654	NC_014718	ATCA	2	8	241043	241050	50 %	25 %	0 %	25 %	312602325
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4661	NC_014718	GCCT	2	8	241447	241454	0 %	25 %	25 %	50 %	312602326
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4669	NC_014718	GCTTA	2	10	241947	241956	20 %	40 %	20 %	20 %	312602326
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4676	NC_014718	AAG	2	6	243323	243328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602327
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4678	NC_014718	CGA	2	6	243414	243419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602327
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4682	NC_014718	TAT	2	6	243658	243663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602327
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4685	NC_014718	CATT	2	8	243817	243824	25 %	50 %	0 %	25 %	312602327
4686	NC_014718	TGA	2	6	243834	243839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602327
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4689	NC_014718	TTA	2	6	243967	243972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602327
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4694	NC_014718	TGA	2	6	244709	244714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602328
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4700	NC_014718	GGTTT	2	10	244972	244981	0 %	60 %	40 %	0 %	312602328
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4721	NC_014718	CGCA	2	8	245927	245934	25 %	0 %	25 %	50 %	312602328
4722	NC_014718	GGTT	2	8	246019	246026	0 %	50 %	50 %	0 %	312602328
4723	NC_014718	CG	3	6	246047	246052	0 %	0 %	50 %	50 %	312602328
4724	NC_014718	GTC	2	6	246087	246092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602328
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4728	NC_014718	TCGCG	2	10	246244	246253	0 %	20 %	40 %	40 %	312602328
4729	NC_014718	GC	3	6	246321	246326	0 %	0 %	50 %	50 %	312602328
4730	NC_014718	ATGT	2	8	246333	246340	25 %	50 %	25 %	0 %	312602328
4731	NC_014718	CAA	2	6	246423	246428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602328
4732	NC_014718	A	6	6	246463	246468	100 %	0 %	0 %	0 %	312602328
4733	NC_014718	TTTGAC	2	12	246474	246485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312602328
4734	NC_014718	TTC	2	6	246501	246506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602328
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4736	NC_014718	AGC	2	6	246539	246544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602328
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4738	NC_014718	TCA	2	6	246583	246588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602328
4739	NC_014718	CAC	2	6	246602	246607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602328
4740	NC_014718	GTG	2	6	246694	246699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602328
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4742	NC_014718	TA	3	6	246757	246762	50 %	50 %	0 %	0 %	312602328
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4988	NC_014718	CAAA	2	8	261722	261729	75 %	0 %	0 %	25 %	312602340
4989	NC_014718	GCT	2	6	261836	261841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
4990	NC_014718	TGA	2	6	261844	261849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602340
4991	NC_014718	AGC	2	6	261916	261921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
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4993	NC_014718	CGA	2	6	262060	262065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
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4999	NC_014718	GATG	2	8	262322	262329	25 %	25 %	50 %	0 %	312602340
5000	NC_014718	AGTTG	2	10	262337	262346	20 %	40 %	40 %	0 %	312602340

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