MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum BBMN68 chromosome

Total Repeats: 4327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014656	CGTC	2	8	581	588	0 %	25 %	25 %	50 %	312132276
2	NC_014656	GTTC	2	8	2728	2735	0 %	50 %	25 %	25 %	312132277
3	NC_014656	CCGG	2	8	3367	3374	0 %	0 %	50 %	50 %	312132277
4	NC_014656	GCGA	2	8	3908	3915	25 %	0 %	50 %	25 %	312132278
5	NC_014656	TGAC	2	8	5239	5246	25 %	25 %	25 %	25 %	312132280
6	NC_014656	TTGT	2	8	5322	5329	0 %	75 %	25 %	0 %	312132280
7	NC_014656	AGAT	2	8	5833	5840	50 %	25 %	25 %	0 %	312132280
8	NC_014656	CATC	2	8	5843	5850	25 %	25 %	0 %	50 %	312132280
9	NC_014656	GAAA	2	8	6043	6050	75 %	0 %	25 %	0 %	312132280
10	NC_014656	TTGA	2	8	6175	6182	25 %	50 %	25 %	0 %	312132280
11	NC_014656	CGAT	2	8	6376	6383	25 %	25 %	25 %	25 %	312132280
12	NC_014656	GTAG	2	8	6392	6399	25 %	25 %	50 %	0 %	312132280
13	NC_014656	CATG	2	8	6500	6507	25 %	25 %	25 %	25 %	312132281
14	NC_014656	ACGG	2	8	7187	7194	25 %	0 %	50 %	25 %	312132282
15	NC_014656	GAAA	2	8	7290	7297	75 %	0 %	25 %	0 %	312132282
16	NC_014656	CCGG	2	8	8576	8583	0 %	0 %	50 %	50 %	312132284
17	NC_014656	GCCG	2	8	9731	9738	0 %	0 %	50 %	50 %	312132285
18	NC_014656	CGCC	2	8	10197	10204	0 %	0 %	25 %	75 %	312132285
19	NC_014656	ACGG	2	8	10239	10246	25 %	0 %	50 %	25 %	312132285
20	NC_014656	CGAC	2	8	11550	11557	25 %	0 %	25 %	50 %	312132287
21	NC_014656	CACC	2	8	11565	11572	25 %	0 %	0 %	75 %	312132287
22	NC_014656	GAAC	2	8	13230	13237	50 %	0 %	25 %	25 %	312132289
23	NC_014656	CCTG	2	8	14884	14891	0 %	25 %	25 %	50 %	312132291
24	NC_014656	ACTG	2	8	16426	16433	25 %	25 %	25 %	25 %	312132291
25	NC_014656	CGCA	2	8	16701	16708	25 %	0 %	25 %	50 %	312132292
26	NC_014656	GGCC	2	8	16885	16892	0 %	0 %	50 %	50 %	312132292
27	NC_014656	GTCC	2	8	17036	17043	0 %	25 %	25 %	50 %	312132292
28	NC_014656	CGCC	2	8	17299	17306	0 %	0 %	25 %	75 %	312132292
29	NC_014656	ACGC	2	8	17776	17783	25 %	0 %	25 %	50 %	312132293
30	NC_014656	GCCG	2	8	17791	17798	0 %	0 %	50 %	50 %	312132293
31	NC_014656	CGGC	2	8	18784	18791	0 %	0 %	50 %	50 %	312132294
32	NC_014656	GGTC	2	8	18877	18884	0 %	25 %	50 %	25 %	312132294
33	NC_014656	CGCA	2	8	18938	18945	25 %	0 %	25 %	50 %	312132294
34	NC_014656	ACGC	2	8	19067	19074	25 %	0 %	25 %	50 %	312132294
35	NC_014656	CCAG	2	8	19182	19189	25 %	0 %	25 %	50 %	312132294
36	NC_014656	CGGC	2	8	19315	19322	0 %	0 %	50 %	50 %	312132294
37	NC_014656	CATC	2	8	19919	19926	25 %	25 %	0 %	50 %	312132294
38	NC_014656	CTCC	2	8	20197	20204	0 %	25 %	0 %	75 %	312132294
39	NC_014656	CTCG	2	8	20479	20486	0 %	25 %	25 %	50 %	312132294
40	NC_014656	GTGC	2	8	20526	20533	0 %	25 %	50 %	25 %	312132294
41	NC_014656	CAGC	2	8	21369	21376	25 %	0 %	25 %	50 %	312132295
42	NC_014656	GCTC	2	8	21448	21455	0 %	25 %	25 %	50 %	312132295
43	NC_014656	AACC	2	8	21478	21485	50 %	0 %	0 %	50 %	312132295
44	NC_014656	CGAC	2	8	21617	21624	25 %	0 %	25 %	50 %	312132296
45	NC_014656	TGGG	2	8	21889	21896	0 %	25 %	75 %	0 %	312132296
46	NC_014656	CGCT	2	8	22027	22034	0 %	25 %	25 %	50 %	312132296
47	NC_014656	GCTC	2	8	22476	22483	0 %	25 %	25 %	50 %	312132297
48	NC_014656	ATCA	2	8	22810	22817	50 %	25 %	0 %	25 %	312132297
49	NC_014656	TCCG	3	12	22839	22850	0 %	25 %	25 %	50 %	312132297
50	NC_014656	GCCC	2	8	23048	23055	0 %	0 %	25 %	75 %	312132297
51	NC_014656	GATC	2	8	23445	23452	25 %	25 %	25 %	25 %	312132297
52	NC_014656	CGGC	2	8	23496	23503	0 %	0 %	50 %	50 %	312132297
53	NC_014656	ATCC	2	8	24066	24073	25 %	25 %	0 %	50 %	312132298
54	NC_014656	GCAC	2	8	24395	24402	25 %	0 %	25 %	50 %	312132298
55	NC_014656	CATC	2	8	24989	24996	25 %	25 %	0 %	50 %	312132298
56	NC_014656	TACG	2	8	25932	25939	25 %	25 %	25 %	25 %	312132299
57	NC_014656	ACCT	2	8	26043	26050	25 %	25 %	0 %	50 %	312132299
58	NC_014656	GCCG	2	8	27341	27348	0 %	0 %	50 %	50 %	312132301
59	NC_014656	CCCG	2	8	27426	27433	0 %	0 %	25 %	75 %	312132301
60	NC_014656	TCCG	2	8	27595	27602	0 %	25 %	25 %	50 %	312132301
61	NC_014656	ACGA	2	8	29459	29466	50 %	0 %	25 %	25 %	312132303
62	NC_014656	GCCG	2	8	29476	29483	0 %	0 %	50 %	50 %	312132303
63	NC_014656	TGAA	2	8	29879	29886	50 %	25 %	25 %	0 %	312132303
64	NC_014656	CAGC	2	8	30034	30041	25 %	0 %	25 %	50 %	312132303
65	NC_014656	TGAG	2	8	30540	30547	25 %	25 %	50 %	0 %	312132303
66	NC_014656	AGGA	2	8	30785	30792	50 %	0 %	50 %	0 %	312132303
67	NC_014656	GAGC	2	8	30984	30991	25 %	0 %	50 %	25 %	312132303
68	NC_014656	CGGT	2	8	31313	31320	0 %	25 %	50 %	25 %	312132303
69	NC_014656	GCTG	2	8	31544	31551	0 %	25 %	50 %	25 %	312132304
70	NC_014656	AGCG	2	8	31589	31596	25 %	0 %	50 %	25 %	312132304
71	NC_014656	TGGA	2	8	31810	31817	25 %	25 %	50 %	0 %	312132304
72	NC_014656	CGGT	2	8	33172	33179	0 %	25 %	50 %	25 %	312132305
73	NC_014656	ACGA	2	8	34209	34216	50 %	0 %	25 %	25 %	312132306
74	NC_014656	CTCC	2	8	34363	34370	0 %	25 %	0 %	75 %	312132307
75	NC_014656	TGCC	2	8	35089	35096	0 %	25 %	25 %	50 %	312132308
76	NC_014656	CCAG	2	8	35230	35237	25 %	0 %	25 %	50 %	312132308
77	NC_014656	CCGC	2	8	35538	35545	0 %	0 %	25 %	75 %	312132308
78	NC_014656	TCCT	2	8	35558	35565	0 %	50 %	0 %	50 %	312132308
79	NC_014656	GCTC	2	8	36097	36104	0 %	25 %	25 %	50 %	312132309
80	NC_014656	GGTG	2	8	36126	36133	0 %	25 %	75 %	0 %	312132309
81	NC_014656	GGAC	2	8	36288	36295	25 %	0 %	50 %	25 %	312132309
82	NC_014656	GCAA	2	8	37338	37345	50 %	0 %	25 %	25 %	312132311
83	NC_014656	CATC	2	8	37528	37535	25 %	25 %	0 %	50 %	312132311
84	NC_014656	GATC	2	8	37807	37814	25 %	25 %	25 %	25 %	312132311
85	NC_014656	ACAA	2	8	38223	38230	75 %	0 %	0 %	25 %	312132311
86	NC_014656	GATG	2	8	38680	38687	25 %	25 %	50 %	0 %	312132312
87	NC_014656	CGTG	2	8	38953	38960	0 %	25 %	50 %	25 %	312132312
88	NC_014656	CCAC	2	8	39404	39411	25 %	0 %	0 %	75 %	312132313
89	NC_014656	TGCG	2	8	39761	39768	0 %	25 %	50 %	25 %	312132313
90	NC_014656	AGTC	2	8	39944	39951	25 %	25 %	25 %	25 %	312132314
91	NC_014656	GCGT	2	8	40426	40433	0 %	25 %	50 %	25 %	312132314
92	NC_014656	GGCG	2	8	40678	40685	0 %	0 %	75 %	25 %	312132314
93	NC_014656	CATC	2	8	40738	40745	25 %	25 %	0 %	50 %	312132314
94	NC_014656	CCTT	2	8	40804	40811	0 %	50 %	0 %	50 %	312132314
95	NC_014656	AGGC	2	8	40817	40824	25 %	0 %	50 %	25 %	312132314
96	NC_014656	GCCT	2	8	41986	41993	0 %	25 %	25 %	50 %	312132316
97	NC_014656	TGCT	2	8	44464	44471	0 %	50 %	25 %	25 %	312132319
98	NC_014656	GCTG	2	8	45293	45300	0 %	25 %	50 %	25 %	312132319
99	NC_014656	CCTG	2	8	45602	45609	0 %	25 %	25 %	50 %	312132319
100	NC_014656	GACC	2	8	45668	45675	25 %	0 %	25 %	50 %	312132319
101	NC_014656	AGCG	2	8	45973	45980	25 %	0 %	50 %	25 %	312132320
102	NC_014656	TGGA	2	8	45982	45989	25 %	25 %	50 %	0 %	312132320
103	NC_014656	GCCT	2	8	46117	46124	0 %	25 %	25 %	50 %	312132320
104	NC_014656	CCTA	2	8	48306	48313	25 %	25 %	0 %	50 %	312132323
105	NC_014656	TTCC	2	8	48766	48773	0 %	50 %	0 %	50 %	312132323
106	NC_014656	GCCA	2	8	48897	48904	25 %	0 %	25 %	50 %	312132323
107	NC_014656	CCAG	2	8	49021	49028	25 %	0 %	25 %	50 %	312132323
108	NC_014656	GCCG	2	8	49373	49380	0 %	0 %	50 %	50 %	312132323
109	NC_014656	GCTC	2	8	49397	49404	0 %	25 %	25 %	50 %	312132323
110	NC_014656	CCCG	2	8	50119	50126	0 %	0 %	25 %	75 %	312132324
111	NC_014656	CGGC	2	8	50179	50186	0 %	0 %	50 %	50 %	312132324
112	NC_014656	TGGC	2	8	51702	51709	0 %	25 %	50 %	25 %	312132326
113	NC_014656	GACC	2	8	51835	51842	25 %	0 %	25 %	50 %	312132326
114	NC_014656	ACCA	2	8	51992	51999	50 %	0 %	0 %	50 %	312132326
115	NC_014656	AGCG	2	8	52203	52210	25 %	0 %	50 %	25 %	312132326
116	NC_014656	ACCG	2	8	52724	52731	25 %	0 %	25 %	50 %	312132327
117	NC_014656	GAAG	2	8	54109	54116	50 %	0 %	50 %	0 %	312132327
118	NC_014656	CGGC	2	8	55550	55557	0 %	0 %	50 %	50 %	312132328
119	NC_014656	TGGC	2	8	56021	56028	0 %	25 %	50 %	25 %	312132328
120	NC_014656	TCCT	2	8	56242	56249	0 %	50 %	0 %	50 %	312132328
121	NC_014656	GGTC	2	8	56391	56398	0 %	25 %	50 %	25 %	312132328
122	NC_014656	TTTC	2	8	56439	56446	0 %	75 %	0 %	25 %	312132328
123	NC_014656	CGAG	2	8	57073	57080	25 %	0 %	50 %	25 %	312132329
124	NC_014656	CCGG	2	8	57577	57584	0 %	0 %	50 %	50 %	312132329
125	NC_014656	CCGG	2	8	60780	60787	0 %	0 %	50 %	50 %	312132330
126	NC_014656	GCGT	2	8	60822	60829	0 %	25 %	50 %	25 %	312132330
127	NC_014656	ACGT	2	8	61540	61547	25 %	25 %	25 %	25 %	312132331
128	NC_014656	ACAA	2	8	62155	62162	75 %	0 %	0 %	25 %	312132331
129	NC_014656	CGGT	2	8	62185	62192	0 %	25 %	50 %	25 %	312132331
130	NC_014656	CCGA	2	8	62636	62643	25 %	0 %	25 %	50 %	312132331
131	NC_014656	CAGC	2	8	62756	62763	25 %	0 %	25 %	50 %	312132331
132	NC_014656	CGGC	2	8	63539	63546	0 %	0 %	50 %	50 %	312132332
133	NC_014656	GACG	2	8	65166	65173	25 %	0 %	50 %	25 %	312132333
134	NC_014656	TGCG	2	8	65759	65766	0 %	25 %	50 %	25 %	312132333
135	NC_014656	CACC	2	8	65789	65796	25 %	0 %	0 %	75 %	312132333
136	NC_014656	GCCC	2	8	66216	66223	0 %	0 %	25 %	75 %	312132334
137	NC_014656	CCGT	2	8	66455	66462	0 %	25 %	25 %	50 %	312132334
138	NC_014656	CGTG	2	8	67259	67266	0 %	25 %	50 %	25 %	312132334
139	NC_014656	CAGC	2	8	68859	68866	25 %	0 %	25 %	50 %	312132335
140	NC_014656	ATGC	2	8	68923	68930	25 %	25 %	25 %	25 %	312132335
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