MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014638	GCC	2	6	159459	159464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063583
3002	NC_014638	C	6	6	159850	159855	0 %	0 %	0 %	100 %	311063584
3003	NC_014638	GCT	2	6	159887	159892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3004	NC_014638	CTT	2	6	159918	159923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063584
3005	NC_014638	TCG	2	6	159928	159933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3006	NC_014638	ATG	2	6	159934	159939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063584
3007	NC_014638	CGC	3	9	159971	159979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063584
3008	NC_014638	CGT	2	6	159980	159985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3009	NC_014638	GC	3	6	160010	160015	0 %	0 %	50 %	50 %	311063584
3010	NC_014638	TCA	2	6	160019	160024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063584
3011	NC_014638	CAT	2	6	160028	160033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063584
3012	NC_014638	CTT	2	6	160125	160130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063584
3013	NC_014638	CTT	2	6	160182	160187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063584
3014	NC_014638	GAT	2	6	160206	160211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063584
3015	NC_014638	GC	3	6	160216	160221	0 %	0 %	50 %	50 %	311063584
3016	NC_014638	CTC	2	6	160287	160292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063584
3017	NC_014638	GACA	2	8	160321	160328	50 %	0 %	25 %	25 %	311063584
3018	NC_014638	CTC	2	6	160329	160334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063584
3019	NC_014638	GAA	2	6	160344	160349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063584
3020	NC_014638	CGT	2	6	160412	160417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3021	NC_014638	CTT	2	6	160437	160442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063584
3022	NC_014638	ACG	2	6	160468	160473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3023	NC_014638	GCC	2	6	160587	160592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063584
3024	NC_014638	TCACCA	2	12	160670	160681	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	311063584
3025	NC_014638	TCG	2	6	160697	160702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3026	NC_014638	GAC	2	6	160746	160751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3027	NC_014638	GCA	2	6	160838	160843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3028	NC_014638	GTC	2	6	160844	160849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3029	NC_014638	GCC	2	6	160907	160912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063584
3030	NC_014638	CCA	2	6	160929	160934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063584
3031	NC_014638	CGA	2	6	160979	160984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063584
3032	NC_014638	CG	3	6	161060	161065	0 %	0 %	50 %	50 %	311063584
3033	NC_014638	CCCG	2	8	161071	161078	0 %	0 %	25 %	75 %	311063584
3034	NC_014638	GC	3	6	161316	161321	0 %	0 %	50 %	50 %	311063585
3035	NC_014638	CGG	2	6	161324	161329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063585
3036	NC_014638	CGCTG	2	10	161375	161384	0 %	20 %	40 %	40 %	311063585
3037	NC_014638	TGCCGA	2	12	161393	161404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311063585
3038	NC_014638	CAT	2	6	161414	161419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063585
3039	NC_014638	GCG	2	6	161434	161439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063585
3040	NC_014638	CA	3	6	161550	161555	50 %	0 %	0 %	50 %	311063585
3041	NC_014638	CTG	2	6	161598	161603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063585
3042	NC_014638	GCT	2	6	161711	161716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063585
3043	NC_014638	CGC	2	6	161729	161734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063585
3044	NC_014638	GC	3	6	161733	161738	0 %	0 %	50 %	50 %	311063585
3045	NC_014638	GAAATC	2	12	161748	161759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	311063585
3046	NC_014638	CGG	2	6	161768	161773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063585
3047	NC_014638	GCCG	2	8	161822	161829	0 %	0 %	50 %	50 %	311063585
3048	NC_014638	GGC	2	6	161972	161977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063585
3049	NC_014638	CCG	3	9	162007	162015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063585
3050	NC_014638	CGG	2	6	162062	162067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063585
3051	NC_014638	GCGGT	2	10	162099	162108	0 %	20 %	60 %	20 %	311063585
3052	NC_014638	CGT	2	6	162113	162118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063585
3053	NC_014638	GAA	2	6	162227	162232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063585
3054	NC_014638	GGC	2	6	162278	162283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063585
3055	NC_014638	CGT	2	6	162287	162292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063585
3056	NC_014638	AGC	2	6	162304	162309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063585
3057	NC_014638	CCG	2	6	162316	162321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063585
3058	NC_014638	CGA	2	6	162663	162668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3059	NC_014638	AGGCAA	2	12	162669	162680	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	311063586
3060	NC_014638	CGG	2	6	162729	162734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063586
3061	NC_014638	CAA	2	6	162735	162740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063586
3062	NC_014638	CTG	2	6	162787	162792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3063	NC_014638	CAT	2	6	162801	162806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063586
3064	NC_014638	CGT	3	9	162840	162848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3065	NC_014638	GAG	2	6	162868	162873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063586
3066	NC_014638	CTG	2	6	162913	162918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3067	NC_014638	CAC	2	6	163005	163010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063586
3068	NC_014638	CGGCC	2	10	163023	163032	0 %	0 %	40 %	60 %	311063586
3069	NC_014638	AGA	2	6	163124	163129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063586
3070	NC_014638	GACCA	2	10	163174	163183	40 %	0 %	20 %	40 %	311063586
3071	NC_014638	GCT	2	6	163191	163196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3072	NC_014638	CGA	2	6	163260	163265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3073	NC_014638	TCC	2	6	163342	163347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063586
3074	NC_014638	CCG	2	6	163355	163360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063586
3075	NC_014638	GCG	2	6	163361	163366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063586
3076	NC_014638	GCACCG	2	12	163370	163381	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311063586
3077	NC_014638	CCA	2	6	163391	163396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063586
3078	NC_014638	CGA	2	6	163473	163478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3079	NC_014638	CAG	2	6	163498	163503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3080	NC_014638	ACC	2	6	163522	163527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063586
3081	NC_014638	CGC	2	6	163537	163542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063586
3082	NC_014638	GCCA	2	8	163576	163583	25 %	0 %	25 %	50 %	311063586
3083	NC_014638	ACG	2	6	163664	163669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3084	NC_014638	ACG	2	6	163685	163690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3085	NC_014638	GCC	2	6	163708	163713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063586
3086	NC_014638	CTG	2	6	163718	163723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3087	NC_014638	CGA	2	6	163785	163790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063586
3088	NC_014638	CGC	2	6	163797	163802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063586
3089	NC_014638	CAT	2	6	163884	163889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063586
3090	NC_014638	CTC	2	6	164015	164020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063587
3091	NC_014638	GGC	2	6	164037	164042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063587
3092	NC_014638	CGC	2	6	164045	164050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063587
3093	NC_014638	GACTC	2	10	164112	164121	20 %	20 %	20 %	40 %	311063587
3094	NC_014638	CGC	2	6	164141	164146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063587
3095	NC_014638	CAC	2	6	164236	164241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063587
3096	NC_014638	TTCCA	2	10	164243	164252	20 %	40 %	0 %	40 %	311063587
3097	NC_014638	TGG	2	6	164314	164319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063587
3098	NC_014638	TCG	2	6	164323	164328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063587
3099	NC_014638	TTC	2	6	164334	164339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063587
3100	NC_014638	CGATA	2	10	164347	164356	40 %	20 %	20 %	20 %	311063587
3101	NC_014638	GCT	2	6	164366	164371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063587
3102	NC_014638	CCT	2	6	164399	164404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063587
3103	NC_014638	CGC	2	6	164459	164464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063587
3104	NC_014638	GGC	2	6	164486	164491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063587
3105	NC_014638	GGCATG	2	12	164535	164546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311063587
3106	NC_014638	GCG	2	6	164548	164553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063587
3107	NC_014638	GAT	3	9	164573	164581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063587
3108	NC_014638	GC	3	6	164600	164605	0 %	0 %	50 %	50 %	311063587
3109	NC_014638	GCT	2	6	164636	164641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063587
3110	NC_014638	ATC	2	6	164661	164666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063587
3111	NC_014638	GC	3	6	164715	164720	0 %	0 %	50 %	50 %	311063587
3112	NC_014638	GTG	2	6	164721	164726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063587
3113	NC_014638	CG	3	6	164730	164735	0 %	0 %	50 %	50 %	311063587
3114	NC_014638	GCC	2	6	164751	164756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063587
3115	NC_014638	TCCG	2	8	164762	164769	0 %	25 %	25 %	50 %	311063587
3116	NC_014638	CGA	2	6	164843	164848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063587
3117	NC_014638	CGT	2	6	164860	164865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063587
3118	NC_014638	GCG	2	6	164957	164962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063588
3119	NC_014638	GGT	2	6	165008	165013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063588
3120	NC_014638	CG	3	6	165019	165024	0 %	0 %	50 %	50 %	311063588
3121	NC_014638	TCA	3	9	165041	165049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063588
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3235	NC_014638	CTGA	2	8	170084	170091	25 %	25 %	25 %	25 %	311063592
3236	NC_014638	TGC	2	6	170118	170123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063592
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3238	NC_014638	GGC	3	9	170213	170221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063592
3239	NC_014638	ACCA	2	8	170234	170241	50 %	0 %	0 %	50 %	311063592
3240	NC_014638	TGA	2	6	170259	170264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063592
3241	NC_014638	CCTG	2	8	170301	170308	0 %	25 %	25 %	50 %	311063592
3242	NC_014638	CGT	2	6	170327	170332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063592
3243	NC_014638	GC	3	6	170355	170360	0 %	0 %	50 %	50 %	311063592
3244	NC_014638	CTG	2	6	170390	170395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063592
3245	NC_014638	GGTC	2	8	170407	170414	0 %	25 %	50 %	25 %	311063592
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3362	NC_014638	CTC	2	6	177212	177217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063596
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3480	NC_014638	CAG	2	6	182834	182839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063599
3481	NC_014638	GC	4	8	182852	182859	0 %	0 %	50 %	50 %	311063599
3482	NC_014638	AAG	2	6	182867	182872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063599
3483	NC_014638	GCT	3	9	182878	182886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063599
3484	NC_014638	CGA	2	6	182890	182895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063599
3485	NC_014638	GC	3	6	182904	182909	0 %	0 %	50 %	50 %	311063599
3486	NC_014638	AGG	2	6	182928	182933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063599
3487	NC_014638	CTG	2	6	182942	182947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063599
3488	NC_014638	TCA	3	9	182982	182990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063599
3489	NC_014638	CGCT	2	8	183003	183010	0 %	25 %	25 %	50 %	311063599
3490	NC_014638	GTC	2	6	183026	183031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063599
3491	NC_014638	GGT	2	6	183049	183054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063599
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3493	NC_014638	GGC	2	6	183225	183230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3494	NC_014638	GGC	2	6	183244	183249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063600
3495	NC_014638	GCT	2	6	183351	183356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063600
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3497	NC_014638	CCGCG	2	10	183405	183414	0 %	0 %	40 %	60 %	311063600
3498	NC_014638	ACG	2	6	183425	183430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063600
3499	NC_014638	GAT	2	6	183478	183483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063600
3500	NC_014638	TGGCA	2	10	183693	183702	20 %	20 %	40 %	20 %	311063600

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